Равиндра Н. Сингх

Равиндра Н. Сингх
Равиндра Н. Сингх
Рожденный	31 марта 1963 г. (61 год)
Национальность	американец индийского происхождения
Род занятий	Ученый, изобретатель и академик
Награды	Президентская премия за раннюю карьеру для ученых и инженеров , федеральное правительство США (2006 г.)
Академическое образование
Образование	Бакалавр химии ; Магистр биохимии ; Кандидат биохимических наук
Альма-матер	Индуистский университет Банарас ; Российская академия наук
Академическая работа
Учреждения	Университет штата Айова

Равиндра Н. Сингх — американский учёный, изобретатель и академик индийского происхождения. Он является профессором кафедры биомедицинских наук Колледжа ветеринарной медицины Университета штата Айова . ^{[ 1 ]}

Сингх наиболее известен своими исследованиями в области биологии РНК и молекулярной генетики ; ^{[ 2 ]} в частности, за изобретение мишени для глушителя сплайсинга интронов N1 (ISS-N1), что привело к созданию первого одобренного FDA препарата ( Спинраза/Нусинерсен ) для лечения спинальной мышечной атрофии (СМА) . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Он является лауреатом нескольких наград, в том числе Фонда Салсбери в Университете штата Айова и Президентской премии за раннюю карьеру для ученых и инженеров 2006 года (PECASE) . ^{[ 5 ]}

Образование

Сингх получил степень бакалавра наук. степень бакалавра химии в 1983 году и степень магистра наук. Индуистском университете в 1985 году получили степень бакалавра биохимии в Банараса . Он получил степень доктора философии. Кандидат биохимии Института биохимии и физиологии микроорганизмов РАН в 1993 году. ^{[ 1 ]}

Карьера

Сингх начал свою академическую карьеру в качестве постдокторанта-исследователя, сначала занимая должность в Онкологическом центре доктора медицины Андерсона Техасского университета , затем в Университете штата Орегон , а затем в Техасском университете в Остине . В 2001 году он стал специальным и научным сотрудником и доцентом по исследованиям в Медицинском центре Новой Англии и Медицинской школе Университета Тафтса , после чего был назначен доцентом медицинского факультета Массачусетского университета , где он работал над разработка МКС-Н1 до 2007 года. ^{[ 6 ]} Он присоединился к Университету штата Айова в качестве доцента в 2007 году и с 2008 по 2016 год был назначен заведующим кафедрой ветеринарной медицины Солсбери. С 2012 года он работает профессором на кафедре биомедицинских наук Колледжа ветеринарной медицины в Айове. государственный университет, ^{[ 1 ]} где он возглавляет исследовательскую группу Сингха. Он также связан с кафедрой биохимии, биофизики и молекулярной биологии Роя Дж. Карвера в Университете штата Айова, где он был членом Совета по биотехнологиям и Совета выпускников. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Исследовать

Как независимый исследователь, Сингх внес вклад в область молекулярной биологии, изучая механизм альтернативного сплайсинга, особенно в контексте спинальной мышечной атрофии (СМА), и разрабатывая таргетные методы лечения, включая антисмысловые препараты, для коррекции аберрантного сплайсинга, связанного с генетическими заболеваниями. заболевания. ^{[ 2 ]} Его ранние исследования были сосредоточены на очистке и характеристике ферментов, в том числе целлюлаз , трансглутаминаз и РНК-репликазы из вируса желтой мозаики репы . Работая в лаборатории Алана Ламбовица , он также проанализировал, как матураза LtrA связывается с интроном Ll.LtrB группы II у Lactococcus Lactis , облегчая синтез кДНК и проливая свет на ее роль в сплайсинге РНК и ее эволюционное происхождение. ^{[ 10 ]}

Сингх углубился в функции белка Survival Motor Neuron (SMN) в метаболизме РНК, связав его роль со СМА и различными другими состояниями. ^{[ 11 ]} Сотрудничая с Нирмалом К. Сингхом, Натальей Н. Сингх и Эллиотом Дж. Андрофи, он исследовал функцию интронного сайленсера сплайсинга N1 (ISS-N1) в гене SMN2, его участие в пропуске экзона 7 и его терапевтический потенциал при СМА. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} что привело к первому медикаментозному лечению этого заболевания ^{[ 14 ]} и получение патентов. ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} Он также установил, что 8-мерный антисмысловой олигонуклеотид (ASO) корректирует аберрации сплайсинга экзона 7 SMN2 в моделях СМА, увеличивая уровни SMN со специфичностью и эффективностью. ^{[ 17 ]} Кроме того, он исследовал мутацию C6U и экзонные энхансеры сплайсинга в экзоне 7 гена SMN, проливая свет на регуляцию сплайсинга при СМА. ^{[ 18 ]}

