Таверна
Разработчик (ы) | Университет Саймона Фрейзер |
---|---|
Веб -сайт | связь |
Таверна - это программный набор для РНК / ДНК вторичной структуры. Он разработан в лабораториях для вычислительной биологии Школы компьютерных наук в Университете Саймона Фрейзер . Набор состоит из Alterna, для сгибающих вычислений плотности РНК, международной, для прогнозирования взаимодействия РНК-РНК, PIRNA , для прогнозирования функции совместного разделения, концентрации равновесия, энергии ансамбля и температуры плавления для двух последовательностей РНК, [ 1 ] Pruna, на взаимодействия РНК поисковая система основе последовательностей , и Smyrna, независимая от программы C, новая программа A ab initio ncrna finder.
Таверна не связана с системой рабочих процессов биоинформатики Apache Taverna .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Chitsaz, H.; и др. (2009). «Алгоритм функции разделения для взаимодействующих цепей нуклеиновых кислот» . Биоинформатика . 25. 25 (12): 365–373. doi : 10.1093/bioinformatics/btp212 . PMC 2687966 . PMID 19478011 .