База данных горчицы
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | Содержит детерминанты AR и курируемые гены AR, идентифицированные с помощью метагеномики. |
| Типы данных захвачен | Гены устойчивости к противомикробным препаратам и детерминанты AR |
| Организмы | Бактерии |
| Контакт | |
| Первичное цитирование | ПМИД 30478291 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | мгпс |
| URL-адрес загрузки | Скачать |
| Разнообразный | |
| Добавить в закладки сущности | да |
Mustard — это база данных, в которой отслеживаются детерминанты устойчивости к противомикробным препаратам (ARD) . Метод, с помощью которого он отслеживает ARD, использует их собственный метод, адаптированный из моделирования гомологии белков, называемый парным сравнительным моделированием (PCM), который повышает специфичность прогнозирования белков, особенно для отдаленно родственных белковых гомологов. [ 1 ] Используя PCM, 6095 ОРЗ из 20 семейств микробиоты кишечника человека. Использовались базы данных по устойчивости к антибиотикам : ResFinder , [ 2 ] АРГ- АННОТ [ 3 ] ныне несуществующая клиника Лэхи, [ 4 ] Веб-сайт Мэрилин Робертс, посвященный генам устойчивости к тетрациклину и макролидам [ 5 ] и метагеномика. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Эрлих, С. Душко; Кеннеди, Шон П.; Доре, Жоэль; Хаймет, Флоренция; Вайсзер, Кевин; Левенес, Флоренция; Летур, Алин; Лежар, Вероника; Леонар, Пьер (январь 2019 г.). «Прогнозирование кишечного резистома методом трехмерной структуры» (PDF) . Природная микробиология . 4 (1): 112–123. дои : 10.1038/s41564-018-0292-6 . ISSN 2058-5276 . ПМИД 30478291 . S2CID 53757858 .
- ^ Занкари, Э.; Хасман, Х.; Косентино, С.; Вестергаард, М.; Расмуссен, С.; Лунд, О.; Аареструп, FM; Ларсен, М.В. (10 июля 2012 г.). «Идентификация генов приобретенной устойчивости к противомикробным препаратам» . Журнал антимикробной химиотерапии . 67 (11): 2640–2644. дои : 10.1093/jac/dks261 . ISSN 0305-7453 . ПМК 3468078 . ПМИД 22782487 .
- ^ Гупта, Сушим Кумар; Падманабхан, Бабу Рошан; Дьене, Сейдина М.; Лопес-Рохас, Рафаэль; Кемпф, Мари; Ландро, Люси; Ролен, Жан-Марк (21 октября 2013 г.). «ARG-ANNOT, новый биоинформационный инструмент для обнаружения генов устойчивости к антибиотикам в бактериальных геномах» . Антимикробные средства и химиотерапия . 58 (1): 212–220. дои : 10.1128/aac.01310-13 . ISSN 0066-4804 . ПМК 3910750 . ПМИД 24145532 .
- ^ «РЕД-ДБ» . Проверено 27 июля 2019 г.
- ^ «Сайт Мэрилин Робертс» .
- ^ Аллен, Хизер К.; Мо, Люк А; Родбумрер, Джицупанг; Гардер, Андхра; Хэндлсман, Джо (9 октября 2008 г.). «Функциональная метагеномика выявила разнообразные β-лактамазы в отдаленной почве Аляски» . Журнал ISME . 3 (2): 243–251. дои : 10.1038/ismj.2008.86 . ISSN 1751-7362 . ПМИД 18843302 . S2CID 16496336 .
- ^ Мур, Эме М.; Патель, Санкет; Форсберг, Кевин Дж.; Ван, Бин; Бентли, Гейл; Разия, Ясмин; Цинь, Сюань; Тарр, Филипп И.; Дантас, Гаутам (13 ноября 2013 г.). «Детская фекальная микробиота несет в себе разнообразные и новые гены устойчивости к антибиотикам» . ПЛОС ОДИН . 8 (11): е78822. Бибкод : 2013PLoSO...878822M . дои : 10.1371/journal.pone.0078822 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 3827270 . ПМИД 24236055 .
- ^ Соммер, МОА; Дантас, Г.; Черч, генеральный директор (27 августа 2009 г.). «Функциональная характеристика резервуара устойчивости к антибиотикам микрофлоры человека» . Наука . 325 (5944): 1128–1131. Бибкод : 2009Sci...325.1128S . дои : 10.1126/science.1176950 . ISSN 0036-8075 . ПМЦ 4720503 . ПМИД 19713526 .
 | Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |