Обмен данными
![]() | в этой статье Использование внешних ссылок может не соответствовать политике и рекомендациям Википедии . ( Апрель 2016 г. ) |

Обмен данными — это практика предоставления доступа к данным, используемым в научных исследованиях, другим исследователям. Многие финансирующие агентства, учреждения и издательские площадки имеют политику обмена данными, поскольку многие считают прозрачность и открытость частью научного метода . [1]
Ряд финансирующих агентств и научных журналов требуют от авторов рецензируемых статей делиться любой дополнительной информацией ( исходными данными , статистическими методами или исходным кодом ), необходимой для понимания, разработки или воспроизведения опубликованных исследований. На большую часть научных исследований не распространяются требования по обмену данными, и многие из этих правил имеют либеральные исключения. В отсутствие каких-либо обязательных требований обмен данными осуществляется по усмотрению самих ученых. Кроме того, в определенных ситуациях правительства [2] и учреждения запрещают или строго ограничивают обмен данными для защиты имущественных интересов, национальной безопасности и конфиденциальности субъекта/пациента/жертвы. Обмен данными также может быть ограничен, чтобы защитить учреждения и ученых от использования данных в политических целях.
Данные и методы могут быть запрошены у автора спустя годы после публикации. Чтобы стимулировать обмен данными [3] и предотвратить потерю или повреждение данных, ряд финансирующих агентств и журналов разработали политику архивирования данных . Доступ к общедоступным архивным данным – это недавнее событие в истории науки, ставшее возможным благодаря технологическим достижениям в области коммуникаций и информационных технологий . Чтобы в полной мере воспользоваться преимуществами современной быстрой связи, может потребоваться консенсусное соглашение о критериях, лежащих в основе взаимного признания соответствующего вклада. Модели, признанные за улучшение своевременного обмена данными для более эффективного реагирования на возникающие угрозы инфекционных заболеваний, включают механизм обмена данными, введенный Инициативой GISAID . [4] [5]
Несмотря на политику совместного использования и архивирования данных, удержание данных все еще происходит. Авторы могут не архивировать данные или архивировать только часть данных. Невозможность заархивировать данные сама по себе не является сокрытием данных. Когда исследователь запрашивает дополнительную информацию, автор иногда отказывается ее предоставить. [6] Когда авторы скрывают подобные данные, они рискуют потерять доверие научного сообщества. [7] Исследование 2022 года выявило около 3500 научных статей, в которых содержались утверждения о доступности данных, но по запросу и дальнейшему поиску данных выяснилось, что они недоступны для 94% статей. [8]
Обмен данными может также означать обмен личной информацией на платформе социальных сетей.
Политика правительства США
[ редактировать ]Федеральный закон
[ редактировать ]9 августа 2007 года президент Буш подписал Закон «Америка конкурирует» (или «Америка создает возможности для значимого продвижения передового опыта в области технологий, образования и науки»), требующий от гражданских федеральных агентств предоставить руководящие принципы, политику и процедуры для облегчения и оптимизации открытый обмен данными и исследованиями между агентствами, общественностью и политиками. См. раздел 1009. [9]
Политика обмена данными NIH
[ редактировать ]«Заявление о политике в отношении грантов Национального института здравоохранения (NIH) определяет «данные» как «записанную информацию, независимо от формы или носителя, на котором она может быть записана, и включает в себя письменные произведения, фильмы, звукозаписи, графические репродукции, рисунки, образцы, или другие графические изображения, методические инструкции, формы, диаграммы, схемы рабочих процессов, описания оборудования, файлы данных, программы обработки данных или компьютерные программы (программное обеспечение), статистические записи и другие данные исследований».
