Эмма Шимански

Эмма Шимански (урожденная Эмма Крэйвен ) — химик, известный своей работой по выявлению неизвестных органических соединений, особенно загрязняющих веществ, и сторонница открытой науки.
Образование и карьера
[ редактировать ]Шимански получил степень бакалавра наук. Степень бакалавра химии и степень бакалавра инженерии окружающей среды Университета Западной Австралии в 2003 году. [1] Во время работы в Университете Западной Австралии Шимански объединил химию и экологическую инженерию для изучения загрязненных территорий, требующих оценки и восстановления. [1] Будучи студенткой, она участвовала в конференции лауреатов Нобелевской премии 2002 года , которая объединяет лауреатов Нобелевской премии и молодых ученых; Шимански и Пиа Саппл были первыми студентами Университета Западной Австралии, получившими это приглашение, и, возможно, первыми австралийцами. [2]
После колледжа Шимански проработал три года в компании Golder Associates в Перте в качестве инженера-эколога. [3] а затем поступила в Центр экологических исследований имени Гельмгольца в Лейпциге, Германия, где защитила докторскую диссертацию. в 2011 году. [3] Последующая постдокторская должность Шимански находилась в Швейцарском федеральном институте водных наук и технологий (Eawag), включая внутриевропейскую постдокторскую стипендию Марии Кюри. [3] Шимански в настоящее время является доцентом Люксембургского университета , где она возглавляет группу экологической химинформатики. [4]
В 2021 году Шимански дала интервью статье Общества метаболомики в MetaboNews, и во время интервью она описывает свое введение в область метаболомики , текущие сильные стороны этой области и потенциальные будущие применения исследований метаболомики. [5]
Исследовать
[ редактировать ]Первые исследовательские публикации Шимански были связаны с ее студенческой работой, когда она работала над разработкой новых металлосодержащих полимеров, в результате чего появились три публикации ведущих авторов. [6] [7] [8]
Будучи аспирантом, Шимански начал использовать информацию о характере фрагментации органических соединений как средство расширения идентификации неизвестных соединений. [9] Шимански применил эти новые методы для идентификации неизвестных органических соединений, обнаруженных в сточных водах. [10] и использовали данные, коллективно собранные Ассоциацией НОРМАН, для определения препятствий на пути идентификации неизвестных органических соединений в воде. [11] Идентификация и отслеживание неизвестных органических соединений продолжает оставаться направлением исследований Шиманского. [12] и она является соавтором учебника 2014 года, описывающего эти методы. [13]
В 2012 году Шимански и Штеффен Нойман начали конкурс «Критическая оценка идентификации малых молекул» (CASMI), который предоставил исследователям информацию о неизвестных органических соединениях и предложил им использовать автоматизированные вычислительные инструменты для идентификации неизвестных соединений. [14] [15] Общество метаболомики рассказало о конкурсе 2012 года в своем информационном бюллетене. [16] Конкурс проводился несколько раз, и Шимански изучил результаты конкурса 2016 года. [17]
Исследования Шимански сосредоточены на характеристике органических соединений, содержащихся в сточных водах. [10] [18] и экспосомика, или наука о соединениях, воздействию которых люди подвергаются в течение своей жизни. [19] Шимански разработал подмножество PubChem для экспосомики, PubChemLite, к которому можно добавлять аннотации, чтобы повысить способность исследователей идентифицировать неизвестные соединения окружающей среды. [20] В этой области Шимански работает над автоматизацией идентификации группы фторированных соединений, называемых « пер- и полифторалкильные вещества » (PFAS), чтобы расширить возможности исследователей находить неизвестные PFAS в окружающей среде. [21]
