Мотивы, направленные на APC/C

Анафаза , способствующая комплексу или циклосоме ( APC/C ), является очень специфической белкой-лигазой убиквитина, ответственной за запуск событий позднего митоза. При раннем митозе уровни CDC20 повышаются, а APC/C связывается с образованием активного APC/CCDC20. Это затем приводит к разрушению митотических циклинов, секурин и других белков, чтобы вызвать разделение хромосом в анафазе. ^{[ 1 ]} В раннем анафазе CDK1 инактивируется, что приводит к активации CDH1, другой субъединицы активатора APC/C. Это затем запускает деградацию CDC20 и приводит к активации APC/CCDH1 до G1 для подавления активности S-фазы циклина-CDK . В конце G1 APC/CCDH1 инактивируется, а S-фаза и митотические циклины получают повторные по мере развития клетки до S-фазы. ^{[ 1 ]}

APC/C находит свои субстраты с помощью коротких линейных мотивов последовательности или дегрон, обнаруженных в его субстратах. Эти дегроны могут быть разделены на три основные группы: коробки разрушения, коробки Ken и мотивы ABBA. ^{[ 1 ]} Свяживающие карманы на поверхности субъединиц активатора CDC20 или CDH1 взаимодействуют с дегронами на субстратах, чтобы нацелиться на их для убиквитинирования и деградации, чтобы вызвать специфические события в клеточном цикле. ^{[ 1 ]}

Дегроны, нацеленные на APC/C

APC/C представляет собой платформу связывания, которая ассоциируется с субъединицей активатора ( CDC20 или CDH1 ), которая имеет связывающие карманы на своей поверхности, чтобы взаимодействовать с дегронами на подложке. Три основных дегрона, с которыми взаимодействует APC/C, являются коробкой разрушения (также известная как D Box), Ken Box и ABBA Motif. Большинство целей APC содержат D и KEN Box. Эти дегроны обычно расположены в в основном неструктурированных областях субстратов. ^{[ 1 ]}

Коробка разрушения (D Box)

Коробка D представляет собой мотив последовательности, обнаруженный во многих мишенях APC с консенсусной аминокислотой последовательности RXXLXXXXN. R - аргинин , x - это любая аминокислота, L - лейцин , а N - аспарагин . ^{[ 2 ]} Этот привязывающий карман включает в себя домен активатора WD40, который расположен в половине C-клеммы субъединицы активатора APC/C, и сайт на субъединице APC10/DOC1 APC/C. Мотивы RXXL на подложках-мишенях содержат кислый пятно и алифатический (не ароматическая углеродная цепь). Существует водородная связь между кислым положением на коробке D и аминокислотой аргинина на поверхности активатора. ^{[ 2 ]}

Кен Бокс

Коробка KEN является мотивом последовательности, нацеленной на APC с консенсусом Kenxxxn (k является лизином, а E - глутамат). ^{[ 2 ]} Этот мотив связывается на верхней поверхности домена WD40 субъединицы активатора APC (CDH1 или CDC20) и образует спираль с недостатком с плотным поворотом карма Полем ^{[ 1 ]}

Одним из интересных примеров является коробка KEN, расположенная на активирующей субъединице APC/C CDC20, которая предпочтительно распознается CDH1. Это обеспечивает деградацию CDC20 после дефосфорилирования CDH1 и активации на выходе митоза. ^{[ 3 ]}

Абба разум

ABBA Motif распознает пептиды с консенсусом [ILVF] x [ILMVP] [fHY] x [de]. Было показано, что только небольшое количество субстратов имеет этот мотив. Этот мотив нацелен на фазовые цикклины, такие как CLB5 и Cyclin A2, которые являются первыми субстратами, которые разлагаются при митозе. ^{[ 1 ]}

Несколько мотивов APC/C на субстратах

Субстраты могут иметь более одного мотива, и это делает их особенно хорошими субстратами для APC/C. Например, S-фазовый циклин5 ( CLB5 ), белок у почкующихся дрожжей, содержит коробку Ken, D Box, ABBA Motif и CKS1, который будет нацелен на дометафазу для кооперативности дезорона. Cyclin A2, белок у людей, содержит Ken Box, Abba Motif, D Box и соавтор CKS1, который должен быть нацелен во время прометафазы. ^{[ 1 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Дэйви, Морган, Норман, Дэвид (2016). «Создание регуляторной сети с короткими линейными мотивами последовательности-уроки из дегронов комплекса, способствующего анафазу» . Молекулярная клетка . 64 (1). Mol Cel: 12–23. doi : 10.1016/j.molcel.2016.09.006 . PMC 5098475 . PMID 27716480 . {{cite journal}}: Cs1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Морган, Дэвид; Морган, Дэвид Оуэн (2007). Клеточный цикл: принципы контроля . OUP/New Science Press. ISBN 9780199206100 Полем Получено 14 декабря 2018 года .
^ Майкл, Трейв, Раму, Чика, Гибсон, Сушама, Жиль, Ченна, Клаудия, Тоби (2008). «Обнаружение кандидатов Ken-Box с использованием обогащения ключевых слов клеточного цикла в сочетании с прогнозом нативного расстройства и сохранением мотивов» . Биоинформатика . 24 (4). Биоинформатика, том 24, выпуск 4: 453–457. doi : 10.1093/bioinformatics/btm624 . PMID 18184688 . Получено 13 декабря 2018 года . {{cite journal}}: Cs1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[auto-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Дэйви, Морган, Норман, Дэвид (2016). «Создание регуляторной сети с короткими линейными мотивами последовательности-уроки из дегронов комплекса, способствующего анафазу» . Молекулярная клетка . 64 (1). Mol Cel: 12–23. doi : 10.1016/j.molcel.2016.09.006 . PMC 5098475 . PMID 27716480 . {{cite journal}}: Cs1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[auto1-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Морган, Дэвид; Морган, Дэвид Оуэн (2007). Клеточный цикл: принципы контроля . OUP/New Science Press. ISBN 9780199206100 Полем Получено 14 декабря 2018 года .

[3] Майкл, Трейв, Раму, Чика, Гибсон, Сушама, Жиль, Ченна, Клаудия, Тоби (2008). «Обнаружение кандидатов Ken-Box с использованием обогащения ключевых слов клеточного цикла в сочетании с прогнозом нативного расстройства и сохранением мотивов» . Биоинформатика . 24 (4). Биоинформатика, том 24, выпуск 4: 453–457. doi : 10.1093/bioinformatics/btm624 . PMID 18184688 . Получено 13 декабря 2018 года . {{cite journal}}: Cs1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]