✖


Jump to content

Вычислительный институт Возрождения

Add links
Координаты : 35 ° 56'22 "с.ш. 79 ° 01'08" з.д.  /  35,939561 ° с.ш. 79,018753 ° з.д.  / 35,939561; -79.018753
Вычислительный институт Возрождения (RENCI)
Главный кампус RENCI на Европа-Драйв, Чапел-Хилл, Северная Каролина.
Учредил 2004
Область исследований
наука о данных и киберинфраструктура; науки об окружающей среде; биомедицинские и медицинские науки
Директор Стэнли К. Ахальт, доктор философии
Расположение Чапел-Хилл, Северная Каролина
Принадлежности Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл
Веб-сайт renci.org

Вычислительный институт Возрождения (RENCI) был основан в 2004 году в результате сотрудничества штата Северная Каролина , Университета Северной Каролины в Чапел-Хилл (UNC-CH), Университета Дьюка и Университета штата Северная Каролина . RENCI организационно структурирован как исследовательский институт в рамках UNC-CH, а его главный кампус расположен в Чапел-Хилл, Северная Каролина , в нескольких милях от кампуса UNC-CH. RENCI имеет центры взаимодействия в UNC-CH, Университете Дьюка (Дарем) и Университете штата Северная Каролина (Роли).

Директором-основателем RENCI был Дэниел А. Рид; Стэнли С. Ахальт - нынешний директор. В компании RENCI работает более 80 сотрудников.

Заявление о миссии

[ редактировать ]

Текущая миссия RENCI: «разрабатывать и внедрять передовые технологии, способствующие исследовательским открытиям и практическим инновациям». [ 1 ] RENCI достигает своей миссии, сотрудничая с академическими исследователями, государственными политиками и лидерами отрасли, участвуя в исследованиях и разработках, направленных на решение важнейших задач в нескольких основных областях: наука о данных и киберинфраструктура; науки об окружающей среде; и биомедицинские и медицинские науки.

История

[ редактировать ]

RENCI был основан в январе 2004 года Дэниелом А. Ридом, доктором философии, при финансовой поддержке штата Северная Каролина, UNC-CH, Университета штата Северная Каролина и Университета Дьюка. [ 2 ] [ 3 ] Доктор Рид ранее работал директором Национального центра суперкомпьютерных приложений (NCSA), главным архитектором Национального научного фонда (NSF) инициативы TeraGrid и членом президентского консультативного комитета по информационным технологиям. В мае 2004 года Алан Блатеки присоединился к РЕНСИ в качестве заместителя директора. Г-н Блатеки ранее занимал должность исполнительного директора Суперкомпьютерного центра Сан-Диего и руководителя инициативы NSF Middleware.

Первоначальная миссия RENCI заключалась в следующем:

служить многопрофильным институтом, объединяющим академию, торговлю и общество для обогащения и расширения возможностей человеческого потенциала, создания межинституциональных партнерств, а также разработки и развертывания ведущей в мире вычислительной инфраструктуры.

В декабре 2005 года RENCI получила 5,9 миллиона долларов в виде финансирования от штата Северная Каролина на 2005-2006 финансовый год и 11,8 миллиона долларов в виде периодических средств на «поддержку персонала, компьютерные операции и оборудование». Это финансирование имело решающее значение для RENCI, поскольку оно разработало общештатную инфраструктуру для создания виртуальной организации и использовало эту инфраструктуру и опыт сотрудников RENCI для участия в финансируемых из федерального бюджета проектах, представляющих интерес для штата. Первоначальное внимание RENCI было сосредоточено на применении кибертехнологий и передовой аналитики для планирования, смягчения последствий и реагирования на стихийные бедствия в прибрежных районах. С тех пор РЕНСИ участвует в различных партнерских отношениях по всей Северной Каролине и по всей стране. Эти партнерства принесли многочисленные федеральные гранты, что обеспечило организации дополнительный поток доходов.

