Пол Бабицке

Пол Бабицке
Пол Бабицке
Альма-матер	Государственный университет Сент-Клауда
	Научная карьера
Поля	Молекулярная биология
Учреждения	Государственный университет Пенсильвании

Пол Бабицке — профессор биохимии и молекулярной биологии и директор Центра молекулярной биологии РНК в Университете штата Пенсильвания . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Образование

Пол Бабицке получил степень бакалавра биомедицинских наук в Государственном университете Сент-Клауд в Миннесоте в 1994 году. ^{[ 3 ]} Он получил докторскую степень. Степень бакалавра генетики в Университете Джорджии в 1991 году. ^{[ 1 ]}

Карьера

Прежде чем приступить к работе в Университете штата Пенсильвания в 1994 году, Бабицке в течение трех лет работал научным сотрудником на факультете биологических наук Стэнфордского университета. ^{[ 3 ]} В настоящее время он является профессором биохимии и молекулярной биологии в Пенсильванском университете. ^{[ 1 ]}

Он стал доцентом кафедры биохимии и молекулярной биологии в 1994 году и доцентом в 2000 году. В 2006 году Бабицке получил звание профессора. ^{[ 4 ]}

С 2009 года он занимает должность директора Центра молекулярной биологии РНК в Институте наук о жизни штата Пенсильвания. ^{[ 5 ]} Его исследования сосредоточены на регуляции экспрессии генов, опосредованной приостановкой РНК-полимеразы, терминацией транскрипции, структурой РНК и РНК-связывающими белками.

В 2016 году он был избран членом Американской ассоциации содействия развитию науки. ^{[ 1 ]}

В 2017 году он был избран членом Американской академии микробиологии. ^{[ 1 ]}

Почести и награды

Председатель отдела H Американского общества микробиологии (ASM) (2006 г.) ^{[ 3 ]}
Председатель подкомитета 2 NIGMS по микробной физиологии и генетике (MBC-2) (2004 г.) ^{[ 3 ]}
Премия Дэниела Р. Тершака за преподавание (2009 г.) ^{[ 3 ]}
Представитель дивизиональной группы IV Американского общества микробиологии (ASM) (2011–2015 гг.) ^{[ 3 ]}
Премия Чарльза Э. Кауфмана за исследования новой инициативы (2016 г.) ^{[ 3 ]}
Сотрудник Американской ассоциации содействия развитию науки (AAAS) (2016 г.) ^{[ 6 ]}
Сотрудник Американской академии микробиологии (AAM) (2017 г.) ^{[ 3 ]}
Премия выдающимся выпускникам биологических наук Государственного университета Сент-Клу (2018) ^{[ 3 ]}

