QIAGEN Кремниевая долина
 | В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
| Промышленность | Программное обеспечение |
|---|---|
| Основан | 2003 |
| Штаб-квартира | Редвуд-Сити, Калифорния |
| Веб-сайт | www |
QIAGEN Silicon Valley (ранее Ingenuity Systems ) — компания, базирующаяся в Редвуд-Сити, Калифорния , США, которая разрабатывает программное обеспечение для анализа сложных биологических систем. Первый продукт QIAGEN Кремниевой долины, IPA, был представлен в 2003 году и используется, чтобы помочь исследователям анализировать данные омики и моделировать биологические системы. Программное обеспечение упоминается в тысячах научных публикаций по молекулярной биологии и является одним из нескольких инструментов для исследователей системной биологии и биоинформатиков, занимающихся открытием лекарств и институциональными исследованиями.
Технология
[ редактировать ]Во всех продуктах QIAGEN Silicon Valley используется база знаний Ingenuity, которая содержит биологические и химические взаимодействия, а также функциональные аннотации, созданные на основе миллионов индивидуально смоделированных взаимосвязей между белками, генами, комплексами, клетками, тканями, лекарствами и заболеваниями. [ нужна ссылка ] Каждое соотношение основано на экспериментальных фактах, полученных из первичных литературных источников, включая рецензируемые журнальные статьи. [ нужна ссылка ] и учебники [ нужна ссылка ] . Процесс получения и извлечения знаний защищен многочисленными патентами США. [ 1 ]
Продукты и услуги
[ редактировать ]IPA используется в медико-биологическом сообществе и упоминается в тысячах рецензируемых журнальных статей. [ 2 ] IPA можно использовать с данными или без них. IPA помогает исследователям анализировать данные, полученные в результате экспрессии и микрочипов SNP , протеомных экспериментов и мелкомасштабных экспериментов, в результате которых генерируются списки генов, чтобы получить представление о молекулярных и химических взаимодействиях, клеточных фенотипах и болезненных процессах внутри системы. IPA также позволяет исследователям искать информацию о генах, белках, химических веществах, лекарствах и реагентах . Полученную информацию можно использовать для построения биологических моделей, разработки экспериментов или ускорения работы в той или иной области исследований. [ 3 ]
Ingenuity предлагает инструменты поиска и визуализации для веб-сайтов электронной коммерции, связанных с наукой. Ingenuity имеет два выдающихся партнерства: Sigma-Aldrich использует технологию Ingenuity в своем приложении «Ваш любимый ген» , а BD Biosciences использует технологию Ingenuity в своем BD Cell Pathways. [ 4 ] приложение.
Хронология
[ редактировать ]2003 — Ingenuity впервые предлагает базу знаний Ingenuity. [ 5 ]
2004 г. - Стэнфордский университет лицензирует IPA. [ 6 ]
2004 г. - Независимый анализ выявил значительную рентабельность инвестиций фармацевтических компаний, использующих IPA. [ 7 ]
2005 г. – Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США принимает IPA для рассмотрения заявок по фармакогеномике. [ 8 ]
2006 г. — Ingenuity вступает в партнерские отношения с Asuragen, Spotfire, Agilent, Genedata и Inforsense. [ 9 ]
2007 — Ingenuity представляет токсикологии и биомаркеров в IPA 5.0. возможности [ 10 ]
2007 — IPA 5.0 выигрывает Best in Show — лучший новый продукт на выставке Bio-IT World [ 11 ]
2007 г. — Ingenuity и FDA заключают трехлетнее сотрудничество с целью усовершенствования процесса проверки со стороны регулирующих органов. [ 12 ]
2008 — Новейшая функция IPA, Path Designer, признана лучшим новым продуктом на выставке молекулярной медицины. [ 13 ]
2009 — Сигма Олдрич запускает «Ваш любимый ген» — Powered by Ingenuity [ 14 ]
2009 г. — BD Biosciences запускает BD Cell Pathways на базе Ingenuity. [ 15 ]
2011 — Ingenuity объявляет о раннем доступе к Ingenuity iReport. [ 16 ]
2012 — Ingenuity объявляет о коммерческой доступности Ingenuity iReport и Ingenuity Variant Analysis. [ 17 ] [ 18 ]
2013 — Ingenuity объявляет о сотрудничестве с Laboratory Corporation и Quest Diagnostics для разработки решения для оценки генетических вариаций для данных секвенирования следующего поколения (NGS) и приобретается QIAGEN в мае того же года.
См. также
[ редактировать ]- Системная биология
- Биоинформатика
- Вычислительная геномика
- Вычислительная биология
- Микроматричный анализ
- ДНК-микрочип
- Анализ пути
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Патент США: 7943742» . Патентное ведомство США . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Библиография» (PDF) . Системы изобретательности . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Программное обеспечение Ingenuity IPA — анализ путей, микроРНК, NGS, секвенирование РНК, микрочипы, экспрессия генов, биомаркеры» . Системы изобретательности . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ Пути клеток BD
- ^ «Ingenuity Systems объявляет о немедленной доступности базы знаний Ingenuity Pathways» (пресс-релиз). Системы изобретательности. 27 мая 2003 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Стэнфордский университет лицензирует IPA, сотрудничает в области системной биологии» (пресс-релиз). Системы изобретательности. 3 ноября 2003 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Окупаемость инвестиций в анализ путей изобретательности в фармацевтической цепочке создания стоимости», Циммерман, Рив и Голден, Life Science Insights, компания IDC, июль 2004 г.
- ^ «Управление по контролю за продуктами и лекарствами США будет использовать IPA при проверке заявок на фармакогеномику» (пресс-релиз). Системы изобретательности. 21 июня 2005 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Архив пресс-релизов» . Системы изобретательности . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Ingenuity Systems выпускает программное обеспечение IPA™ 5.0, предлагающее новые возможности биомаркеров и молекулярной токсикологии» (PDF) (пресс-релиз). Системы изобретательности. 17 апреля 2007 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Лучшее на выставке: программное обеспечение и информатика для биологических наук» . Мир БиоИТ . 13 июня 2007 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Ingenuity Systems и FDA заключают трехлетнее сотрудничество на сумму 6 миллионов долларов США для улучшения процесса проверки нормативных требований» (пресс-релиз). Системы изобретательности. 27 ноября 2007 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Названы победители премии Best of Show на Пятнадцатой Международной трехконференции по молекулярной медицине» (пресс-релиз). Кембриджский институт медицинских технологий. 3 апреля 2008 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Sigma-Aldrich запускает ваш любимый ген, основанный на изобретательности, Sigma-Aldrich Co» (пресс-релиз). Sigma-Aldrich Co., Inc., 27 января 2009 г. Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Технология Ingenuity позволяет использовать инструмент BD Cell Pathways на новом веб-сайте BD Biosciences» (пресс-релиз). Системы изобретательности. 10 августа 2009 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Ingenuity Systems представляет ранний доступ к революционному новому iReport» (пресс-релиз). Системы изобретательности. 29 сентября 2011 года. Архивировано из оригинала 5 марта 2016 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Новые продукты: массив бета-лактамов от Randox Laboratories; iReport от Ingenuity Systems» . Новости БиоАррэя . ГеномВеб. 24 января 2012 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
- ^ «Ingenuity готовит новый инструмент анализа вариантов NGS и подписывает контракт с группой трансляционной онкологии в качестве бета-тестера» . БиоИнформ . ГеномВеб. 13 января 2012 года . Проверено 7 апреля 2012 г.