В 2007 году в РЕНСИ произошла смена руководства с уходом доктора Рида и назначением г-на Блатецкого временным директором. За это время RENCI внедрила свой первый процесс стратегического планирования. Этот процесс привел к пересмотренной формулировке миссии:

Вычислительный институт Возрождения, многоинституциональная организация, объединяет междисциплинарных экспертов и передовые технологические возможности для решения актуальных исследовательских проблем и поиска решений сложных проблем, которые влияют на качество жизни в Северной Каролине, нашей стране и мире.

В 2009 году на должность директора был назначен доктор философии Стэнли К. Ахалт. Доктор Ахалт ранее занимал должность исполнительного директора Суперкомпьютерного центра Огайо (OSC) и был профессором кафедры электротехники и вычислительной техники Университета штата Огайо (OSU). По прибытии в RENCI д-р Ахальт получил должность профессора кафедры информатики UNC-CH.

Ашок Кришнамурти, доктор философии, был назначен заместителем директора в феврале 2013 года. Доктор Кришнамурти ранее был директором по исследованиям и научным разработкам в OSC и доцентом кафедры компьютерной и электротехники ОГУ.

Под руководством доктора. Ахальта и Кришнамурти, РЕНСИ расширила численность своего персонала, внешних партнеров и широту деятельности. Было запущено несколько ключевых партнерств и инициатив. Первым из них является партнерство с Медицинским факультетом UNC-CH в рамках премии Центра трансляционных и клинических наук Национального института здравоохранения (NIH), которое привело к созданию в 2008 году Института трансляционных и клинических наук Северной Каролины (NC TraCS). ). Доктора. Ахальт и Кришнамурти являются соответственно директором и содиректором Службы биомедицинской информатики в NC TraCS. Вторым ключевым мероприятием стало основание Института программного обеспечения для водных наук (WSSI), соучредителями которого выступили RENCI и Национальный центр социально-экологического синтеза (SESYNC) в сентябре 2012 года. Третьим ключевым мероприятием стало создание Национального консорциума. по науке о данных (NCDS) в феврале 2013 года. Штаб-квартира NCDS находится в RENCI, и в нее входят представители ученых, промышленности и правительства. Наконец, четвертым ключевым мероприятием стало создание Консорциума iRODS в марте 2013 года. Консорциум iRODS также имеет штаб-квартиру в RENCI и включает в себя разнообразных международных членов.

Текущее руководство

[ редактировать ]
  • Стэнли С. Ахальт, директор
  • Ашок Кришнамурти, заместитель директора
  • Джей Айкат, главный операционный директор
  • Илья Балдин, директор по сетевым исследованиям и инфраструктуре
  • Брайан Блэнтон, директор по наукам о Земле
  • Террел Рассел, директор по управлению данными и исполнительный директор консорциума iRODS
  • Роб Фаулер, директор по высокопроизводительным вычислениям
  • Рэй Идашак, директор DevOps
  • Рик Люттич, главный научный сотрудник прибрежных моделей
  • Леа Шэнли, соисполнительный директор South Big Data Hub
  • Кирк К. Вильгельмсен, главный научный сотрудник в области геномики и директор инициатив биомедицинских исследований

Ключевые направления исследований и разработок и технологии

[ редактировать ]

Наука о данных и киберинфраструктура

[ редактировать ]

RENCI имеет ряд активных исследовательских программ, направленных на разработку и внедрение передовых вычислительных и сетевых возможностей. Многие из полученных технологий имеют открытый исходный код. Например, ExoGENI с открытым исходным кодом (Exo-Global Environment for Network Innovation) разрабатывается в рамках инициативы GENI, финансируемой NSF. [ 4 ] [ 5 ] ExoGENI функционирует как интегрированная облачная платформа «Сетевая инфраструктура как услуга» (NIaaS) для динамического предоставления сетевых, хранилищ и вычислительных ресурсов. ADAMANT (Адаптивные топологии многодоменных приложений с учетом данных), также финансируемый NSF, основан на ExoGENI. АДАМАНТ интегрирует Pegasus (управление рабочими процессами) и HT Condor систему научных рабочих процессов с платформой ExoGENI NIAaS для организации выполнения крупномасштабных научных рабочих процессов через распределенное облако или традиционные высокопроизводительные вычислительные ресурсы. iRODS (интегрированная система данных, ориентированная на правила) была разработана Центрами киберсред с интенсивным использованием данных (DICE) в UNC-CH и Калифорнийском университете в Сан-Диего и в настоящее время поддерживается RENCI. iRODS — это технология промежуточного программного обеспечения с открытым исходным кодом, предназначенная для обеспечения контроля на основе политик над доступом к данным, их перемещением, использованием и архивированием в различных географических точках, с использованием различных технологий хранения и нескольких групп пользователей, каждая из которых имеет разные политики в отношении доступа и использования данных. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] RADII (Ресурсно-ориентированная инфраструктура для совместной работы с данными; ссылка в Интернете) интегрирует ORCA (открытую архитектуру управления ресурсами) GENI с iRODS для динамического предоставления распределенной облачной инфраструктуры для многоинституционального сотрудничества в области исследований, основанных на данных. RADII достигает этого с помощью программного обеспечения, предназначенного для моделирования данных исследований и сопоставления элементов данных, вычислений и хранения с базовой физической инфраструктурой iRODS. DataBridge стремится предоставить многомерную социометрическую сетевую систему для обмена коллекциями данных с длинным хвостом. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] DataBridge — это инструмент для совместной работы с открытым исходным кодом, который позволяет ученым исследовать доступные наборы данных и соответствующие им алгоритмы, а также определять семантические мосты для связи и доступа к различным наборам данных в социометрической сети.

Науки об окружающей среде

[ редактировать ]

Многие из проектов RENCI в области наук об окружающей среде сосредоточены на гидрологии , прибрежных штормовых нагонах и передовом моделировании, помогающем подготовиться к стихийным бедствиям. ADCIRC — это модель программного обеспечения с открытым исходным кодом, которая применяет расширенную аналитику к множеству источников и типов данных (например, наборам гидрологических данных, наборам атмосферных данных, данным прогнозирования тропических штормов, данным Географической информационной системы и т. д.), чтобы обеспечить возможность работы в режиме реального времени с высоким разрешением. прогнозирование воздействия прибрежных штормовых нагонов и наводнений после ураганов и связанных с ними событий. [ 13 ] [ 14 ] В сотрудничестве с исследователями из Центра устойчивости прибрежных районов UNC и Национального центра ураганов ADCIRC разрабатывается как система прибрежного прогнозирования, которая поможет в планировании на случай стихийных бедствий на уровне штата и на федеральном уровне и поддержке принятия решений. EarthCube — это инициатива, финансируемая NSF, целью которой является «разработка в течение следующего десятилетия структуры, которая поможет исследователям понять и предсказать земную систему от Солнца до центра Земли». [ 15 ] [ 16 ] EarthCube разрабатывается как открытая динамическая киберинфраструктура, обеспечивающая управляемый сообществом обмен данными в области наук о Земле, включая науку об океане , полярные исследования, науки об атмосфере, геокосмос, информатику и другие области. HydroShare поддерживается финансируемым NSF CUAHSI (Консорциумом университетов по развитию гидрологической науки Inc.) и находится в стадии разработки как киберинфраструктура открытого сотрудничества для гидрологии. [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] HydroShare позволяет ученым-водникам идентифицировать и извлекать наборы данных, связанных с водой, а также связанные с ними алгоритмы и модели, а затем анализировать и выполнять вычисления на основе данных с использованием распределенной вычислительной среды, которая включает в себя облачные технологии на основе сетки, а также возможности высокопроизводительных вычислений и хранения данных.

