ВА РНК
ВА РНК | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности VA | |
Идентификаторы | |
Символ | И |
Рфам | RF00102 |
Другие данные | |
РНК Тип | Ген |
Домен(ы) | Эукариоты ; Вирусы |
ТАК | ТАК: 0005836 |
PDB Структуры | ПДБе |
VA (вирусная ассоциированная) РНК представляет собой тип некодирующей РНК, обнаруженной в аденовирусе . [ 1 ] [ 2 ] Он играет роль в регулировании перевода . [ 3 ] Существует две копии этой РНК, называемые VAI или VA RNAI и VAII или VA RNAII. Эти два гена VA РНК представляют собой отдельные гены в геноме аденовируса. VA RNAI является основным видом, у которого VA RNAII экспрессируется на более низком уровне. Ни один из транскриптов не полиаденилирован, и оба транскрибируются PolIII.
Функция
[ редактировать ]VAI стимулирует трансляцию как ранних, так и поздних вирусных генов, включая E3 и гексон . [ 4 ] VAII не стимулирует трансляцию. Анализы транзиентной трансфекции показали, что VAI-РНК повышает стабильность транскриптов, связанных с рибосомами. [ 5 ]
РНК VAI обрабатывается в клетке для создания РНК длиной 22 нуклеотида, которые могут действовать как миРНК или микроРНК . [ 6 ] РНК VAI действует как РНК-ловушка для двухцепочечной РНК, активирующей протеинкиназы R, которая в противном случае фосфорилировала бы фактор инициации эукариот 2 .
Структура
[ редактировать ]VA РНК состоит из двух стебельчатых петель, разделенных центральной областью, необходимой для функционирования. [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мэтьюз, МБ (1995). «Структура, функции и эволюция РНК, ассоциированной с аденовирусным вирусом». Curr Top Microbiol Immunol . Актуальные темы микробиологии и иммунологии. 199 : 173–187. дои : 10.1007/978-3-642-79499-5_7 . ISBN 978-3-642-79501-5 . ПМИД 7555067 .
- ^ Кидд, АХ; Гарвич Д; Оберг М (1995). «Аденовирусы человека и обезьян: филогенетические выводы на основе анализа генов VA РНК» . Вирусология . 207 (1): 32–45. дои : 10.1006/виро.1995.1049 . ПМИД 7871747 .
- ^ Тиммаппайя, Б; Вайнбергер С; Шнайдер Р.Дж.; Шенк Т. (1982). «РНК VAI аденовируса необходима для эффективной трансляции вирусных мРНК на поздних этапах после заражения». Клетка . 31 (3 ч. 2): 543–551. дои : 10.1016/0092-8674(82)90310-5 . ПМИД 6297772 . S2CID 42720272 .
- ^ Свенссон, К; Акусярви Г (1984). «Аденовирусная РНК ВА: положительный регулятор трансляции мРНК» . Мол Клеточная Биол . 4 (4): 736–742. дои : 10.1128/mcb.4.4.736 . ПМК 368790 . ПМИД 6201722 .
- ^ Страйкер, Р; Фриц Д.Т.; Левинсон А.Д. (1989). «ВАИ-РНК аденовируса регулирует экспрессию генов, контролируя стабильность РНК, связанных с рибосомами» . ЭМБО Дж . 8 (9): 2669–2675. дои : 10.1002/j.1460-2075.1989.tb08407.x . ПМК 401273 . ПМИД 2583126 .
- ^ Сано М., Като Ю., Тайра К. (2006). «Специфическое для последовательности вмешательство малых РНК, полученных из РНК аденовируса VAI» . ФЭБС Летт . 580 (6): 1553–1564. doi : 10.1016/j.febslet.2006.01.085 . ПМИД 16472808 . S2CID 6612125 .
- ^ Может; Мэтьюз МБ (1996). «Вторичная и третичная структура центрального домена РНК I аденовируса типа 2» . РНК . 2 (9): 937–951. ПМЦ 1369428 . ПМИД 8809020 .