Сингх исследовал, как структура РНК, в частности терминальная петля ствола 2 (TSL2), влияет на сплайсинг экзона 7 в генах SMN. ^{[ 19 ]} и идентифицировали белки TIA1 и TIAR как положительные регуляторы сплайсинга экзона 7 SMN2, ^{[ 20 ]} раскрывая понимание патологии СМА. Он разработал анализ обнаружения пропуска нескольких экзонов (MESDA) для захвата нескольких изоформ сплайсинга генов SMN в одном эксперименте. ^{[ 21 ]} Он открыл терапевтическое значение структуры РНК, образованной в результате взаимодействия на больших расстояниях внутри интрона. ^{[ 22 ]} и продемонстрировали, как небольшую ASO (8-мерную ASO) можно использовать для терапевтической коррекции сплайсинга при СМА. ^{[ 17 ]} Его исследование также выявило связь мужского бесплодия с низким уровнем SMN в легкой мышиной модели СМА. ^{[ 23 ]} и показал, как активацию загадочного сайта сплайсинга можно использовать для лечения редких случаев СМА. ^{[ 24 ]} Кроме того, он продемонстрировал новые последовательности и структурные мотивы, связанные с взаимодействиями РНК-SMN. ^{[ 25 ]} и обнаружили огромный репертуар кольцевых РНК (circRNA), генерируемых генами SMN человека. ^{[ 26 ]} В статье, опубликованной в журнале Scientific Reports , он продемонстрировал аберрантную транскрипцию генов на хромосомах 4, 7, 10 и X при сверхэкспрессии циркРНК, охватывающей четыре ранних экзона генов SMN. ^{[ 27 ]} Его исследования выявили и охарактеризовали нецелевые эффекты терапевтических соединений, модулирующих сплайсинг, включая ASO и малые молекулы. ^{[ 28 ]}^{[ 29 ]} его лаборатория была первой, кто сконструировал суперминиген для изучения влияния генетических мутаций на транскрипцию, сплайсинг и трансляцию. ^{[ 30 ]}

Награды и почести

2006 - Президентская премия за раннюю карьеру для ученых и инженеров (PECASE), федеральное правительство США. ^{[ 5 ]}
2014–2016 гг. – избранный член Совета выпускников Университета штата Айова. ^{[ 9 ]}
2014-2017 – Член Совета по биотехнологиям Университета штата Айова. ^{[ 8 ]}

Избранные статьи

Сингх Р.Н. и Акименко В.К. (1993). Выделение целлобиогидролазы Clostridium thermocellum, способной разрушать природные кристаллические субстраты. Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями, 192(3), 1123–1130.
Сингх, Р.Н., и Мехта, К. (1994). Очистка и характеристика новой трансглутаминазы филяриальной нематоды Brugia malayi. Европейский журнал биохимии, 225(2), 625–634.
Сингх, Р.Н., и Дреер, Т.В. (1997). РНК-зависимая РНК-полимераза вируса желтой мозаики репы: инициация синтеза минус-цепи in vitro. Вирусология, 233(2), 430–439.
Сингх, Р.Н., и Дреер, Т.В. (1998). Выбор специфического сайта в РНК в результате сочетания неспецифической вторичной структуры и CCR-боксов: инициация синтеза минус-цепи РНК-зависимой РНК-полимеразой вируса желтой мозаики репы. Рна, 4(9), 1083–1095.
Ванк Х., СанФилиппо Дж., Сингх Р.Н., Мацуура М. и Ламбовиц А.М. (1999). Обратная транскриптаза/матураза способствует сплайсингу путем связывания своего собственного кодирующего сегмента в интронной РНК группы II. Молекулярная клетка, 4(2), 239–250.
Сингх, Р.Н., Салданья, Р.Дж., Д'Суза, Л.М., и Ламбовиц, А.М. (2002). Связывание обратной транскриптазы/матуразы, кодируемой интроном группы II, с ее высокоаффинным сайтом связывания интрона с РНК включает специфическое распознавание последовательности и ауторегуляцию трансляции. Журнал молекулярной биологии, 318 (2), 287–303.
Сингх, Н.Н., Андрофи, Э.Дж., и Сингх, Р.Н. (2004). Расширенный ингибирующий контекст вызывает пропуск экзона 7 SMN2 при спинальной мышечной атрофии. Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями, 315(2), 381–388.
Сингх, Н.Н., Андрофи, Э.Дж., и Сингх, Р.Н. (2004). Отбор in vivo выявил комбинаторный контроль, определяющий критический экзон в генах спинальной мышечной атрофии. Рна, 10(8), 1291–1305.
Сингх, Н.К., Сингх, Н.Н., Андрофи, Э.Дж., и Сингх, Р.Н. (2006). Сплайсинг критического экзона моторного нейрона выживания человека регулируется уникальным элементом-глушителем, расположенным в последнем интроне. Молекулярная и клеточная биология, 26 (4), 1333–1346.
Луо Д., Оттесен Э.В., Ли Дж.Х. и Сингх Р.Н. (2024). Эффекты кольцевой РНК, охватывающей четыре ранних экзона генов спинальной мышечной атрофии, на уровне транскриптома и протеома. Научные отчеты, 14(1), 10442.

