Nurcan Tunçbağ

Nurcan Tunçbağ
Nurcan Tunçbağ
Альма -матер	Стамбул технический университет ; Университет Коса
Награды	L'Oréal-Unesco для женщин в науке.
	Научная карьера
Учреждения	Массачусетский технологический институт ; Технический университет на Ближнем Востоке

Nurcan Tunçbağ является профессором химической и биологической инженерии в университете Коса . Она работает над вычислительными моделями сложных биологических систем. Tuntcbağ-это L'Oréal-Unesco 2019 года для женщин в науке международного растущего таланта.

Ранняя жизнь и образование

Тунчбаг изучал химический инженер в техническом университете в Стамбуле . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Она поступила в Университет Коса для обучения в аспирантуре, получив степень магистра в области вычислительной науки и инженерии в 2007 году. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Она оставалась там для своих докторских исследований, изучая белковые взаимодействия и их включение в сети взаимодействия белка. ^{[ 6 ]} Она работала под надзором Эзлема Кескина и Аттилы Гурсоя. В 2010 году Tuntcbağ присоединился к Массачусетскому технологическому институту в качестве постдокторского партнера с Эрнестом Фраенкелем. ^{[ 4 ]}^{[ 7 ]} В 2014 году Танчбаг присоединился к Институту информации о техническом университете Ближнего Востока . ^{[ 1 ]}^{[ 4 ]} Она - ИП Сетевой лаборатории моделирования в Университете Коса. ^{[ 8 ]}

Исследовать

Тунчбаг работает над вычислительными моделями сложных биологических систем. Она была в команде разработчиков алгоритма призмы (белковой взаимодействия путем структурного соответствия), который можно использовать для прогнозирования взаимодействия и сборки белка и белка . ^{[ 9 ]} Призма может использоваться для построения клеточных путей и аннотации протеома . ^{[ 9 ]} Алгоритм можно использовать для идентификации областей связывания «горячей точки», которые можно использовать для нацеливания на лекарства. ^{[ 2 ]}

Регуляторные и сигнальные сети необходимы для сотовой функции, но данные OMIC часто имеют низкое качество. Tuntcbağ продемонстрировал, как эти данные можно проанализировать с использованием приза сбора дерева Steiner , анализируя изменения в сетях во время болезни. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Она может включить фармацевтические и биологические агенты в свой алгоритм, чтобы помочь информировать будущую терапию. ^{[ 12 ]} С Fraenkel Tuntcbağ создал Steinernet, веб -сервер, который позволил интеграции данных OMIC. ^{[ 13 ]} Пользователи предоставляют информацию о белках и генах, которые были обнаружены экспериментально, и сервер ищет соединения в данных, используя серию взаимодействия . ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} Она также была в команде разработчиков программного обеспечения Omics Integrator, которая интегрирует многоэмические данные для реконструкции сигнальных сетей.

Танчбаг надеется определить, как геном изменяется во время болезни. ^{[ 15 ]} Одним из заболеваний, рассматриваемых Tuntcbağ, является глиобластома , особенно злокачественная опухоль головного мозга. Tuntcbağ разработал сетевую модель, которую можно использовать для определения изменений на уровне пути опухоли. ^{[ 16 ]} Она также работала над нейродегенеративными заболеваниями, включая болезнь Паркинсона . ^{[ 17 ]} Она стала доцентом в 2017 году. ^{[ 18 ]}