— Совет по связям с органами власти [10]
В окончательном заявлении НИЗ об обмене исследовательскими данными говорится:
«NIH подтверждает свою поддержку концепции совместного использования данных. Мы считаем, что обмен данными необходим для ускорения перевода результатов исследований в знания, продукты и процедуры для улучшения здоровья человека. НИЗ одобряет обмен окончательными исследовательскими данными для достижения этих и других важных научных целей. НИЗ ожидает и поддерживает своевременную публикацию и обмен окончательными данными исследований, проводимых при поддержке НИЗ, для использования другими исследователями.«NIH признает, что исследователи, собирающие данные, имеют законный интерес в получении выгоды от вложенных ими времени и усилий. Поэтому мы пересмотрели наше определение «своевременного выпуска и распространения», чтобы оно происходило не позднее момента принятия к публикации основных выводов из окончательного набора данных. НИЗ продолжает ожидать, что первоначальные исследователи могут получить пользу от первого и дальнейшего использования, но не от длительного эксклюзивного использования».
Политика NSF из Общих условий гранта
[ редактировать ]36. Обмен выводами, данными и другими исследовательскими продуктами
а. ННФ … ожидает, что исследователи поделятся с другими исследователями, не более чем за дополнительную плату и в течение разумного периода времени, данными, образцами, физическими коллекциями и другими вспомогательными материалами, созданными или собранными в ходе работы. Он также поощряет лауреатов делиться программным обеспечением и изобретениями или иным образом действовать, чтобы сделать инновации, которые они воплощают, широко полезными и полезными.
б. Корректировки и, где это необходимо, исключения могут быть разрешены для защиты прав отдельных лиц и субъектов, достоверности результатов или целостности коллекций или для удовлетворения законных интересов следователей.
- « Национальный научный фонд : Общие условия гранта (GC-1)», 1 апреля 2001 г. (стр. 17).
Управление честности исследований
[ редактировать ]Обвинения в ненадлежащем проведении медицинских исследований влекут за собой серьезные последствия. Министерство здравоохранения и социальных служб США создало офис для надзора за расследованием обвинений в неправомерных действиях, включая сокрытие данных. Сайт определяет миссию:
«Управление по обеспечению честности исследований (ORI) способствует обеспечению честности в биомедицинских и поведенческих исследованиях при поддержке Службы общественного здравоохранения США (PHS) примерно в 4000 учреждениях по всему миру. ORI контролирует институциональные расследования неправомерных исследований и содействует ответственному проведению исследований (RCR) посредством просветительская, профилактическая и нормативная деятельность».
Идеалы в обмене данными
[ редактировать ]Некоторые исследовательские организации особенно серьезно относятся к обмену данными. Стэнфордского университета WaveLab придерживается философии воспроизводимых исследований и раскрытия всех алгоритмов и исходного кода, необходимых для воспроизведения исследований. В статье под названием «WaveLab и воспроизводимые исследования» авторы описывают некоторые проблемы, с которыми они столкнулись при попытке воспроизвести свои собственные исследования через определенный период времени. Во многих случаях это было настолько сложно, что они отказывались от усилий. Именно этот опыт убедил их в важности раскрытия исходного кода. [12] Философия описана:
- Идея такова: статья о вычислительной науке в научном издании — это не сама стипендия, а просто реклама стипендии. Настоящая стипендия — это полная среда разработки программного обеспечения и полный набор инструкций, с помощью которых были созданы цифры. [13] [14]
Сеть наблюдения за данными на Земле ( DataONE ) и сохранение данных [15] — это проекты, поддерживаемые Национальным научным фондом, призванные поощрять и облегчать обмен данными между учеными-исследователями и улучшать поддержку метаанализа . В области наук об окружающей среде исследовательское сообщество признает, что крупные научные достижения, включающие интеграцию знаний в разных областях, потребуют от исследователей преодоления не только технологических барьеров для обмена данными, но также исторически укоренившихся институциональных и социологических барьеров. [16] Доктор Ричард Дж. Ходес, директор Национального института старения, заявил: «Старая модель, в которой исследователи ревностно охраняли свои данные, больше не применима». [17]
