База данных конформационного разнообразия белков

ПКБД
Содержание
Описание	Конформационное разнообразие белков.
Контакт
Исследовательский центр	Национальный университет Кильмеса
Лаборатория	Учебно-исследовательский центр
Авторы	Эсекьель I Юриц
Первичное цитирование	Юриц и др. (2011)
Дата выпуска	2010
Доступ
Веб-сайт	http://www.pcdb.unq.edu.ar

База данных конформационного разнообразия белков ( PCDB ) представляет собой базу данных разнообразия третичных структур белков внутри белковых доменов , определенных методом рентгеновской кристаллографии . ^[1]^[2] Белки по своей природе гибки , и эта база данных собирает информацию по этому вопросу для использования в молекулярных исследованиях. Он использует базу данных CATH в качестве источника структур для каждого белка и сообщает о диапазоне различий в структурах на основе их суперпозиции, а также сообщает максимальное RMSD . Интерфейс базы данных позволяет исследователям находить белки с различной конформационной гибкостью, что позволяет им, например, находить очень гибкие белки. База данных управляется и поддерживается группой исследователей из Национального университета Кильмеса в Аргентине. ^{[ нужна ссылка ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Юриц Э.И., Альберти С.Ф., Паризи Г.Д. (январь 2011 г.). «PCDB: база данных конформационного разнообразия белков» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных): D475–9. дои : 10.1093/nar/gkq1181 . ПМК 3013735 . ПМИД 21097895 .
^ Гальперин М.Ю., Кокрейн Г.Р. (январь 2011 г.). «Выпуск базы данных исследований нуклеиновых кислот 2011 года и онлайн-коллекция баз данных по молекулярной биологии» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных): D1–6. дои : 10.1093/nar/gkq1243 . ПМК 3013748 . ПМИД 21177655 .

Внешние ссылки

Юриц, Эсекьель Иван; Фернандес Альберти, Себастьян; Паризи, Густаво Дани. «База данных конформаций белков» . Группа структурной биоинформатики; Национальный университет Кильмеса. Архивировано из оригинала 30 марта 2012 г. Проверено 19 августа 2011 г.

Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid21097895-1] Jump up to: ^а ^б Юриц Э.И., Альберти С.Ф., Паризи Г.Д. (январь 2011 г.). «PCDB: база данных конформационного разнообразия белков» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных): D475–9. дои : 10.1093/nar/gkq1181 . ПМК 3013735 . ПМИД 21097895 .

[pmid21177655-2] Гальперин М.Ю., Кокрейн Г.Р. (январь 2011 г.). «Выпуск базы данных исследований нуклеиновых кислот 2011 года и онлайн-коллекция баз данных по молекулярной биологии» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных): D1–6. дои : 10.1093/nar/gkq1243 . ПМК 3013748 . ПМИД 21177655 .

[1]

[2]