Избранные публикации

Бейкер К.С., Морозов И., Сузуки К., Ромео Т. и Бабицке П. (2002) CsrA регулирует биосинтез гликогена, предотвращая трансляцию glgC в Escherichia coli. Мол. Микробиол. 44:1599-1610. ^{[ 7 ]}
Яхнин А.В. и Бабицке П. (2002)Приостановка и терминация РНК-полимеразы, стимулируемая NusA, участвует в механизме аттенуации оперона trp Bacillus subtilis in vitro. Учеб. Натл. акад. наук. США. 99:11067-11072. ^{[ 8 ]}
Яхнин А.В., Яхнин Х. и Бабицке П. (2006) Пауза РНК-полимеразы участвует в механизме контроля трансляции trpE Bacillus subtilis , предоставляя TRAP дополнительное время для связывания с возникающим лидерным транскриптом trp . Мол. Ячейка 24: 547–557. ^{[ 9 ]}
Яхнин А.В., Яхнин Х. и Бабицке П. (2008) Функция фактора элонгации транскрипции NusG Bacillus subtilis в шпилько-зависимой РНК-полимеразе, останавливающейся в лидере trp . Учеб. Натл. акад. наук. США 105:16131-16136. ^{[ 10 ]}
Яхнин Х., Яхнин А.В., Бейкер К.С., Синева Е., Березин И., Ромео Т. и Бабицке П. (2011) Комплексная регуляция глобального регуляторного гена csrA : CsrA-опосредованная репрессия трансляции , транскрипция с пяти промоторов с помощью Es ⁷⁰ и Эс ^Си непрямая активация транскрипции с помощью CsrA. Мол. Микробиол. 81:689-704. ^{[ 11 ]}
Яхнин А.В., Бейкер К.С., Вакульскас К.А., Яхнин Х., Березин И., Ромео Т. и Бабицке П. (2013) CsrA активирует экспрессию flhDC , защищая мРНК flhDC от расщепления, опосредованного РНКазой E. Мол. Микробиол. 87:851-866. ^{[ 12 ]}
Мондал С., Яхнин А.В., Себастьян А., Альберт И. и Бабицке П. (2016) NusA-зависимая терминация транскрипции предотвращает неправильную регуляцию глобальной экспрессии генов. Нат. Микробиол. 1:15007. ^{[ 13 ]}
Поттс, А.Х., Вакульскас, К.А., Паннури, А., Яхнин, Х., Бабицке, П. и Ромео, Т. (2017)Глобальная роль бактериального посттранскрипционного регулятора CsrA, выявленная с помощью интегрированной транскриптомики. Нат. Коммун. 8:1596. ^{[ 14 ]}
Яхнин А.В., Фитцджеральд П.С., Макинтош К., Яхнин Х., Киреева М., Турек-Херман Дж., Манделл З.Ф., Кашлев М. и Бабицке П. (2020) NusG контролирует транскрипцию пауза и транслокация РНК-полимеразы по всему геному Bacillus subtilis . Учеб. Натл. акад. наук. США 117:21628-21636. ^{[ 15 ]}
Манделл З.Ф., Оширо Р.Т., Яхнин А.В., Кашлев М., Кирнс Д.Б. и Бабицке П. (2021) NusG представляет собой внутренний фактор терминации транскрипции, который стимулирует подвижность и координирует экспрессию генов с NusA. eLife 10: e61880. ^{[ 16 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Пол Бабицке избран членом Американской академии микробиологии» . psu.edu . Проверено 4 апреля 2017 г.
^ «Поль Бабицке» . psu.edu . Проверено 4 апреля 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я «Пол Бабицке - Научный колледж Эберли» . science.psu.edu . Проверено 1 октября 2019 г.
^ «Выпускники лаборатории» . сайты.psu.edu . Проверено 22 мая 2019 г.
^ «Поль Бабицке» . www.huck.psu.edu . Проверено 17 августа 2020 г. .
^ «Профессор Брайан Томас - Личный ПГУ - Пенсильванский университет» . www.personal.psu.edu . Проверено 1 ноября 2016 г.
^ Бейкер, Кэрол С.; Морозов Игорь; Сузуки, Казуши; Ромео, Тони; Бабицке, Пол (июнь 2002 г.). «CsrA регулирует биосинтез гликогена, предотвращая трансляцию glgC в Escherichia coli» . Молекулярная микробиология . 44 (6): 1599–1610. дои : 10.1046/j.1365-2958.2002.02982.x . ISSN 0950-382X . ПМИД 12067347 . S2CID 34798274 .
