Чарльз Офриа

Чарльз Офриа
Чарльз Офриа
Рожденный	13 декабря 1973 г. (50 лет) ; Нью-Йорк, штат Нью-Йорк (США)
Альма-матер	Университет Стоуни-Брук (бакалавр наук, 1994 г.) ; Калифорнийский технологический институт (доктор философии, 1999 г.)
Известный	Цифровая эволюция , Авида
Награды	Премия Withrow выдающемуся ученому (2006, 2016) ; Премия NSF CAREER (2007) ; Премия Withrow за выдающиеся достижения в области преподавания (2010 г.)
	Научная карьера
Поля	Информатика, Эволюционная биология
Учреждения	Мичиганский государственный университет
Докторантура	Кристоф Адами
Другие научные консультанты	Ричард Ленски
Веб-сайт	www .бесплатно .с

Доктор Чарльз А. Офриа — профессор кафедры компьютерных наук и инженерии Мичиганского государственного университета , директор лаборатории цифровой эволюции (DEvo) и директор Центра BEACON по изучению эволюции в действии. Он сын покойного Чарльза Офрии, ^{[ 3 ]} который разработал первую полностью интегрированную программу управления цехом для автомобильной ремонтной отрасли. Офриа учился в средней школе Стуйвесант и окончил среднюю школу Уорда Мелвилла в 1991 году. В 1994 году он получил степень бакалавра компьютерных наук, чистой математики и прикладной математики в Университете Стоуни-Брук , а также степень доктора философии. Получил степень доктора вычислительной техники и нейронных систем в Калифорнийском технологическом институте в 1999 году. Исследования Офрии сосредоточены на взаимодействии информатики и дарвиновской эволюции. ^{[ 4 ]}

Офриа — один из разработчиков Avida , программной платформы искусственной жизни для изучения эволюционной биологии самовоспроизводящихся и развивающихся компьютерных программ ( цифровые организмы , см. также Цифровые симуляторы организмов ). Avida широко использовалась для изучения основных процессов, лежащих в основе дарвиновской эволюции. ^{[ 5 ]} Avida находится в стадии активной разработки в лаборатории цифровой эволюции Ofria в Университете штата Мичиган и первоначально была разработана Офрией, Крисом Адами и К. Титусом Брауном из Калифорнийского технологического института в 1993 году.

Почести

Офрия получила Карьерную премию NSF в 2007 году. ^{[ 6 ]} и награда Withrow Excellence Award за выдающиеся достижения в преподавании в 2010 году. ^{[ 7 ]} и за выдающиеся достижения в области исследований в 2006 и 2016 годах. ^{[ 8 ]} Он также был лауреатом Премии выдающегося факультета Уильяма Дж. Била в 2017 году. ^{[ 9 ]}

Репрезентативные журнальные публикации

Клюн Дж., Пеннок Р.Т., Офриа С., Ленски Р.Э. (2012). Онтогенез имеет тенденцию повторять филогению цифровых организмов» The American Naturalist 180: E54–E63. ( pdf )
Клюн Дж., Голдсби Х.Дж., Офриа С. и Пеннок Р.Т. (2011)Избирательное давление для точного нацеливания на альтруизм: данные цифровой эволюции для труднопроверяемых аспектов инклюзивной теории приспособленности. Труды Королевского общества. 278: 666-674. ( PDF )
Клюн Дж., Стэнли К.О., Пеннок Р.Т., Офриа С. (2011) О производительности косвенного кодирования в континууме регулярности. Транзакции IEEE по эволюционным вычислениям. 15(3): 346–367. ( PDF )
Клюн Дж., Мишевич Д., Офрия К., Ленски Р.Э., Елена С.Ф. и Санхуан Р. Естественный отбор не может оптимизировать скорость мутаций для долгосрочной адаптации в суровых условиях фитнеса. ^{[ 10 ]}
Офриа С., Хуанг В. и Торнг Э. О постепенной эволюции сложности и внезапном появлении сложных особенностей. ^{[ 11 ]}
Елена С.Ф., Уилке СО, Офрия С и Ленски Р.Э. Влияние размера популяции и частоты мутаций на эволюцию мутационной устойчивости ^{[ 12 ]}
Островский Э., Офрия С. и Ленски Р.Э., Экологическая специализация и адаптивный распад цифровых организмов. ^{[ 13 ]}
Ленски Р.Э., Баррик Дж.Е., Офриа К. Баланс между надежностью и возможностью развития ^{[ 14 ]}
Мишевич Д., Офрия С. и Ленски Р.Э. Половое размножение меняет генетическую архитектуру цифровых организмов ^{[ 15 ]}

Избранные научные публикации с участием Avida

Р.Э. Ленски , К. Офриа, Т.С. Коллиер, К. Адами (1999). Геномная сложность, надежность и генетические взаимодействия в цифровых организмах. Природа 400: 661-664. Абстрактный
К. Адами , К. Офриа и Т.С. Коллиер (2000). Эволюция биологической сложности. «Труды Национальной академии наук» 97 : 4463-4468. Абстрактный
К.О. Уилке, Дж.Л. Ван, К. Офриа, Р.Э. Ленски и К. Адами (2001). Эволюция цифровых организмов при высокой скорости мутаций приводит к выживанию самых плоских. Природа 412: 331-333 Аннотация .
Р.Э. Ленски , К. Офриа, Р.Т. Пеннок и К. Адами (2003). Эволюционное происхождение сложных функций. Природа 423: 139–145. Абстрактный
С.С. Чоу, К.О. Уилке, К. Офриа, Р.Э. Ленски и К. Адами (2004). Адаптивная радиация от конкуренции за ресурсы в цифровых организмах. Наука 305: 84-86 Аннотация .

Ссылки

^ «Офриа и Оуэн получают награду Withrow Awards» . Мичиганский государственный университет . Архивировано из оригинала 4 июня 2016 года . Проверено 2 октября 2017 г.
^ «Офриа и Тан получают награды Withrow» . Мичиганский государственный университет . Архивировано из оригинала 25 марта 2015 года . Проверено 2 октября 2017 г.
^ «Чарльз Офриа (старший)» . FamilyCar.com. Архивировано из оригинала 8 февраля 2013 года . Проверено 11 декабря 2011 г.
^ Компьютерные науки Мичиганский государственный университет
^ «Испытание Дарвина» . Откройте для себя журнал . Февраль 2005 г.
^ «Чарльз Офриа получает награду NSF CAREER Award» . Мичиганский государственный университет . 2007. Архивировано из оригинала 6 апреля 2012 г.
^ «Офриа и Тан получают награду Withrow Awards» . 2010.
^ «Джайн, Офрия и Стайруолт получают награду Withrow Awards» . 2006.
^ «Награды выдающегося факультета Уильяма Дж. Била 2017 года» . 2017.
^ Клюн, Дж; Мишевич, Д; Офрия, К; Ленский, Р.Э.; Елена, Сан-Франциско; Санхуан, Р. (2008). «Естественный отбор не может оптимизировать скорость мутаций для долгосрочной адаптации в суровых условиях фитнеса» . PLOS Вычислительная биология . 4 (9): e1000187. Бибкод : 2008PLSCB...4E0187C . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000187 . ПМК 2527516 . ПМИД 18818724 .
^ Офрия, Чарльз; Хуан, Вэй; Торнг, Эрик (2007). «О постепенной эволюции сложности и внезапном появлении сложных особенностей». Искусственная жизнь . 14 (3): 255–263. дои : 10.1162/артл.2008.14.3.14302 . ПМИД 18489251 . S2CID 2010637 .
^ Елена, Сантьяго Ф.; Вилке, Клаус О.; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2007). «Влияние размера популяции и частоты мутаций на эволюцию мутационной устойчивости» . Эволюция . 61 (3): 666–674. дои : 10.1111/j.1558-5646.2007.00064.x . ПМИД 17348929 . S2CID 14353070 .
^ Островский, Элизабет А.; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2007). «Экологическая специализация и адаптивный распад цифровых организмов». Американский натуралист . 169 (1): E1–20. дои : 10.1086/510211 . JSTOR 10.1086/510211 . ПМИД 17206577 . S2CID 15024491 .
^ Ленский, Р.Э.; Баррик, Дж. Э.; Офрия, К. (2006). «Баланс между надежностью и возможностью развития» . ПЛОС Биология . 4 (12): е428. doi : 10.1371/journal.pbio.0040428 . ПМК 1750925 . ПМИД 17238277 .
^ Мишевич, Душан; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2005). «Половое размножение меняет генетическую архитектуру цифровых организмов» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 273 (1585): 457–464. дои : 10.1098/rspb.2005.3338 . ПМК 1560214 . ПМИД 16615213 .

