Планококк (бактерия)
Planococcus — род грамположительных или грамвариабельных кокков или коротких палочковидных бактерий семейства Caryophanaceae из порядка Caryophanales . [ 1 ] Типовым видом этого рода является Planococcus citreus. [ 2 ]
Некоторые представители Planococcus ранее относились к видам Planomirobium. Вместо того, чтобы разветвляться с видами Planomicrobum , эти виды образовали монофилетическую ветвь с представителями Planococcus в различных филогенетических деревьях, построенных на основе консервативных последовательностей генома, что указывает на их филогенетическое родство. [ 1 ] Семейство Caryophanaceae включает в себя множество аномалий ветвления, подобных этой, частично из-за использования последовательностей 16S рРНК в качестве метода классификации, который, как известно, имеет низкую разрешающую способность и дает разные результаты в зависимости от используемого алгоритма. [ 3 ] В 2020 году сравнительное геномное исследование внесло изменения в семейство, в результате чего были выделены три новых рода, а также внесены изменения в ряд родов, включая Planococcus . [ 1 ]
Название Planococcus происходит от греческого существительного planes , что переводится как «странник», и латинского термина coccus. В совокупности Planococcus можно перевести как подвижный кокк. [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные характеристики [ 1 ]
[ редактировать ]Клетки имеют грамположительное или грамвариабельное окрашивание, представляют собой кокки или короткие палочки и обычно подвижны.
Геномный анализ выявил пять консервативных сигнатурных инделей (CSI), которые уникально присутствуют у представителей этого рода в следующих белках : пенициллинсвязывающий белок 2 , гипотетический белок, НАДФН-зависимая 7-циано-7-деазагуанинредуктаза QueF, домен ACT, содержащий белок и метилмалонил-КоА-мутаза . [ 1 ] Эти молекулярные сигнатуры обеспечивают надежный метод дифференциации видов Planococcus от других родов семейства Caryophanaceae и всех других бактерий.
Таксономия
[ редактировать ]Planococcus по состоянию на 2021 год содержит 24 вида с достоверно опубликованными названиями. [ 2 ] Этот род был идентифицирован как монофилетическая клада и филогенетически не связанный с другими видами семейства Caryophanaceae в исследованиях, изучающих таксономические отношения внутри семейства. [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Гупта, Рэдхи С.; Патель, Судип (14 января 2020 г.). «Надежное разграничение семейства Caryophanaceae (Planococcaceae) и его различных родов, включая три новых рода, на основе филогеномики и высокоспецифичных молекулярных характеристик» . Границы микробиологии . 10 :2821.дои : 10.3389 / fmicb.2019.02821 . ISSN 1664-302X . ПМК 6971209 . ПМИД 32010063 .
- ^ Перейти обратно: а б «Род: Planococcus» . lpsn.dsmz.de. Проверено 5 июня 2021 г.
- ^ Людвиг, Вольфганг; Шлейфер, Карл-Хайнц; Уитмен, Уильям Б. (14 сентября 2015 г.). «Планококковые» . Руководство Берджи по систематике архей и бактерий : 1. doi : 10.1002/9781118960608.fbm00116 . ISBN 9781118960608 .