Биомедицинские и медицинские науки

[ редактировать ]

Основным направлением работы RENCI в области биомедицины и здравоохранения является клиническая геномика. RENCI сотрудничает с NC TraCS, Комплексным онкологическим центром Lineberger в UNC-CH и Отделом исследований и вычислений служб информационных технологий UNC над разработкой и внедрением технологий для поддержки технологий геномного секвенирования следующего поколения, таких как полногеномное секвенирование (WGS) и полноэкзомное секвенирование. (ВЕС). Эти технологии включают в себя механизм GMW (Genetic Medical Workflow), который частично финансировался НИЗ и обеспечивает сквозной сбор, анализ, проверку и отчетность данных WGS и WES. GMW Engine спроектирован как архитектура с открытым исходным кодом, которая координирует рабочие процессы, подпроцессы, образцы, данные и людей для поддержки всех аспектов геномных исследований и клинического применения, от первоначального визита пациента до отчета о геномных результатах под руководством врача. [ 20 ] MapSeq (Masily Parallel Sequencing) — это сервис-ориентированная архитектура (SOA) на основе плагинов с открытым исходным кодом, которая обеспечивает безопасное управление и выполнение сложных последующих вычислительных и аналитических шагов, связанных с высокопроизводительным геномным секвенированием и другими приложениями с интенсивным использованием данных. [ 21 ] MaPSeq и родственная ему технология GATE (Grid Access Triage Engine) построены на основе Apache Karaf и вместе обеспечивают расширяемые возможности для последующего анализа геномных данных и других больших наборов данных, включая выполнение и управление конвейером рабочих процессов, метапланирование рабочие процессы, гибкое использование вычислительных ресурсов, безопасная передача данных и доступ клиентов через Интернет. CANVAS (хранилище вариантов аннотаций CAroliNa) и AnnoBot (бот аннотаций) работают вместе, чтобы предоставлять аннотации и метаданные с контролем версий для данных о геномных вариантах, чтобы поддерживать современную клиническую интерпретацию геномных вариантов и тем самым направлять процесс принятия клинических решений. [ 22 ] CANVAS спроектирован как реляционная реляционная база данных PostgreSQL с открытым исходным кодом , в которой хранятся данные о геномных вариантах со соответствующими аннотациями и метаданными. AnnoBot состоит из модулей Python и кода программного драйвера, настроенного для обеспечения автоматического мониторинга и получения внешних источников данных для обновления аннотаций. CHAT (маркировка конвергентных гаплотипических ассоциаций) — это программный алгоритм, который позволяет идентифицировать умеренно проникающие геномные варианты с использованием межпопуляционных генетических структур. CHAT использует алгоритм, основанный на теории графов, для определения фазы гаплотипа популяции неродственных людей путем: идентификации подмножеств людей, которые имеют общую область генома по происхождению; а затем создание консенсусного гаплотипа для общего региона. [ 23 ] SMW Институциональным (Secure Medical Workspace) обеспечивает безопасную среду для доступа к конфиденциальным данным пациентов для клинической помощи или наблюдательным советом . клинических исследований, одобренных [ 24 ] [ 25 ] Архитектура SMW с открытым исходным кодом использует технологию виртуализации (т. е. VMWare ) и технологию защиты от утечки данных (DLP) (т. е. WebSense ) для создания безопасного виртуального рабочего пространства в сочетании с возможностью предотвратить (или разрешить с помощью вызова и аудита со стороны персонала информационных технологий). ) физическое удаление данных из центральной безопасной среды хранения.

Институты и консорциумы

[ редактировать ]

RENCI был инициатором создания национального института WSSI и двух крупных консорциумов: iRODS Consortium и NCDS.

WSSI

[ редактировать ]

WSSI, финансируемый NSF, был создан в сентябре 2012 года в результате сотрудничества RENCI и SESYNC. Миссия WSSI состоит в том, чтобы «обеспечить и ускорить новую трансформационную науку о водных ресурсах путем одновременного преобразования как культуры программного обеспечения, так и исследовательской культуры сообщества наук о водных ресурсах». [ 26 ] [ 27 ] Когда WSSI заработает на полную мощность, WSSI планирует работать в рамках модели взаимодействия с открытым сообществом, которая будет интегрировать многочисленные инициативы, финансируемые NSF (центры синтеза, экологические обсерватории, институты устойчивости программного обеспечения и т. д.) для сбора данных, идей, теорий и методов. и тем самым предоставить синтетическую информацию для решения проблем науки о водных ресурсах, которые невозможно решить с помощью традиционных дисциплинарных методов. Деятельность WSSI сосредоточена на развитии открытого сообщества и содействии разработке гибкого программного обеспечения с открытым исходным кодом с целью ускорения преобразующих исследований в области водных ресурсов. Помимо RENCI и SESYNC, в число нынешних членов входят Институт окружающей среды UNC-CH, Университет Иллинойса в Урбане-Шампейн , Мичиганский университет , Университет Мэриленда , NCSA, RedHat , Национальное управление океанических и атмосферных исследований и IBM .

