Сергей Миркин

Сергей Миркин
Сергей Миркин
Рожденный	29 сентября 1956 г. ; Москва, Россия
Альма-матер	Московский государственный университет Российской академии наук
Известный	Нестабильность генома
	Научная карьера
Поля	Биология, геномика
Учреждения	Университет Тафтса

Сергей Миркин (родился 29 сентября 1956 г.) — российско-американский биолог, изучающий нестабильность генома , опосредованную повторяющейся ДНК во время репликации и транскрипции ДНК . Он является профессором генетики и молекулярной биологии и возглавляет кафедру биологии семьи Белых в Университете Тафтса .

Ранняя жизнь и образование

Миркин родился в Москве, Россия . Он учился в Московском государственном университете , где в 1978 году получил степень бакалавра наук и магистра наук в области генетики. Миркин продолжил работу над докторской степенью по молекулярной биологии в Российской академии наук Институте молекулярной генетики . Его докторская степень была под руководством Романа Б. Хесина, молекулярного биолога, и Миркин позже описал годы своего становления в лаборатории Хесина в своем эссе «Думая о Р.Б. Хесине». ^{[ 1 ]} Изучая условно летальные мутанты ДНК-гиразы , он установил фундаментальную взаимосвязь между суперспирализацией ДНК и транскрипцией в E. coli.

Карьера и исследования

Постдокторантуру Миркин вел в Институте молекулярной генетики у биофизика Максима Франк-Каменецкого. Эта работа завершилась открытием трехцепочечной структуры H-ДНК . ^{[ 2 ]} Миркин переехал в США в качестве международного научного сотрудника Фогарти в 1989 году и поступил на факультет генетики Иллинойского университета в Чикаго (UIC) в 1990 году. ^{[ 3 ]} Проработал в МСЖД до 2006 года, дослужившись до звания профессора биохимии и молекулярной генетики. В 2007 году он поступил на работу в Университет Тафтса в качестве профессора на кафедру биологии семьи Уайт.

Основные вклады Миркина в науку включают открытие первой многоцепочечной структуры ДНК ( H-ДНК ); обнаружение динамических структур ДНК, отличных от B, включая крестоформы и триплексы ДНК in vivo; открытие того, что репликация тринуклеотидных повторов нарушена из-за их необычной структуры. ^{[ 4 ]} что приводит к нарушению тринуклеотидных повторов и распутывает механизмы и последствия столкновений транскрипции и репликации in vivo. ^{[ 5 ]} ^{[ 6 ]}

The «Миркин Лаборатория» . продолжает изучать структуру и функцию генома с двух точек зрения: механизмы, ответственные за нестабильность повторов ДНК, вовлеченных в болезни человека, роль столкновений транскрипции-репликации в нестабильности генома и механизмы нестабильности генома, опосредованные интерстициальными теломерными последовательностями .

