EVA (контрольный показатель)

EVA представлял собой постоянно действующий эталонный проект для оценки качества и ценности методов прогнозирования структуры белка и вторичной структуры . Методы предсказания как вторичной, так и третичной структуры , включая моделирование гомологии , белковые нити и предсказание порядка контактов , сравнивались с результатами вновь решенных белковых структур каждую неделю, хранящихся в Банке данных белков . Целью проекта было определение точности прогнозирования, которую можно было бы ожидать от неопытных пользователей общедоступных веб-серверов прогнозирования ; это похоже на соответствующий проект LiveBench и контрастирует с тестом CASP, проводимым два раза в год , целью которого является определение максимальной точности, достижимой экспертами по прогнозированию.

Ссылки

Рост Б, Эйрих В.А. (2001). EVA: крупномасштабный анализ предсказания вторичной структуры. Белки, Приложение 5:192-9. PMID 11835497
Эйрих В.А., Марти-Реном М.А., Пшибильски Д., Мадхусудхан М.С., Фисер А., Пасос Ф., Валенсия А., Сали А., Рост Б. (2001). EVA: непрерывная автоматическая оценка серверов прогнозирования структуры белков. Биоинформатика 17(12):1242-3. PMID 11751240
Кох И.Ю., Эйрих В.А., Марти-Реном М.А., Пшибильски Д., Мадхусудхан М.С., Эсвар Н., Грана О., Пасос Ф., Валенсия А., Сали А., Рост Б. (2003). EVA: Оценка серверов предсказания структуры белков. Нуклеиновые кислоты Res 31(13):3311-5. ПМИД 12824315