НЦДС

[ редактировать ]

NCDS была основана RENCI в феврале 2013 года как государственно-частное партнерство ведущих университетов, правительственных и некоммерческих учреждений и предприятий, занимающееся развитием науки о данных, которую NCDS определяет как «систематическое исследование организации и использования цифровых технологий». данных, чтобы ускорить открытие, улучшить процессы принятия важных решений и создать экономику, основанную на данных». [ 28 ] Миссия NCDS заключается в том, чтобы «обеспечить основу, необходимую для продвижения исследований в области науки о данных, образования и экономических возможностей». NCDS работает над выполнением этой миссии, обеспечивая интеллектуальное лидерство и организуя многочисленные семинары, стипендии для академических и отраслевых преподавателей, серию летних краткосрочных курсов Data Matters, карьерные мероприятия для студентов, приглашенные доклады и встречи на высшем уровне. Кроме того, NCDS спонсирует Обсерваторию данных, которая обеспечивает общую федеративную инфраструктуру для совместного использования данных и вычислений. NCDS также сотрудничает с многочисленными региональными усилиями в области науки о данных, включая Datapalooza, Triangle Open Data Day, Pearl Hacks, Data4Decisions, Analytics Forward UnConference и другие. По состоянию на июнь 2015 года в состав NCDS входят 15 организаций-членов, 8 из которых базируются в Северной Каролине, а 4 транснациональные компании имеют сильное присутствие в Research Triangle Park , Северная Каролина.

Консорциум iRODS

[ редактировать ]

Консорциум iRODS был основан RENCI в марте 2013 года, его штаб-квартира находится в RENCI, как и основная команда разработчиков iRODS. Миссия консорциума — «обеспечить устойчивость интегрированной системы данных, ориентированной на правила (iRODS), а также способствовать ее внедрению и дальнейшему развитию». [ 29 ] Для достижения своей миссии консорциум работает над разработкой стандартов для технологии iRODS с открытым исходным кодом и ее будущим развитием, продвигает достижения в этой технологии и расширяет базу пользователей. Консорциум также поддерживает разработку критически важной версии iRODS производственного уровня (в настоящее время v4.1). Консорциум iRODS включает в себя различные организации пользователей iRODS со всего мира. В настоящее время в состав консорциума входят RENCI, центры DICE в UNC-CH и Калифорнийском университете в Сан-Диего, DataDirect Networks , Seagate Technology , Wellcome Trust Sanger Institute , EMC Corporation (EMC2), IBM и Центр обработки данных НАСА по атмосферным наукам.

