Jump to content

База данных терапевтических целей

База данных терапевтических целей (TTD)
Содержание
Описание База данных по целевым препаратам
Контакт
Лаборатория Группа инновационных исследований лекарств и биоинформатики (IDRB) Группа биоинформатики и разработки лекарств (BIDD)
Первичное цитирование ПМИД   37713619
Дата выпуска 1 октября 2023 г.
Доступ
Веб-сайт https://idrblab.org/ttd/
Разнообразный
Лицензия Свободный доступ
Версия 8.1.01

База данных терапевтических целей ( TTD ) — фармацевтический и медицинский репозиторий. [1] Создан Группой инновационных исследований лекарств и биоинформатики (IDRB) в Университете Чжэцзян, Китай , и Группой биоинформатики и дизайна лекарств Национального университета Сингапура . Он предоставляет информацию об известных и изученных терапевтических белках и мишенях нуклеиновых кислот . [2] целевое заболевание, [3] информация о пути [4] и соответствующие препараты, направленные на каждую из этих мишеней. [1] Подробные знания о целевой функции, последовательности, трехмерной структуре, свойствах связывания лигандов, номенклатуре ферментов и структуре лекарств, терапевтическом классе и статусе клинической разработки. [1] TTD доступен бесплатно без необходимости входа в систему по адресу https://idrblab.org/ttd/ .

Статистика

[ редактировать ]

Эта база данных содержит 3730 терапевтических целей (532 успешных, 1442 клинических исследования, 239 доклинических/запатентованных и 1517 исследовательских целей) и 39862 лекарств (2895 одобренных, 11796 клинических испытаний, 5041 доклинических/запатентованных и 20130 экспериментальных препаратов). Цели и лекарства в TTD охватывают 583 биохимических класса белков и 958 терапевтических классов лекарств соответственно. [1] Последняя версия кодов Международной классификации болезней (МКБ-11), выпущенная ВОЗ, включена в TTD, чтобы облегчить четкое определение болезни/класса болезни. [5]

Проверка первичной терапевтической цели

[ редактировать ]

Проверка цели обычно требует определения того, что мишень экспрессируется в клетках/тканях, имеющих отношение к заболеванию. [6] его можно напрямую модулировать лекарственным средством или подобной ему молекулой с адекватной эффективностью в биохимическом анализе, [7] и что целевая модуляция на клеточных и/или животных моделях улучшает фенотип соответствующего заболевания. [8] Таким образом, TTD собирает три типа целевых данных проверки: [9]

  • Экспериментально определенная эффективность лекарств против их основной цели или целей. [6]
  • Очевидная эффективность или воздействие лекарств на модели заболеваний (клеточные линии, модели ex-vivo, in-vivo), связанные с их основной мишенью или мишенями. [8]
  • Наблюдаемые эффекты нокаута мишени, нокдауна, РНК-интерференции, трансгенетических, обработанных антителами или антисмысловыми моделями in vivo. [7]

Категоризация терапевтических целей на основе клинического статуса

[ редактировать ]

Терапевтические цели в TTD подразделяются на успешную цель, цель клинических испытаний, доклиническую цель, запатентованную цель и цель, описанную в литературе, которые определяются наивысшим статусом соответствующих препаратов.

  • Успешная цель: нацелена как минимум на один одобренный препарат;
  • Цель клинических испытаний: не нацелена ни на один одобренный препарат, но на нее нацелен хотя бы один препарат, участвующий в клинических испытаниях;
  • Доклиническая цель: не нацелена ни на один одобренный/проходящий клинические испытания препарат, но на нее нацелен хотя бы один доклинический препарат;
  • Запатентованная мишень: не нацелена ни на один одобренный/проходящий клинические испытания/доклинический препарат, но на нее нацелен хотя бы один запатентованный препарат;
  • Цель, указанная в литературе: нацелена только на исследуемые наркотики.

Классификация терапевтических мишеней на основе типов молекул

[ редактировать ]

Молекулярные типы терапевтических мишеней при TTD включают белок, нуклеиновую кислоту и другие молекулы.