Внешние ссылки

Программное обеспечение Авида
Проект Avida-ED под руководством Роберта Т. Пеннока
Сайт разработчика Avida
Эволюционное происхождение сложных адаптивных функций. Архивировано 2 марта 2009 г. в Wayback Machine, журнал Nature Paper, 2003 г.
Подкаст 2010 г. с Карлом Циммером в Microbe WORLD
Публикации Офрии в в Google Scholar цитировании

[1] «Офриа и Оуэн получают награду Withrow Awards» . Мичиганский государственный университет . Архивировано из оригинала 4 июня 2016 года . Проверено 2 октября 2017 г.

[2] «Офриа и Тан получают награды Withrow» . Мичиганский государственный университет . Архивировано из оригинала 25 марта 2015 года . Проверено 2 октября 2017 г.

[3] «Чарльз Офриа (старший)» . FamilyCar.com. Архивировано из оригинала 8 февраля 2013 года . Проверено 11 декабря 2011 г.

[4] Компьютерные науки Мичиганский государственный университет

[5] «Испытание Дарвина» . Откройте для себя журнал . Февраль 2005 г.

[6] «Чарльз Офриа получает награду NSF CAREER Award» . Мичиганский государственный университет . 2007. Архивировано из оригинала 6 апреля 2012 г.

[7] «Офриа и Тан получают награду Withrow Awards» . 2010.

[8] «Джайн, Офрия и Стайруолт получают награду Withrow Awards» . 2006.

[9] «Награды выдающегося факультета Уильяма Дж. Била 2017 года» . 2017.

[10] Клюн, Дж; Мишевич, Д; Офрия, К; Ленский, Р.Э.; Елена, Сан-Франциско; Санхуан, Р. (2008). «Естественный отбор не может оптимизировать скорость мутаций для долгосрочной адаптации в суровых условиях фитнеса» . PLOS Вычислительная биология . 4 (9): e1000187. Бибкод : 2008PLSCB...4E0187C . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000187 . ПМК 2527516 . ПМИД 18818724 .

[11] Офрия, Чарльз; Хуан, Вэй; Торнг, Эрик (2007). «О постепенной эволюции сложности и внезапном появлении сложных особенностей». Искусственная жизнь . 14 (3): 255–263. дои : 10.1162/артл.2008.14.3.14302 . ПМИД 18489251 . S2CID 2010637 .

[12] Елена, Сантьяго Ф.; Вилке, Клаус О.; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2007). «Влияние размера популяции и частоты мутаций на эволюцию мутационной устойчивости» . Эволюция . 61 (3): 666–674. дои : 10.1111/j.1558-5646.2007.00064.x . ПМИД 17348929 . S2CID 14353070 .

[13] Островский, Элизабет А.; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2007). «Экологическая специализация и адаптивный распад цифровых организмов». Американский натуралист . 169 (1): E1–20. дои : 10.1086/510211 . JSTOR 10.1086/510211 . ПМИД 17206577 . S2CID 15024491 .

[14] Ленский, Р.Э.; Баррик, Дж. Э.; Офрия, К. (2006). «Баланс между надежностью и возможностью развития» . ПЛОС Биология . 4 (12): е428. doi : 10.1371/journal.pbio.0040428 . ПМК 1750925 . ПМИД 17238277 .

[15] Мишевич, Душан; Офрия, Чарльз; Ленски, Ричард Э. (2005). «Половое размножение меняет генетическую архитектуру цифровых организмов» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 273 (1585): 457–464. дои : 10.1098/rspb.2005.3338 . ПМК 1560214 . ПМИД 16615213 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]