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Веб-сайт РЕНСИ, renci.org.
  2. ^ Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. (2004-2010). Годовые финансовые отчеты. Чапел-Хилл, Северная Каролина: Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. Доступно по адресу: http://research.unc.edu/offices/vice-chancellor/about/annual-reports .
  3. ^ Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. (2011-2014). Комплексные годовые финансовые отчеты. Чапел-Хилл, Северная Каролина: Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. Доступно по адресу: http://finance.unc.edu/reports-and-data/financial-statements-archive .
  4. ^ Балдин И., Рут П., Синь Ю., Мандал А., Чейз Дж., Тилсон Дж. и Прасад. С. (2013). Видения будущего Интернета: пример ExoGENI. RENCI/NCDS, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл, Чапел-Хилл, Северная Каролина, США. дои : 10.7921/G0CC0XM1 .
  5. ^ Балдин И., Синь Ю., Мандал А., Рут П., Хирман К. и Чейз Дж. (2012). ExoGENI: многодоменная испытательная площадка «инфраструктура как услуга». Материалы 8-й Международной конференции ИКСТ по испытательным стендам и исследовательским инфраструктурам для развития сетей и сообществ (TridentCom). Доступно по адресу: https://www.cs.duke.edu/~chase/exogeni.pdf .
  6. ^ Раджасекар, А.; Мур, Р.; Хоу, К.; Ли, Калифорния; Марчиано, Р.; де Торси, А.; Ван, М.; Шредер, В.; Чен, С.; Гилберт, Л.; Туби, П.; Чжу, Б. (2010a). «iRODS Primer: интегрированная система данных, ориентированная на правила» . Обобщающие лекции по информационным концепциям, поиску и услугам . 2 (1): 1–143. дои : 10.2200/s00233ed1v01y200912icr012 .
  7. ^ Раджасекар А., Мур Р., Ван М., Шредер В. и Хасан А. (2010b). Применение правил как политики для крупномасштабного обмена данными. Интеллектуальные системы, моделирование и моделирование (ISMS), Международная конференция 2010 г. по интеллектуальным системам, моделированию и симуляции. Доступно по адресу: https://ieeexplore.ieee.org/xpls/abs_all.jsp?arnumber=5416072 .
  8. ^ Шмитт К., Вильгельмсен К., Кришнамурти А., Ахальт С. и Фечо К. (2013b). Безопасность и конфиденциальность в эпоху больших данных: iRODS, технологическое решение проблемы реализации политик и процедур безопасности и конфиденциальности. РЕНСИ, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. Доступно по адресу: http://www.renci.org/wp-content/uploads/2014/02/0313WhitePaper-iRODS.pdf .
  9. ^ Фортнер Б., Ахальт С., Копоски Дж., Фечо К., Кришнамурти А., Мур Р., Раджасекар А., Шмитт К. и Шредер В. (2014). Контролируйте свои данные: iRODS, интегрированная система данных, ориентированная на правила. РЕНСИ, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. Доступно по адресу: http://renci.org/wp-content/uploads/2014/07/0214WhitePaper-iRODS-2-FINAL-v6.pdf .
  10. ^ Раджасекар, А., Кум, Х., Крозас, М., Крэбтри, Дж., Шанкаран, С., Ландер, Х., Карси, Т., Кинг, Г., и Жан, Дж. (2013a). Мост данных. Научный журнал, ASE. Доступно по адресу: http://databridge.web.unc.edu/files/2013/01/DataBridge_Journal_Final.pdf .
  11. ^ Раджасекар А., Шанкаран С., Ландер Х., Карси Т., Крэбтри Дж., Кум Х., Кросас М., Кинг Г. и Жан Дж. (2013b). Социометрические методы анализа релевантности научных данных «длинного хвоста». Международная конференция ASE/IEEE по большим данным. Доступно по адресу: http://databridge.web.unc.edu/files/2013/01/Databridge-ConferenceVersion-final.pdf .
  12. ^ Крэбтри, Дж. (2013). DataBridge: создание инструмента среды для совместной работы в области электронных наук для объединения различных наборов данных в социометрическую сеть. IASSIST 2013. Доступно по адресу: http://databridge.web.unc.edu/files/2013/07/IASSIST2013DataBridgeFinal.ppt .
