Jump to content

Джошуа Шаевитц

Джошуа Уильям Шаевитц
Джошуа Уильям Шаевитц в Принстоне в 2019 году.
Рожденный ( 1977-11-06 ) 6 ноября 1977 г. (46 лет)
Лос-Анджелес, Калифорния
Национальность Американский
Альма-матер Колумбийский университет
Стэнфордский университет
Научная карьера
Учреждения Калифорнийский университет, Беркли
Принстонский университет
Докторантура Стивен Блок
Веб-сайт shaevitzlab.princeton.edu

Джошуа Шаевиц (1977 г.р.) — американский биофизик и профессор физики Института Льюиса-Сиглера Принстонского университета в Принстоне, штат Нью-Джерси . [ 1 ] Он известен своими работами в области биофизики одиночных молекул, роста и подвижности бактерий, а также поведения животных. [ 2 ]

Образование и ранняя карьера

[ редактировать ]

Шаевиц получил степень бакалавра физики в Колумбийском университете в Нью-Йорке в 1999 году, где он был стипендиатом II Раби . Он получил докторскую степень в 2004 году в Стэнфордском университете , где изучал молекулярные моторы кинезина. [ 3 ] и РНК-полимераза [ 4 ] [ 5 ] использование оптического пинцета в группе Стивена Блока . Затем Шаевиц перешел в Калифорнийский университет в Беркли в качестве научного сотрудника Миллера . Там он сосредоточился на подвижности бактерий, в том числе на актиновых Rickettsia rickettsii . [ 6 ] Миксококк ксантус [ 7 ] и бесстеночная спироплазма . [ 8 ] С 2007 года Шаевиц работает на факультете Принстонского университета , занимая должности на кафедре физики и в Институте интегративной геномики Льюиса-Сиглера , где имеет звание профессора.

Исследовать

[ редактировать ]

Работа Шаевица сосредоточена на прецизионных измерениях в различных биологических системах, уделяя особое внимание темам, связанным с формой клеток бактерий, формированием активного вещества и структур в группах движущихся клеток, а также количественной оценкой поведения животных.

Его группа впервые применила трехмерную визуализацию живых клеток для изучения формы бактерий во время роста. В серии статей Шаевитц и его коллеги раскрыли, как механизм внедрения клеточной стенки со спиральной координацией может производить клетки правильной формы как в виде палочек, так и в виде спиральных клеток. [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Его группа также изучает механику бактериальных клеток, в том числе жесткость при изгибе, [ 13 ] тургорное давление и жесткость клеточной стенки, [ 14 ] и регулирование давления. [ 15 ] [ 16 ]

Шаевиц также работал над механизмами скользящей подвижности и коллективного поведения социальной бактерии Myxococcus xanthus . Эта работа включает измерение механохимии отдельных скользящих двигателей внутри живых бактерий. [ 17 ] [ 18 ] и связь между фазовыми переходами активной материи и формированием эволюционно выгодных плодовых тел. [ 19 ] [ 20 ]

Третье направление исследований Шаевица связано с количественной оценкой поведения животных с использованием контролируемых и неконтролируемых алгоритмов машинного обучения. Шаевитц и профессор нейробиологии Принстона Мала Мурти опубликовали автоматизированную систему (LEAP) для измерения поз животных на основе больших наборов данных из фильмов. [ 21 ] Недавно это было распространено на данные о нескольких животных в пакете под названием SLEAP . [ 22 ] Его работа расширилась до понимания динамики поведения животных с помощью методов неконтролируемой кластеризации в сотрудничестве с коллегой из Принстона по физике Уильямом Биалеком и другими. [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ]

Научная деятельность

[ редактировать ]