  • Белок : наиболее распространенный тип мишени при разработке лекарств.
  • Нуклеиновая кислота : включает ДНК, мРНК, микроРНК, мишени днРНК.
  • Другие молекулы: такие как мочевая кислота, железо и активные формы кислорода.

В ТТД собраны различные виды наркотиков

[ редактировать ]

Основные типы лекарств при TTD включают низкомолекулярные препараты, антитела, препараты нуклеиновых кислот, клеточную терапию, генную терапию и вакцины.

  • Малая молекула : самые распространенные лекарства на фармацевтическом рынке
  • Антитела : включают моноклональные антитела и несколько альтернатив, таких как конъюгаты антитело-лекарственное средство, биспецифические антитела, смеси IgG и слитые белки антител.
  • Препарат нуклеиновой кислоты: в основном включает антисмысловые олигонуклеотиды, малые интерферирующие РНК, малые активирующие РНК, микроРНК, мРНК и т. д.
  • Клеточная терапия : инъекции, трансплантация или имплантация жизнеспособных клеток пациенту для достижения лекарственного эффекта.
  • Генная терапия : манипулирование экспрессией генов или изменение биологических свойств живых клеток для достижения терапевтического эффекта.
  • Вакцина : обеспечивает активный приобретенный иммунитет к определенному инфекционному или злокачественному заболеванию.

Основные улучшения в различных версиях TTD

[ редактировать ]

Обновление 2024 г. ( Nucleic Acids Res . 2023, doi: 10.1093/nar/gkad751) [1]

[ редактировать ]

Целевая доступность лекарств, иллюстрируемая молекулярными взаимодействиями или регулированием;

Целевая лекарственная способность, характеризующаяся различными особенностями человеческой системы;

Целевая доступность лекарств, отражаемая разнообразными вариациями клеточной экспрессии;

Обновление 2022 года ( Nucleic Acids Res . 2022, 50: D1398-D1407) [10]

[ редактировать ]

Структурно-ориентированный ландшафт деятельности и профиль свойств объектов, подобных наркотикам;

Пролекарства вместе с исходным лекарственным средством и мишенью;

Совместные цели, модулируемые одобренными/прошедшими клинические испытания лекарствами;

Плохое связывание и несвязывание мишеней;

Обновление 2020 г. ( Nucleic Acids Res . 2020, 48: D1031-D1041) [11]

[ редактировать ]

Регуляторы-мишени (микроРНК и факторы транскрипции) и белки, взаимодействующие с мишенью;

Запатентованные агенты и их мишени (структуры и значения экспериментальной активности, если таковые имеются);

Обновление 2018 г. ( Nucleic Acids Res . 2018, 46: D1121-D1127) [12]

[ редактировать ]

Профили дифференциальной экспрессии и загружаемые данные о мишенях у пациентов и здоровых людей;

Целевое сочетание многоцелевых препаратов и комбинированной терапии;

Обновление 2016 г. ( Nucleic Acids Res . 2016, 44: D1069-D1074) [13]

[ редактировать ]

Перекрестные ссылки большинства записей о целевых показателях TTD и лекарствах с соответствующими записями о пути;

Доступ к многочисленным мишеням и лекарствам, перекрестно связанным с каждым из этих путей пути;

Обновление 2014 г. ( Nucleic Acids Res . 2014, 42: D1118-D1123) [14]

[ редактировать ]

Биомаркеры болезненных состояний;

Наркологические основы для наркотиков/лидов;

Обновление 2012 г. ( Nucleic Acids Res . 2012, 40: D1128-D1136) [15]

[ редактировать ]

Информация о проверке цели (лекарственное средство-мишень-заболевание);

Количественные модели взаимосвязи структура-активность (QSAR) для соединений;

Обновление 2010 г. ( Nucleic Acids Res . 2010, 38: D787-D791) [16]

[ редактировать ]

Клинические испытания лекарств и их цели;

Цель сходства и поиск лекарств.