Шимански — сторонник открытой науки и обмена данными. В рамках сети NORMAN, совместной деятельности в Европе, Северной Америке и Азии, Шимански работал в 2011 году с командой, основавшей NORMAN MassBank, [22] [23] это был проект сообщества по сбору информации о малых молекулах. В 2015 году Шимански расширил этот тип данных с помощью обмена списками подозреваемых NORMAN. [24] Шимански также работал над разработкой вычислительных инструментов, которые позволяют обрабатывать сложные данные масс-спектрометрии высокого разрешения. [25] и стремились установить стандарты для учета качества данных масс-спектрометрии. [26] Публикация Шимански в журнале Environmental Science & Technology за 2014 г. [27] устанавливает средства для оценки уверенности в качестве идентификации неизвестных органических соединений и по состоянию на 2021 год имеет более 1000 цитирований. В 2018 году Шимански сочла эту статью своим величайшим достижением, поскольку она установила стандарт идентификации соединений в метаболомике и стимулировала обсуждение в сообществе будущего этих инструментов. [28]
Известные публикации
[ редактировать ]- Шимански, Эмма Л.; Чон, Чуно; Гульде, Ребекка; Феннер, Кэтрин; Рафф, Матиас; Певец, Хайнц П.; Холлендер, Джулиана (18 февраля 2014 г.). «Идентификация малых молекул с помощью масс-спектрометрии высокого разрешения: уверенность в себе» . Экологические науки и технологии . 48 (4): 2097–2098. Бибкод : 2014EnST...48.2097S . дои : 10.1021/es5002105 . ISSN 0013-936X . ПМИД 24476540 .
- Шимански, Эмма Л.; Певец, Хайнц П.; Слободник, Ярослав; Иполий, Ильдико М.; Освальд, Питер; Краусс, Мартин; Шульце, Тобиас; Хаглунд, Питер; Летцель, Томас; Гросс, Сильвия; Томаидис, Николаос С. (1 августа 2015 г.). «Нецелевой скрининг с помощью масс-спектрометрии высокого разрешения: критический обзор с использованием совместного исследования по анализу воды» . Аналитическая и биоаналитическая химия . 407 (21): 6237–6255. дои : 10.1007/s00216-015-8681-7 . hdl : 10234/147867 . ISSN 1618-2650 . ПМИД 25976391 . S2CID 29696368 .
Награды
[ редактировать ]- Королевское общество Западной Австралии, Университетская медаль выдающемуся студенту в области естественных наук и наук о Земле (2003 г.) [29]
- Общество экологической токсикологии и химии, лучшая презентация студента (2008 г.) [30]
- Стипендия FNR ATTRACT [31] за разработку новых методов идентификации неизвестных химических веществ (2018 г.) [32] [33]
- Ученый-аналитик, список 40 лучших людей до 40 лет (2018) [28]
Личная жизнь
[ редактировать ]Шимански замужем за Стэном Шимански, экогидрологом. [34] и он поделился мыслями о парах с двойной карьерой и их пути к должностям в Люксембурге. [35] Они первая пара, занимающаяся двойной карьерой, которая оба получили награду FNR ATTRACT. [32]
Публикации
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б «Жизнь и наука Физическая карьера» (PDF) . Университет Западной Австралии .
- ^ «Двое из наших лучших присоединяются к лучшим в мире» (PDF) . UWAnews . Том. 21, нет. 10. 29 июля 2002 г.
- ^ Перейти обратно: а б с «Что находится в нашей воде? Идентификация «известных» и «неизвестных» органических загрязнений – EPFL» . memento.epfl.ch . Проверено 21 мая 2021 г.
- ^ Люксембург, Университет дю. «Эмма Шимански» . Университет Люксембурга . Проверено 21 мая 2021 г.
- ^ «Интервью Metabo | Доктор Эмма Шимански» (PDF) . МетабоНьюс . Том. 11, нет. 3. Март 2021 г.
- ^ Крейвен, Эмма; Абу Шанди, Халид; Джаниак, Кристоф (2003). «Корреляция между раствором и твердым состоянием: состав, зависящий от pH, в тройной системе [Co(H2O)6]2+ или [Ni(H2O)6]2+/пиперазин/фосфат» . Журнал неорганической и общей химии . 629 (2): 195–201. дои : 10.1002/zaac.200390031 . ISSN 1521-3749 .
