Metalysinibacillus
| Metalysinibacillus | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Филум: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Metalysinibacillus gupta и Patel 2020
|
| Разновидность | |
|
на основе LPSN 2021 | |
Metalysinibacillus является род грамположительных бактерий в форме стержней в семействе Caryophanaceae из порядка Caryophanales. [ 1 ] Типовым видом этого рода является Metalyysinibacillus jejuensis. [ 2 ]
Члены Metalysinibacillus ранее являются видами, принадлежащими к лизинибациллу . Вместо того, чтобы разветвляться с видами из Lysinibacillus , эти два вида образовали монофилетическую ветвь в различных филогенетических деревьях, построенных на основе консервативных последовательностей генома, что указывает на их филогенетическое родство. [ 1 ] Семейство Caryophanaceae охватывала множество разветвленных аномалий, таких как этот, частично из -за зависимости от последовательностей 16S рРНК в качестве метода классификации, который, как известно, имеет низкую мощность разрешения и дает различные результаты в зависимости от используемого алгоритма. [ 3 ] В 2020 году сравнительное геномное исследование вызвало семейство, что привело к созданию трех новых родов, включая MetalySinibacillus . [ 1 ]
Название Metalysinibacillus получено из греческой мета -мета , переводимой в «кроме» и латинский термин Lysinibacillus , ссылаясь на название рода. Вместе металлисинибацилл может быть переведен как род, помимо лизинибацилла . [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные подписи [ 1 ]
[ редактировать ]Члены этого рода являются аэробные и эндоспорообразующие. Metalysinibacillus растет оптимально при температурах в диапазоне 30–37 ° C. Сообщается, что некоторые виды являются положительными для каталазы и Voges -Proskauer тестов .
Analyses of genome sequences from Metalysinibacillus species identified 17 conserved signature indels (CSIs) that are specific for this genus in the following proteins: arginine-binding extracellular protein ArtP precursor, oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative hydrolase MhqD, helix-turn-helix регулятор транскрипции, тРНК Preq1 (34) S-аденозилметионин рибозилтрансфераза-изомераза Quea, ДНК-примаза , FMN-редуктаза (NADPH) , белок системы UVRABC, датчика гистидина киназы YYCG, гипотетические белки, рибонуклеаза Y , белок клеток FTSA, ABC Transporter Atp-связывание, рибонуклеаза Y, белок-дивизион клеток, ABC-транспортер Atp-связы цистеин -трна лигаза , Coproporphorphyrinogen III оксидаза и семейство PBP1A-связывающее пенициллин белок. [ 1 ] Эти молекулярные сигнатуры обеспечивают надежный метод идентификации и дифференцировки видов металлисинибацилла от других родов в семействе Caryophanaceae и всех других бактериях.
Таксономия
[ редактировать ]MetalySinibacillus , по состоянию на 2021 год, содержит один вид с обоснованным названием. [ 2 ] Этот род был идентифицирован как монофилетическая клада и филогенетически не связан с другими видами семейства Caryophanaceae в исследованиях, изучающих таксономические отношения в семье. [ 1 ]
Есть еще один вид, который не публикуется, но считается членом этого рода из-за общих молекулярных маркеров и группировки на филогенетических деревьях с типовыми видами.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый и фон глин Гупта, Радхей С.; Патель, Судип (2020-01-14). «Надежная разграничение семейства Caryophanaceae (Planococcaceae) и его различные роды, включая три новых рода, основанные на филогеномике и высокоспецифических молекулярных сигнатурах» . Границы в микробиологии . 10 : 2821. DOI : 10.3389/fmicb.2019.02821 . ISSN 1664-302X . PMC 6971209 . PMID 32010063 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный «Род: Metalysinibacillus» . lpsn.dsmz.de. Получено 2021-06-05 .
- ^ Людвиг, Вольфганг; Шлейфер, Карл -Хейнц; (2015-09-14). " Planoccaceae . : 1. 10.1002/9781118960608.fbm00116 ISBN 9781118960608 .