Джесси Д. Блум
Джесси Д. Блум — американский компьютерный вирусолог и профессор отдела фундаментальных наук, отдела наук об общественном здравоохранении и программы вычислительной биологии Гербольда в Онкологическом центре Фреда Хатчинсона . [1] Он также является исследователем Медицинского института Говарда Хьюза и доцентом Вашингтонского университета . кафедры геномных наук и микробиологии [2] [3] [4]
Образование и карьера
[ редактировать ]Блум получил степень бакалавра биохимии в Чикагском университете , степень магистра философии. Он получил степень доктора теоретической химии в Кембриджском университете и докторскую степень по химии в Калифорнийском технологическом институте под руководством Фрэнсис Арнольд . [1] После получения докторской степени он завершил постдокторантуру в лаборатории Дэвида Балтимора . [5] Он стал профессором Онкологического центра Фреда Хатчинсона в 2011 году и исследователем Медицинского института Говарда Хьюза в 2018 году. [6] [7]
Исследовать
[ редактировать ]Исследования Блума сосредоточены на молекулярной эволюции вирусов и вирусных белков, особенно быстро развивающихся РНК-вирусов, таких как грипп, ВИЧ и SARS-CoV-2. [1] [8] [9] [10] Его лаборатория использует комбинацию вычислительных и экспериментальных методов, чтобы понять, как изменения в вирусных белках приводят к ускользанию от иммунитета, устойчивости к лекарствам и сдвигам в специфичности хозяина. [2] Его группа провела первое экспериментальное исследование, показавшее, что человеческие коронавирусы эволюционируют, спасаясь от человеческих антител. [11]
Блум помог возглавить разработку методов глубокого мутационного сканирования для параллельного измерения эффектов большого количества мутаций в вирусных белках. [8] [10] [12] Примечательно, что его лаборатория предоставила первую карту влияния мутаций в домене, связывающем шиповый рецептор SARS-CoV-2, на сворачивание и сродство ACE2 . [10] Используя тот же метод, исследовательская группа Блума проспективно выявила мутации в белке-шипе SARS-CoV-2, которые подрывают иммунитет, обеспечиваемый как терапевтическими антителами , так и естественными иммунными реакциями. [13] [14] Его группа интегрировала эти измерения в калькулятор выхода антител, который используется для отслеживания эволюции SARS-CoV-2. [15] Они также показали, что способность связывать человеческий ACE2 широко распространена и быстро развивается среди природных коронавирусов, связанных с атипичной пневмонией , что подчеркивает зоонозный потенциал этого семейства вирусов. [16]
Научные работы Блума были опубликованы в ведущих научных журналах, включая Science , Nature и Cell . [13] [17] [10] [16]
Помимо своих научных публикаций, Блум вместе с Сарой Коби написал в New York Times несколько колонок об эволюции SARS-CoV-2. [18] [19]
Блум также утверждал, что вирусологам важно обеспечить, чтобы вирусологические исследования проводились ответственно и не создавали рисков биобезопасности или биозащищенности. Он изложил свои взгляды в колонке, опубликованной по этой теме в газете « Нью-Йорк Таймс» . [20]
В 2021 году Блум был соавтором письма с призывом к дальнейшему расследованию происхождения COVID-19 , опубликованного в журнале Science . [21] Исследование Блума о происхождении COVID-19 «подняло вероятность того, что китайское правительство может пытаться скрыть доказательства раннего распространения пандемии» и стало темой встречи с Энтони Фаучи , директором Национального института аллергии и инфекционных заболеваний. Болезни (НИАВД). [22] [23]
Почести и награды
[ редактировать ]- Премия Макдугалла за наставничество 2019 г. [24]
- 2018 Исследователь HHMI [25]
- Премия Мерка Ирвинга С. Сигала, 2017 г., от Американского общества микробиологии [26]
- Премия Энн Палменберг младшему исследователю 2016 года от Американского общества вирусологии [27]
- Стипендиат факультета HHMI-Саймонс, 2016 г. [28]
- Премия «Молодой исследователь в области вирусологии» 2015 г. [29]
- Стипендиат Pew в области биомедицинских наук, 2015 г. [30]
- 2012 г. Премия Сирла [31]
Внешние ссылки
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с «Джесси Блум, доктор философии». Фред Хатч . Проверено 18 мая 2022 г.
- ^ Перейти обратно: а б «Джесси Д. Блум» . ХХМИ . Проверено 29 октября 2022 г.
- ^ «Джесси Д. Блум | UW Microbiology» . microbiology.washington.edu . Проверено 29 октября 2022 г.
- ^ «UW Genome Sciences: Джесси Блум» . www.gs.washington.edu . Проверено 29 октября 2022 г.
