LiveBench
LiveBench — это постоянно действующий эталонный проект для оценки качества методов прогнозирования структуры белка и вторичной структуры . LiveBench фокусируется в основном на моделировании гомологии и распределении белков , но также включает в себя прогнозирование вторичной структуры , сравнивая общедоступные выходные данные веб-сервера с вновь депонированными белковыми структурами в банке данных белков . Как и проект EVA , и в отличие от связанных с ним экспериментов CASP и CAFASP , LiveBench предназначен для изучения точности прогнозов, которые могут быть получены неспециалистами-пользователями общедоступных методов прогнозирования. Основным преимуществом LiveBench и EVA перед проектами CASP, которые выполняются раз в два года, является сравнительно большой набор данных.
Ссылки
[ редактировать ]- Буйницкий Дж. М., Элофссон А., Фишер Д., Рыхлевски Л. (2001). LiveBench-1: непрерывное тестирование серверов прогнозирования структуры белков. Protein Sci 10(2):352-61. PMID 11266621
- Рыхлевски Л., Фишер Д. (2005). LiveBench-8: крупномасштабная непрерывная оценка автоматического прогнозирования структуры белка. Белок Sci 14(1):240-5. PMID 15608124