Избранные публикации

Mirkin, S. M.; Lyamichev, V. I.; Drushlyak, K. N.; Dobrynin, V. N.; Filippov, S. A.; Frank-Kamenetskii, M. D. (December 1987). "DNA H form requires a homopurine–homopyrimidine mirror repeat". Nature . 330 (6147): 495–497. Bibcode : 1987Natur.330..495M . doi : 10.1038/330495a0 . PMID 2825028 . S2CID 4360764 .
Самадашвили, генеральный менеджер; Дайен, А.; Миркин С.М. (декабрь 1993 г.). «Суицидальные нуклеотидные последовательности для полимеризации ДНК» . Журнал ЭМБО . 12 (13): 4975–4983. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb06191.x . ПМК 413758 . ПМИД 8262040 .
Кокс, Рэндал; Миркин, Сергей М. (13 мая 1997 г.). «Характерное обогащение повторов ДНК в разных геномах» . Труды Национальной академии наук . 94 (10): 5237–5242. Бибкод : 1997PNAS...94.5237C . дои : 10.1073/pnas.94.10.5237 . ПМК 24662 . ПМИД 7574496 .
Самадашвили, Джордж М.; Рака, Гордана; Миркин, Сергей М. (ноябрь 1997 г.). «Тринуклеотидные повторы влияют на репликацию ДНК in vivo». Природная генетика . 17 (3): 298–304. дои : 10.1038/ng1197-298 . ПМИД 9354793 . S2CID 6341978 .
Красильникова, М.М. (1 сентября 1998 г.). «Транскрипция через простой повтор ДНК блокирует удлинение репликации» . Журнал ЭМБО . 17 (17): 5095–5102. дои : 10.1093/emboj/17.17.5095 . ПМК 1170837 . ПМИД 9724645 .
Красильникова Мария Михайловна; Миркин, Сергей М. (1 марта 2004 г.). «Остановка репликации при атаксии Фридрейха (ГАА) n повторяется in vivo» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (6): 2286–2295. дои : 10.1128/MCB.24.6.2286-2295.2004 . ПМК 355872 . ПМИД 14993268 .
Миркин Екатерина Владимировна; Миркин, Сергей М. (1 февраля 2005 г.). «Механизмы столкновений транскрипции-репликации у бактерий» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (3): 888–895. дои : 10.1128/MCB.25.3.888-895.2005 . ПМК 544003 . ПМИД 15657418 .
Миркин Екатерина Владимировна; Миркин, Сергей М. (март 2007 г.). «Остановка репликационной вилки при естественных препятствиях» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 71 (1): 13–35. дои : 10.1128/MMBR.00030-06 . ПМЦ 1847372 . ПМИД 17347517 .
Миркин, Сергей М. (июнь 2007 г.). «Расширяемые повторы ДНК и болезни человека». Природа . 447 (7147): 932–940. Бибкод : 2007Natur.447..932M . дои : 10.1038/nature05977 . ПМИД 17581576 . S2CID 4397592 .
Войнеагу, Ирина; Нараянан, Видхья; Лобачев Кирилл С.; Миркин, Сергей М. (22 июля 2008 г.). «Остановка репликации при нестабильных инвертированных повторах: взаимодействие между шпильками ДНК и белками, стабилизирующими вилку» . Труды Национальной академии наук . 105 (29): 9936–9941. Бибкод : 2008PNAS..105.9936V . дои : 10.1073/pnas.0804510105 . ПМЦ 2481305 . ПМИД 18632578 .
Войнеагу, Ирина; Сурка, Кристина Ф.; Шишкин, Александр А.; Красильникова Мария Михайловна; Миркин, Сергей М. (февраль 2009 г.). «Задержка и стабилизация реплисомы на повторах CGG, которые ответственны за хрупкость хромосом» . Структурная и молекулярная биология природы . 16 (2): 226–228. дои : 10.1038/nsmb.1527 . ПМК 2837601 . ПМИД 19136957 .
Шишкин, Александр А.; Войнеагу, Ирина; Матера, Роберт; Чернг, Николь; Чернет, Брук Т.; Красильникова Мария Михайловна; Нараянан, Видхья; Лобачев Кирилл С.; Миркин, Сергей М. (июль 2009 г.). «Крупномасштабное расширение повторов атаксии GAA Фридрейха в дрожжах» . Молекулярная клетка . 35 (1): 82–92. doi : 10.1016/j.molcel.2009.06.017 . ПМК 2722067 . ПМИД 19595718 .
Шах, Картик А.; Шишкин, Александр А.; Войнеагу, Ирина; Павлов Юрий И.; Щербакова Полина Владимировна; Миркин, Сергей М. (ноябрь 2012 г.). «Роль ДНК-полимераз в повторяющейся нестабильности генома» . Отчеты по ячейкам . 2 (5): 1088–1095. дои : 10.1016/j.celrep.2012.10.006 . ПМЦ 3513503 . ПМИД 23142667 .