- ^ «Джесси Блум» . www.aiche.org . 05.03.2021 . Проверено 29 октября 2022 г.
- ^ «Джесси Блум, доктор философии». Фред Хатч . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ «Джесси Д. Блум» . ХХМИ . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ Перейти обратно: а б Тьягараджан, Баргави; Блум, Джесси Д. (8 июля 2014 г.). Паскуаль, Мерседес (ред.). «Врожденная мутационная толерантность и антигенная эволюция гемагглютинина гриппа» . электронная жизнь . 3 : e03300. doi : 10.7554/eLife.03300 . ISSN 2050-084X . ПМК 4109307 . ПМИД 25006036 .
- ^ Хэддокс, Хью К.; Дингенс, Адам С.; Блум, Джесси Д. (13 декабря 2016 г.). «Экспериментальная оценка влияния всех аминокислотных мутаций белка оболочки ВИЧ на репликацию вируса в клеточной культуре» . ПЛОС Патогены . 12 (12): e1006114. дои : 10.1371/journal.ppat.1006114 . ISSN 1553-7374 . ПМК 5189966 . ПМИД 27959955 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Старр, Тайлер Н.; Грини, Эллисон Дж.; Хилтон, Сара К.; Эллис, Дэниел; Кроуфорд, Кэтрин HD; Дингенс, Адам С.; Наварро, Мэри Джейн; Боуэн, Джон Э.; Торторичи, М. Алехандра; Уоллс, Александра К.; Кинг, Нил П.; Вислер, Дэвид; Блум, Джесси Д. (3 сентября 2020 г.). «Глубокое мутационное сканирование домена связывания рецептора SARS-CoV-2 выявляет ограничения на сворачивание и связывание ACE2» . Клетка . 182 (5): 1295–1310.e20. doi : 10.1016/j.cell.2020.08.012 . ISSN 0092-8674 . ПМЦ 7418704 . ПМИД 32841599 .
- ^ Эгия, Рэйчел Т.; Кроуфорд, Кэтрин HD; Стивенс-Айерс, Терри; Кельнхофер-Миллевольт, Лорел; Гренингер, Александр Л.; Инглунд, Джанет А.; Бек, Майкл Дж.; Блум, Джесси Д. (08 апреля 2021 г.). Лоринг, Адам С. (ред.). «Коронавирус человека эволюционирует антигенно, чтобы избежать иммунитета антител» . ПЛОС Патогены . 17 (4): e1009453. дои : 10.1371/journal.ppat.1009453 . ISSN 1553-7374 . ПМК 8031418 . ПМИД 33831132 .
- ^ Дадонайте, Бернадета; Кроуфорд, Кэтрин HD; Рэдфорд, Кэлан Э.; Фаррелл, Ариана Г.; Ю, Тимоти С.; Хэннон, Уильям В.; Чжоу, Панпан; Андраби, Райес; Бертон, Деннис Р.; Лю, Лихун; Хо, Дэвид Д.; Неер, Ричард А.; Блум, Джесси Д. (13 октября 2022 г.). «Псевдовирусная система обеспечивает глубокое мутационное сканирование полного пика SARS-CoV-2». bioRxiv 10.1101/2022.10.13.512056 .
- ^ Перейти обратно: а б Старр, Тайлер Н.; Грини, Эллисон Дж.; Аддеция, Амин; Хэннон, Уильям В.; Чоудхари, Маниш К.; Дингенс, Адам С.; Ли, Джонатан З.; Блум, Джесси Д. (19 февраля 2021 г.). «Проспективное картирование вирусных мутаций, ускользающих от антител, используемых для лечения COVID-19» . Наука . 371 (6531): 850–854. Бибкод : 2021Sci...371..850S . дои : 10.1126/science.abf9302 . ISSN 0036-8075 . ПМЦ 7963219 . ПМИД 33495308 .
- ^ Грини, Эллисон Дж.; Лоес, Андреа Н.; Кроуфорд, Кэтрин HD; Старр, Тайлер Н.; Мэлоун, Кира Д.; Чу, Хелен Ю.; Блум, Джесси Д. (10 марта 2021 г.). «Комплексное картирование мутаций в домене, связывающем рецептор SARS-CoV-2, которые влияют на распознавание поликлональными антителами плазмы человека» . Клетка-хозяин и микроб . 29 (3): 463–476.e6. дои : 10.1016/j.chom.2021.02.003 . ISSN 1931-3128 . ПМЦ 7869748 . ПМИД 33592168 .
