Цзянь Ма (ученый-компьютерщик)

Цзянь Ма
Цзянь Ма
Ма Цзянь
Гражданство	Соединенные Штаты
Награды	Стипендия Гуггенхайма (2020) ; Сотрудник AAAS (2022 г.) ;
	Научная карьера
Поля	Вычислительная биология ; Вычислительная геномика ; Машинное обучение ; Системная биология ;
Учреждения	Университет Карнеги-Меллон (с 2016 г.) ; Университет Иллинойса Урбана-Шампейн (2009–2015 гг.) ;
Научные консультанты	Дэвид Хаусслер (консультант постдока), Уэбб Миллер (консультант доктора философии)
Веб-сайт	www .cs .cmu .edu /~цзяньма /

Цзянь Ма ( китайский : 马坚) — американский учёный-компьютерщик и компьютерный биолог . ^{[ 1 ]} Он является Рэя и Стефани Лейн профессором вычислительной биологии в Школе компьютерных наук Университета Карнеги-Меллон . ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Он является преподавателем кафедры вычислительной биологии Рэя и Стефани Лейн . Его лаборатория разрабатывает алгоритмы машинного обучения для изучения структуры и функций генома человека. ^{[ 5 ]} и клеточная организация и их значение для здоровья и болезней. Во время его докторской степени. и постдокторантское обучение, он разработал алгоритмы для реконструкции генома предков млекопитающих. ^{[ 6 ]} Его исследовательская группа недавно разработала серию новых методов машинного обучения для трехмерной эпигеномики, сравнительной геномики, пространственной геномики и анализа отдельных клеток. В 2011 году он получил награду NSF CAREER . ^{[ 7 ]} В 2020 году он был удостоен стипендии Гуггенхайма. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} в области компьютерных наук. Он является избранным членом Американской ассоциации содействия развитию науки . ^{[ 11 ]} Он возглавляет Центр нуклеома NIH 4D, занимающийся разработкой алгоритмов машинного обучения, позволяющих лучше понять клеточное ядро. ^{[ 5 ]}^{[ 12 ]} Он является председателем программы RECOMB 2024. ^{[ 13 ]}

Избранные недавние публикации

Сюн К. ^#, Чжан Р ^#и Ма Дж. scGHOST: Идентификация одноклеточных субкомпартментов 3D-генома. Nature Methods , 21(5):814-822, 2024.
Чжоу Т., Чжан Р., Цзя Д., Доти РТ, Мандей А.Д., Гао Д., Синь Л., Абковиц Дж.Л., Дуань З* и Ма Дж.*. GAGE-seq одновременно профилирует многомасштабную трехмерную организацию генома и экспрессию генов в отдельных клетках. Природная генетика , https://doi.org/10.1038/s41588-024-01745-3, 2024.
Чжан Й., Бонинсенья Л., Ян М., Мистели Т., Альбер Ф. и Ма Дж. Вычислительные методы анализа многомасштабной организации трехмерного генома. Nature Reviews Genetics , 5(2):123-141, 2024.
Чидестер Б ^#, Чжоу Т ^#, Алам С. и Ма Дж. SPICEMIX обеспечивает интегративное пространственное моделирование клеточной идентичности. Nature Genetics , 55(1):78-88, 2023. [Обложка статьи]
Чжан Р ^#, Чжоу Т ^#и Ма Дж. Сверхбыстрый и интерпретируемый трехмерный анализ генома одной клетки с помощью Fast-Higashi. Cell Systems , 13(10):P798-807.E6, 2022. [Обложка]
ЧжуХ ^#, Чжан Ю. ^#, Ван Ю, Тянь Д., Белмонт А.С., Сведлоу Дж. Р. и Ма Дж. Браузер нуклеома: интегративная и мультимодальная платформа навигации по данным для 4D Nucleome. Nature Methods , 19(8):911-913, 2022.
Чжан Р., Чжоу Т. и Ма Дж. Многомасштабный и интегративный одноклеточный анализ Hi-C с помощью Higashi. Природная биотехнология , 40:254–261, 2022.

