Анализ молекулярной дисперсии
Анализ молекулярной дисперсии ( AMOVA ) представляет собой статистическую модель молекулярного алгоритма для одного вида , обычно биологического . [1] Название и модель вдохновлены ANOVA . Метод был разработан Лораном Экскофье , Питером Смусом и Джозефом Кватро в Университете Рутгерса в 1992 году.
С момента разработки AMOVA Экскофье написал программу для проведения такого анализа. Эта программа, работающая в Windows , называется Arlequin и находится в свободном доступе на веб-сайте Excoffier. Также существуют реализации на языке R в пакетах ade4 и pegas, оба доступны в CRAN (Comprehensive R Archive Network). Другая реализация есть в Info-Gen , который также работает в Windows . Студенческая версия бесплатна и полностью функциональна. Родной язык приложения — испанский, но доступна также английская версия.
Дополнительный бесплатный статистический пакет GenAlEx, [2] ориентирован как на обучение, так и на исследования и позволяет проводить сложный генетический анализ и сравнивать его с помощью широко используемого интерфейса Microsoft Excel. Это программное обеспечение позволяет рассчитывать анализы, такие как AMOVA, а также сравнивать с другими типами тесно связанных статистических данных, включая F-статистику, индекс Шеннона и многое другое.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Экскофье, Л; Смус, Пе; Кватро, Дж. М. (июнь 1992 г.). «Анализ молекулярной дисперсии, выведенной на основе метрических расстояний между гаплотипами ДНК: применение к данным ограничения митохондриальной ДНК человека» (бесплатный полный текст) . Генетика . 131 (2): 479–91. дои : 10.1093/генетика/131.2.479 . ISSN 0016-6731 . ПМК 1205020 . ПМИД 1644282 .
- ^ Пикалл, Р. и Смаус П.Е. (2012) GenAlEx 6.5: генетический анализ в Excel. Обновление популяционно-генетического программного обеспечения для обучения и исследований. Биоинформатика 28, 2537–2539.
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта статистике статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |