ОриДБ

ОриДБ
Содержание
Описание	База данных источников репликации ДНК .
Организмы	Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces pombe
Контакт
Лаборатория	Лаборатория Недушинского.
Первичное цитирование	Сиов аль. (2012)
Дата выпуска	2006, 2012
Доступ
Веб-сайт	http://cerevisiae.oridb.org , http://pombe.oridb.org
Разнообразный
Лицензия	Бесплатно

OriDB — это биологическая база данных подтвержденных и предсказанных сайтов начала репликации ДНК в модельных организмах Saccharomyces cerevisiae и Schizosaccharomyces pombe . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

База данных происхождения репликации ДНК (OriDB) предоставляет доступ к сопоставленным опубликованным наборам данных, которые предсказали и/или подтвердили местоположение источников репликации. Каждый потенциальный сайт происхождения репликации указан как подтвержденный, вероятный или сомнительный, в зависимости от уровня подтверждающих данных. Для каждого сайта доступна дополнительная информация, в том числе:

геномное расположение исходного сайта;
последовательность ДНК ;
графическое представление исходного участка, включающее экспериментальные данные;
опубликованные исследования, предполагающие происхождение;
ссылки на соответствующие оригинальные исследования.

Кроме того, существует графический просмотрщик, который позволяет пользователям выбирать хромосомные области и отображать выбранные наборы данных. Все оригинальные наборы данных, представленные в OriDB, доступны для скачивания.

См. также

Происхождение репликации

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Сиов, CC; Недушинска, СР; Мюллер, Калифорния; Недушинский, Калифорния (январь 2012 г.). «OriDB, база данных происхождения репликации ДНК обновлена и расширена» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D682-6. дои : 10.1093/nar/gkr1091 . ПМЦ 3245157 . ПМИД 22121216 .
^ Недушинский, Калифорния; Хирага, С; Ак, П; Бенхэм, CJ; Дональдсон, AD (январь 2007 г.). «OriDB: база данных происхождения репликации ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (Проблема с базой данных): D40-6. дои : 10.1093/nar/gkl758 . ПМЦ 1781122 . ПМИД 17065467 .

Внешние ссылки

Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[PMID_22121216-1] Jump up to: ^а ^б Сиов, CC; Недушинска, СР; Мюллер, Калифорния; Недушинский, Калифорния (январь 2012 г.). «OriDB, база данных происхождения репликации ДНК обновлена и расширена» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D682-6. дои : 10.1093/nar/gkr1091 . ПМЦ 3245157 . ПМИД 22121216 .

[PMID_17065467-2] Недушинский, Калифорния; Хирага, С; Ак, П; Бенхэм, CJ; Дональдсон, AD (январь 2007 г.). «OriDB: база данных происхождения репликации ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (Проблема с базой данных): D40-6. дои : 10.1093/nar/gkl758 . ПМЦ 1781122 . ПМИД 17065467 .

[ 1 ]

[ 2 ]