  1. ^ Jump up to: а б с д и Ван, Цзю, Юньцин; Чжу, Фэн (15 сентября 2023 г.). Чжань, Иньтао; Ю, Синьюань, Синьи ; описывающая информацию о целевой лекарственной способности» . Nucleic Acids Research : gkad751. doi : 10.1093/nar/gkad751 . ISSN   1362-4962 . PMC   10767903. . PMID   37713619 База данных ,
  2. ^ Хопкинс А.Л., Жених С.Р. (2002). «Наркотический геном». Nature Reviews Открытие лекарств . 1 (9): 727–30. дои : 10.1038/nrd892 . ПМИД   12209152 . S2CID   13166282 .
  3. ^ Оверингтон Дж. П., Аль-Лазикани Б., Хопкинс А. Л. (2006). «Сколько существует целей по борьбе с наркотиками?». Nature Reviews Открытие лекарств . 5 (12): 993–6. дои : 10.1038/nrd2199 . ПМИД   17139284 . S2CID   11979420 .
  4. ^ Чжэн CJ, Хан LY, Яп CW, Цзи ZL, Цао ZW, Чен YZ (2006). «Терапевтические цели: прогресс их исследования и исследование их характеристик». Фармакол. Преподобный . 58 (2): 259–79. дои : 10.1124/пр.58.2.4 . ПМИД   16714488 . S2CID   3082221 .
  5. ^ The Lancet, ноль (8 июня 2019 г.). «МКБ-11» . Ланцет . 393 (10188): 2275. doi : 10.1016/S0140-6736(19)31205-X . ISSN   1474-547X . ПМИД   31180012 .
  6. ^ Jump up to: а б Линдси, Марк А. (1 октября 2003 г.). «Обнаружение цели». Обзоры природы. Открытие наркотиков . 2 (10): 831–838. дои : 10.1038/nrd1202 . ISSN   1474-1776 . ПМИД   14526386 . S2CID   40029453 .
  7. ^ Jump up to: а б Видалин, Оливье; Муслмани, Мачадия; Этьен, Клеман; Эччакир, Хамид; Абина, Амин М. (1 октября 2009 г.). «Проверка цели in vivo с использованием инвалидации генов, РНК-интерференции и моделей функционального нокаута белков: настало время объединиться». Современное мнение в фармакологии . 9 (5): 669–676. дои : 10.1016/j.coph.2009.06.017 . ISSN   1471-4973 . ПМИД   19646923 .
  8. ^ Jump up to: а б В целом, Кристофер М.; Кляйфельд, Одед (15 марта 2006 г.). «Микроокружение опухоли - мнение: подтверждение матриксных металлопротеиназ в качестве мишеней и антимишеней лекарств для терапии рака». Обзоры природы. Рак . 6 (3): 227–239. дои : 10.1038/nrc1821 . ISSN   1474-175Х . ПМИД   16498445 . S2CID   21114447 .
  9. ^ Чжу, Фэн; Ши, Чжэ; Цинь, Чу; Тао, Лин; Лю, Синь; Сюй, Фэн; Чжан, Ли; Сун, Ян; Лю, Сянхуэй; Чжан, Цзинсянь; Хан, Буконг (1 января 2012 г.). «Обновление базы данных по терапевтическим мишеням, 2012 г.: ресурс для облегчения открытия целевых лекарств» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D1128–1136. дои : 10.1093/nar/gkr797 . ISSN   1362-4962 . ПМК   3245130 . ПМИД   21948793 .
  10. ^ Чжоу, Ин; Чжан, Иньтао; Лиан, Сичэнь; Ли, Фэнчэн; Ван, Чаосинь; Чжу, Фэн; Цю, Юньцин; Чен, Юзонг (7 января 2022 г.). «Обновление базы данных по терапевтическим мишеням 2022 года: содействие открытию лекарств с помощью расширенных сравнительных данных о таргетных агентах» . Исследования нуклеиновых кислот . 50 (Д1): Д1398–Д1407. дои : 10.1093/nar/gkab953 . ISSN   1362-4962 . ПМЦ   8728281 . ПМИД   34718717 .
