Открытый язык синтетической биологии
биологии Открытый язык синтетической ( SBOL ) [1] представляет собой предлагаемый стандарт данных для обмена проектами синтетической биологии между пакетами программного обеспечения . [2] Он находится в стадии разработки группой разработчиков SBOL. [3] с 2008 года. Эта группа стремится разработать стандарт открытым и демократичным способом, чтобы включить как можно больше интересов и избежать доминирования одной компании. Группа также стремится со временем разрабатывать и улучшать стандарты проектирования, поскольку это развитие отражается в области синтетической биологии.
Visual . Для визуализации проектов SBOL также был создан язык графического моделирования под названием SBOL [4]

Релизы
[ редактировать ]Версия | Дата |
---|---|
1.0 | ноябрь 2011 г. |
1.1 | Октябрь 2012 г. |
2.0 | июль 2015 г. |
2.1.0 | Октябрь 2016 г. [5] |
3.0 | сентябрь 2020 г. |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Открытый язык синтетической биологии (SBOL)» .
- ^ Гальдзицкий, Михал; Клэнси, Кевин П; Оберортнер, Эрнст; Покок, Мэтью; Куинн, Жаклин Ю; Родригес, Сезар А; Ренер, Николас; Уилсон, Мэнди Л; Адам, Лаура; Андерсон, Дж. Кристофер; Бартли, Брайан А; Бил, Джейкоб; Чандран, Дипак; Чен, Джоанна; Денсмор, Дуглас; Энди, Дрю; Грюнберг, Райк; Халлинан, Дженнифер; Хиллсон, Натан Дж; Джонсон, Джеффри Д.; Кучинский, Аллан; Люкс, Мэтью; Мисирли, Гоксель; Пекку, Жан; Плахар, Гектор А; Сирин, Эврен; Стэн, Гай-Барт; Вильялобос, Алан; Випат, Анил; Дженнари, Джон Х; Майерс, Крис Дж; Сауро, Герберт М. (6 июня 2014 г.). «Открытый язык синтетической биологии (SBOL) обеспечивает стандарт сообщества для обмена информацией о проектах в области синтетической биологии» . Природная биотехнология . 32 (6): 545–550. дои : 10.1038/nbt.2891 . ПМИД 24911500 .
- ^ «Управление | Открытый язык синтетической биологии (SBOL)» . sbolstandard.org . Архивировано из оригинала 1 декабря 2015 г.
- ^ Куинн, Жаклин Ю.; Кокс, Роберт Сидни; Адлер, Аарон; Бил, Джейкоб; Бхатия, Свапнил; Цай, Ижи; Чен, Джоанна; Клэнси, Кевин; Гальдзицкий, Михал; Хиллсон, Натан Дж.; Ле Новер, Николя; Махешвари, Акшай Дж.; Маклафлин, Джеймс Аластер; Майерс, Крис Дж.; П, Умеш; Покок, Мэтью; Родригес, Сезар; Солдатова, Лариса; Стэн, Гай-Барт В.; Суэйнстон, Нил; Випат, Анил; Сауро, Герберт М. (3 декабря 2015 г.). «SBOL Visual: графический язык для генетического проектирования» . ПЛОС Биология . 13 (12): е1002310. дои : 10.1371/journal.pbio.1002310 . ПМК 4669170 . ПМИД 26633141 .
- ^ Бил, Джейкоб; Кокс, Роберт Сидни; Грюнберг, Райк; Маклафлин, Джеймс; Нгуен, Трэми; Бартли, Брайан; Бисселл, Майкл; Чой, Кири; Клэнси, Кевин; МакКлин, Крис; Мэдсен, Кертис; Мисирли, Гоксель; Оберортнер, Эрнст; Покок, Мэтью; Ренер, Николас; Саминени, Мехер; Чжан, Майкл; Чжан, Чжэнь; Зундел, Зак; Дженнари, Джон Х.; Майерс, Крис; Сауро, Герберт; Випат, Анил (2016). «Открытый язык синтетической биологии (SBOL), версия 2.1.0» . Журнал интегративной биоинформатики . 13 (3): 291. doi : 10.1515/jib-2016-291 . hdl : 1983/5e0058e9-0cfa-40a5-b0b8-6195f61ff524 . ПМИД 28187407 .