Аксенова Анна Юрьевна; Гринвелл, Патрисия В.; Доминска, Маргарет; Шишкин, Александр А.; Ким, Джейн С.; Питс, Томас Д.; Миркин, Сергей М. (3 декабря 2013 г.). «Перестройки генома, вызванные интерстициальными теломерными последовательностями у дрожжей» . Труды Национальной академии наук . 110 (49): 19866–19871. Бибкод : 2013PNAS..11019866A . дои : 10.1073/pnas.1319313110 . ПМЦ 3856781 . ПМИД 24191060 .
Ким, Джейн С; Харрис, Саманта Т; Динтер, Тереза; Шах, Картик А; Миркин, Сергей М (январь 2017 г.). «Роль репликации, индуцированной разрывом, в крупномасштабном расширении повторов (CAG) n / (CTG) n» . Структурная и молекулярная биология природы . 24 (1): 55–60. дои : 10.1038/nsmb.3334 . ПМК 5215974 . ПМИД 27918542 .
Нил, Александр Дж; Лян, Миранда У; Христич, Александра Н; Шах, Картик А; Миркин, Сергей М (20 апреля 2018 г.). «Гибриды РНК-ДНК способствуют расширению повторов атаксии Фридрейха (GAA)n посредством репликации, индуцированной разрывом» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (7): 3487–3497. дои : 10.1093/nar/gky099 . ПМК 5909440 . ПМИД 29447396 .
Кононенко Артем Владимирович; Эберсол, Томас; Васкес, Карен М.; Миркин, Сергей М. (август 2018 г.). «Механизмы генетической нестабильности, вызванные повторами (CGG) n в экспериментальной системе млекопитающих» . Структурная и молекулярная биология природы . 25 (8): 669–676. дои : 10.1038/s41594-018-0094-9 . ПМК 6082162 . ПМИД 30061600 .
Христич, Александра Н.; Армения, Джиллиан Ф.; Матера, Роберт М.; Колчинский, Анна А.; Миркин, Сергей М. (21 января 2020 г.). «Крупномасштабные сокращения повторов GAA атаксии Фридрейха у дрожжей происходят во время репликации ДНК из-за их способности образовывать триплекс» . Труды Национальной академии наук . 117 (3): 1628–1637. Бибкод : 2020PNAS..117.1628K . дои : 10.1073/pnas.1913416117 . ПМК 6983365 . ПМИД 31911468 .
Христич, Александра Н.; Миркин, Сергей М. (март 2020 г.). «На неправильном пути ДНК: Молекулярные механизмы повторяющейся нестабильности генома» . Журнал биологической химии . 295 (13): 4134–4170. дои : 10.1074/jbc.REV119.007678 . ПМЦ 7105313 . ПМИД 32060097 .
Нил, Александр Дж.; Хайси, Джулия А.; Квасем, Иштиак; МакГинти, Райан Дж.; Хитченко, Марцин; Христич, Александра Н.; Миркин, Сергей М. (2 февраля 2021 г.). «Независимая от репликации нестабильность повторов GAA атаксии Фридрейха во время хронологического старения» . Труды Национальной академии наук . 118 (5). Бибкод : 2021PNAS..11813080N . дои : 10.1073/pnas.2013080118 . ПМЦ 7865128 . ПМИД 33495349 .
Матос-Родригес, Габриэль; ван Витмаршен, Ник; Ву, Вэй; Трипати, Вину; Кусса, Наташа К.; Павани, Рафаэль; Натан, Уильям Дж.; Каллен, Эльза; Белинки, Фрида; Мохаммед, Ашраф; Напиерала, Марек; Усдин, Карен; Ансари, Асим З.; Миркин Сергей М.; Нусенцвейг, Эндрю (октябрь 2022 г.). «S1-END-seq выявляет вторичные структуры ДНК в клетках человека» . Молекулярная клетка . 82 (19):3538–3552.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2022.08.007 . ПМЦ 9547894 . ПМИД 36075220 .
Растокина А; Себриан, Дж; Мозафари, Н; Мандель, Нью-Хэмпшир; Смит, CIE; Лопес, М; Зейн, Р; Миркин, С.М. (8 сентября 2023 г.). «Крупномасштабное расширение повторов атаксии Фридрейха GAA • TTC в экспериментальной человеческой системе: роль репликации ДНК и предотвращения с помощью олигонуклеотидов LNA-ДНК и олигомеров PNA» . Исследования нуклеиновых кислот . 51 (16): 8532–8549. дои : 10.1093/nar/gkad441 . ПМЦ 10484681 . ПМИД 37216608 .
Матос-Родригес, Г; Хайси, Дж.А.; Нусенцвейг, А; Миркин С.М. (19 октября 2023 г.). «Обнаружение альтернативных структур ДНК и его значение для болезней человека». Молекулярная клетка . 83 (20): 3622–3641. doi : 10.1016/j.molcel.2023.08.018 . ПМИД 37863029 .
Хайси, Дж.А.; Радченко Е.А.; Мандель, Нью-Хэмпшир; МакГинти, Р.Дж.; Матос-Родригес, Г; Растокина А; Масново, С; Чески, С; Эрнандес, А; Нусенцвейг, А; Миркин С.М. (21 февраля 2024 г.). «Патогенный CANVAS (AAGGG)n повторяет срыв репликации ДНК из-за образования альтернативных структур ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . дои : 10.1093/nar/gkae124 . ПМК 11077069 . ПМИД 38381906 .

