Арлекин (программное обеспечение)

Арлекин
Стабильная версия	'v3.5.2.2.', '2008'
Операционная система	Microsoft Windows , Mac OS и Linux
Веб-сайт	http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin35/

Arlequin — это бесплатное программное обеспечение для популяционной генетики , распространяемое как интегрированное программное обеспечение для анализа данных с графическим пользовательским интерфейсом. ^{[ 1 ]} Он выполняет несколько типов тестов и расчетов, включая индекс фиксации (Fst _, также известный как «F-статистика»). ^{[ 2 ]}), вычисление генетического расстояния , равновесие Харди – Вайнберга , неравновесие по сцеплению , анализ молекулярной дисперсии , распределение несоответствий и тесты на парные различия. Программное обеспечение предназначено для обработки различных типов данных молекулярного, немолекулярного и/или частотного типа. ^{[ 3 ]}

О

Arlequin — это пакет программного обеспечения, который объединяет базовые и расширенные уровни/методы популяционной генетики и анализа данных. ^{[ 4 ]}

Версия 3.5.2.2 ^{[ 1 ]} доступен только в Microsoft Windows в виде zip-архива и исполняемых файлов установки. ^{[ 1 ]}

Mac OS X и Linux имеют только более старую версию 3.5.2, но ограничены 64-битными средами и имеют только интерфейс командной строки в качестве «arlecore». ^{[ 5 ]} программа "арлсумстат" ^{[ 6 ]} программу, а также файлы примеров.

В 2019 году новые функции R были интегрированы в программное обеспечение Arlequin. Новые функции R позволяют интегрировать программное обеспечение в zip-файлы для версий Windows , Mac и Linux . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с "Арлекин версия 3.5.2.2 (выпущена 08.02.2015)" . 2 августа 2015 г. Проверено 17 января 2017 г.
^ Лю, Чун-Фан; Ли, Цуй; Ван, Хай-Янь (март 2015 г.). «Генетическое разнообразие различных популяций tegillarca granosa в разных прибрежных районах Китая» [Генетическое разнообразие различных популяций tegillarca granosa ]. в прибрежных водах Китая на основе частичных последовательностей гена COI]. Oceanologia et Limnologia Sinica (на упрощенном китайском языке 46 (2): 364–371 дои : 10.11693/hyhz20140400105 .
^ «Арлекин: Об Арлекине» . cmpg.unibe.ch . Проверено 7 апреля 2023 г.
^ Экскофье, Лоран; Лаваль, Гийом; Шнайдер, Стефан (23 февраля 2007 г.). «Арлекин (версия 3.0): Интегрированный пакет программного обеспечения для анализа данных популяционной генетики» . Эволюционная биоинформатика онлайн . 1 : 47–50. ISSN 1176-9343 . ПМЦ 2658868 . ПМИД 19325852 .
^ «ARLECORE (v 3.5.2) README.txt» . Апрель 2015 года . Проверено 17 января 2017 г.
^ «ARLSUMSTAT (v 3.5.2) README.txt» . Декабрь 2009 года . Проверено 17 января 2017 г.
^ «Арлекин 3,5» . cmpg.unibe.ch . Проверено 30 марта 2023 г.

Внешние ссылки

Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Arlequin35-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с "Арлекин версия 3.5.2.2 (выпущена 08.02.2015)" . 2 августа 2015 г. Проверено 17 января 2017 г.

[Liu_2015-2] Лю, Чун-Фан; Ли, Цуй; Ван, Хай-Янь (март 2015 г.). «Генетическое разнообразие различных популяций tegillarca granosa в разных прибрежных районах Китая» [Генетическое разнообразие различных популяций tegillarca granosa ]. в прибрежных водах Китая на основе частичных последовательностей гена COI]. Oceanologia et Limnologia Sinica (на упрощенном китайском языке 46 (2): 364–371 дои : 10.11693/hyhz20140400105 .

[3] «Арлекин: Об Арлекине» . cmpg.unibe.ch . Проверено 7 апреля 2023 г.

[4] Экскофье, Лоран; Лаваль, Гийом; Шнайдер, Стефан (23 февраля 2007 г.). «Арлекин (версия 3.0): Интегрированный пакет программного обеспечения для анализа данных популяционной генетики» . Эволюционная биоинформатика онлайн . 1 : 47–50. ISSN 1176-9343 . ПМЦ 2658868 . ПМИД 19325852 .

[arlecore-5] «ARLECORE (v 3.5.2) README.txt» . Апрель 2015 года . Проверено 17 января 2017 г.

[arlsumstat-6] «ARLSUMSTAT (v 3.5.2) README.txt» . Декабрь 2009 года . Проверено 17 января 2017 г.

[7] «Арлекин 3,5» . cmpg.unibe.ch . Проверено 30 марта 2023 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]