Желтый флуоресцентный белок

Желтый флуоресцентный белок ( YFP ) представляет собой генетический мутант зеленого флуоресцентного белка (GFP), первоначально полученного из медузы Aequorea victoria . ^[1] Его пик возбуждения составляет 513 нм, а пик эмиссии — 527 нм. ^[2] Как и родительский GFP, YFP является полезным инструментом в клеточной и молекулярной биологии , поскольку пики возбуждения и эмиссии YFP отличаются от GFP, что позволяет изучать несколько процессов/белков в рамках одного и того же эксперимента.

Три улучшенные версии YFP — это Citrine, Venus и Ypet. Они имеют пониженную чувствительность к хлоридам, более быстрое созревание и повышенную яркость (определяемую как произведение коэффициента экстинкции и квантового выхода ). Обычно YFP служит акцептором для генетически закодированных сенсоров FRET , из которых наиболее вероятным донором FP является мономерный голубой флуоресцентный белок (mCFP). Красное смещение относительно GFP вызвано стэкинг-взаимодействием Pi-Pi в результате замены T203Y, внесенной мутацией, которая существенно увеличивает поляризуемость локального окружения хромофора , а также обеспечивает дополнительную электронную плотность в хромофоре.

«Венера» содержит новую аминокислотную замену – F46L–, которая ускоряет окисление хромофора при 37 ° C, стадии, лимитирующей скорость созревания. В белке есть и другие замены (F64L/M153T/V163A/S175G), позволяющие Венере хорошо сворачиваться и придающие ей относительную толерантность к ацидозу и Cl. ⁻. ^[3]

Эволюция YFP от GFP

Для создания мутанта YFP потребовались четыре белковые мутации GFP дикого типа, обнаруженные у медузы Aequorea Victoria. Наиболее важной мутацией была замена треонина на тирозин в положении остатка 203. ^[1] (замена обозначена T203Y, где T и Y представляют собой однобуквенный код аминокислот треонина и тирозина соответственно).

См. также

Красный флуоресцентный белок

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Ормо, Матс; Кубитт, Эндрю Б.; Каллио, Карен; Гросс, Ларри А.; Цянь, Роджер Ю.; Ремингтон, С. Джеймс (6 сентября 1996 г.). «Кристаллическая структура зеленого флуоресцентного белка Aequorea victoria» . Наука . 273 (5280): 1392–1395. Бибкод : 1996Sci...273.1392O . дои : 10.1126/science.273.5280.1392 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 8703075 .
^ Ламберт, Тэлли. «EYFP в FPbase» . ФПбаза . Проверено 22 февраля 2021 г.
^ Нагай, Т; Ибата, К; Парк, ES; Кубота, М; Микошиба, К; Мияваки, А (2002). «Вариант желтого флуоресцентного белка с быстрым и эффективным созреванием для клеточно-биологических применений». Природная биотехнология . 20 (1): 87–90. дои : 10.1038/nbt0102-87 . ПМИД 11753368 .

Внешние ссылки

Знакомство с флуоресцентными белками
EYFP на FPbase
Мияваки, Ацуши; Ллопис, Хуан; Хейм, Роджер; Маккаффери, Дж. Майкл; Адамс, Джозеф А.; Икура, Мицухико; Цянь, Роджер Ю. (1997). «Флуоресцентные индикаторы Ca2+ на основе зеленых флуоресцентных белков и кальмодулина» . Природа . 388 (6645): 882–7. дои : 10.1038/42264 . ПМИД 9278050 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[:0-1] Jump up to: ^а ^б Ормо, Матс; Кубитт, Эндрю Б.; Каллио, Карен; Гросс, Ларри А.; Цянь, Роджер Ю.; Ремингтон, С. Джеймс (6 сентября 1996 г.). «Кристаллическая структура зеленого флуоресцентного белка Aequorea victoria» . Наука . 273 (5280): 1392–1395. Бибкод : 1996Sci...273.1392O . дои : 10.1126/science.273.5280.1392 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 8703075 .

[2] Ламберт, Тэлли. «EYFP в FPbase» . ФПбаза . Проверено 22 февраля 2021 г.

[3] Нагай, Т; Ибата, К; Парк, ES; Кубота, М; Микошиба, К; Мияваки, А (2002). «Вариант желтого флуоресцентного белка с быстрым и эффективным созреванием для клеточно-биологических применений». Природная биотехнология . 20 (1): 87–90. дои : 10.1038/nbt0102-87 . ПМИД 11753368 .

[1]

[2]

[3]