Награды и почести

Главный редактор журнала «Современные мнения в области генетики и развития», 2010–2013 гг.
Премия выдающемуся старшему учёному, Университет Тафтса, 2020 г.

Ссылки

^ Миркин, С.М. (2002). «Думая о Р.Б. Хесине». Молекулярная биология . 36 (2): 267–279. дои : 10.1023/A:1015334325856 . S2CID 1820228 . ПроКвест 760104752 . ^{[ нужен неосновной источник ]}
^ Сойфер, Валерий Н.; Потаман, Владимир Н. (1996). Трехспиральные нуклеиновые кислоты . дои : 10.1007/978-1-4612-3972-7 . ISBN 978-1-4612-8454-3 . S2CID 2354265 .
^ Лейн, Эрл (декабрь 1991 г.). «Советская наука отправляется в путь» . Газеты.com . Новостной день.
^ «Ересь Хеликса» . Новый учёный .
^ Кацнельсон, Алла (5 июня 2006 г.). «Геномная пунктуация». Журнал клеточной биологии . 173 (5): 643а. дои : 10.1083/jcb.1735rr3 .
^ «Генетика: выбоины ДНК». Природа . 454 (7203): 371–371. 24 июля 2008 г. doi : 10.1038/454371f .

[1] Миркин, С.М. (2002). «Думая о Р.Б. Хесине». Молекулярная биология . 36 (2): 267–279. дои : 10.1023/A:1015334325856 . S2CID 1820228 . ПроКвест 760104752 . ^{[ нужен неосновной источник ]}

[2] Сойфер, Валерий Н.; Потаман, Владимир Н. (1996). Трехспиральные нуклеиновые кислоты . дои : 10.1007/978-1-4612-3972-7 . ISBN 978-1-4612-8454-3 . S2CID 2354265 .

[3] Лейн, Эрл (декабрь 1991 г.). «Советская наука отправляется в путь» . Газеты.com . Новостной день.

[4] «Ересь Хеликса» . Новый учёный .

[5] Кацнельсон, Алла (5 июня 2006 г.). «Геномная пунктуация». Журнал клеточной биологии . 173 (5): 643а. дои : 10.1083/jcb.1735rr3 .

[6] «Генетика: выбоины ДНК». Природа . 454 (7203): 371–371. 24 июля 2008 г. doi : 10.1038/454371f .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]