- ^ Грини, Эллисон Дж; Старр, Тайлер Н; Блум, Джесси Д. (11 мая 2022 г.). «Оценщик ускользания антител для мутаций в домене, связывающем рецептор SARS-CoV-2» . Эволюция вирусов . 8 (1): veac021. дои : 10.1093/ve/veac021 . ISSN 2057-1577 . ПМК 9092643 . ПМИД 35573973 .
- ^ Перейти обратно: а б Старр, Тайлер Н.; Зепеда, Саманта К.; Уоллс, Александра К.; Грини, Эллисон Дж.; Альховский, Сергей; Вислер, Дэвид; Блум, Джесси Д. (март 2022 г.). «Связывание ACE2 является наследственной и развивающейся чертой сарбековирусов» . Природа . 603 (7903): 913–918. Бибкод : 2022Natur.603..913S . дои : 10.1038/s41586-022-04464-z . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 8967715 . ПМИД 35114688 .
- ^ Старр, Тайлер Н.; Чудноховский, Надин; Лю, Чжомин; Затта, Фабриция; Пак Ён-Джун; Аддеция, Амин; Пинто, Дора; Бельтрамелло, Мартина; Эрнандес, Патрик; Грини, Эллисон Дж.; Марци, Роберта; Гласс, Уильям Г.; Чжан, Айви; Дингенс, Адам С.; Боуэн, Джон Э. (сентябрь 2021 г.). «Антитела RBD к SARS-CoV-2, которые максимизируют широту распространения и устойчивость к побегу» . Природа . 597 (7874): 97–102. Бибкод : 2021Natur.597...97S . дои : 10.1038/s41586-021-03807-6 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 9282883 . ПМИД 34261126 . S2CID 235907733 .
- ^ Коби, Сара; Блум, Джесси; Старр, Тайлер; Лэш, Натаниэль (28 марта 2022 г.). «Мнение | Мы изучаем эволюцию вирусов. Вот куда, по нашему мнению, движется коронавирус» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ Блум, Джесси; Коби, Сара (12 декабря 2021 г.). «Мнение | Руководство для ученых по пониманию Омикрона» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ Блум, Джесси (30 октября 2022 г.). «Мнение | Призыв сделать исследования вирусов более безопасными» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ Блум, Джесси Д.; Чан, Юцзя Алина; Барик, Ральф С.; Бьоркман, Памела Дж.; Коби, Сара; Деверман, Бенджамин Э.; Фисман, Дэвид Н.; Гупта, Равиндра; Ивасаки, Акико; Липсич, Марк; Меджитов, Руслан; Неер, Ричард А.; Нильсен, Расмус; Паттерсон, Ник; Стернс, Тим (14 мая 2021 г.). Силлс, Дженнифер (ред.). «Исследование происхождения COVID-19» . Наука . 372 (6543): 694. Бибкод : 2021Sci...372..694B . дои : 10.1126/science.abj0016 . ISSN 0036-8075 . ПМЦ 9520851 . ПМИД 33986172 .
- ^ « Этого не должно случиться»: внутри некоммерческой организации по охоте за вирусами в центре спора об утечках из лаборатории» . Ярмарка тщеславия . 31 марта 2022 г. Проверено 18 мая 2022 г.
- ^ Блум, Джесси Д. (9 декабря 2021 г.). Нильсен, Расмус (ред.). «Восстановление удаленных данных глубокого секвенирования проливает больше света на раннюю эпидемию SARS-CoV-2 в Ухане» . Молекулярная биология и эволюция . 38 (12): 5211–5224. дои : 10.1093/molbev/msab246 . ISSN 1537-1719 . ПМЦ 8436388 . ПМИД 34398234 .
- ^ «Премия Макдугалла за наставничество» (PDF) . 6 января 2022 г.
- ^ «Джесси Блум, доктор философии» . ХХМИ . Проверено 29 октября 2022 г.
- ^ «Хорошие новости: Малик и Блум получают награды ASM; пилотный проект, финансируемый семьей Безоса, направлен на создание персонализированных противораковых вакцин» . Фред Хатч . 14 ноября 2016 г. Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ «Премия Энн Палменберг младшему следователю» . Американское общество вирусологии . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ "Люди" . Фонд Саймонса . Проверено 29 октября 2022 г.
- ^ Васкес, Франк (17 февраля 2015 г.). «Премия молодого исследователя вирусов 2015 года вручена!» . Блог МДПИ . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ Трасты, Благотворительная организация Pew. «Pew называет 22 ведущих ученых в области биомедицинских наук» . www.prnewswire.com (пресс-релиз) . Проверено 17 декабря 2022 г.
- ^ «Профиль ученого Джесси Д. Блум» . Программа стипендий Сирла . Архивировано из оригинала 5 сентября 2015 года . Проверено 2 июня 2023 г.
| Международный | |
|---|---|
| Национальный | |
| академики | |
