Кривая Карлсона
Кривая Карлсона — это термин, описывающий скорость секвенирования ДНК или стоимость секвенированного основания в зависимости от времени. [1] Это биотехнологический эквивалент закона Мура . Карлсон предсказал, что время удвоения технологий секвенирования ДНК (измеряемое по стоимости и производительности) будет, по крайней мере, таким же быстрым, как и закон Мура. [2]
История
[ редактировать ]Этот термин был придуман The Economist. [3] и назван в честь автора Роба Карлсона . [1]
Кривые Карлсона иллюстрируют быстрое (в некоторых случаях рост выше экспоненциального ) снижение стоимости и повышение производительности различных технологий, включая секвенирование ДНК, синтез ДНК и ряд физических и вычислительных инструментов, используемых при производстве белка и определении белка. структуры .
Секвенирование нового поколения
[ редактировать ]
Закон Мура начал существенно отставать в январе 2008 года, когда центры перешли от секвенирования Сэнгера к более новым технологиям секвенирования ДНК: [4] Секвенирование 454 со средней длиной считывания = 300-400 оснований (10-кратное) Секвенирование Illumina и SOLiD со средней длиной считывания = 50-100 оснований (30-кратное).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Роберт Х. Карлсон (апрель 2011 г.). Биология — это технология: обещания, опасности и новый бизнес инженерной жизни . Кембридж, Массачусетс: Издательство Гарвардского университета .
- ^ Роберт Карлсон (сентябрь 2003 г.). «Темп и распространение биологических технологий» . Биобезопасность и биотерроризм: стратегия, практика и наука биозащиты . 1 (3: 203–214): 203–214. дои : 10.1089/153871303769201851 . ПМИД 15040198 .
- ^ «Жизнь 2.0» . Экономист. 31 августа 2006 г.
- ^ «Затраты на секвенирование ДНК» . Национальный институт исследования генома человека .