  13. ^ Люттич, Р.А., Вестеринк, Дж.Дж., и Шеффнер, Н.З. (1992). ADCIRC: усовершенствованная трехмерная модель циркуляции для шельфовых побережий и эстуариев, отчет 1: теория и методология ADCIRC-2DDI и ADCIRC-3DL. Технический отчет по программе дноуглубительных исследований DRP-92-6. Экспериментальная станция водных путей армии США, Виксбург, штат Массачусетс. Доступно по адресу: http://www.dtic.mil/dtic/tr/fulltext/u2/a261608.pdf .
  14. ^ Вестеринк, Дж.; Люттич, Р.; Фейен, Дж.; Аткинсон, Дж.; Доусон, К.; Робертс, Х.; Пауэлл, М.; Данион, Дж.; Кубатько Е.; Пуртахери, Х. (2008). «Модель неструктурированной сетки ураганного штормового нагона в масштабе бассейна и канала, примененная к Южной Луизиане» . Ежемесячный обзор погоды . 136 (3): 833–864. Бибкод : 2008MWRv..136..833W . дои : 10.1175/2007MWR1946.1 .
  15. ^ Кэрон, Б. (2011). Технический документ по управлению EarthCube: получение ожидаемой прибыли от инвестиций EarthCube в строительство сообществ и демократическое управление. Институт исследований новых медиа, Санта-Барбара, Калифорния. Доступно по адресу: http://semanticommunity.info/@api/deki/files/13792/=004_Caron.pdf .
  16. ^ Гил Ю. , Чан М., Гомес Б. и Кэрон Б. (2014). EarthCube: прошлое, настоящее и будущее. Отчет о проекте EarthCube. ЕС, 3. Доступно по адресу: http://earthcube.org/file/3616/download?token=bVernkf4 .
  17. ^ Тарботон, Д.Г., Идашак, Р., Хорсбург, Дж.С., Херд, Дж., Эймс, Д., Гудолл, Дж.Л., Бэнд, Л.Е., Мервейд, В., Коуч, А., Арриго, Дж., Хупер, Р. ., Валентайн Д. и Мейдмент Д. (2014a). Ресурсно-ориентированный подход для развития сотрудничества посредством обмена гидрологическими данными и моделями. 11-я Международная конференция по гидроинформатике, HIC 2014, Нью-Йорк, США. Доступно по адресу: http://www.hic2014.org/proceedings/bitstream/handle/123456789/1539/1566.pdf?sequence=1&isAllowed=y .
  18. ^ Тарботон, Д.Г., Идашак, Р., Хорсбург, Дж.С., Херд, Дж., Эймс, Д., Гудолл, Дж.Л., Бэнд, Л.Е., Мервейд, В., Коуч, А., Арриго, Дж., Хупер, Р. ., Валентайн Д. и Мейдмент Д. (2014b). HydroShare: Развитие сотрудничества посредством обмена гидрологическими данными и моделями. В Д. П. Эймсе, С. В. Т. Куинн и А. Е. Риццоли (редакторы), Труды 7-го Международного конгресса по экологическому моделированию и программному обеспечению. Сан-Диего, Калифорния: Международное общество экологического моделирования и программного обеспечения (iEMS). ISBN   978-88-9035-744-2 . http://www.iemss.org/sites/iemss2014/papers/iemss2014_submission_243.pdf .
  19. ^ Херд, Дж., Тарботон, Д., Идашак, Р., Хорсбург, Дж., Эймс, Д., Бедиг, А., Кастронова, А.М., Коуч, А., Дэш, П., Фрисби, К., Ган, Т., Гудолл, Дж., Джексон, С., Ливингстон, С., Мейдмент, Д., Мартин, Н., Майлз, Б., Миллс, С., Сэдлер Дж., Валентайн Д. и Чжао Л. (2014). Архитектурный обзор Hydroshare, гидрологической информационной системы следующего поколения. 11-я Международная конференция по гидроинформатике, HIC 2014, Нью-Йорк, США. Доступно по адресу: http://www.hic2014.org/proceedings/bitstream/handle/123456789/1536/1562.pdf?sequence=1&isAllowed=y .
  20. ^ Оуэн, П., Ахальт, С., Берг, Дж., Койл, Дж., Эванс, Дж., Фечо, К., Гиллис, Д., Шмитт, К., Янг, Д. и Вильгельмсен, К. (2014): Технологии геномной медицины: GMW, механизм генетического медицинского рабочего процесса. РЕНСИ, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. дои : 10.7921.G0KW5CXC . Доступно по адресу: http://renci.org/technical-reports/tr-14-02-the-gmw-a-genetic-medical-workflow-engine .
