Актинобактериальная семья Фага Холин
Семейство актинобактериального фага Holin (APH) ( TC# 1.E.57 ) представляет собой довольно большое семейство белков между 105 и 180 амино ацилами в длину, обычно демонстрирующее один трансмембранной сегмент (TMS) вблизи N-конце. Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству APH, можно найти в базе данных классификации Transporter . [ 1 ]
Одним из белков архетипа в этом семействе является GP5 Holin микобактериофага MS6. Микобактериофаг MS6 представляет собой двухцепочечный бактериофаг ДНК (DSDNA) , который, в дополнение к прогнозируемому эндолизину (LysA) -holin (GP4) системы лизиса, кодирует три дополнительных белка в модуле лизиса: gp1, lysb и gp5. [ 2 ]
MS6 GP4 ( TC# 1.E.18.1.2 ) был ранее описан как Holin-подобный белок класса II. Второй предполагаемый ген Holin ( GP5 ), кодирующий белок (gp5) с предсказанным односторонним TMS, был идентифицирован в конце литического оперона MS6. Ни предполагаемый холин класса II, ни отдельный полипептид TMS не могли запускать лизис в парных комбинациях с лизой эндолизина в Escherichia coli . Тем не менее, дальнейшие исследования показали, что GP4 и GP5 MS6 взаимодействуют друг с другом. Это говорит о том, что при инфекции MS6 правильное и запрограммированное время лизиса достигается комбинированным действием GP4 и GP5. [ 2 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Петровский, Стив; Seviour, Robert J.; Тиллетт, Даниэль (2011). «Характеристика генома поливалентного литического бактериофага GTE2, который потенциал для биоконтроля Gordonia-, Rhodococcus и нокардий, стабилизированных пенами в растениях с активированным осадком» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (12): 3923–3929. Bibcode : 2011apenm..77.3923p . doi : 10.1128/aem.00025-11 . PMC 3131622 . PMID 21498753 .
- Редди, Бхаскара Л.; Saier JR, Milton H. (2013). «Топологический и филогенетический анализ бактериальных семейств Holin и суперсемей » » Biochimica et Biophysica Acta (BB) - Biomemmbranes 1828 (11): 2654–2 Doi : 10.1016/ j.beem.2013.07.0 3788059PMC 23856191PMID
- Saier, Milton H.; Редди, Бхаскара Л. (2015). «Holins в бактериях, эукариотах и археи: многофункциональные ксенологи с потенциальными биотехнологическими и биомедицинскими применениями» . Журнал бактериологии . 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/jb.02046-14 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
- Ван, в; Смит, DL; Янг Р. (2000). «Holins: белковые часы бактериофажных инфекций». Ежегодный обзор микробиологии . 54 : 799–825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . PMID 11018145 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «1.e.57. Семейство актинобактериального фага Хелин (APH)» . TCDB . Получено 2016-03-29 .
- ^ Jump up to: а беременный Каталуао, Мария Жоао; Гил, Филипа; Moniz-Pereira, Хосе; Pimentel, Magdalene (2011-06-01). «Функциональный анализ Holin-подобных белков микобактериофага MS6» . Журнал бактериологии . 193 (11): 2793–2803. Doi : 10.1128/jb.01519-10 . ISSN 1098-5530 . PMC 3133122 . PMID 21441511 .
На момент редактирования в этой статье используется контент из «1.E.57. Актинобактериальное семейство фага Хелин (APH)» , которое лицензировано таким образом, что позволяет повторно использовать в рамках лицензии Creative Commons Attribution-Sharealik 3.0 , но не под GFDL . Все соответствующие условия должны соблюдаться.