Джошуа Шаевитц
![]() | в этой статье Использование внешних ссылок может не соответствовать политике и рекомендациям Википедии . ( Октябрь 2020 г. ) |
Джошуа Уильям Шаевитц | |
---|---|
![]() Джошуа Уильям Шаевитц в Принстоне в 2019 году. | |
Рожденный | Лос-Анджелес, Калифорния | 6 ноября 1977 г.
Национальность | Американский |
Альма-матер | Колумбийский университет Стэнфордский университет |
Научная карьера | |
Учреждения | Калифорнийский университет, Беркли Принстонский университет |
Докторантура | Стивен Блок |
Веб-сайт | shaevitzlab.princeton.edu |
Джошуа Шаевиц (1977 г.р.) — американский биофизик и профессор физики Института Льюиса-Сиглера Принстонского университета в Принстоне, штат Нью-Джерси . [ 1 ] Он известен своими работами в области биофизики одиночных молекул, роста и подвижности бактерий, а также поведения животных. [ 2 ]
Образование и ранняя карьера
[ редактировать ]Шаевиц получил степень бакалавра физики в Колумбийском университете в Нью-Йорке в 1999 году, где он был стипендиатом II Раби . Он получил докторскую степень в 2004 году в Стэнфордском университете , где изучал молекулярные моторы кинезина. [ 3 ] и РНК-полимераза [ 4 ] [ 5 ] использование оптического пинцета в группе Стивена Блока . Затем Шаевиц перешел в Калифорнийский университет в Беркли в качестве научного сотрудника Миллера . Там он сосредоточился на подвижности бактерий, в том числе на актиновых Rickettsia rickettsii . [ 6 ] Миксококк ксантус [ 7 ] и бесстеночная спироплазма . [ 8 ] С 2007 года Шаевиц работает на факультете Принстонского университета , занимая должности на кафедре физики и в Институте интегративной геномики Льюиса-Сиглера , где имеет звание профессора.
Исследовать
[ редактировать ]Работа Шаевица сосредоточена на прецизионных измерениях в различных биологических системах, уделяя особое внимание темам, связанным с формой клеток бактерий, формированием активного вещества и структур в группах движущихся клеток, а также количественной оценкой поведения животных.
Его группа впервые применила трехмерную визуализацию живых клеток для изучения формы бактерий во время роста. В серии статей Шаевитц и его коллеги раскрыли, как механизм внедрения клеточной стенки со спиральной координацией может производить клетки правильной формы как в виде палочек, так и в виде спиральных клеток. [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Его группа также изучает механику бактериальных клеток, в том числе жесткость при изгибе, [ 13 ] тургорное давление и жесткость клеточной стенки, [ 14 ] и регулирование давления. [ 15 ] [ 16 ]
Шаевиц также работал над механизмами скользящей подвижности и коллективного поведения социальной бактерии Myxococcus xanthus . Эта работа включает измерение механохимии отдельных скользящих двигателей внутри живых бактерий. [ 17 ] [ 18 ] и связь между фазовыми переходами активной материи и формированием эволюционно выгодных плодовых тел. [ 19 ] [ 20 ]
Третье направление исследований Шаевица связано с количественной оценкой поведения животных с использованием контролируемых и неконтролируемых алгоритмов машинного обучения. Шаевитц и профессор нейробиологии Принстона Мала Мурти опубликовали автоматизированную систему (LEAP) для измерения поз животных на основе больших наборов данных из фильмов. [ 21 ] Недавно это было распространено на данные о нескольких животных в пакете под названием SLEAP . [ 22 ] Его работа расширилась до понимания динамики поведения животных с помощью методов неконтролируемой кластеризации в сотрудничестве с коллегой из Принстона по физике Уильямом Биалеком и другими. [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ]
Научная деятельность
[ редактировать ]- Аспенский центр физики , генеральный член, 2019 – настоящее время
- Содиректор, Пограничный центр физики биологических функций NSF, 2017 – настоящее время
- Physical Review Letters , 2017–2023 гг. Помощник редактора отдела
- Отборочный комитет премии за развитие карьеры программы Human Frontier Science , 2017–2019 гг.
- Американского физического общества (DBIO), 2013–2016 гг. Член Отдела биологической физики
- Американского физического общества (2024 г.) Председатель исполнительного комитета Отдела биологической физики (DBIO) [ 27 ] [ 28 ]
- программы Pew Scholars , 2013–2019 гг. Комиссия по рассмотрению номинаций выпускников
Награды и почести
[ редактировать ]- Избран членом Американского физического общества за «фундаментальный вклад в понимание механики и динамики биологических систем, от отдельных молекул до клеточных коллективов и поведения животных, посредством разработки новых методов точных измерений», 2019 г. [ 29 ]
- Президентская премия за раннюю карьеру для ученых и инженеров (PECASE), 2009 г. [ 30 ]
- Ученый Pew в области биомедицинских наук, 2009 г. [ 31 ]
- Исследовательская стипендия Слоана , 2008 г. [ 32 ]
- Института фундаментальных исследований Миллера , 2004–2007 гг. Докторантура
- Премия физического факультета Альфреда Морица Михаэлиса, Колумбийский университет, 1999 г.
