Чунхён Ким

Чунхён Ким — профессор биологии Университета Пенсильвании, присуждаемый Эдмундом Дж. и Луизой Кан , и автор более восьмидесяти опубликованных научных статей.

Карьера

Ким специализируется на вычислительной биологии , геномике и эволюционной биологии. Родом из Южной Кореи, он получил степень бакалавра микробиологии в Сеульском национальном университете . Во время учебы в бакалавриате он сильно заинтересовался информатикой и программированием. Он разработал программу сворачивания последовательностей тРНК, опубликованную в Корейском журнале биохимии. Эта статья теперь известна как первая статья по вычислительной биологии, опубликованная в Корее. Он получил докторскую степень в области экологии и эволюции в Университете Стоуни-Брук в 1992 году под руководством Льва Гинзбурга и Дэна Дыхейзена. Его диссертация называлась «Факторы, влияющие на рост населения и его пространственное распределение». Его постдокторские исследования проводились вместе с Маргарет Кидвелл из Университета Аризоны, занимаясь молекулярной эволюцией видов дрозофилы. В 1994 году он стал доцентом кафедры биологии Йельского университета , а в 2000 году был назначен на постоянную должность. В 2002 году он перешел в Пенсильванский университет, где в настоящее время является профессором Эдмунда Дж. и Луизы Кан. биологии, адъюнкт-профессор компьютерных наук и содиректор Пенсильванского института исследований генома . Он был членом руководящего комитета и председателем конференции семинара по алгоритмам в биоинформатике ; председатель программы и программный комитет « Интеллектуальные системы молекулярной биологии» ; и он является старейшим помощником редактора журнала IEEE/ACM Transactions по вычислительной биологии и биоинформатике . Награды Джунхёна Кима включают премию молодого исследователя Фонда Слоана , премию Йельского факультета, приглашенного научного сотрудника в Институте Ньютона ( Кембриджский университет ) и IHES (Франция), Медицинского фонда Эллисона в области старения, старшего научного сотрудника и стипендия Гуггенхайма .

Ким работал в самых разных областях исследований. Его ранние работы были сосредоточены на математической филогенетике, которая началась во время его аспирантуры у доктора. Роберт Р. Сокал и Ф. Джеймс Рольф, которые впервые разработали вычислительные методы оценки эволюционного дерева. Среди своих работ в этой области Чунхён Ким представил использование алгебро-геометрических методов в филогенетической оценке. В 1999 году, работая с Джоном Карлсоном в Йельском университете, он разработал новый алгоритм для компьютерной идентификации рецепторов, связанных с G-белком (GPCR), без использования гомологии первичных последовательностей, что привело к клонированию обонятельных рецепторов у насекомых. После переезда в Пенсильванский университет его исследования были сосредоточены на сравнительной функциональной геномике, особенно на экспрессии генов и биологии РНК в двух модельных системах. В одной области он работает с почкующимися дрожжами, чтобы понять механизмы и эволюцию контроля времени экспрессии генов. В другой области он работает с Джеймсом Эбервайном, чтобы понять биологию РНК нейронов млекопитающих и эволюцию индивидуальных характеристик клеток. Вместе с доктором Эбервайном он помог разработать новый метод использования прямого переноса РНК для перепрограммирования клеток млекопитающих и помог расшифровать механизмы локализации РНК в нейронах. Совсем недавно лаборатории Кима и Эбервина работали вместе, чтобы понять изменчивость транскриптома в отдельных клетках и то, как эти вариации связаны с дисфункцией клеток. Доктора. Ким и Эбервин в настоящее время руководят новым пятилетним проектом, финансируемым Национальными институтами здравоохранения .

Внешние ссылки

• Веб-сайт Чунхёна Кима UPenn