Вирусный нуклеопротеин динофлагеллят

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Вирусный нуклеопротеин динофлагеллят
Вирусный нуклеопротеин динофлагеллят
Идентификаторы
Символ	DUF5756
Пфам	PF19060
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Динофлагелляты/вирусные нуклеопротеины (DVNP) представляют собой семейство положительно заряженных ДНК-связывающих нуклеопротеинов , обнаруженных исключительно у динофлагеллят и нуклеоцитовирикоты . Он служит для уплотнения ДНК в этих организмах. ^{[ 1 ]}

Известно, что белки упаковывают ДНК более плотно, чем гистоны. При экспрессии у эукариот, обладающих гистонами, они вытесняют нуклеосомы и нарушают трансляцию. Считается, что это действие является одной из движущих сил, побуждающих динофлагеллят переключиться на этот белок вместо гистона для упаковки. ^{[ 2 ]} Некоторые динофлагелляты в дальнейшем переключились на гистоноподобные белки (HLP) динофлагеллят для упаковки. ^{[ 3 ]}

Варианты DVNP у динофлагеллят имеют переменный N-концевой хвост с сигналом ядерной локализации . Он также имеет множество сайтов фосфорилирования , что не наблюдается у вирусных аналогов. Фиксированный С-концевой домен может иметь складку спираль-поворот-спираль. ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Ху II, Уоллер (март 2019 г.). «Неортодоксальная хромосомная организация динофлагеллят» . Доступ к микробиологии . 1 (1А). дои : 10.1099/acmi.ac2019.po0119 .
^ Ирвин Н.А., Мартин Б.Дж., Янг Б.П., Браун М.Дж., Флаус А., Лоуэн С.Дж. и др. (апрель 2018 г.). «Вирусные белки как потенциальный фактор истощения гистонов у динофлагеллят» . Природные коммуникации . 9 (1): 1535. doi : 10.1038/s41467-018-03993-4 . ПМК 5906630 . ПМИД 29670105 .
^ Риаз С., Суй З., Нияз З., Хан С., Лю Ю., Лю Х. (декабрь 2018 г.). «Отличительные ядерные особенности динофлагеллят с особым акцентом на гистоны и гистонзамещающие белки» . Микроорганизмы . 6 (4): 128. doi : 10.3390/microorganisms6040128 . ПМК 6313786 . ПМИД 30558155 .
^ Горник С.Г., Форд К.Л., Малхерн Т.Д., Бачич А., Макфадден Г.И., Уоллер Р.Ф. (декабрь 2012 г.). «Потеря конденсации нуклеосомной ДНК совпадает с появлением нового ядерного белка у динофлагеллят» . Современная биология . 22 (24): 2303–12. дои : 10.1016/j.cub.2012.10.036 . ПМИД 23159597 .

[1] Ху II, Уоллер (март 2019 г.). «Неортодоксальная хромосомная организация динофлагеллят» . Доступ к микробиологии . 1 (1А). дои : 10.1099/acmi.ac2019.po0119 .

[2] Ирвин Н.А., Мартин Б.Дж., Янг Б.П., Браун М.Дж., Флаус А., Лоуэн С.Дж. и др. (апрель 2018 г.). «Вирусные белки как потенциальный фактор истощения гистонов у динофлагеллят» . Природные коммуникации . 9 (1): 1535. doi : 10.1038/s41467-018-03993-4 . ПМК 5906630 . ПМИД 29670105 .

[3] Риаз С., Суй З., Нияз З., Хан С., Лю Ю., Лю Х. (декабрь 2018 г.). «Отличительные ядерные особенности динофлагеллят с особым акцентом на гистоны и гистонзамещающие белки» . Микроорганизмы . 6 (4): 128. doi : 10.3390/microorganisms6040128 . ПМК 6313786 . ПМИД 30558155 .

[4] Горник С.Г., Форд К.Л., Малхерн Т.Д., Бачич А., Макфадден Г.И., Уоллер Р.Ф. (декабрь 2012 г.). «Потеря конденсации нуклеосомной ДНК совпадает с появлением нового ядерного белка у динофлагеллят» . Современная биология . 22 (24): 2303–12. дои : 10.1016/j.cub.2012.10.036 . ПМИД 23159597 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]