- ^ Крейвен, Эмма; Чжан, Кунген; Джаниак, Кристоф; Рейнвальд, Герд; Ланг, Генрих (2003). «Синтез, структура и химия растворов (5,5'-диметил-2,2'-бипиридина)(IDA)меди(II) и структурное сравнение с Aqua(IDA)(1,10-фенантролин)медью(II) ( IDA = иминодиацетато)» . Журнал неорганической и общей химии (на немецком языке). 629 (1213): 2282–2290. дои : 10.1002/zaac.200300223 . ISSN 0044-2313 .
- ^ Крейвен, Эмма; Мутлу, Эсра; Лундберг, Дэниел; Темиздемир, Саваш; Дэкерт, Себастьян; Бромбахер, Хорст; Джаниак, Кристоф (2002). «Комплексы таллия (I) с модифицированными поли(пиразолил)боратными лигандами - координация металл-лиганд и кристаллическая упаковка» . Многогранник . 21 (5–6): 553–562. дои : 10.1016/S0277-5387(01)01026-9 .
- ^ Шимански, Е.Л.; Мейнерт, К.; Мерингер, М.; Брэк, В. (19 мая 2008 г.). «Использование классификаторов MS и генерации структур для помощи в идентификации неизвестных в анализе, ориентированном на эффект» . Аналитика Химика Акта . 615 (2): 136–147. Бибкод : 2008AcAC..615..136S . дои : 10.1016/j.aca.2008.03.060 . ISSN 0003-2670 . ПМИД 18442519 .
- ^ Перейти обратно: а б Шимански, Эмма Л.; Певец, Хайнц П.; Лонгри, Филипп; Лоос, Мартин; Рафф, Матиас; Стравс, Майкл А.; Рипольес Видаль, Кристина; Холлендер, Джулиана (4 февраля 2014 г.). «Стратегии характеристики полярных органических загрязнений в сточных водах: изучение возможностей масс-спектрометрии высокого разрешения» . Экологические науки и технологии . 48 (3): 1811–1818. Бибкод : 2014EnST...48.1811S . дои : 10.1021/es4044374 . ISSN 0013-936X . ПМИД 24417318 .
- ^ Шимански, Эмма Л.; Певец, Хайнц П.; Слободник, Ярослав; Иполий, Ильдико М.; Освальд, Питер; Краусс, Мартин; Шульце, Тобиас; Хаглунд, Питер; Летцель, Томас; Гросс, Сильвия; Томаидис, Николаос С. (1 августа 2015 г.). «Нецелевой скрининг с помощью масс-спектрометрии высокого разрешения: критический обзор с использованием совместного исследования по анализу воды» . Аналитическая и биоаналитическая химия . 407 (21): 6237–6255. дои : 10.1007/s00216-015-8681-7 . hdl : 10234/147867 . ISSN 1618-2650 . ПМИД 25976391 . S2CID 29696368 .
- ^ Эшер, Беате И.; Стэплтон, Хизер М.; Шимански, Эмма Л. (24 января 2020 г.). «Отслеживание сложных смесей химических веществ в нашей меняющейся окружающей среде» . Наука . 367 (6476): 388–392. Бибкод : 2020Sci...367..388E . дои : 10.1126/science.aay6636 . ISSN 0036-8075 . ПМК 7153918 . ПМИД 31974244 .
- ^ Кербер, Адальберт (2014). Математическая химия и хемоинформатика: генерация структуры, объяснение и количественные связи структура-свойство . Райнхард Лауэ, Маркус Мерингер, Кристоф Рюкер, Эмма Шимански. Берлин. ISBN 978-3-11-025407-5 . ОСЛК 865012006 .
{{cite book}}
: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка ) - ^ Шимански, Эмма; Нойманн, Штеффен (25 июня 2013 г.). «Критическая оценка идентификации малых молекул (CASMI): проблемы и решения» . Метаболиты . 3 (3): 517–538. дои : 10.3390/metabo3030517 . ISSN 2218-1989 . ПМК 3901296 . ПМИД 24958137 .
- ^ Шимански, Эмма; Нойманн, Штеффен (24 мая 2013 г.). «КАСМИ: И победителем становится...» . Метаболиты . 3 (2): 412–439. дои : 10.3390/metabo3020412 . ISSN 2218-1989 . ПМК 3901266 . ПМИД 24957999 .
- ^ Форсайт, Ян (октябрь 2012 г.). «Критическая оценка идентификации малых молекул: новая серия конкурсов» . www.metabonews.ca . Проверено 23 мая 2021 г.
- ^ Шимански, Эмма Л.; Ратткис, Кристоф; Краусс, Мартин; Бруар, Селин; Добрый, Тобиас; Дюркоп, Кай; Аллен, Фелисити; Вания, Арпана; Вердегем, Дрис; Бёккер, Себастьян; Роусу, Юхо (2017). «Критическая оценка идентификации малых молекул 2016: автоматизированные методы» . Журнал хеминформатики . 9 (1): 22. дои : 10.1186/s13321-017-0207-1 . ISSN 1758-2946 . ПМК 5368104 . ПМИД 29086042 .
- ^ Гаго-Ферреро, Пабло; Шимански, Эмма Л.; Блетсу, Анна А.; Аализаде, Реза; Холлендер, Джулиана; Томаидис, Николаос С. (20 октября 2015 г.). «Расширенные подозрительные и нецелевые стратегии для характеристики новых полярных органических загрязнителей в неочищенных сточных водах с помощью ЖХ-МСВР/МС» . Экологические науки и технологии . 49 (20): 12333–12341. Бибкод : 2015EnST...4912333G . дои : 10.1021/acs.est.5b03454 . hdl : 10795/3064 . ISSN 0013-936X . ПМИД 26418421 .
- ^ Вермюлен, Роэль; Шимански, Эмма Л.; Барабаши, Альберт-Ласло; Миллер, Гэри В. (24 января 2020 г.). «Разоблачение и здоровье: где химия встречается с биологией» . Наука . 367 (6476): 392–396. Бибкод : 2020Sci...367..392В . дои : 10.1126/science.aay3164 . ISSN 0036-8075 . ПМЦ 7227413 . ПМИД 31974245 .
- ^ Шимански, Эмма Л.; Кондич, Тодор; Нойманн, Штеффен; Тиссен, Пол А.; Чжан, Цзянь; Болтон, Эван Э. (8 марта 2021 г.). «Расширение возможностей больших баз химических знаний для экспозомики: PubChemLite и MetFrag» . Журнал хеминформатики . 13 (1): 19. дои : 10.1186/s13321-021-00489-0 . ISSN 1758-2946 . ПМЦ 7938590 . ПМИД 33685519 .
- ^ Лим, Сяочжи (6 февраля 2019 г.). «Загрязненная вода: ученые отслеживают тысячи фторированных химикатов в нашей окружающей среде» . Природа . 566 (7742): 26–29. Бибкод : 2019Natur.566...26L . дои : 10.1038/d41586-019-00441-1 . ПМИД 30728524 . S2CID 59615914 .
- ^ Шульце, Тобиас; Шимански, Эмма; Стравс, Майкл; Нойманн, Штеффен; Краусс, Мартин; Певец, Хайнц; Обнимаю, Кристина; Галлампуа, Кристина; Холлендер, Джулиана; Слободник, Ярослав; Брэк, Вернер (апрель 2011 г.), NORMAN MassBank: На пути к управляемой сообществом точной масс-спектральной базе данных с открытым доступом для идентификации новых загрязнителей (PDF) , NORMAN Network Bulletin, стр. 9–10
- ^ «Годовой отчет Совета ETH за 2016 год» . 2016.
- ^ НОРМАН Сеть; Аализаде, Реза; Алигизакис, Никифорос; Шимански, Эмма; Слободник, Ярослав; Фишер, Стеллан; Цирка, Любош (23 февраля 2021 г.), «Проверка подозреваемых» , S0 | СУСДАТ | Объединенный список подозреваемых НОРМАН: SusDat , doi : 10.5281/zenodo.2664077 , получено 22 мая 2021 г.
- ^ Стравс, Майкл А.; Шимански, Эмма Л.; Певец, Хайнц П.; Холлендер, Джулиана (2013). «Автоматическая перекалибровка и обработка тандемных масс-спектров с использованием аннотации формул» . Журнал масс-спектрометрии . 48 (1): 89–99. Бибкод : 2013JMSp...48...89S . дои : 10.1002/jms.3131 . ISSN 1096-9888 . ПМИД 23303751 .
- ^ Оберачер, Герберт; Сасс, Майкл; Антиньяк, Жан-Филипп; Гиттон, Джон; Дебраувер, Лоран; Жамин, Эмильен Л.; Шульце, Тобиас; Краусс, Мартин; Ковачи, Адриан; Кабальеро-Касеро, Ноэлия; Руссо, Кэтлин; Дамонт, Аннелор; Фенай, Франсуа; Ламори, Марья; Шимански, Эмма Л. (2020). «Европейское предложение по контролю качества и обеспечению качества тандемных библиотек масс-спектров» . Науки об окружающей среде Европы . 32 (1): 43. дои : 10.1186/s12302-020-00314-9 . hdl : 10067/1676870151162165141 . ISSN 2190-4707 . S2CID 212691912 .
- ^ Шимански, Эмма Л.; Чон, Чуно; Гульде, Ребекка; Феннер, Кэтрин; Рафф, Матиас; Певец, Хайнц П.; Холлендер, Джулиана (18 февраля 2014 г.). «Идентификация малых молекул с помощью масс-спектрометрии высокого разрешения: уверенность в себе» . Экологические науки и технологии . 48 (4): 2097–2098. Бибкод : 2014EnST...48.2097S . дои : 10.1021/es5002105 . ISSN 0013-936X . ПМИД 24476540 .
- ^ Перейти обратно: а б «Список власти 2018: Эмма Шимански» . Ученый-аналитик . 2018 . Проверено 21 мая 2021 г.
- ^ https://www.rswa.org.au/awards/student%20medalists/Student%20Medallists%201998%20to%202006.pdf .
{{cite web}}
: Отсутствует или пусто|title=
( помощь ) - ^ админ (19 ноября 2019 г.). «Победители премий Европы прошлого» . Награды СЕТАК . Проверено 21 мая 2021 г.
- ^ «Экологическая хеминформатика для идентификации неизвестных химических веществ и их воздействия» . FNR – Национальный исследовательский фонд Люксембурга . 13 декабря 2018 года . Проверено 21 мая 2021 г.
- ^ Перейти обратно: а б Люксембург, Университет дю. «Эмма Шимански получила стипендию FNR ATTRACT» . Университет Люксембурга . Проверено 21 мая 2021 г.
- ^ «Эмма Шимански награждена стипендией FNR ATTRACT» . FNR – Национальный исследовательский фонд Люксембурга . 17 октября 2018 года . Проверено 20 мая 2021 г.
- ^ «ЗНАКОМЬТЕСЬ С ЛИСТОМ: СТЭН Шимански» . АГУ Экогидрологии . Проверено 21 мая 2021 г.
- ^ «Стипендиаты FNR ATTRACT — люди, стоящие за наукой: Стэн Шимански» . FNR – Национальный исследовательский фонд Люксембурга . 22 ноября 2018 года . Проверено 22 мая 2021 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Публикации Эммы Шимански , проиндексированные Google Scholar