Награды и награды

2015: Научная академия молодой ученый награда ^{[ 19 ]}
2017: Научная премия Фонда Парлара ^{[ 20 ]}
2017: премия L'Oréal-Unesco для женщин в науке ^{[ 21 ]}
2018: награда Тюба-Гебип ^{[ 22 ]}^{[ 23 ]}
2019: L'Oréal-Unesco для женщин в науке международный рост талантов ^{[ 24 ]}
2020: Выборы в глобальную молодую академию ^{[ 25 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Женщины, наука (2018-10-15). "Nurcan Tunçbag" . Середина . Помножено 2019-03-16 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Привлек внимание международных кругов » . www.haberturk.com (на турецком). 11 февраля 2019 года . Помножено 2019-03-16 .
^ Кескин, Озлем; Тункбаг, Нуркан; Гурсоя, Аттила (2008). «Характеристика и прогнозирование белковых интерфейсов, чтобы вывести сети взаимодействия белка-белка». Текущая фармацевтическая биотехнология . 9 (2): 67–76. doi : 10.2174/138920108783955191 . HDL : 11511/32640 . ISSN 1873-4316 . PMID 18393863 . S2CID 25155774 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Кескин, Озлем; Тункбаг, Нуркан; Гурсоя, Аттила (2016-04-27). «Прогнозирование белка -белковых взаимодействий от молекулярного к уровню протеома». Химические обзоры . 116 (8): 4884–4909. doi : 10.1021/acs.chemrev.5b00683 . ISSN 0009-2665 . PMID 27074302 .
^ «Кафедра компьютерной инженерии Университета Хасетпепе» . www.cs.hacettepe.edu.tr . Архивировано с оригинала 2016-03-27 . Получено 2019-03-16 .
^ Танчбаг, Нуркан (2010). Многомасштабный анализ и прогнозирование белковых взаимодействий . Университет Коса.
^ «Nurcan Tuncbag | Массачусетский технологический институт (MIT) - Academia.edu» . mit.academia.edu . Получено 2019-03-16 .
^ «Добро пожаловать в лабораторию моделирования сети! - NetLab - Lab сетевой моделирование» . misstral.ii.metu.edu.tr . Получено 2019-03-16 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Тункбаг, Нуркан; Гурсой, Аттила; Нуссинови, Рут; Кескин, Озлем (2011-08-11). «Прогнозирование белка-белковых взаимодействий в масштабе протеома путем сопоставления эволюционного и структурного сходства на интерфейсах с использованием призмы» . Природные протоколы . 6 (9): 1341–1354. doi : 10.1038/nprot.2011.367 . ISSN 1750-2799 . PMC 7384353 . PMID 21886100 .
^ "Nurcan Tuncbag, Ph.D." (PDF) . Грань Архивировано из оригинала (PDF) 2015-01-05 . Получено 2019-03-16 .
^ Тункбаг, Нуркан; Браунштейн, Альфредо; Пэгнани, Андреа; Хуан, Шао-Шан Кэрол; Чейс, Дженнифер; Боргс, Кристиан; Zecchina, Риккардо; Fraenkel, Ernest (2013-02-01). «Одновременная реконструкция множественных сигнальных путей посредством призовой проблемы Стейнера лесного леса» . Журнал вычислительной биологии . 20 (2): 124–136. doi : 10.1089/cmb.2012.0092 . PMC 3576906 . PMID 23383998 .
^ «Nurcan Tuncbag - личная веб -страница» . Nurcan Tuncbag - личная веб -страница . Получено 2019-03-16 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Фрэнкель, Эрнест; Хуан, Шао-Шан Кэрол; МакКаллум, Скотт; Tuncbag, Nurcan (2012-07-01). «Steinernet: веб -сервер для интеграции« Omic »данных для обнаружения скрытых компонентов пути ответа» . Исследование нуклеиновых кислот . 40 (W1): W505 - W509. doi : 10.1093/nar/gks445 . ISSN 0305-1048 . PMC 3394335 . PMID 22638579 .
^ "Fraenkel Lab - конфигуратор Steinernet" . Fraenkel-nsf.csbi.mit.edu . Получено 2019-03-16 .
^ "2. Ebat Congress" . ebatconss.org . Поврежден 2019-03-16 . ^{[ Постоянная мертвая ссылка ]}
^ Фрэнкель, Эрнест; Саркария, Янн Н.; Белый, Форест М.; Iyekegbe, Dennis O.; Симона Далин; Сио, Теренс Т.; Джонсон, Ханна; Pokorny, Jenny L.; Милани, Памела (2016-06-29). «Моделирование сети идентифицирует конкретные пути пациента при глиобластоме» . Научные отчеты . 6 : 28668. BIBCODE : 2016NATSR ... 628668T . doi : 10.1038/srep28668 . ISSN 2045-2322 . PMC 4926112 . PMID 27354287 .
^ «Новые подсказки на основе болезни Паркинсона, других« синуклеинопатий » . Scienceday . Получено 2019-03-16 .
^ «Ассоценция. Проф. Доктор Нуркан Тунцбаг» (PDF) . Получено 19 января 2022 года .
^ "2. Ebat Congress" . ebatconss.org . Поврежден 2019-03-16 . ^{[ Постоянная мертвая ссылка ]}
^ честь. «Награды 2017 года - Metu Prof.dr.mustafa.n.parlar Образование и исследовательский фонд» (на Турции) . Помножено 2019-03-16 .
^ "ЮНЕСКО Л'ОРАЛ НАЦИОНАЛЬНАЯ МОЛОДОЙ Стипендия науки . ii.metu.edu.tr. Помножено 2019-03-16 .
^ Академия, Türkiye Sciences. «Награда 2018 года за науки женщин» от L'Oréal & UNESCO до «премии 2018 года за научные женщины» | Tuba.gov.tr (на турецком) . Помножено 2019-03-16 .
^ «4 Награды Tüba-GebiP, предоставленные Metu | Высшая школа информатики» . ii.metu.edu.tr. Получено 2019-03-16 .
^ «21-е издание Международной премии L'Oréal-Unesco для женщин в науке» . ЮНЕСКО . 2019-03-13 . Получено 2019-03-16 .
^ «Глобальная молодая академия приветствует новых членов из 30 стран мира» . Глобальная молодая академия . 2020-03-24 . Получено 2020-04-07 .