- II стипендия Раби, Колумбийский университет , 1995–1999 гг.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Джошуа Шаевитц | Факультет физики» . phy.princeton.edu . Проверено 15 октября 2020 г.
- ^ «Лаборатория Шаевица в Принстоне | Экспериментальная биофизика от молекул к клеткам и животным» . shaevitzlab.princeton.edu . Проверено 15 октября 2020 г.
- ^ Блок, Стивен М.; Эсбери, Чарльз Л.; Шаевитц, Джошуа В.; Ланг, Мэтью Дж. (4 марта 2003 г.). «Изучение цикла реакции кинезина с помощью двухмерного оптического силового зажима» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (5): 2351–2356. Бибкод : 2003PNAS..100.2351B . дои : 10.1073/pnas.0436709100 . ISSN 0027-8424 . ПМК 151344 . ПМИД 12591957 .
- ^ Шаевитц, Джошуа В.; Аббонданциери, Элио А.; Ландик, Роберт; Блок, Стивен М. (11 декабря 2003 г.). «Обратное отслеживание одиночных молекул РНК-полимеразы, наблюдаемое с разрешением, близким к паре оснований» . Природа . 426 (6967): 684–687. Бибкод : 2003Natur.426..684S . дои : 10.1038/nature02191 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 1483218 . ПМИД 14634670 .
- ^ Аббонданциери, Элио А.; Гринлиф, Уильям Дж.; Шаевитц, Джошуа В.; Ландик, Роберт; Блок, Стивен М. (24 ноября 2005 г.). «Прямое наблюдение шагания пары оснований с помощью РНК-полимеразы» . Природа . 438 (7067): 460–465. Бибкод : 2005Natur.438..460A . дои : 10.1038/nature04268 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 1356566 . ПМИД 16284617 .
- ^ Шаевитц, Джошуа В.; Флетчер, Дэниел А. (02 октября 2007 г.). «Колебания нагрузки стимулируют рост актиновой сети» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (40): 15688–15692. arXiv : 0708.1791 . Бибкод : 2007PNAS..10415688S . дои : 10.1073/pnas.0702601104 . ISSN 0027-8424 . ПМК 2000411 . ПМИД 17895390 .
- ^ Миньо, Тэм; Шаевитц, Джошуа В.; Хартцелл, Патрисия Л.; Зусман, Дэвид Р. (9 февраля 2007 г.). «Доказательства того, что комплексы фокальной адгезии обеспечивают скользящую подвижность бактерий» . Наука . 315 (5813): 853–856. Бибкод : 2007Sci...315..853M . дои : 10.1126/science.1137223 . ISSN 1095-9203 . ПМК 4095873 . ПМИД 17289998 .
- ^ Шаевитц, Джошуа В.; Ли, Джоанна Ю.; Флетчер, Дэниел А. (23 сентября 2005 г.). «Спироплазмы плавают за счет процессивного изменения спиральности тела» . Клетка . 122 (6): 941–945. дои : 10.1016/j.cell.2005.07.004 . ISSN 0092-8674 . ПМИД 16179261 . S2CID 5070808 .
- ^ ван Теффелен, Свен; Ван, Сиюань; Ферхтготт, Леон; Хуанг, Кервин Кейси; Уингрин, Нед С.; Шаевитц, Джошуа В.; Гитай, Земер (20 сентября 2011 г.). «Бактериальный актин MreB вращается, а вращение зависит от сборки клеточной стенки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (38): 15822–15827. Бибкод : 2011PNAS..10815822V . дои : 10.1073/pnas.1108999108 . ISSN 1091-6490 . ПМК 3179079 . ПМИД 21903929 .
- ^ Ван, Сиюань; Ферхтготт, Леон; Хуанг, Кервин Кейси; Шаевиц, Джошуа В. (6 марта 2012 г.). «Спиральная вставка пептидогликана приводит к хиральному упорядочению бактериальной клеточной стенки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (10): E595–604. дои : 10.1073/pnas.1117132109 . ISSN 1091-6490 . ПМК 3309786 . ПМИД 22343529 .
