КАФАСП
CAFASP , или «Критическая оценка полностью автоматизированного предсказания структуры», представляет собой крупномасштабный слепой эксперимент по предсказанию структуры белка , в ходе которого изучается производительность веб-серверов автоматического предсказания структуры при моделировании гомологии , распознавании складок и ab initio предсказании третичных структур белков, основываясь только на аминокислотная последовательность . [ 1 ] Эксперимент проводится раз в два года параллельно с CASP , который фокусируется на прогнозах, основанных на человеческом вмешательстве и опыте. [ 2 ] По сравнению с аналогичными методами сравнительного анализа LiveBench и EVA , которые еженедельно запускаются на основе вновь решенных белковых структур, хранящихся в банке данных белков , CAFASP генерирует гораздо меньше данных, но имеет преимущество в том, что дает прогнозы, которые напрямую сопоставимы с прогнозами, сделанными экспертами по предсказаниям людей. В последнее время CAFASP проводился, по сути, интегрированно с результатами CASP, а не как отдельный эксперимент.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фишер, Д.; Баррет, К.; Брайсон, К.; Элофссон, А.; Годзик, А.; Джонс, Д.; Карплюс, К.Дж.; Келли, Луизиана; МакКаллум, Р.М.; Павловский, К.; Рост, Б.; Рыхлевский, Л.; Штернберг, М. (1999). «CAFASP-1: Критическая оценка полностью автоматизированных методов прогнозирования структуры». Белки . Приложение 3: 209–217. doi : 10.1002/(SICI)1097-0134(1999)37:3+<209::AID-PROT27>3.0.CO;2-Y . ПМИД 10526371 .
- ^ Борн, ЧП (2003). «Эксперименты CASP и CAFASP и их результаты». Методы биохимического анализа . 44 : 501–507. ПМИД 12647401 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]  | Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |