Центр геномной регуляции

CRG, Центр геномной регуляции
Учредил	2000
Директор	Луис Серрано
Персонал	~400 [ нужна ссылка ]
Расположение	Барселона , Испания
Веб-сайт	http://www.crg.eu

Центр геномной регуляции (CRG, Centre de Regulació Genòmica на каталонском языке ) — это биомедицинский и геномный исследовательский центр, базирующийся в Барселоне . Большинство его объектов и лабораторий расположены в Парке биомедицинских исследований Барселоны , напротив пляжа Соморростро .

С июля 2015 года CNAG (Национальный центр геномного анализа), расположенный в научном парке Барселоны (недалеко от Камп Ноу ), стал филиалом CRG. ^{[ 1 ]} CRG является членом EU-LIFE, ^{[ 2 ]} альянс ведущих исследовательских центров медико-биологических наук в Европе.

Исследовательские программы

Биоинформатика и геномика

В рамках биоинформатики и геномики существует несколько направлений исследований. Прогнозирование генов и моделирование сплайсинга связано с исследованиями по регуляции альтернативного сплайсинга, регуляции синтеза белка в рамках программы «Регуляция генов» и программы «Гены и болезни». Другое направление исследований включает идентификацию и характеристику геномных регионов, связанных с регуляцией генов. Это связано с исследованиями хроматина и экспрессии генов, а также с исследованиями взаимодействия белков РНК. Еще одно направление исследований относится к молекулярной эволюции, которая включает в себя эволюцию экзонной структуры генов и сплайсинг.

В рамках этой программы также есть группа, занимающаяся изучением микрочипов.

Программа «Биоинформатика» связана с Исследовательской группой биомедицинской информатики (GRIB). В этой группе направления исследований в области молекулярного моделирования, прогнозирования структуры белков и сложных систем находятся на зарождающейся стадии. ^{[ 3 ]}

Клеточная биология и биология развития

Клеточная биология и биология развития (CDB) основана на идее о том, что клетка должна быть в центре внимания биологии развития и что клетку следует понимать в контексте ее организма-хозяина. ^{[ 3 ]}

Поскольку принципы, лежащие в основе поведения белков внутри клеток и между ними, плохо изучены, программа CDB направлена на изучение взаимодействий между межклеточными сигнальными системами и цитоскелетом. Другая цель — понять, как это влияет на пространственную организацию клеток и обработку информации. Методы включают многомерные фенотипы, основанные на геномике и протеомике. ^{[ 3 ]}

Регуляция генов, стволовые клетки и рак

Программа «Регуляция генов, стволовые клетки и рак» фокусируется на механизмах экспрессии генов, механизмах эпигенетической регуляции и молекулярных основах клеточных операций, связанных с гомеостазом тканей и раком. Исследования регуляции генов включают организацию и эволюцию регуляторного генома, состав хроматина и регуляцию транскрипции, опосредованную стероидными гормонами, эпигенетические механизмы при лейкемии и стволовых клетках, регуляцию периодического сплайсинга и трансляции мРНК, а также функцию генов и эпигенетическое перепрограммирование в эмбриогенезе и зародышевой линии. . Исследования стволовых клеток включают дифференцировку и трансдифференцировку в кроветворной системе, перепрограммирование соматических клеток и регенерацию тканей. ^{[ 3 ]}

Системная биология

Исследования в области системной биологии включают в себя динамические сети регуляции генов и системную нейробиологию. В качестве некоторых моделей используются прокариоты, клеточные линии, C. elegans, дрозофила и мыши. ^{[ 3 ]}

Эта исследовательская программа сочетает в себе систематический и количественный сбор данных с вычислительными моделями с целью обнаружить динамическое понимание сложных биологических процессов. Применяется междисциплинарный подход: объединяются физики, математики и компьютерщики. Некоторые конкретные темы исследования: передача сигнала, регуляторные сети генов, формирование многоклеточного паттерна, хемотаксис, системная нейробиология, эволюция сетей и влияние стохастического шума на уровне организма. ^{[ 3 ]}

Международные проекты

Восстановление полярности клеток и определение оси в бесклеточной системе

Полярность клеток является предпосылкой для нескольких фундаментальных операций в клетках животных, таких как асимметричное деление клеток и морфогенез. В обоих случаях поляризация определяется одним и тем же набором белков, известных как белки PAR. Неизвестно, как эти белки устанавливают полярность. Исследователи предложили двойной подход, сочетающий методы in vitro и извлечения клеток. Цель состоит в том, чтобы получить знания о поведении поляризационной системы в микрометровом масштабе, а также о характеристиках ее компонентов. ^{[ 3 ]}

Методы анализа с высоким разрешением влияния генериков на экспрессию генов

Многие из общих генетических сигналов, связанных с заболеваниями, находятся далеко от последовательности ДНК, которая кодирует последовательность белка. Вероятно, они играют роль в регуляции экспрессии генов. В этом проекте исследователи разрабатывают методологии, которые будут изучать влияние генетических вариаций на экспрессию генов. ^{[ 3 ]}

Прогнозирование риска возрастных заболеваний

Эта программа изучает основные изменения в современном обществе и сопутствующие им риски. Этот проект объединяет подходы молекулярной, клеточной, вычислительной и системной биологии к модельным организмам и болезням человека для изучения генетических причин возрастных заболеваний. Одной из целей является создание новых диагностических и терапевтических методов. ^{[ 3 ]}

Основные объекты

Отделение усовершенствованной световой микроскопии

Отделение усовершенствованной световой микроскопии предлагает инструменты, охватывающие весь спектр применения современной световой микроскопии. Оборудование для подготовки и обслуживания проб находится в ведении этого подразделения. Также обеспечивается поддержка во время обработки, рендеринга и анализа полученных наборов данных. ^{[ 3 ]}

Доступные технологии охватывают: микроскопию сверхвысокого разрешения, двухфотонную микроскопию, конфокальную микроскопию, флуоресцентную микроскопию полного внутреннего отражения, флуоресцентную микроскопию с отображением времени жизни, микроинъекцию, микродиссекцию, обработку и анализ изображений и другие области. ^{[ 3 ]}

Отдел биоинформатики

Отдел биоинформатики предоставляет исследователям услуги консультаций, планирования экспериментов, обработки данных, разработки программного обеспечения и баз данных, обучения биоинформатике и доступа к высокопроизводительным вычислительным ресурсам. ^{[ 3 ]}

Среди предлагаемых услуг: обработка образцов и секвенирование, разработка заявок на гранты, обнаружение вариантов в геномике, оценка качества сборок, анализ высокопроизводительных данных, идентификация микробных и грибковых сообществ по последовательностям и функциональная аннотация белков. ^{[ 3 ]}

Отделение тканевой инженерии

Цель подразделения тканевой инженерии — предоставить исследователям передовые технологии в области биологии стволовых клеток, дифференцировки стволовых клеток, образования органоидов и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток. Это подразделение сотрудничает с Отделом биомолекулярного скрининга и белковых технологий, предоставляя технологические услуги по редактированию генома. ^{[ 3 ]}

См. также

Европейский архив генома-фенома

Ссылки

^ «Другие соглашения правительства. Пресс-центр. Правительство Каталонии » нажмите.закрытый.кот . Архивировано из оригинала 24 октября 2018 г. Проверено 17 августа 2016 г.
^ «Наши участники» . ЕС-ЖИЗНЬ .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н 2013. Центр регуляции генома. Получено с www.crg.eu/en.

Внешние ссылки

Официальный сайт

41 ° 23'08 "N 2 ° 11'38" E / 41,3855 ° N 2,1940 ° E / 41,3855; 2.1940 г.

[1] «Другие соглашения правительства. Пресс-центр. Правительство Каталонии » нажмите.закрытый.кот . Архивировано из оригинала 24 октября 2018 г. Проверено 17 августа 2016 г.

[2] «Наши участники» . ЕС-ЖИЗНЬ .

[auto-3] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н 2013. Центр регуляции генома. Получено с www.crg.eu/en.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ
Национальный	Каталония