- ^ Бартлетт, Томас М.; Браттон, Бенджамин П.; Дувшани, Амит; Мигель, Аманда; Шэн, Инь; Мартин, Николас Р.; Нгуен, Джеффри П.; Персат, Александр; Демарэ, Саманта М.; ВанНьевензе, Майкл С.; Хуанг, Кервин Кейси (12 января 2017 г.). «Периплазматический полимер изменяет холерный вибрион и способствует патогенезу» . Клетка . 168 (1–2): 172–185.e15. дои : 10.1016/j.cell.2016.12.019 . ISSN 1097-4172 . ПМК 5287421 . ПМИД 28086090 .
- ^ Тейлор, Дженнифер А.; Браттон, Бенджамин П.; Сичел, Софи Р.; Блэр, Крис М.; Джейкобс, Холли М.; ДеМистер, Кристен Э.; Куру, Эркин; Грей, Джо; Бибой, Джейкоб; ВанНьевенце, Майкл С.; Фоллмер, Вальдемар (9 января 2020 г.). «Различные белки цитоскелета определяют зоны усиленного синтеза клеточной стенки у Helicobacter pylori» . электронная жизнь . 9 . дои : 10.7554/eLife.52482 . ISSN 2050-084X . ПМК 7012605 . ПМИД 31916938 .
- ^ Ван, Сиюань; Арельяно-Сантойо, Хьюго; Комбс, Питер А.; Шаевиц, Джошуа В. (18 мая 2010 г.). «Актин-подобные нити цитоскелета участвуют в клеточной механике бактерий» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (20): 9182–9185. Бибкод : 2010PNAS..107.9182W . дои : 10.1073/pnas.0911517107 . ISSN 1091-6490 . ПМК 2889055 . ПМИД 20439764 .
- ^ Дэн, Йи; Сунь, Минчжай; Шаевиц, Джошуа В. (07 октября 2011 г.). «Прямое измерение напряжения клеточной стенки и тургорного давления в живых бактериальных клетках» . Письма о физических отзывах . 107 (15): 158101. arXiv : 1104.1421 . Бибкод : 2011PhRvL.107o8101D . doi : 10.1103/PhysRevLett.107.158101 . ISSN 1079-7114 . ПМИД 22107320 . S2CID 15880029 .
- ^ Пилизота, Теута; Шаевиц, Джошуа В. (18 июня 2013 г.). «Плазмолиз и форма клеток зависят от проницаемости внешней мембраны растворенных веществ во время гиперосмотического шока у E. coli» . Биофизический журнал . 104 (12): 2733–2742. Бибкод : 2013BpJ...104.2733P . дои : 10.1016/j.bpj.2013.05.011 . ISSN 1542-0086 . ПМЦ 3686340 . ПМИД 23790382 .
- ^ Пилизота, Теута; Шаевиц, Джошуа В. (21 октября 2014 г.). «Происхождение скорости роста Escherichia coli и изменения формы клеток при высокой внешней осмоляльности» . Биофизический журнал . 107 (8): 1962–1969. Бибкод : 2014BpJ...107.1962P . дои : 10.1016/j.bpj.2014.08.025 . ISSN 1542-0086 . ПМК 4213672 . ПМИД 25418177 .
- ^ Сунь, Минчжай; Вартель, Морган; Каскалес, Эрик; Шаевитц, Джошуа В.; Миньо, Тэм (3 мая 2011 г.). «Моторный внутриклеточный транспорт обеспечивает скользящую подвижность бактерий» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (18): 7559–7564. дои : 10.1073/pnas.1101101108 . ISSN 1091-6490 . ПМК 3088616 . ПМИД 21482768 .
- ^ Балагам, Раджеш; Литвин, Дуглас Б.; Червинский, Фабиан; Сунь, Минчжай; Каплан, Хайди Б.; Шаевитц, Джошуа В.; Игошин, Олег А. (май 2014 г.). «Скользящие двигатели Myxococcus xanthus эластично связаны с подложкой, как это предсказывает модель фокальной адгезии скользящей подвижности» . PLOS Вычислительная биология . 10 (5): e1003619. arXiv : 1401.3220 . Бибкод : 2014PLSCB..10E3619B . дои : 10.1371/journal.pcbi.1003619 . ISSN 1553-7358 . ПМК 4014417 . ПМИД 24810164 .
- ^ Тутупалли, Шаши; Сунь, Минчжай; Буняк, Филиз; Паланиаппан, Каннаппан; Шаевиц, Джошуа В. (6 августа 2015 г.). «Изменение направления позволяет клеткам Myxococcus xanthus производить коллективные одномерные потоки во время формирования плодового тела» . Журнал Королевского общества, Интерфейс . 12 (109): 20150049. doi : 10.1098/rsif.2015.0049 . ISSN 1742-5662 . ПМЦ 4535398 . ПМИД 26246416 .
