Составной транспозон
Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( сентябрь 2014 г. ) |
по Составной транспозон функциям аналогичен простым транспозонам и элементам инсерционной последовательности (IS) в том, что он имеет сегменты ДНК , кодирующие белок , фланкированные инвертированными повторяющимися последовательностями, которые могут распознаваться ферментами транспозазами. Однако составной транспозон окружен двумя отдельными IS-элементами, которые могут быть или не быть точными копиями. Вместо того, чтобы каждый IS-элемент перемещался отдельно, вся длина ДНК, простирающаяся от одного IS-элемента к другому, транспонируется как одна полная единица. Составные транспозоны также часто несут один или несколько генов, обеспечивающих устойчивость к антибиотикам .
В окружении SINE в геномах млекопитающих
[ редактировать ]Два SINE могут действовать согласованно, фланкируя и мобилизуя промежуточную однокопийную последовательность ДНК. Об этом сообщалось для последовательности ДНК длиной 710 п.н., расположенной выше гена бычьего бета-глобина. [ 1 ] Расположение ДНК образует составной транспозон, присутствие которого подтверждено полной геномной последовательностью быка , где мобилизованная последовательность может быть найдена на хромосоме 15 быка в контиге NW_001493315.1 нуклеотидов # 1085432–1086142, а исходная последовательность может быть найдена на хромосоме 2 быка. в контиге NW_001501789.2 нуклеотида № 1096679–1097389. Вполне вероятно, что подобные составные транспозоны существуют в других геномных регионах крупного рогатого скота и других геномах млекопитающих. Их можно обнаружить с помощью подходящих алгоритмов.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Зельник CR, Беркс DJ, Дункан CH (декабрь 1987 г.). «Композитный транспозон 3' гена глобина плода коровы связывает фактор, специфичный для последовательности» . Нуклеиновые кислоты Рез . 15 (24): 10437–53. дои : 10.1093/нар/15.24.10437 . ПМК 339954 . ПМИД 2827124 .