Сплайсосомная РНК дрожжей U1
Сплайсосомная РНК дрожжей U1 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности U1_deast | |
Идентификаторы | |
Символ | U1_дрожжи |
Рфам | RF00488 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; сращивание |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | GO:0000368 GO:0030627 GO:0005685 |
ТАК | ТАК: 0000391 |
PDB Структуры | ПДБе |
U1 представляет собой компонент малой ядерной РНК (мяРНК) сплайсосомы и участвует в сплайсинге пре-мРНК .
В процессе сплайсинга 5'- конец мяРНК U1 образует комплементарное спаривание оснований с 5'-концом сплайсинга интрона, подлежащего вырезанию, тем самым определяя 5'-донорный сайт интрона.
Существуют существенные различия в последовательности и вторичной структуре между мяРНК U1 многоклеточных животных и дрожжей, причем последняя значительно длиннее (568 нуклеотидов по сравнению со 164 нуклеотидами у человека). Тем не менее, предсказания вторичной структуры предполагают, что все U1 snRNAs имеют «общее ядро», состоящее из спиралей I, II, проксимальной области III и IV. [ 1 ] [ 2 ] Модель вторичной структуры показывает предсказание структуры более крупных последовательностей дрожжей.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Звиб С (1997). «База данных мРНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (1): 102–3. дои : 10.1093/нар/25.1.102 . ПМК 146409 . ПМИД 9016512 .
- ^ Крецнер Л., Крол А., Росбаш М. (1990). «Вторичная структура малой ядерной РНК Saccharomyces cerevisiae U1 содержит как универсальные, так и специфичные для дрожжей домены» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (2): 851–5. Бибкод : 1990PNAS...87..851K . дои : 10.1073/pnas.87.2.851 . ПМК 53364 . ПМИД 2405391 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]