Jump to content

Открытый язык синтетической биологии

биологии Открытый язык синтетической ( SBOL ) [1] представляет собой предлагаемый стандарт данных для обмена проектами синтетической биологии между пакетами программного обеспечения . [2] Он находится в стадии разработки группой разработчиков SBOL. [3] с 2008 года. Эта группа стремится разработать стандарт открытым и демократичным способом, чтобы включить как можно больше интересов и избежать доминирования одной компании. Группа также стремится со временем разрабатывать и улучшать стандарты проектирования, поскольку это развитие отражается в области синтетической биологии.

Visual . Для визуализации проектов SBOL также был создан язык графического моделирования под названием SBOL [4]

Стандартные визуальные символы открытого языка синтетической биологии (SBOL): промотор , сайт связывания праймера , cds , сайт рестрикции и т. д.
Версия Дата
1.0 ноябрь 2011 г.
1.1 Октябрь 2012 г.
2.0 июль 2015 г.
2.1.0 Октябрь 2016 г. [5]
3.0 сентябрь 2020 г.
  1. ^ «Открытый язык синтетической биологии (SBOL)» .
  2. ^ Гальдзицкий, Михал; Клэнси, Кевин П; Оберортнер, Эрнст; Покок, Мэтью; Куинн, Жаклин Ю; Родригес, Сезар А; Ренер, Николас; Уилсон, Мэнди Л; Адам, Лаура; Андерсон, Дж. Кристофер; Бартли, Брайан А; Бил, Джейкоб; Чандран, Дипак; Чен, Джоанна; Денсмор, Дуглас; Энди, Дрю; Грюнберг, Райк; Халлинан, Дженнифер; Хиллсон, Натан Дж; Джонсон, Джеффри Д.; Кучинский, Аллан; Люкс, Мэтью; Мисирли, Гоксель; Пекку, Жан; Плахар, Гектор А; Сирин, Эврен; Стэн, Гай-Барт; Вильялобос, Алан; Випат, Анил; Дженнари, Джон Х; Майерс, Крис Дж; Сауро, Герберт М. (6 июня 2014 г.). «Открытый язык синтетической биологии (SBOL) обеспечивает стандарт сообщества для обмена информацией о проектах в области синтетической биологии» . Природная биотехнология . 32 (6): 545–550. дои : 10.1038/nbt.2891 . ПМИД   24911500 .
  3. ^ «Управление | Открытый язык синтетической биологии (SBOL)» . sbolstandard.org . Архивировано из оригинала 1 декабря 2015 г.
  4. ^ Куинн, Жаклин Ю.; Кокс, Роберт Сидни; Адлер, Аарон; Бил, Джейкоб; Бхатия, Свапнил; Цай, Ижи; Чен, Джоанна; Клэнси, Кевин; Гальдзицкий, Михал; Хиллсон, Натан Дж.; Ле Новер, Николя; Махешвари, Акшай Дж.; Маклафлин, Джеймс Аластер; Майерс, Крис Дж.; П, Умеш; Покок, Мэтью; Родригес, Сезар; Солдатова, Лариса; Стэн, Гай-Барт В.; Суэйнстон, Нил; Випат, Анил; Сауро, Герберт М. (3 декабря 2015 г.). «SBOL Visual: графический язык для генетического проектирования» . ПЛОС Биология . 13 (12): е1002310. дои : 10.1371/journal.pbio.1002310 . ПМК   4669170 . ПМИД   26633141 .
  5. ^ Бил, Джейкоб; Кокс, Роберт Сидни; Грюнберг, Райк; Маклафлин, Джеймс; Нгуен, Трэми; Бартли, Брайан; Бисселл, Майкл; Чой, Кири; Клэнси, Кевин; МакКлин, Крис; Мэдсен, Кертис; Мисирли, Гоксель; Оберортнер, Эрнст; Покок, Мэтью; Ренер, Николас; Саминени, Мехер; Чжан, Майкл; Чжан, Чжэнь; Зундел, Зак; Дженнари, Джон Х.; Майерс, Крис; Сауро, Герберт; Випат, Анил (2016). «Открытый язык синтетической биологии (SBOL), версия 2.1.0» . Журнал интегративной биоинформатики . 13 (3): 291. doi : 10.1515/jib-2016-291 . hdl : 1983/5e0058e9-0cfa-40a5-b0b8-6195f61ff524 . ПМИД   28187407 .


Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 371df4c9bf16ed62ce1f0acf1e3dda05__1704488460
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/37/05/371df4c9bf16ed62ce1f0acf1e3dda05.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Synthetic Biology Open Language - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)