Ссылки

[aaa-1] Jump up to: ^а ^б ^с «Университет штата Айова – Равиндра Н. Сингх» .

[ggg-2] Jump up to: ^а ^б «Ученый Google – Равиндра Сингх» .

[3] «Исследователи ISU находят возможное лечение спинальной мышечной атрофии» .

[4] «Первый в своем роде суперминиген, стимулирующий исследования спинальной мышечной атрофии» .

[pea-5] Jump up to: ^а ^б «Исследователь из Университета штата Айова удостоен чести на церемонии в Белом доме» .

[6] «В лаборатории Массачусетского университета: момент Эврики» .

[7] «Равиндра Сингх» .

[bcm-8] Jump up to: ^а ^б «Названы новые члены Совета по биотехнологии» .

[gcm-9] Jump up to: ^а ^б «Посещаемость заседаний Совета выпускников в 2015–2016 гг.» .

[10] «Обратная транскриптаза/матураза способствует сплайсингу путем связывания своего собственного кодирующего сегмента в интронной РНК группы II» .

[11] «Разнообразная роль белка двигательных нейронов выживания» .

[12] «Сплайсинг критического экзона двигательного нейрона выживания человека регулируется уникальным элементом-глушителем, расположенным в последнем интроне» .

[13] «Расширенный ингибирующий контекст вызывает пропуск экзона 7 SMN2 при спинальной мышечной атрофии» .

[14] «Как открытие МКС-N1 привело к первому медикаментозному лечению спинальной мышечной атрофии» .

[15] «Лечение спинальной мышечной атрофии (СМА) путем воздействия на последовательности, ингибирующие сайт сплайсинга SMN2» .

[16] «Лечение спинальной мышечной атрофии путем воздействия на каталитическое ядро smn2» .

[doi.org-17] Jump up to: ^а ^б «Короткий антисмысловой олигонуклеотид, маскирующий уникальный интронный мотив, предотвращает пропуск критического экзона при спинальной мышечной атрофии» .

[18] «Отбор in vivo выявляет комбинаторные элементы управления, которые определяют критический экзон в генах спинальной мышечной атрофии» .

[19] «Модулирующая роль структуры РНК в альтернативном сплайсинге критического экзона в генах спинальной мышечной атрофии» .

[20] «TIA1 предотвращает пропуск критического экзона, связанного со спинальной мышечной атрофией» .

[21] «Анализ с пропуском нескольких экзонов обнаруживает удивительное разнообразие сплайс-изоформ генов спинальной мышечной атрофии» .

[22] «Интронная структура, создаваемая взаимодействием на расстоянии, служит новой мишенью для коррекции сплайсинга при спинальной мышечной атрофии» .

[23] «Серьезное нарушение развития мужских репродуктивных органов на мышиной модели спинальной мышечной атрофии с низким уровнем экспрессии SMN» .

[24] «Активация загадочного 5'-сайта сплайсинга обращает вспять влияние патогенных мутаций сайта сплайсинга в гене спинальной мышечной атрофии» .

[25] «Высокоаффинные РНК-мишени белка Survival Motor Neuron демонстрируют разнообразные предпочтения в отношении последовательностей и структурных мотивов» .

[26] «Гены двигательных нейронов выживания человека генерируют обширный набор кольцевых РНК» .

[27] «Эффекты кольцевой РНК, охватывающей четыре ранних экзона генов спинальной мышечной атрофии, на уровне транскриптома и протеома» .

[28] «Высокая концентрация антисмыслового олигонуклеотида, нацеленного на ISS-N1, вызывает массовое нарушение транскриптома» .

[29] «Различные мишени низкомолекулярной терапии, направленной на SMN2 и модулирующей сплайсинг, при спинальной мышечной атрофии» .

[30] «Суперминиген с коротким промотором и укороченными интронами повторяет основные особенности регуляции транскрипции и сплайсинга генов SMN1 и SMN2» .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]