Альянс за доступ налогоплательщиков — это группа организаций, которые поддерживают открытый доступ к исследованиям, спонсируемым государством. Группа опубликовала «Заявление о принципах», объясняющее, почему они считают, что открытый доступ важен. [18] Они также перечисляют ряд международных политик публичного доступа. [19] Речь идет не более чем о своевременной передаче важной информации для эффективного реагирования на чрезвычайные ситуации в области здравоохранения. [20] Хотя общедоступные архивы использовались для хранения данных, в основном после официальной публикации, они не смогли стимулировать быстрый обмен данными во время чрезвычайных ситуаций в области здравоохранения, в том числе во время эпидемии Эболы. [21] и Зика, [22] [23] вспышки. Требуются более четко определенные принципы для признания интересов тех, кто генерирует данные, при одновременном разрешении свободного, беспрепятственного доступа к данным и их использования (предварительная публикация) для исследований и практического применения, например, принципов, принятых Инициативой GISAID для противодействия возникающим угрозам. от гриппа. [24] [25]
Международная политика
[ редактировать ]- Австралия
- Австрия
- Европа — Комиссия Европейских Сообществ
- Германия
- Великобритания
- 'Обмен данными Omic - список политик основных спонсоров науки FAIRsharing.org Каталог политик данных
- Индия – Национальная политика обмена данными и доступности данных – Правительство Индии
Проблемы обмена данными в научных кругах
[ редактировать ]Генетика
[ редактировать ]Сокрытие данных стало настолько обычным явлением в генетике , что исследователи из Массачусетской больницы общего профиля опубликовали на эту тему журнальную статью. Исследование показало: «Поскольку им было отказано в доступе к данным, 28% генетиков сообщили, что не смогли подтвердить опубликованные исследования». [26]
Психология
[ редактировать ]В исследовании 2006 года было замечено, что из 141 автора публикации эмпирических статей Американской психологической ассоциации (APA) 103 (73%) не предоставили свои данные в течение 6-месячного периода. [27] В последующем исследовании, опубликованном в 2015 году, было обнаружено, что 246 из 394 авторов статей в журналах APA, с которыми связались, не предоставили свои данные по запросу (62%). [28]
Археология
[ редактировать ]В исследовании 2018 года сообщалось об изучении случайной выборки из 48 статей, опубликованных в феврале – мае 2017 года в Журнале археологических наук, в результате чего были обнаружены общедоступные необработанные данные для 18 статей (53%), причем наиболее часто публикуемыми типами являются данные о составе и датировке. . Это же исследование также отправило электронное письмо авторам статей об экспериментах с каменными артефактами, опубликованных в 2009 и 2015 годах, с просьбой запросить данные, относящиеся к публикациям. Они связались с авторами 23 статей и получили 15 ответов, в результате чего доля откликнувшихся составила 70%. Они получили пять ответов, включающих файлы данных, что дает общий уровень обмена 20%. [29]
Ученые на стажировке
[ редактировать ]Исследование ученых, проходящих обучение, показало, что многие из них уже столкнулись с сокрытием данных. [30] Это исследование породило опасения, что будущее поколение учёных не будет соблюдать устоявшуюся практику.
Разные подходы в разных областях
[ редактировать ]Требования к обмену данными чаще предъявляются учреждениями, финансирующими агентствами и местами публикации в медицинских и биологических науках, чем в физических науках. Требования сильно различаются в зависимости от того, должны ли данные вообще передаваться, кому должны передаваться данные и кто должен нести расходы по обмену данными.
Финансирующие агентства, такие как NIH и NSF, как правило, требуют более широкого обмена данными, но даже эти требования, как правило, признают проблемы конфиденциальности пациентов, затрат, понесенных при обмене данными, и законности запроса. [31] Частные интересы и государственные учреждения с интересами национальной безопасности (оборона и правоохранительные органы) часто препятствуют обмену данными и методами посредством соглашений о неразглашении.