  11. ^ Ван, Юнься; Чжан, Сун; Ли, Фэнчэн; Чжоу, Ин; Чжан, Ин; Ван, Чжэнвэнь; Чжан, Рунюань; Чжу, Цзян; Рен, Юйсян; Тан, Ин; Цинь, Чу (6 ноября 2019 г.). «База данных по терапевтическим целям 2020: расширенный ресурс для облегчения исследований и ранней разработки таргетных терапевтических средств» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (Д1): Д1031–Д1041. дои : 10.1093/nar/gkz981 . ISSN   1362-4962 . ПМЦ   7145558 . ПМИД   31691823 .
  12. ^ Ли, Ин Хун; Ю, Чун Ян; Ли, Сяо Сюй; Чжан, Пэн; Тан, Цзин; Ян, Цинся; Фу, Тинтин; Чжан, Сяоюй; Цуй, Сюэцзяо; Ту, Гао; Чжан, Ян (4 января 2018 г.). «Обновление базы данных таргетных терапевтических средств, 2018 г.: расширенный ресурс для облегчения клинических исследований таргетных терапевтических средств» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д1121–Д1127. дои : 10.1093/нар/gkx1076 . ISSN   1362-4962 . ПМЦ   5753365 . ПМИД   29140520 .
  13. ^ Ян, Хун; Цинь, Чу; Ли, Ин Хун; Тао, Лин; Чжоу, Цзинь; Ю, Чун Ян; Сюй, Фэн; Чен, Чжэ; Чжу, Фэн; Чен, Ю Цзун (4 января 2016 г.). «Обновление базы данных по терапевтическим целям, 2016 г.: расширенный ресурс для получения информации о целевых клинических лекарственных препаратах и ​​целевых путях» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (Д1): Д1069–1074. дои : 10.1093/nar/gkv1230 . ISSN   1362-4962 . ПМК   4702870 . ПМИД   26578601 .
  14. ^ Цинь, Чу; Чжан, Ченг; Чжу, Фэн; Сюй, Фэн; Чен, Шан Ин; Чжан, Пэн; Ли, Ин Хун; Ян, Шэн Юн; Вэй, Юй Цюань; Тао, Лин; Чен, Ю Цзун (7 января 2014 г.). «Обновление базы данных по терапевтической мишени 2014: ресурс по таргетной терапии» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Проблема с базой данных): D1118–1123. дои : 10.1093/nar/gkt1129 . ISSN   1362-4962 . ПМЦ   3964951 . ПМИД   24265219 .
  15. ^ Чжу, Фэн; Ши, Чжэ; Цинь, Чу; Тао, Лин; Лю, Синь; Сюй, Фэн; Чжан, Ли; Сун, Ян; Лю, Сянхуэй; Чжан, Цзинсянь; Хан, Буконг; Чжан, Пэн; Чен, Юзонг (8 января 2012 г.). «Обновление базы данных по терапевтическим мишеням, 2012 г.: ресурс для облегчения открытия целевых лекарств» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D1128–1136. дои : 10.1093/nar/gkr797 . ISSN   1362-4962 . ПМК   3245130 . ПМИД   21948793 .
  16. ^ Чжу, Фэн; Кумар, Панкай; Ма, СяоХуа; Хуан, Лу, ЯнФань; Чжэн, Чэнь, Юцзун» . Обновление TTD: База данных терапевтических целей» . Nucleic Acids Research . 38 ): D787–791. doi : 10.1093/nar/gkp1014 . ISSN   1362-4962 . PMC   2808971. . PMID   19933260 (выпуск базы данных
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 097aa76c54305d0b8b06fa6cfa57fc9f__1705284480
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/09/9f/097aa76c54305d0b8b06fa6cfa57fc9f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Therapeutic Targets Database - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)