ФОКИД
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | база данных посттрансляционных модификаций . |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Институт биохимии Макса Планка |
| Лаборатория | Отдел протеомики и передачи сигналов |
| Авторы | Флориан Грейс |
| Первичное цитирование | Грейс и др. (2011) [ 1 ] |
| Дата выпуска | 2009 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://www.phosida.com |
PHO - спорилирование SI te DA tabase PHOSIDA объединяет тысячи высоконадежных in vivo, фосфозитов идентифицированных у различных видов на основе технологии масс-спектрометрии . Для каждого фосфозита PHOSIDA перечисляет соответствующие киназные мотивы, предсказанные вторичные структуры, закономерности консервации и его динамическую регуляцию при стимулировании или других воздействиях, таких как, например, ингибирование киназы. Он включает фосфопротеомы различных организмов, от эукариот, таких как человек и дрожжи , до бактерий, таких как Escherichia coli и Lactococcus Lactis . даже фосфопротеом архейного организма, а именно Halobacterium salinarium Доступен . Интеграция фосфопротеомов, идентифицированных в организмах, которые репрезентативно охватывают филогенетическое дерево, позволяет рассматривать события фосфорилирования с глобальной точки зрения, включая консервацию и эволюционное сохранение во времени. [ 1 ]
Более того, PHOSIDA также прогнозирует фосфозиты на основе машин опорных векторов .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Гнад, Флориан; Гунавардена Джереми; Манн Матиас (январь 2011 г.). «PHOSIDA 2011: база данных посттрансляционных модификаций» . Нуклеиновые кислоты Рез . 39 (Проблема с базой данных): D253-60. дои : 10.1093/нар/gkq1159 . ПМК 3013726 . ПМИД 21081558 .