^ Яхнин Александр Васильевич; Бабицке, Пол (20 августа 2002 г.). «Приостановка и терминация РНК-полимеразы, стимулируемая NusA, участвует в механизме ослабления оперона trp Bacillus subtilis in vitro» . Труды Национальной академии наук . 99 (17): 11067–11072. Бибкод : 2002PNAS...9911067Y . дои : 10.1073/pnas.162373299 . ISSN 0027-8424 . ПМК 123211 . ПМИД 12161562 .
^ Яхнин Александр Васильевич; Яхнин, Елена; Бабицке, Пол (17 ноября 2006 г.). «Приостановка РНК-полимеразы регулирует инициацию трансляции, предоставляя дополнительное время для взаимодействия TRAP-РНК» . Молекулярная клетка . 24 (4): 547–557. doi : 10.1016/j.molcel.2006.09.018 . ISSN 1097-2765 . ПМИД 17114058 .
^ Яхнин Александр Васильевич; Яхнин, Елена; Бабицке, Пол (21 октября 2008 г.). «Функция фактора элонгации транскрипции NusG Bacillus subtilis в шпилько-зависимой РНК-полимеразе, останавливающейся в лидере trp» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (42): 16131–16136. Бибкод : 2008PNAS..10516131Y . дои : 10.1073/pnas.0808842105 . ISSN 1091-6490 . ПМК 2571025 . ПМИД 18852477 .
^ Яхнин, Елена; Яхнин Александр Васильевич; Бейкер, Кэрол С.; Синева, Елена; Березин Игорь; Ромео, Тони; Бабицке, Пол (август 2011 г.). «Комплексная регуляция глобального регуляторного гена csrA: CsrA-опосредованная репрессия трансляции, транскрипция с пяти промоторов с помощью Eσ ⁷⁰ и Eσ(S) и непрямая активация транскрипции с помощью CsrA» . Molecular Microbiology . 81 (3): 689–704. doi : 10.1111/j.1365-2958.2011.07723.x . ISSN 1365-2958 . PMC 3189700. . PMID 21696456 .
^ Яхнин Александр Васильевич; Бейкер, Кэрол С.; Вакульскас, Кристофер А.; Яхнин, Елена; Березин Игорь; Ромео, Тони; Бабицке, Пол (февраль 2013 г.). «CsrA активирует экспрессию flhDC, защищая мРНК flhDC от расщепления, опосредованного РНКазой E» . Молекулярная микробиология . 87 (4): 851–866. дои : 10.1111/mmi.12136 . ISSN 0950-382X . ПМЦ 3567230 . ПМИД 23305111 .
^ Мондал, Смараджит; Яхнин Александр Васильевич; Себастьян, Асвати; Альберт, Иштван; Бабицке, Пол (11 января 2016 г.). «NusA-зависимая терминация транскрипции предотвращает неправильную регуляцию глобальной экспрессии генов» . Природная микробиология . 1 : 15007. doi : 10.1038/nmicrobiol.2015.7 . ISSN 2058-5276 . ПМК 5358096 . ПМИД 27571753 .
^ Поттс, Анастасия Х.; Вакульскас, Кристофер А.; Паннури, Арчана; Яхнин, Елена; Бабицке, Пол; Ромео, Тони (17 ноября 2017 г.). «Глобальная роль бактериального посттранскрипционного регулятора CsrA, выявленная с помощью интегрированной транскриптомики» . Природные коммуникации . 8 (1): 1596. Бибкод : 2017NatCo...8.1596P . дои : 10.1038/s41467-017-01613-1 . ISSN 2041-1723 . ПМК 5694010 . ПМИД 29150605 .
^ Яхнин А.В.; Фицджеральд, ПК; Макинтош, К.; Яхнин, Х.; Киреева, М.; Турек-Херман, Дж.; Манделл, З.Ф.; Кашлев, М.; Бабицке, П. (2020). «ЧВК Европа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (35): 21628–21636. дои : 10.1073/pnas.2006873117 . ПМЦ 7474616 . ПМИД 32817529 .
^ Манделл, Закари Ф.; Осиро, Рид Т.; Яхнин Александр Васильевич; Вишвакарма, Риши; Кашлев Михаил; Кернс, Дэниел Б.; Бабицке, Пол (9 апреля 2021 г.). «NusG — это внутренний фактор терминации транскрипции, который стимулирует подвижность и координирует экспрессию генов с NusA» . электронная жизнь . 10 . doi : 10.7554/eLife.61880 . ПМК 8060035 . ПМИД 33835023 .