Ссылки

^ «Цзянь Ма — цитаты из Google Scholar» . ученый.google.com . Проверено 22 мая 2020 г.
^ «Веб-страница Цзянь Ма в Карнеги-Меллон» .
^ Карнеги-Меллон. «Цзянь Ма — Кафедра вычислительной биологии — Школа компьютерных наук — Университет Карнеги-Меллона» . cbd.cmu.edu . Проверено 18 июня 2021 г.
^ «Факультет SCS получает звание профессора» . Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона . Проверено 23 декабря 2021 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Карнеги-Меллон. «Карнеги-Меллон возглавляет новый центр изучения структуры клеточного ядра - Новости - Университет Карнеги-Меллон» . www.cmu.edu . Проверено 19 июня 2021 г.
^ Пенниси, Элизабет (3 июня 2005 г.). «Вымерший геном в разработке» . Наука . 308 (5727): 1401–1402. дои : 10.1126/science.308.5727.1401b . ISSN 0036-8075 . ПМИД 15933177 . S2CID 83068891 .
^ «Цзянь Ма получает награду CAREER за крупномасштабные геномные исследования | Институт геномной биологии Карла Р. Везе» . www.igb.illinois.edu . Проверено 22 мая 2020 г.
^ «Фонд Джона Саймона Гуггенхайма | Цзянь Ма» . Проверено 22 мая 2020 г.
^ «Фонд Джона Саймона Гуггенхайма | Объявлены победители стипендии Гуггенхайма 2020 года» . Проверено 22 мая 2020 г.
^ Карнеги-Меллон (10 апреля 2020 г.). «Цзянь Ма выигрывает стипендию Гуггенхайма - Новости - Университет Карнеги-Меллон» . www.cmu.edu . Проверено 22 мая 2020 г.
^ «Цзянь Ма избран членом AAAS 2022 года» . Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона . Проверено 2 февраля 2023 г.
^ «CMU возглавит исследовательский центр NIH, создающий 3D-карту ядер клеток» . Питтсбург Пост-Газетт . Проверено 19 июня 2021 г.
^ «РЕКОМБ 2024 | ДОМ» . сайт recomb.org . Проверено 23 сентября 2023 г.

Внешние ссылки

Публикации Цзянь Ма индексируются Google Scholar

[1] «Цзянь Ма — цитаты из Google Scholar» . ученый.google.com . Проверено 22 мая 2020 г.

[2] «Веб-страница Цзянь Ма в Карнеги-Меллон» .

[3] Карнеги-Меллон. «Цзянь Ма — Кафедра вычислительной биологии — Школа компьютерных наук — Университет Карнеги-Меллона» . cbd.cmu.edu . Проверено 18 июня 2021 г.

[4] «Факультет SCS получает звание профессора» . Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона . Проверено 23 декабря 2021 г.

[:0-5] Перейти обратно: ^а ^б Карнеги-Меллон. «Карнеги-Меллон возглавляет новый центр изучения структуры клеточного ядра - Новости - Университет Карнеги-Меллон» . www.cmu.edu . Проверено 19 июня 2021 г.

[6] Пенниси, Элизабет (3 июня 2005 г.). «Вымерший геном в разработке» . Наука . 308 (5727): 1401–1402. дои : 10.1126/science.308.5727.1401b . ISSN 0036-8075 . ПМИД 15933177 . S2CID 83068891 .

[7] «Цзянь Ма получает награду CAREER за крупномасштабные геномные исследования | Институт геномной биологии Карла Р. Везе» . www.igb.illinois.edu . Проверено 22 мая 2020 г.

[8] «Фонд Джона Саймона Гуггенхайма | Цзянь Ма» . Проверено 22 мая 2020 г.

[9] «Фонд Джона Саймона Гуггенхайма | Объявлены победители стипендии Гуггенхайма 2020 года» . Проверено 22 мая 2020 г.

[10] Карнеги-Меллон (10 апреля 2020 г.). «Цзянь Ма выигрывает стипендию Гуггенхайма - Новости - Университет Карнеги-Меллон» . www.cmu.edu . Проверено 22 мая 2020 г.

[11] «Цзянь Ма избран членом AAAS 2022 года» . Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона . Проверено 2 февраля 2023 г.

[12] «CMU возглавит исследовательский центр NIH, создающий 3D-карту ядер клеток» . Питтсбург Пост-Газетт . Проверено 19 июня 2021 г.

[13] «РЕКОМБ 2024 | ДОМ» . сайт recomb.org . Проверено 23 сентября 2023 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]