Vts1

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Vts1
Vts1
	Кристаллическая структура комплекса VTS1P - SRE.
Идентификаторы
Символ	Vts1
Pfam	PF07647
Краткое содержание	1b0x / scope / supfam
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

VTS1 -это посттранскрипционный регулятор, который обладает РНК-связывающим стерильным доменом альфа-мотива (SAM). ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Белок обнаруживается в Saccharomyces cerevisiae и нескольких эукариотах . В Saccharomyces VTS1 влияет на везикулярный транспорт и споруляцию . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Взаимодействие белка-белка через домены SAM участвуют в различных регуляторных действиях, таких как передача сигнала . Также было показано, что белки, имеющие такие домены, распознают и взаимодействуют со структурами РНК сходной формы с элементом ответа SMAUG (SRE). ^{[ 6 ]} VTS1 связывается с РНК -мишенями, которые имеют Cuggc на петлях шпильки . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Джонсон П.Е., Дональдсон Л.В. (февраль 2006 г.). «Распознавание РНК доменом VTS1P SAM». Природа структурная и молекулярная биология . 13 (2): 177–178. doi : 10.1038/nsmb1039 . PMID 16429155 . S2CID 9561521 .
^ Schultz J, Ponting CP, Hofmann K, Bork P (январь 1997 г.). «SAM как домен взаимодействия белка, участвующий в регуляции развития» . Белковая наука . 6 (1): 249–253. doi : 10.1002/pro.5560060128 . PMC 2143507 . PMID 9007998 .
^ Oberstrass FC, Lee A, Stefl R, Janis M, Chanfreau G, Allain FH (февраль 2006 г.). «Специфичное распознавание в структуре домена VTS1p SAM с РНК». Природа структурная и молекулярная биология . 13 (2): 160–167. doi : 10.1038/nsmb1038 . PMID 16429156 . S2CID 15416866 .
^ Deutschbauer AM, Williams RM, Chu AM, Davis RW (ноябрь 2002 г.). «Параллельный фенотипический анализ споруляции и роста постгерации у Saccharomyces cerevisiae» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (24): 15530–15535. Bibcode : 2002pnas ... 9915530d . doi : 10.1073/pnas.202604399 . PMC 137751 . PMID 12432101 .
^ Dilcher M, Köhler B, Von Mollard GF (сентябрь 2001 г.). «Генетические взаимодействия с дрожжами Q-SNARE VTI1 выявляют новые функции для R-SNARE YKT6» . Журнал биологической химии . 276 (37): 34537–34544. doi : 10.1074/jbc.m101551200 . PMID 11445562 .
^ Зал TM (сентябрь 2003 г.). «Сэм нарушает свой стереотип» . Природа структурная биология . 10 (9): 677–679. doi : 10.1038/nsb0903-677 . PMID 12942139 . S2CID 9072100 .
^ Oberstrass FC, Lee A, Stefl R, Janis M, Chanfreau G, Allain FH (февраль 2006 г.). «Специфичное распознавание в структуре домена VTS1p SAM с РНК». Природа структурная и молекулярная биология . 13 (2): 160–167. doi : 10.1038/nsmb1038 . PMID 16429156 . S2CID 15416866 .

[1] Джонсон П.Е., Дональдсон Л.В. (февраль 2006 г.). «Распознавание РНК доменом VTS1P SAM». Природа структурная и молекулярная биология . 13 (2): 177–178. doi : 10.1038/nsmb1039 . PMID 16429155 . S2CID 9561521 .

[PUB00005047-2] Schultz J, Ponting CP, Hofmann K, Bork P (январь 1997 г.). «SAM как домен взаимодействия белка, участвующий в регуляции развития» . Белковая наука . 6 (1): 249–253. doi : 10.1002/pro.5560060128 . PMC 2143507 . PMID 9007998 .

[3] Oberstrass FC, Lee A, Stefl R, Janis M, Chanfreau G, Allain FH (февраль 2006 г.). «Специфичное распознавание в структуре домена VTS1p SAM с РНК». Природа структурная и молекулярная биология . 13 (2): 160–167. doi : 10.1038/nsmb1038 . PMID 16429156 . S2CID 15416866 .

[4] Deutschbauer AM, Williams RM, Chu AM, Davis RW (ноябрь 2002 г.). «Параллельный фенотипический анализ споруляции и роста постгерации у Saccharomyces cerevisiae» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (24): 15530–15535. Bibcode : 2002pnas ... 9915530d . doi : 10.1073/pnas.202604399 . PMC 137751 . PMID 12432101 .

[5] Dilcher M, Köhler B, Von Mollard GF (сентябрь 2001 г.). «Генетические взаимодействия с дрожжами Q-SNARE VTI1 выявляют новые функции для R-SNARE YKT6» . Журнал биологической химии . 276 (37): 34537–34544. doi : 10.1074/jbc.m101551200 . PMID 11445562 .

[6] Зал TM (сентябрь 2003 г.). «Сэм нарушает свой стереотип» . Природа структурная биология . 10 (9): 677–679. doi : 10.1038/nsb0903-677 . PMID 12942139 . S2CID 9072100 .

[7] Oberstrass FC, Lee A, Stefl R, Janis M, Chanfreau G, Allain FH (февраль 2006 г.). «Специфичное распознавание в структуре домена VTS1p SAM с РНК». Природа структурная и молекулярная биология . 13 (2): 160–167. doi : 10.1038/nsmb1038 . PMID 16429156 . S2CID 15416866 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]