ЛокБД

ЛокБД
Содержание
Описание	экспериментальные аннотации локализации
Организмы	Мудрый человек ; Арабидопсис Талиана
Контакт
Исследовательский центр	Колумбийский университет
Лаборатория	Кафедра биохимии и молекулярной биофизики
Авторы	Шрути Растоги
Первичное цитирование	Растоги и др. (2011)
Дата выпуска	2010
Доступ
Формат данных	База данных MySQL
Веб-сайт	http://www.rostlab.org/services/locDB
веб-службы URL-адрес	http://www.rostlab.org/services/locDB/search.php
Разнообразный
Версия	Версия 1.0

ЛокБД ^{[ 1 ]} представляет собой базу данных, курируемую экспертами, в которой собраны экспериментальные аннотации по субклеточной локализации белков у Homo sapiens (человека) и Arabidopsis thaliana (сорняков). База данных также содержит прогнозы субклеточной локализации, полученные с помощью различных современных методов прогнозирования для всех белков с экспериментальной информацией.

Белки являются основными функциональными компонентами клеток. Они отвечают за преобразование генетической информации в физическую реальность. Эти макромолекулы опосредуют регуляцию генов, ферментативный катализ, клеточный метаболизм, репликацию ДНК и транспорт питательных веществ, распознавание и передачу сигналов. Интерпретация этого огромного количества данных для выяснения функций белков в постгеномную эпоху является фундаментальной задачей. На сегодняшний день даже для наиболее хорошо изученных организмов, таких как дрожжи, около четверти белков остаются неохарактеризованными. Основным препятствием в экспериментальном определении функции белка является то, что исследования требуют огромных ресурсов. Следовательно, разрыв между количеством последовательностей, хранящихся в базах данных, и экспериментальной характеристикой соответствующих белков постоянно растет. Биоинформатика играет центральную роль в преодолении этого разрыва между последовательностями и функциями посредством разработки инструментов для более быстрого и эффективного прогнозирования функции белка. Этот репозиторий эффективно заполняет пробел между экспериментальными аннотациями и прогнозами и предоставляет более крупный и надежный набор данных для тестирования новых методов прогнозирования. ^{[ 1 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Растоги, Шрути; Рост Буркхард (январь 2011 г.). «LocDB: экспериментальные аннотации локализации Homo sapiens и Arabidopsis thaliana» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных). Англия: D230-4. дои : 10.1093/nar/gkq927 . ПМК 3013784 . ПМИД 21071420 .

Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid21071420-1] Jump up to: ^а ^б ^с Растоги, Шрути; Рост Буркхард (январь 2011 г.). «LocDB: экспериментальные аннотации локализации Homo sapiens и Arabidopsis thaliana» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных). Англия: D230-4. дои : 10.1093/nar/gkq927 . ПМК 3013784 . ПМИД 21071420 .

[ 1 ]