У Scholia есть профиль для Nurcan Tuncbag (Q41044794) .

[:0-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Женщины, наука (2018-10-15). "Nurcan Tunçbag" . Середина . Помножено 2019-03-16 .

[:1-2] Jump up to: ^а ^{беременный} «Привлек внимание международных кругов » . www.haberturk.com (на турецком). 11 февраля 2019 года . Помножено 2019-03-16 .

[3] Кескин, Озлем; Тункбаг, Нуркан; Гурсоя, Аттила (2008). «Характеристика и прогнозирование белковых интерфейсов, чтобы вывести сети взаимодействия белка-белка». Текущая фармацевтическая биотехнология . 9 (2): 67–76. doi : 10.2174/138920108783955191 . HDL : 11511/32640 . ISSN 1873-4316 . PMID 18393863 . S2CID 25155774 .

[:2-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Кескин, Озлем; Тункбаг, Нуркан; Гурсоя, Аттила (2016-04-27). «Прогнозирование белка -белковых взаимодействий от молекулярного к уровню протеома». Химические обзоры . 116 (8): 4884–4909. doi : 10.1021/acs.chemrev.5b00683 . ISSN 0009-2665 . PMID 27074302 .

[5] «Кафедра компьютерной инженерии Университета Хасетпепе» . www.cs.hacettepe.edu.tr . Архивировано с оригинала 2016-03-27 . Получено 2019-03-16 .

[6] Танчбаг, Нуркан (2010). Многомасштабный анализ и прогнозирование белковых взаимодействий . Университет Коса.

[7] «Nurcan Tuncbag | Массачусетский технологический институт (MIT) - Academia.edu» . mit.academia.edu . Получено 2019-03-16 .

[8] «Добро пожаловать в лабораторию моделирования сети! - NetLab - Lab сетевой моделирование» . misstral.ii.metu.edu.tr . Получено 2019-03-16 .

[:4-9] Jump up to: ^а ^{беременный} Тункбаг, Нуркан; Гурсой, Аттила; Нуссинови, Рут; Кескин, Озлем (2011-08-11). «Прогнозирование белка-белковых взаимодействий в масштабе протеома путем сопоставления эволюционного и структурного сходства на интерфейсах с использованием призмы» . Природные протоколы . 6 (9): 1341–1354. doi : 10.1038/nprot.2011.367 . ISSN 1750-2799 . PMC 7384353 . PMID 21886100 .