Награды и почести

[ редактировать ]
  1. ^ «Джошуа Шаевитц | Факультет физики» . phy.princeton.edu . Проверено 15 октября 2020 г.
  2. ^ «Лаборатория Шаевица в Принстоне | Экспериментальная биофизика от молекул к клеткам и животным» . shaevitzlab.princeton.edu . Проверено 15 октября 2020 г.
  3. ^ Блок, Стивен М.; Эсбери, Чарльз Л.; Шаевитц, Джошуа В.; Ланг, Мэтью Дж. (4 марта 2003 г.). «Изучение цикла реакции кинезина с помощью двухмерного оптического силового зажима» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (5): 2351–2356. Бибкод : 2003PNAS..100.2351B . дои : 10.1073/pnas.0436709100 . ISSN   0027-8424 . ПМК   151344 . ПМИД   12591957 .
  4. ^ Шаевитц, Джошуа В.; Аббонданциери, Элио А.; Ландик, Роберт; Блок, Стивен М. (11 декабря 2003 г.). «Обратное отслеживание одиночных молекул РНК-полимеразы, наблюдаемое с разрешением, близким к паре оснований» . Природа . 426 (6967): 684–687. Бибкод : 2003Natur.426..684S . дои : 10.1038/nature02191 . ISSN   1476-4687 . ПМЦ   1483218 . ПМИД   14634670 .
  5. ^ Аббонданциери, Элио А.; Гринлиф, Уильям Дж.; Шаевитц, Джошуа В.; Ландик, Роберт; Блок, Стивен М. (24 ноября 2005 г.). «Прямое наблюдение шагания пары оснований с помощью РНК-полимеразы» . Природа . 438 (7067): 460–465. Бибкод : 2005Natur.438..460A . дои : 10.1038/nature04268 . ISSN   1476-4687 . ПМЦ   1356566 . ПМИД   16284617 .
  6. ^ Шаевитц, Джошуа В.; Флетчер, Дэниел А. (02 октября 2007 г.). «Колебания нагрузки стимулируют рост актиновой сети» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (40): 15688–15692. arXiv : 0708.1791 . Бибкод : 2007PNAS..10415688S . дои : 10.1073/pnas.0702601104 . ISSN   0027-8424 . ПМК   2000411 . ПМИД   17895390 .
  7. ^ Миньо, Тэм; Шаевитц, Джошуа В.; Хартцелл, Патрисия Л.; Зусман, Дэвид Р. (9 февраля 2007 г.). «Доказательства того, что комплексы фокальной адгезии обеспечивают скользящую подвижность бактерий» . Наука . 315 (5813): 853–856. Бибкод : 2007Sci...315..853M . дои : 10.1126/science.1137223 . ISSN   1095-9203 . ПМК   4095873 . ПМИД   17289998 .
  8. ^ Шаевитц, Джошуа В.; Ли, Джоанна Ю.; Флетчер, Дэниел А. (23 сентября 2005 г.). «Спироплазмы плавают за счет процессивного изменения спиральности тела» . Клетка . 122 (6): 941–945. дои : 10.1016/j.cell.2005.07.004 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   16179261 . S2CID   5070808 .
  9. ^ ван Теффелен, Свен; Ван, Сиюань; Ферхтготт, Леон; Хуанг, Кервин Кейси; Уингрин, Нед С.; Шаевитц, Джошуа В.; Гитай, Земер (20 сентября 2011 г.). «Бактериальный актин MreB вращается, а вращение зависит от сборки клеточной стенки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (38): 15822–15827. Бибкод : 2011PNAS..10815822V . дои : 10.1073/pnas.1108999108 . ISSN   1091-6490 . ПМК   3179079 . ПМИД   21903929 .
  10. ^ Ван, Сиюань; Ферхтготт, Леон; Хуанг, Кервин Кейси; Шаевиц, Джошуа В. (6 марта 2012 г.). «Спиральная вставка пептидогликана приводит к хиральному упорядочению бактериальной клеточной стенки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (10): E595–604. дои : 10.1073/pnas.1117132109 . ISSN   1091-6490 . ПМК   3309786 . ПМИД   22343529 .
  11. ^ Бартлетт, Томас М.; Браттон, Бенджамин П.; Дувшани, Амит; Мигель, Аманда; Шэн, Инь; Мартин, Николас Р.; Нгуен, Джеффри П.; Персат, Александр; Демарэ, Саманта М.; ВанНьевензе, Майкл С.; Хуанг, Кервин Кейси (12 января 2017 г.). «Периплазматический полимер изменяет холерный вибрион и способствует патогенезу» . Клетка . 168 (1–2): 172–185.e15. дои : 10.1016/j.cell.2016.12.019 . ISSN   1097-4172 . ПМК   5287421 . ПМИД   28086090 .
