ShelXle
![]() главное окно ShelXle со структурой C60F18 | |
Разработчик(и) | Кристиан Б. Хюбшле |
---|---|
Первоначальный выпуск | 2011 |
Стабильная версия | 1.0.1229 [1] ![]() |
Написано в | С++ |
Операционная система | Windows , Linux , MacOS |
Тип | Молекулярное моделирование |
Лицензия | Меньшая стандартная общественная лицензия GNU |
Веб-сайт | http://www.shelxle.org/index.php |
Программа ShelXle [2] представляет собой графический интерфейс пользователя для программы уточнения структуры SHELXL. [3] ShelXle сочетает в себе редактор с подсветкой синтаксиса для связанных с SHELXL файлов .ins (входной) и .res (выходной) с интерактивным графическим дисплеем для визуализации трехмерной структуры, включая электронную плотность (Fo) и разностную плотность (Fo- Фк) карты.
Обзор [ править ]
ShelXle может отображать карты электронной плотности, как макромолекулярная программа Coot , но больше предназначена для более мелких молекул.Существует ряд превосходных графических пользовательских интерфейсов (GUI) для уточнения кристаллической структуры малых молекул с помощью SHELX (например, WINGX, [4] Олекс2 , [5] XSEED, [6] ПЛАТОН и СИСТЕМА-С, [7] и программы Bruker XP и XSHELL)
ShelXle — бесплатное программное обеспечение , распространяемое под лицензией GNU LGPL. Он доступен на сайте ShelXle или на SourceForge . [8] [9] Двоичные файлы доступны для Windows, macOS и дистрибутивов Linux SuSE , Debian и Ubuntu .Бинарный файл Windows распространяется вместе с установщиком NSIS .
Особенности [ править ]
- Редактор с подсветкой синтаксиса и автодополнением кода для инструкций SHELX.
- Щелчок по атому в представлении структуры устанавливает текстовый курсор на строку, содержащую этот атом.
- Расположение атомов в представлении структуры из редактора.
- Режим переименования с поддержкой остатков , неупорядоченных частей и свободных переменных .
Архитектура программы [ править ]
ShelXle использует Qt (фреймворк) . Он полностью написан на C++ и не использует никаких языков сценариев . Для уточнения он вызывает внешний двоичный файл SHELXL, который также может быть SHELXH, SHELXLMP от Джорджа М. Шелдрика или XL от Bruker.
ШЕЛКС [ править ]
ШЕЛКС [3] разрабатывается Джорджем М. Шелдриком с конца 1960-х годов. Важными выпусками являются SHELX76 и SHELX97. Он все еще находится в разработке, но релизы обычно выходят после десяти лет тестирования.Академические пользователи могут бесплатно загружать программы SHELX после регистрации. [10]
Внешние ссылки [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ https://www.shelxle.org/shelx/chlg/changelog.php .
{{cite web}}
: Отсутствует или пусто|title=
( помощь ) - ^ Хюбшле, Кристиан Б.; Шелдрик, Джордж М.; Диттрих, Биргер (12 ноября 2011 г.). «ShelXle: графический пользовательский интерфейс Qt для SHELXL» . Журнал прикладной кристаллографии . 44 (6): 1281–1284. дои : 10.1107/S0021889811043202 . ПМЦ 3246833 . ПМИД 22477785 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Шелдрик, Джордж М. (21 декабря 2007 г.). «Краткая история ШЭЛКСа» . Acta Crystallographica Раздел А. 64 (1): 112–122. Бибкод : 2008AcCrA..64..112S . дои : 10.1107/S0108767307043930 . ПМИД 18156677 .
- ^ Фарруджа, Луи Дж. (1 августа 1999 г.). «Комплекс WinGX для кристаллографии монокристаллов малых молекул». Журнал прикладной кристаллографии . 32 (4): 837–838. дои : 10.1107/S0021889899006020 .
- ^ Доломанов Олег В.; Бурхис, Люк Дж.; Гильдеа, Ричард Дж.; Ховард, Джудит АК; Пушманн, Хорст (24 января 2009 г.). «OLEX2: комплексное структурное решение, программа уточнения и анализа». Журнал прикладной кристаллографии . 42 (2): 339–341. дои : 10.1107/S0021889808042726 .
- ^ Барбур, Леонард Дж. (2001). «X-Seed — программный инструмент для супрамолекулярной кристаллографии». Дж. Супрамол. Хим . 1 (4–6): 189–19. дои : 10.1016/S1472-7862(02)00030-8 .
- ^ Спек, Энтони Л. (20 января 2009 г.). «Подтверждение структуры в химической кристаллографии» . Acta Crystallographica Раздел D. 65 (2): 148–155. дои : 10.1107/S090744490804362X . ПМК 2631630 . ПМИД 19171970 .
- ^ «Страница загрузки ShelXle» . www.shelxle.org . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ "ШелХл" . СоурсФордж . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ «Домашняя страница SHELX» . shelx.uni-goettingen.de . Проверено 6 сентября 2016 г.