[10] "Nurcan Tuncbag, Ph.D." (PDF) . Грань Архивировано из оригинала (PDF) 2015-01-05 . Получено 2019-03-16 .

[11] Тункбаг, Нуркан; Браунштейн, Альфредо; Пэгнани, Андреа; Хуан, Шао-Шан Кэрол; Чейс, Дженнифер; Боргс, Кристиан; Zecchina, Риккардо; Fraenkel, Ernest (2013-02-01). «Одновременная реконструкция множественных сигнальных путей посредством призовой проблемы Стейнера лесного леса» . Журнал вычислительной биологии . 20 (2): 124–136. doi : 10.1089/cmb.2012.0092 . PMC 3576906 . PMID 23383998 .

[12] «Nurcan Tuncbag - личная веб -страница» . Nurcan Tuncbag - личная веб -страница . Получено 2019-03-16 .

[:3-13] Jump up to: ^а ^{беременный} Фрэнкель, Эрнест; Хуан, Шао-Шан Кэрол; МакКаллум, Скотт; Tuncbag, Nurcan (2012-07-01). «Steinernet: веб -сервер для интеграции« Omic »данных для обнаружения скрытых компонентов пути ответа» . Исследование нуклеиновых кислот . 40 (W1): W505 - W509. doi : 10.1093/nar/gks445 . ISSN 0305-1048 . PMC 3394335 . PMID 22638579 .

[14] "Fraenkel Lab - конфигуратор Steinernet" . Fraenkel-nsf.csbi.mit.edu . Получено 2019-03-16 .

[15] "2. Ebat Congress" . ebatconss.org . Поврежден 2019-03-16 . ^{[ Постоянная мертвая ссылка ]}

[16] Фрэнкель, Эрнест; Саркария, Янн Н.; Белый, Форест М.; Iyekegbe, Dennis O.; Симона Далин; Сио, Теренс Т.; Джонсон, Ханна; Pokorny, Jenny L.; Милани, Памела (2016-06-29). «Моделирование сети идентифицирует конкретные пути пациента при глиобластоме» . Научные отчеты . 6 : 28668. BIBCODE : 2016NATSR ... 628668T . doi : 10.1038/srep28668 . ISSN 2045-2322 . PMC 4926112 . PMID 27354287 .

[17] «Новые подсказки на основе болезни Паркинсона, других« синуклеинопатий » . Scienceday . Получено 2019-03-16 .

[cv2018-18] «Ассоценция. Проф. Доктор Нуркан Тунцбаг» (PDF) . Получено 19 января 2022 года .

[19] "2. Ebat Congress" . ebatconss.org . Поврежден 2019-03-16 . ^{[ Постоянная мертвая ссылка ]}

[20] честь. «Награды 2017 года - Metu Prof.dr.mustafa.n.parlar Образование и исследовательский фонд» (на Турции) . Помножено 2019-03-16 .

[21] "ЮНЕСКО Л'ОРАЛ НАЦИОНАЛЬНАЯ МОЛОДОЙ Стипендия науки . ii.metu.edu.tr. Помножено 2019-03-16 .

[22] Академия, Türkiye Sciences. «Награда 2018 года за науки женщин» от L'Oréal & UNESCO до «премии 2018 года за научные женщины» | Tuba.gov.tr (на турецком) . Помножено 2019-03-16 .

[23] «4 Награды Tüba-GebiP, предоставленные Metu | Высшая школа информатики» . ii.metu.edu.tr. Получено 2019-03-16 .

[24] «21-е издание Международной премии L'Oréal-Unesco для женщин в науке» . ЮНЕСКО . 2019-03-13 . Получено 2019-03-16 .

[25] «Глобальная молодая академия приветствует новых членов из 30 стран мира» . Глобальная молодая академия . 2020-03-24 . Получено 2020-04-07 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]