Валлемия ихтиофага
| Валлемия ихтиофага | |
|---|---|
 | |
| Микрофотография, демонстрирующая характерную сарциноподобную морфологию W. ichthyophaga и кристаллы NaCl. | |
| Научная классификация | |
| Королевство: | |
| Разделение: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | В. ихтиофага |
| Биномиальное имя | |
| Валлемия ихтиофага Йохан Олсен 1887 г. | |
Wallemia ichthyophaga — один из трёх видов грибов рода Wallemia , который, в свою очередь, является единственным родом класса Wallemiomycetes . [1] Филогенетическое происхождение линии было отнесено к различным частям Basidiomycota (возрастом 495 миллионов лет) , но согласно анализу более крупных наборов данных это сестринская группа Agaricomycotina . [2] [3] Хотя первоначально считалось, что этот вид бесполый , популяционная геномика обнаружила доказательства рекомбинации между штаммами, а локус типа спаривания был идентифицирован во всех секвенированных геномах этого вида. [3] [4]
лишь ограниченное число штаммов W. ichthyophaga К настоящему времени выделено (из гиперсоленой воды солнечных соляных заводов , выпи (богатых магнием остаточных растворов при производстве соли из морской воды) и соленого мяса). [1]
W. ichthyophaga требует как минимум 1,5 М NaCl для роста in vitro (или какого-либо другого осмолита для эквивалентной водной активности ), и он процветает даже в насыщенном растворе NaCl. Это делает его наиболее галофильным из известных грибов и отличает его от галотолерантных (например, Aureobasidium pullulans ) и чрезвычайно галотолерантных грибов (например, Hortaea werneckii ), которые способны хорошо расти даже при отсутствии соли в среде. [5] Неспособность расти без соли является исключением в царстве грибов, но часто встречается у галофильных архей . [6]
Гриб растет в виде сарциноподобных структур или компактных многоклеточных комков. [1] Под воздействием высокой солености они увеличиваются в размерах почти в четыре раза, а клеточная стенка утолщается в три раза. Это приводит к существенному уменьшению функционального объема клеток и считается одним из механизмов галотолерантности этого вида. [7]
Полногеномное секвенирование W. ichthyophaga показало, что он имеет один из самых маленьких из всех секвенированных геномов базидиомицетов (9,6 МБП, всего 4884 предсказанных белка). [3] В отличие от того, что наблюдалось у чрезвычайно галотолерантного H. werneckii , у W. ichthyophaga почти нет экспансии генов переносчиков катионов металлов, и их экспрессия не зависит от соли. С другой стороны, наблюдается огромное обогащение гидрофобинами (белками клеточной стенки с разнообразными функциями и множеством биотехнологических применений), которые содержат необычно высокую долю кислых аминокислот. [3] Считается, что высокая доля кислых аминокислот является адаптацией белков к высоким концентрациям соли. [8] После секвенирования геномов практически всех известных штаммов W. ichthyophaga популяционный геномный анализ показал, что вид образует единую рекомбинирующую популяцию. [4]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Залар, П.; Сибрен Де Хоог, Г.; Шроерс, Х.Дж.; Фрэнк, Дж. М.; Гунде-Цимерман, Н. (2005). «Таксономия и филогения ксерофильного рода Wallemia (Wallemiomycetes и Wallemiales, cl. Et ord. Nov.)». Антоний Левенгук . 87 (4): 311–328. дои : 10.1007/s10482-004-6783-x . ПМИД 15928984 . S2CID 4821447 .
- ^ Падамси, М.; Кумар, ТКА; Райли, Р.; Биндер, М.; Бойд, А.; Кальво, AM; Фурукава, К.; Гессен, К.; Хоманн, С.; Джеймс, Тайвань; Лабутти, К.; Лапидус, А.; Линдквист, Э.; Лукас, С.; Миллер, К.; Шантаппа, С.; Григорьев, ИВ; Хиббетт, Д.С.; Маклафлин, диджей; Спатафора, JW; Эм, MC (2012). «Геном ксеротолерантной плесени Wallemia sebi демонстрирует адаптацию к осмотическому стрессу и предполагает скрытое половое размножение» (PDF) . Грибковая генетика и биология . 49 (3): 217–226. дои : 10.1016/j.fgb.2012.01.007 . ПМИД 22326418 .
- ^ Jump up to: а б с д Зайц, Дж.; Лю, Ю.; Дай, В.; Ян, З.; Ху, Дж.; Гостин Ар, К.; Гунде-Цимерман, Н. (2013). «Секвенирование генома и транскриптома галофильного гриба Wallemia ichthyophaga: галоадаптации присутствуют и отсутствуют» . БМК Геномика . 14 :617. дои : 10.1186/1471-2164-14-617 . ПМЦ 3849046 . ПМИД 24034603 .
- ^ Jump up to: а б Гостинчар, Сене; Сунь, Сяохуань; Зайц, Янья; Фанг, Чао; Хоу, Юн; Ло, Юнлун; Гунде-Цимерман, Нина; Песня, Цевэй (2019). «Популяционная геномика облигатно галофильного базидиомицета Wallemia ichthyophaga» . Границы микробиологии . 10 : 2019. doi : 10.3389/fmicb.2019.02019 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 6738226 . ПМИД 31551960 .
- ^ Гостинчар, К.; Ленасси, М.; Гунде-Цимерман, Н.; Племениташ, А. (2011). Адаптация грибов к чрезвычайно высоким концентрациям солей . Достижения прикладной микробиологии. Том. 77. С. 71–96. дои : 10.1016/B978-0-12-387044-5.00003-0 . ISBN 9780123870445 . ПМИД 22050822 .
- ^ Гостинчар, К.; Грубе, М.; Де Хоог, С.; Залар, П.; Гунде-Цимерман, Н. (2010). «Экстремотолерантность грибов: эволюция на грани» . ФЭМС Микробиология Экология . 71 (1): 2–11. Бибкод : 2010FEMME..71....2G . дои : 10.1111/j.1574-6941.2009.00794.x . ПМИД 19878320 .
- ^ Краль Кунчич, М.; Когей, Т.; Дробне, Д.; Гунде-Цимерман, Н. (2009). «Морфологический ответ галофильных грибов рода Wallemia на высокую соленость» . Прикладная и экологическая микробиология . 76 (1): 329–337. дои : 10.1128/АЕМ.02318-09 . ПМЦ 2798636 . ПМИД 19897760 .
- ^ Мадерн, Д.; Эбель, К.; Заккаи, Г. (2000). «Галофильная адаптация ферментов». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях . 4 (2): 91–98. дои : 10.1007/s007920050142 . ПМИД 10805563 . S2CID 32590023 .