Caryophanaceae
| Caryophanaceae | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Филум: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | Caryophanaceae Пешкофф, 1939
|
| Роды | |
Caryophanaceae это семейство бактерий грамположительных - . В 2020 году ныне несуществующая семейная планококкацей была объединена в Caryophanaceae, чтобы исправить аномалию номенклатуры. [ 1 ] Тип рода этой семьи - Caryophanon . [ 2 ]
Семейство Planococcacae было обоснованно опубликовано в 1949 году, однако в нем содержалось еще одно таксономическое звание семейного уровня, семейство Caryophanaceae, которое было обоснованно опубликовано в 1939 году. [ 3 ] Согласно Международному кодексу номенклатуры прокариот (ICNP) , имя Caryophanacaeae имеет более высокий приоритет, чем Planococcaceae из -за ее более ранней публикации. [ 3 ] Следовательно, семейная семья сохранила имя Caryophanaceae .
Название Caryophanaceae получено из латинского термина Caryophanon , ссылаясь на род типа семьи и суффикс «-Aceae», окончание, используемое для обозначения семьи. Вместе Caryophanaceae относится к семье, чей номенклатный тип которого является род Caryophanon . [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные подписи
[ редактировать ]Клетки от членов семейства Caryophanaceae могут быть кокци или стержнями, иногда образуя нити или трихому. Большинство видов являются строго аэробными гетеротрофами, хотя некоторые из них также являются факультативно аэробузами. Клетки, как правило, подвигают жгутиками или скользящими, и они могут или не могут образовывать эндоспоры. Большинство видов являются каталаз-положительными и оксидазой положительными или отрицательными. [ 1 ]
Анализ последовательностей генома от видов Caryophanaceae, идентифицированных 13 консервативных сигнатурных инделей (CSI), которые уникально присутствуют в этом семействе в белках фенилаланино -трна -лигаза альфа, каперониновой гроэл, фактор созревания рибосом, Rhomboid, семейство Brxa/Brxb, бациллярьян, РНК -метилттраза Семейство Внутренняя сериновая протеаза, АТФ-зависимая CLP-протеаза АТФ-связывающая субъединица, полимеразы РНК- субъединица бета- полимеразы, хоризмат-синтаза , белок споруляции IV, белок , пептидаза, протеин, содержащий домен DUF423. [ 1 ] Эти CSI служат надежным молекулярным средством разграничения членов Caryophanaceae из других семей в порядке кариофаналов и других бактерий.
Историческая систематика и текущая таксономия
[ редактировать ]Caryophanaceae , по состоянию на 2021 год, содержит 19 действительных опубликованных родов. [ 2 ]
В дополнение к аномалии номенклатуры, Caryophanaceae также охватывал более 100 видов, которые имели различную морфологию/биохимические характеристики, демонстрируя, что они филогенетически не связаны. [ 4 ] Первоначальное назначение видов в семейство Caryophanaceae в значительной степени основано на анализе последовательности генома 16S рРНК, который, как известно, обладает низкой дискриминационной мощностью, и результаты которых зависит от использования алгоритма и информации о организме. Несмотря на это, анализы по -прежнему демонстрировали полифилетическое ветвление, что указывает на наличие различных подгрупп в семье. [ 4 ]
В 2020 году Гупта и Патель предложили поменять Caryophanaceae, в частности, объединение с Planoccocacae , предложение 3 новых родов, а также перенос ряда неправильно классифицированных видов в соответствующие роды. [ 1 ] Изменения были предложены на основе различных филогенетических деревьев, построенных на основе множества больших наборов данных белковых последовательностей, и идентификации уникальных молекулярных маркеров, известных как консервативные сигнатуры, инделы в нескольких белках. [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Гупта, Радхей С.; Патель, Судип (2020-01-14). «Надежная разграничение семейства Caryophanaceae (Planococcaceae) и его различные роды, включая три новых рода, основанные на филогеномике и высокоспецифических молекулярных сигнатурах» . Границы в микробиологии . 10 : 2821. DOI : 10.3389/fmicb.2019.02821 . ISSN 1664-302X . PMC 6971209 . PMID 32010063 .
- ^ Jump up to: а беременный «Семья: Caryophanaceae» . lpsn.dsmz.de. Получено 2021-06-05 .
- ^ Jump up to: а беременный Tindall, BJ (2019-08-01). "При обращении как к гетеротипическим синонимам имена Caryophanaceae Peshkoff 1939 (утвержденные списки 1980) и Caryophanales Peshkoff 1939 (утвержденные списки 1980) имеют приоритет над названиями Planococcaceae Krasil'nikov 1949 (утвержденные списки 1980) и Bacilles Prévot 1953 (Approved 1980). Bacillales Prévot 1953 (утвержденные списки 1980), соответственно » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 69 (8): 2187–2195. doi : 10.1099/ijsem.0.003354 . ISSN 1466-5026 . PMID 30896383 .
- ^ Jump up to: а беременный Людвиг, Вольфганг; Шлейфер, Карл -Хейнц; (2015-09-14). " Planoccaceae 10.1002/9781118960608.fbm00116. ISBN 9781118960608 .
 | Эта статья, связанная с бациллами, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |