BP Holin Family
Семейство β-протеобактериального Holin (BP-HOL) ( TC# 1.E.50 ) представляет собой небольшое семейство, которое включает членов, полученных из ряда Burkholderia фага , а также вида Poloromonas . По состоянию на 3 апреля 2016 года эта семья принадлежит к суперсемейству Holin II . Члены Saier Bioinformatics Lab в Калифорнийском университете в Сан-Диего обнаружили, что семья BP-HOL наиболее тесно связана с семьей T7 Holin ( TC# 1.E.6 ). [ 1 ] Эти белки имеют длину от 60 до 110 амино ацильных остатков (AAS) и демонстрируют 1 или 2 трансмембранные сегменты (TMS). Некоторые из них аннотируются как холлины типа II и могут быть связаны с членами семейства T7 Holin ( TC# 1.E.6 ), хотя белки BP-HOL остаются функционально нехарактерными. Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству BP-HOL, можно найти в базе данных классификации Transporter . [ 2 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- «BcepMigl_GP72 - Holin - Burkholderia phage bcepmigl - bcepmigl_gp72 ген и белок» . www.uniprot.org . Получено 2016-03-29.
- Gründling, Анжелика; Мэнсон, Майкл Д.; Янг, Ry (2001-07-31). «Херин убивает без предупреждения» . Труды Национальной академии наук 98 (16): 9348–9352. два : 10.1073/pnas.151247598 . ISSN 0027-8424 . PMC 55423 . PMID 11459934 .
- Престон, Гейл М.; Studholme, David J.; Caldelari, Isabelle (2005-04-01). «Профилирование секретов растительных патогенных протеобактерий» . Обзоры микробиологии FEMS 29 (2): 331–360. два : 10.1016/j.fmrre.2005.01.001 . ISSN 1574-6976 . PMID 15808747 .
- Редди, Бхаскара Л.; Saier Jr., Milton H. (2013-11-01). «Топологический и филогенетический анализ бактериальных семейств Holin и суперсемрий» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes 1828 (11): 2654–2671. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . PMC 3788059 . PMID 23856191 .
- Saier, Milton H.; Редди, Бхаскара Л. (2015-01-01). «Holins в бактериях, эукариотах и археи: многофункциональные ксенологи с потенциальными биотехнологическими и биомедицинскими применениями» . Журнал бактериологии 197 (1): 7–17. два : 10.1128/jb.02046-14 . ISSN 0021-9193 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
- Ван, в; Смит, DL; Янг Р. (2000-01-01). «Holins: белковые часы бактериофажных инфекций» . Ежегодный обзор микробиологии 54 : 799–825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . ISSN 0066-4227 . PMID 11018145 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ "Holin Superbamily II" . TCDB . Получено 2016-04-04 .
- ^ «1.E.50. Семейство β-протеобактериального Holin (BP-HOL)» . TCDB . Получено 2016-03-29 .
На этом редактировании этой статье используется контент из 1.E.50 в . « но не под gfdl . Все соответствующие условия должны соблюдаться.