Holin Superbamily II
Holin Superbamily II -это суперсемейство предполагаемых пор белков . Это один из семи различных суперсемей Holin в общей сложности. В целом, считается, что эти белки играют роль в регулируемой гибели клеток , хотя функциональность варьируется между семействами и отдельными членами. Holin Superwamily II включает в себя семьи TC:
- 1.e.1 - Семейство P21 Holin S (P21 Holin)
- 1.e.6 - Семья T7 Holin (T7 Holin)
- 1.E.7 - Семейство HP1 Holin (HP1 Holin)
- 1.e.25 - Семейство Pseudomonas Phage F116 (F116 Holin)
- 1.E.50 - Семейство бета-протеобактериального Holin (BP-HOL)
Все четыре из этих семейств получены из Pseudomonadota и имеют относительно небольшие размеры, средний размер белков в пределах всей суперсемейства составляет 78 ± 14 амино ацильных остатков (AAS). Некоторые исключения можно найти (то есть белок семейства Lysis S с 720 AAS, TC# 1.E.1.1.7 ). Как и в суперсемействе Holin I , белки в этих семействах, как правило, демонстрируют 2 трансмембранных шесбнейнера (TMS). Семейства 1 и 6 в суперсемействе II являются распознаваемыми доменами в базе данных консервативных доменов (CDD) в качестве лизиса S и Superfamilies PHA00426, соответственно, в то время как семейства 7 и 25 не имеют признанных консервативных доменов. [ 1 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Редди, Бхаскара Л.; Saier, Milton H. (2013-11-01). «Топологический и филогенетический анализ бактериальных семейств Holin и суперсемрий» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1828 (11): 2654–2671. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . ISSN 0006-3002 . PMC 3788059 . PMID 23856191 .