  21. ^ Рейли Дж., Ахальт С., Фечо К., Джонс К., МакГи Дж., Роуч Дж., Шмитт К. и Вильгельмсен К. (2014). Технологии геномной медицины: MaPSeq, менеджер вычислительных и аналитических рабочих процессов для последующего геномного секвенирования. РЕНСИ, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. дои : 10.7921.G0VD6WCF . Доступно по адресу: http://renci.org/technical-reports/mapseq-computational-and-analytical-workflow-manager .
  22. ^ Бизон К., Ахальт С., Фечо К., Нассар Н., Шмитт К., Скотт Э. и Вильгельмсен К. (2014). Технологии геномной медицины: CANVAS и AnnoBot, решения для аннотации геномных вариантов. РЕНСИ, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. дои : 10.7921.G0QN64N3 . Доступно по адресу: http://renci.org/technical-reports/tr-14-04-canvas-and-annobot-solutions-for-genomic-variant-annotation .
  23. ^ Уэбб, AE (2011). Анализ сцепления, ассоциации и гаплотипов: спектр подходов к выяснению генетического влияния сложных признаков человека (докторская диссертация). Получено из электронного собрания диссертаций и диссертаций UNC. (кдм 3992)
  24. ^ Шмитт, К., Шоффнер, М., Оуэн П., Ван, Х., Ламм, Б., Мостафа, Дж., Баркер, М., Кришнамурти, А., Вильгельмсен, К., Ахальт, С., и Фечо, К. (2013a). Безопасность и конфиденциальность в эпоху больших данных: SMW, технологическое решение проблемы утечки данных. РЕНСИ, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл. Доступно по адресу: http://www.renci.org/wp-content/uploads/2014/02/0213WhitePaper-SMW.pdf .
  25. ^ Шоффнер, М.; Оуэнс, П.; Мостафа Дж.; Ламм, Б.; Ван, X.; Шмитт, КП; Ахалт, СП (2014). «Безопасное рабочее пространство для медицинских исследований: ИТ-инфраструктура для обеспечения безопасных исследований клинических данных» . Клиническая и трансляционная наука . 6 (3): 222–225. дои : 10.1111/cts.12060 . ПМЦ   3682797 . ПМИД   23751029 .
  26. ^ Ахальт С., Минскер Б., Тиманн М., Бэнд Л., Палмер М., Идашак Р., Ленхардт К. и Уиттон М. (2013). Институт программного обеспечения для водных наук: процесс взаимодействия с открытым исходным кодом. Материалы 5-го международного семинара по разработке программного обеспечения для вычислительной науки и техники, 40-47. Доступно по адресу: http://waters2i2.org/documents/2013/05/water-science-software-institute-an-open-source-engagement-approach.pdf .
  27. ^ Ленхардт, В.К., Ахальт, С., Джонс, М., Аукема, Дж., Хэмптон, С., Идашак, Р., Ребих-Хеспан, С., и Шильдхауэр, М. (2014). Уроки ISEES-WSSI по программному обеспечению устойчивой науки от Института подготовки молодых специалистов по синтезу открытой науки. Фиговая доля. Доступно по адресу: http://files.figshare.com/1796332/ISEES_WSSI_TrainingInst_REV_20141115.pdf .
  28. ^ Ахальт, К.С., Бизон, К., Эванс, Дж., Эрлих, Ю., и Гинзбург, Г.С., Кришнамурти, А., Ланге, Л., Малтби, Д., Масис, Д., Шмитт, К., Вильгельмсен, К. (2014). Данные для открытий: геномы для здоровья. Белая книга Национального консорциума по науке о данных. РЕНСИ, Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл, Чапел-Хилл, Северная Каролина, США. Доступно по адресу: doi: 10.7921.G03X84K4. Доступно по адресу: http://data2discovery.org/dev/wp-content/uploads/2014/02/NCDS-Summit-2013.pdf .
  29. ^ Консорциум iRODS. По законам. 1 декабря 2014 г. Доступно по адресу: http://irods.org/wp-content/uploads/2014/12/iRODS_ByLaws_V1120114.pdf .
[ редактировать ]

35 ° 56'22 "с.ш. 79 ° 01'08" з.д.  /  35,939561 ° с.ш. 79,018753 ° з.д.  / 35,939561; -79.018753

Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Renaissance_Computing_Institute&oldid=1237720510"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 57430acf3f49bda7dcac9b1081c9e04d__1722390480
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/57/4d/57430acf3f49bda7dcac9b1081c9e04d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Renaissance Computing Institute - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)