Дарвин Ядро
Darwin Core (часто сокращенно DwC ) — это расширение Dublin Core для информатики биоразнообразия . Его цель — предоставить стабильный стандартный справочник для обмена информацией о биологическом разнообразии ( биоразнообразии ). [1] Термины, описанные в этом стандарте, являются частью более широкого набора словарей и технических спецификаций, которые разрабатываются и поддерживаются Стандартами информации о биоразнообразии (TDWG) (ранее — Рабочая группа по таксономическим базам данных).
Описание
[ редактировать ]Darwin Core — это свод стандартов , призванных облегчить обмен информацией о биологическом разнообразии. DwC включает глоссарий терминов и документацию, содержащую справочные определения, примеры и комментарии. Обзор принятых в настоящее время терминов и концепций можно найти в кратком справочном руководстве Darwin Core, поддерживаемом TDWG .
Оперативное подразделение DwC в первую очередь основано на таксонах , их распространении в природе, подтвержденном наблюдениями, образцами и пробами, а также соответствующей информацией. В стандарт включены документы, описывающие, как управляются эти термины, как набор терминов может быть расширен для новых целей и как эти термины можно использовать.
DwC Каждый термин включает определение и обсуждения, призванные способствовать единообразному использованию терминов в различных приложениях и дисциплинах. В других контекстах такие термины могут называться свойствами, элементами, полями, столбцами, атрибутами или понятиями. Хотя типы данных и ограничения не указаны в определениях терминов, даются рекомендации о том, как ограничить значения, где это необходимо, например, предлагая использовать контролируемые словари .
Стандарты DwC имеют версии и постоянно развиваются, а рабочие группы часто добавляют в документацию практические примеры, которые обсуждают, уточняют и расширяют нормативные определения каждого термина. Такой подход к документации позволяет стандарту адаптироваться к новым целям, не нарушая существующие приложения.
На практике Darwin Core отделяет определения и семантику отдельных терминов от применения этих терминов в различных технологиях. Darwin Core предоставляет отдельные рекомендации по кодированию терминов в формате RDF. [2] XML [3] или текстовые файлы. [4]
Простое ядро Дарвина [5] представляет собой спецификацию одного конкретного способа использования терминов и обмена данными о таксонах и их встречаемости в простой структурированной форме. Вероятно, именно это имелось в виду, если кто-то предложил «отформатировать ваши данные в соответствии с ядром Дарвина».
История
[ редактировать ]Первоначально Darwin Core был создан как профиль Z39.50 Группой разработчиков биологии Z39.50 (ZBIG) при финансовой поддержке Национального научного фонда США. [6] Название «Darwin Core» было впервые предложено Алленом Эллисоном на первом заседании ZBIG, состоявшемся в Университете Канзаса в 1998 году, когда он комментировал концептуальное сходство профиля с Dublin Core. Профиль Darwin Core позже был выражен как документ XML-схемы для использования протоколом распределенного общего поиска информации (DiGIR). Рабочая группа TDWG была создана для пересмотра Darwin Core, а ратифицированный стандарт метаданных 9 октября 2009 года был официально выпущен .
Несмотря на то, что Darwin Core с тех пор был ратифицирован в качестве стандарта Стандартами информации о биоразнообразии (TDWG), у него было множество предыдущих версий, используемых в производстве. Опубликованный стандарт содержит перечень нормативных терминов. [7] с полной историей версий терминов, приведших к действующему стандарту.
| Имя | Пространство имен | Количество терминов | XML-схема | Дата выпуска |
|---|---|---|---|---|
| Дарвин Ядро 1.0 | Непригодный | 24 | (З39.50 ГРС-1) | 1998 |
| Дарвин Ядро 1.2 (Классический) | http://digir.net/schema/conceptual/darwin/2003/1.0/ Архивировано 18 августа 2008 г. в Wayback Machine. [8] | 46 | [2] | 2001-09-11 |
| Darwin Core 1.21 (MaNIS/HerpNet/ORNIS/FishNet2) | http://digir.net/schema/conceptual/darwin/2003/1.0/ Архивировано 18 августа 2008 г. в Wayback Machine. [9] | 63 | [3] | 2003-03-15 |
| Дарвин Кор Обис | http://www.iobis.org/obis/ [10] | 27 | [4] | 2005-07-10 |
| Darwin Core 1.4 (проект стандарта) | http://rs.tdwg.org/dwc/dwcore/ [11] | 46 | [5] | 2007-04-23 |
| Основной стандарт Дарвина | http://rs.tdwg.org/dwc/terms/ | 169 | [6] | 2009-10-09 |
Ключевые проекты с использованием Darwin Core
[ редактировать ]- Глобальный информационный фонд по биоразнообразию (GBIF) [12]
- Океанская биогеографическая информационная система (ОБИС) [13]
- Атлас живой Австралии (ALA)
- Интернет-зоологические коллекции австралийских музеев (OZCAM) [ мертвая ссылка ]
- Сетевая информационная система млекопитающих (MaNIS)
- Орнитологическая информационная система (ОРНИС)
- ФишНет 2
- ВертНет
- Канаденсис
- Система Природа 3.0
- Энциклопедия жизни
- Интегрированные оцифрованные биоколлекции (iDigBio) [14] [15]
См. также
[ редактировать ]- Основной архив Дарвина
- Сеть курирования данных. Простое ядро Дарвина для небиологов. Учебное пособие
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Вечорек, Джон; Д. Блум; Р. Гуральник; С. Блюм; М. Дёринг; Р. Де Джованни; Т. Робертсон; Д. Вьегле (2012). «Darwin Core: развивающийся стандарт данных о биоразнообразии, разработанный сообществом» . ПЛОС ОДИН . 7 (1): e29715. Бибкод : 2012PLoSO...729715W . дои : 10.1371/journal.pone.0029715 . ПМЦ 3253084 . ПМИД 22238640 .
- ^ Руководство по XML Darwin Core
- ^ Руководство по XML Darwin Core
- ^ Руководство по основному тексту Дарвина
- ^ Простое ядро Дарвина
- ^ Экспериментальный испытательный стенд протокола поиска информации Z39.50 для сбора биологических и таксономических данных, № 9811443 [1]
- ^ Список основных нормативных терминов Дарвина
- ^ Дарвинское ядро 1.2
- ^ Ядро Дарвина 1.21
- ^ Дарвин Core OBIS
- ^ Дарвинское ядро 1.4
- ^ «Ядро Дарвина» . Глобальный информационный фонд по биоразнообразию . Архивировано из оригинала 12 апреля 2011 года . Проверено 12 апреля 2011 г.
- ^ «Схема данных и метаданные» . Океанская биогеографическая информационная система . Архивировано из оригинала 8 октября 2010 года . Проверено 12 апреля 2011 г.
- ^ «Руководство по приему данных» . iDigBio . Проверено 26 сентября 2016 г.
- ^ «Представление ваших данных: публикация данных и стандарты данных с помощью iDigBio» . iDigBio . Проверено 26 сентября 2016 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Краткое справочное руководство по ядру Darwin
- Сайт основной разработки Дарвина
- Официальный основной веб-сайт Дарвина
- Краткое изложение Darwin Core
- Стандартные спецификации Darwin Core — репозиторий GitHub , где активно поддерживается DwC. [1]
- ^ Основная целевая группа Дарвина, Информационные стандарты по биоразнообразию (TDWG) (08 ноября 2014 г.), Darwin Core: 08 ноября 2014 г. , doi : 10.5281/zenodo.592792 , получено 22 октября 2020 г.