- ^ Лю, Гуаннань; Патч, Адам; Бахар, Фатмагюль; Илланес, Дэвид; Уэлч, Рой Д.; Маркетти, М. Кристина; Тутупалли, Шаши; Шаевиц, Джошуа В. (21 июня 2019 г.). «Самостоятельные фазовые переходы стимулируют образование плодовых тел Myxococcus xanthus» . Письма о физических отзывах . 122 (24): 248102. arXiv : 1709.06012 . Бибкод : 2019PhRvL.122x8102L . doi : 10.1103/PhysRevLett.122.248102 . ISSN 1079-7114 . ПМИД 31322369 . S2CID 38823898 .
- ^ Перейра, Тальмо Д.; Альдарондо, Диего Э.; Уиллмор, Линдси; Кислин Михаил; Ван, Сэмюэл С.-Х.; Мурти, Мала; Шаевиц, Джошуа В. (январь 2019 г.). «Быстрая оценка позы животных с использованием глубоких нейронных сетей» . Природные методы . 16 (1): 117–125. дои : 10.1038/s41592-018-0234-5 . ISSN 1548-7105 . ПМК 6899221 . ПМИД 30573820 .
- ^ Перейра, Тальмо Д.; Табрис, Натаниэль; Ли, Джуньюй; Равиндранат, Шрути; Пападояннис, Элени С.; Ван, З. Ян; Тернер, Дэвид М.; Маккензи-Смит, Грейс; Кохер, Сара Д.; Фолкнер, Аннегрет Л.; Шаевитц, Джошуа В. (2 сентября 2020 г.). «SLEAP: отслеживание поз нескольких животных» . bioRxiv : 2020.08.31.276246. дои : 10.1101/2020.08.31.276246 . S2CID 221510569 .
- ^ Берман, Гордон Дж.; Чой, Дэниел М.; Бялек, Уильям; Шаевиц, Джошуа В. (6 октября 2014 г.). «Картирование стереотипного поведения свободно перемещающихся плодовых мушек» . Журнал Королевского общества, Интерфейс . 11 (99). дои : 10.1098/rsif.2014.0672 . ISSN 1742-5662 . ПМЦ 4233753 . ПМИД 25142523 .
- ^ Берман, Гордон Дж.; Бялек, Уильям; Шаевиц, Джошуа В. (18 октября 2016 г.). «Предсказуемость и иерархия в поведении дрозофилы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (42): 11943–11948. arXiv : 1605.03626 . Бибкод : 2016PNAS..11311943B . дои : 10.1073/pnas.1607601113 . ISSN 1091-6490 . ПМК 5081631 . ПМИД 27702892 .
- ^ Клибайте, Угне; Берман, Гордон Дж.; Канде, Джессика; Стерн, Дэвид Л.; Шаевиц, Джошуа В. (16 февраля 2017 г.). «Неконтролируемый метод количественной оценки поведения парных животных» . Физическая биология . 14 (1): 015006. arXiv : 1609.09345 . Бибкод : 2017PhBio..14a5006K . дои : 10.1088/1478-3975/aa5c50 . ISSN 1478-3975 . ПМК 5414632 . ПМИД 28140374 .
- ^ Канде, Джессика; Намики, Сигэхиро; Цю, Джируй; Корфф, Вятт; Кард, Гвинет М.; Шаевитц, Джошуа В.; Стерн, Дэвид Л.; Берман, Гордон Дж. (26 июня 2018 г.). «Оптогенетическое исследование нисходящего поведенческого контроля у дрозофилы» . электронная жизнь . 7 . дои : 10.7554/eLife.34275 . ISSN 2050-084X . ПМК 6031430 . ПМИД 29943729 .
- ^ «Управление – Подразделение – ДБИО» . Engage.aps.org . Проверено 21 марта 2024 г.
- ^ «Исполком – Отделение – ДБИО» . Engage.aps.org . Проверено 21 марта 2024 г.
- ^ «Архив товарищей APS» . www.aps.org . Проверено 15 октября 2020 г.
- ^ «Президентская премия за раннюю карьеру для ученых и инженеров: сведения о получателях | NSF — Национальный научный фонд» . www.nsf.gov . Проверено 15 октября 2020 г.
- ^ «Ученые Pew в области биомедицины: Джошуа В. Шаевитц, доктор философии». Проверено 15 октября 2020 г.
- ^ «Пять удостоенных исследовательских стипендий Слоана» . Принстонский университет . Проверено 15 октября 2020 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Веб-страница лаборатории Шаевица
- Публикации Джошуа Шаевица , проиндексированные Google Scholar