  12. ^ Тейлор, Дженнифер А.; Браттон, Бенджамин П.; Сичел, Софи Р.; Блэр, Крис М.; Джейкобс, Холли М.; ДеМистер, Кристен Э.; Куру, Эркин; Грей, Джо; Бибой, Джейкоб; ВанНьевенце, Майкл С.; Фоллмер, Вальдемар (9 января 2020 г.). «Различные белки цитоскелета определяют зоны усиленного синтеза клеточной стенки у Helicobacter pylori» . электронная жизнь . 9 . дои : 10.7554/eLife.52482 . ISSN   2050-084X . ПМК   7012605 . ПМИД   31916938 .
  13. ^ Ван, Сиюань; Арельяно-Сантойо, Хьюго; Комбс, Питер А.; Шаевиц, Джошуа В. (18 мая 2010 г.). «Актин-подобные нити цитоскелета участвуют в клеточной механике бактерий» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (20): 9182–9185. Бибкод : 2010PNAS..107.9182W . дои : 10.1073/pnas.0911517107 . ISSN   1091-6490 . ПМК   2889055 . ПМИД   20439764 .
  14. ^ Дэн, Йи; Сунь, Минчжай; Шаевиц, Джошуа В. (07 октября 2011 г.). «Прямое измерение напряжения клеточной стенки и тургорного давления в живых бактериальных клетках» . Письма о физических отзывах . 107 (15): 158101. arXiv : 1104.1421 . Бибкод : 2011PhRvL.107o8101D . doi : 10.1103/PhysRevLett.107.158101 . ISSN   1079-7114 . ПМИД   22107320 . S2CID   15880029 .
  15. ^ Пилизота, Теута; Шаевиц, Джошуа В. (18 июня 2013 г.). «Плазмолиз и форма клеток зависят от проницаемости внешней мембраны растворенных веществ во время гиперосмотического шока у E. coli» . Биофизический журнал . 104 (12): 2733–2742. Бибкод : 2013BpJ...104.2733P . дои : 10.1016/j.bpj.2013.05.011 . ISSN   1542-0086 . ПМЦ   3686340 . ПМИД   23790382 .
  16. ^ Пилизота, Теута; Шаевиц, Джошуа В. (21 октября 2014 г.). «Происхождение скорости роста Escherichia coli и изменения формы клеток при высокой внешней осмоляльности» . Биофизический журнал . 107 (8): 1962–1969. Бибкод : 2014BpJ...107.1962P . дои : 10.1016/j.bpj.2014.08.025 . ISSN   1542-0086 . ПМК   4213672 . ПМИД   25418177 .
  17. ^ Сунь, Минчжай; Вартель, Морган; Каскалес, Эрик; Шаевитц, Джошуа В.; Миньо, Тэм (3 мая 2011 г.). «Моторный внутриклеточный транспорт обеспечивает скользящую подвижность бактерий» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (18): 7559–7564. дои : 10.1073/pnas.1101101108 . ISSN   1091-6490 . ПМК   3088616 . ПМИД   21482768 .
  18. ^ Балагам, Раджеш; Литвин, Дуглас Б.; Червинский, Фабиан; Сунь, Минчжай; Каплан, Хайди Б.; Шаевитц, Джошуа В.; Игошин, Олег А. (май 2014 г.). «Скользящие двигатели Myxococcus xanthus эластично связаны с подложкой, как это предсказывает модель фокальной адгезии скользящей подвижности» . PLOS Вычислительная биология . 10 (5): e1003619. arXiv : 1401.3220 . Бибкод : 2014PLSCB..10E3619B . дои : 10.1371/journal.pcbi.1003619 . ISSN   1553-7358 . ПМК   4014417 . ПМИД   24810164 .
  19. ^ Тутупалли, Шаши; Сунь, Минчжай; Буняк, Филиз; Паланиаппан, Каннаппан; Шаевиц, Джошуа В. (6 августа 2015 г.). «Изменение направления позволяет клеткам Myxococcus xanthus производить коллективные одномерные потоки во время формирования плодового тела» . Журнал Королевского общества, Интерфейс . 12 (109): 20150049. doi : 10.1098/rsif.2015.0049 . ISSN   1742-5662 . ПМЦ   4535398 . ПМИД   26246416 .