[News-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Пол Бабицке избран членом Американской академии микробиологии» . psu.edu . Проверено 4 апреля 2017 г.

[2] «Поль Бабицке» . psu.edu . Проверено 4 апреля 2017 г.

[PSU-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я «Пол Бабицке - Научный колледж Эберли» . science.psu.edu . Проверено 1 октября 2019 г.

[4] «Выпускники лаборатории» . сайты.psu.edu . Проверено 22 мая 2019 г.

[5] «Поль Бабицке» . www.huck.psu.edu . Проверено 17 августа 2020 г. .

[6] «Профессор Брайан Томас - Личный ПГУ - Пенсильванский университет» . www.personal.psu.edu . Проверено 1 ноября 2016 г.

[7] Бейкер, Кэрол С.; Морозов Игорь; Сузуки, Казуши; Ромео, Тони; Бабицке, Пол (июнь 2002 г.). «CsrA регулирует биосинтез гликогена, предотвращая трансляцию glgC в Escherichia coli» . Молекулярная микробиология . 44 (6): 1599–1610. дои : 10.1046/j.1365-2958.2002.02982.x . ISSN 0950-382X . ПМИД 12067347 . S2CID 34798274 .

[8] Яхнин Александр Васильевич; Бабицке, Пол (20 августа 2002 г.). «Приостановка и терминация РНК-полимеразы, стимулируемая NusA, участвует в механизме ослабления оперона trp Bacillus subtilis in vitro» . Труды Национальной академии наук . 99 (17): 11067–11072. Бибкод : 2002PNAS...9911067Y . дои : 10.1073/pnas.162373299 . ISSN 0027-8424 . ПМК 123211 . ПМИД 12161562 .

[9] Яхнин Александр Васильевич; Яхнин, Елена; Бабицке, Пол (17 ноября 2006 г.). «Приостановка РНК-полимеразы регулирует инициацию трансляции, предоставляя дополнительное время для взаимодействия TRAP-РНК» . Молекулярная клетка . 24 (4): 547–557. doi : 10.1016/j.molcel.2006.09.018 . ISSN 1097-2765 . ПМИД 17114058 .

[10] Яхнин Александр Васильевич; Яхнин, Елена; Бабицке, Пол (21 октября 2008 г.). «Функция фактора элонгации транскрипции NusG Bacillus subtilis в шпилько-зависимой РНК-полимеразе, останавливающейся в лидере trp» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (42): 16131–16136. Бибкод : 2008PNAS..10516131Y . дои : 10.1073/pnas.0808842105 . ISSN 1091-6490 . ПМК 2571025 . ПМИД 18852477 .

[11] Яхнин, Елена; Яхнин Александр Васильевич; Бейкер, Кэрол С.; Синева, Елена; Березин Игорь; Ромео, Тони; Бабицке, Пол (август 2011 г.). «Комплексная регуляция глобального регуляторного гена csrA: CsrA-опосредованная репрессия трансляции, транскрипция с пяти промоторов с помощью Eσ ⁷⁰ и Eσ(S) и непрямая активация транскрипции с помощью CsrA» . Molecular Microbiology . 81 (3): 689–704. doi : 10.1111/j.1365-2958.2011.07723.x . ISSN 1365-2958 . PMC 3189700. . PMID 21696456 .

[12] Яхнин Александр Васильевич; Бейкер, Кэрол С.; Вакульскас, Кристофер А.; Яхнин, Елена; Березин Игорь; Ромео, Тони; Бабицке, Пол (февраль 2013 г.). «CsrA активирует экспрессию flhDC, защищая мРНК flhDC от расщепления, опосредованного РНКазой E» . Молекулярная микробиология . 87 (4): 851–866. дои : 10.1111/mmi.12136 . ISSN 0950-382X . ПМЦ 3567230 . ПМИД 23305111 .

[13] Мондал, Смараджит; Яхнин Александр Васильевич; Себастьян, Асвати; Альберт, Иштван; Бабицке, Пол (11 января 2016 г.). «NusA-зависимая терминация транскрипции предотвращает неправильную регуляцию глобальной экспрессии генов» . Природная микробиология . 1 : 15007. doi : 10.1038/nmicrobiol.2015.7 . ISSN 2058-5276 . ПМК 5358096 . ПМИД 27571753 .

[14] Поттс, Анастасия Х.; Вакульскас, Кристофер А.; Паннури, Арчана; Яхнин, Елена; Бабицке, Пол; Ромео, Тони (17 ноября 2017 г.). «Глобальная роль бактериального посттранскрипционного регулятора CsrA, выявленная с помощью интегрированной транскриптомики» . Природные коммуникации . 8 (1): 1596. Бибкод : 2017NatCo...8.1596P . дои : 10.1038/s41467-017-01613-1 . ISSN 2041-1723 . ПМК 5694010 . ПМИД 29150605 .

[15] Яхнин А.В.; Фицджеральд, ПК; Макинтош, К.; Яхнин, Х.; Киреева, М.; Турек-Херман, Дж.; Манделл, З.Ф.; Кашлев, М.; Бабицке, П. (2020). «ЧВК Европа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (35): 21628–21636. дои : 10.1073/pnas.2006873117 . ПМЦ 7474616 . ПМИД 32817529 .

[16] Манделл, Закари Ф.; Осиро, Рид Т.; Яхнин Александр Васильевич; Вишвакарма, Риши; Кашлев Михаил; Кернс, Дэниел Б.; Бабицке, Пол (9 апреля 2021 г.). «NusG — это внутренний фактор терминации транскрипции, который стимулирует подвижность и координирует экспрессию генов с NusA» . электронная жизнь . 10 . doi : 10.7554/eLife.61880 . ПМК 8060035 . ПМИД 33835023 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]