  20. ^ Лю, Гуаннань; Патч, Адам; Бахар, Фатмагюль; Илланес, Дэвид; Уэлч, Рой Д.; Маркетти, М. Кристина; Тутупалли, Шаши; Шаевиц, Джошуа В. (21 июня 2019 г.). «Самостоятельные фазовые переходы стимулируют образование плодовых тел Myxococcus xanthus» . Письма о физических отзывах . 122 (24): 248102. arXiv : 1709.06012 . Бибкод : 2019PhRvL.122x8102L . doi : 10.1103/PhysRevLett.122.248102 . ISSN   1079-7114 . ПМИД   31322369 . S2CID   38823898 .
  21. ^ Перейра, Тальмо Д.; Альдарондо, Диего Э.; Уиллмор, Линдси; Кислин Михаил; Ван, Сэмюэл С.-Х.; Мурти, Мала; Шаевиц, Джошуа В. (январь 2019 г.). «Быстрая оценка позы животных с использованием глубоких нейронных сетей» . Природные методы . 16 (1): 117–125. дои : 10.1038/s41592-018-0234-5 . ISSN   1548-7105 . ПМК   6899221 . ПМИД   30573820 .
  22. ^ Перейра, Тальмо Д.; Табрис, Натаниэль; Ли, Джуньюй; Равиндранат, Шрути; Пападояннис, Элени С.; Ван, З. Ян; Тернер, Дэвид М.; Маккензи-Смит, Грейс; Кохер, Сара Д.; Фолкнер, Аннегрет Л.; Шаевитц, Джошуа В. (2 сентября 2020 г.). «SLEAP: отслеживание поз нескольких животных» . bioRxiv : 2020.08.31.276246. дои : 10.1101/2020.08.31.276246 . S2CID   221510569 .
  23. ^ Берман, Гордон Дж.; Чой, Дэниел М.; Бялек, Уильям; Шаевиц, Джошуа В. (6 октября 2014 г.). «Картирование стереотипного поведения свободно перемещающихся плодовых мушек» . Журнал Королевского общества, Интерфейс . 11 (99). дои : 10.1098/rsif.2014.0672 . ISSN   1742-5662 . ПМЦ   4233753 . ПМИД   25142523 .
  24. ^ Берман, Гордон Дж.; Бялек, Уильям; Шаевиц, Джошуа В. (18 октября 2016 г.). «Предсказуемость и иерархия в поведении дрозофилы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (42): 11943–11948. arXiv : 1605.03626 . Бибкод : 2016PNAS..11311943B . дои : 10.1073/pnas.1607601113 . ISSN   1091-6490 . ПМК   5081631 . ПМИД   27702892 .
  25. ^ Клибайте, Угне; Берман, Гордон Дж.; Канде, Джессика; Стерн, Дэвид Л.; Шаевиц, Джошуа В. (16 февраля 2017 г.). «Неконтролируемый метод количественной оценки поведения парных животных» . Физическая биология . 14 (1): 015006. arXiv : 1609.09345 . Бибкод : 2017PhBio..14a5006K . дои : 10.1088/1478-3975/aa5c50 . ISSN   1478-3975 . ПМК   5414632 . ПМИД   28140374 .
  26. ^ Канде, Джессика; Намики, Сигэхиро; Цю, Джируй; Корфф, Вятт; Кард, Гвинет М.; Шаевитц, Джошуа В.; Стерн, Дэвид Л.; Берман, Гордон Дж. (26 июня 2018 г.). «Оптогенетическое исследование нисходящего поведенческого контроля у дрозофилы» . электронная жизнь . 7 . дои : 10.7554/eLife.34275 . ISSN   2050-084X . ПМК   6031430 . ПМИД   29943729 .
  27. ^ «Управление – Подразделение – ДБИО» . Engage.aps.org . Проверено 21 марта 2024 г.
  28. ^ «Исполком – Отделение – ДБИО» . Engage.aps.org . Проверено 21 марта 2024 г.
  29. ^ «Архив товарищей APS» . www.aps.org . Проверено 15 октября 2020 г.
  30. ^ «Президентская премия за раннюю карьеру для ученых и инженеров: сведения о получателях | NSF — Национальный научный фонд» . www.nsf.gov . Проверено 15 октября 2020 г.
  31. ^ «Ученые Pew в области биомедицины: Джошуа В. Шаевитц, доктор философии». Проверено 15 октября 2020 г.
  32. ^ «Пять удостоенных исследовательских стипендий Слоана» . Принстонский университет . Проверено 15 октября 2020 г.
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 296d213deea22908c0240f78398188d1__1717815000
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/29/d1/296d213deea22908c0240f78398188d1.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Joshua Shaevitz - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)