Обмен данными создает особые проблемы в инициативах по совместному мониторингу , например, когда лесные сообщества собирают данные о местных социальных и экологических условиях. В этом случае правозащитный подход к разработке протоколов обмена данными может основываться на принципах свободного, предварительного и осознанного согласия и отдавать приоритет защите прав тех, кто создал данные, и/или тех, кто потенциально может быть затронут. путем обмена данными. [32]
См. также
[ редактировать ]- Архив данных
- Распространение данных
- Конфиденциальность данных
- Публикация данных
- Цитирование данных
- СПРАВЕДЛИВЫЕ данные
- Обмен файлами
- Обмен информацией
- Обмен знаниями
- Открытые данные
- Реестр хранилищ исследовательских данных
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Глобальная эпидемия здоровья — это бомба замедленного действия, но вирусные базы данных могут и помогают спасать жизни» . HuffPost Великобритания . 12 января 2017 года . Проверено 6 сентября 2017 г.
- ^ «Кадр прозрачности» . Экономист . 10 августа 2006 г. ISSN 0013-0613 . Проверено 6 сентября 2017 г.
- ^ «Как поощрять правильное поведение» . Природа . 416 (6876): 1. 2002. Бибкод : 2002Natur.416R...1. . дои : 10.1038/416001b . ПМИД 11882850 .
- ^ Макколи, Джон В. (23 февраля 2017 г.). «Вирусы: модель ускорения реагирования на эпидемии» . Природа . 542 (7642): 414. Бибкод : 2017Natur.542..414M . дои : 10.1038/542414b . ПМИД 28230113 .
- ^ «Никаких бесплатных обедов не обнаружили министры здравоохранения G20 на первой встрече» . Наблюдение за интеллектуальной собственностью . 20 мая 2017 г. Проверено 6 сентября 2017 г.
- ^ Сэвидж CJ, Викерс AJ (2009). «Эмпирическое исследование обмена данными авторами, публикующимися в журналах PLoS» . ПЛОС ОДИН . 4 (9): е7078. Бибкод : 2009PLoSO...4.7078S . дои : 10.1371/journal.pone.0007078 . ПМЦ 2739314 . ПМИД 19763261 .
- ^ « Публикация и открытость », глава из книги «Как быть ученым: ответственное поведение в исследованиях», Национальная академия наук.
- ^ Габелица, Мирко; Бойчич, Ружица; Пуляк, Ливия (май 2022 г.). «Многие исследователи не выполнили опубликованное заявление об обмене данными: исследование смешанными методами». Журнал клинической эпидемиологии . 150 : 33–41. дои : 10.1016/j.jclinepi.2022.05.019 . ПМИД 35654271 . S2CID 249213574 .
- ^ " Америка конкурирует Закон
- ^ « Доступ к исследовательским данным и их хранение. Архивировано 26 мая 2007 г. в Wayback Machine : Права и обязанности», стр. 5. Совет по связям с правительством, март 2006 г.
- ^ « Политика обмена данными NIH ».
- ^ WaveLab и воспроизводимые исследования Джонатана Б. Бакхейта и Дэвида Л. Донохо
- ^ Веб-сайт WaveLab850
- ^ Риммер, Мэтью (1 сентября 2005 г.). «Японика Райс: интеллектуальная собственность, научные публикации и обмен данными». Прометей . 23 (3): 325–347. дои : 10.1080/08109020500235180 . ISSN 0810-9028 . S2CID 153908749 .
- ^ «Data Conservancy | Data Conservancy занимается разработкой институциональных решений проблем сбора, сохранения и повторного использования данных» .
- ^ Райхман О.Дж.; Джонс МБ; Шильдхауэр депутат (2011). «Вызовы и возможности открытых данных в экологии» . Наука . 331 (6018): 703–705. Бибкод : 2011Sci...331..703R . дои : 10.1126/science.1197962 . ПМИД 21311007 . S2CID 22686503 .
- ^ Колата, Джина (3 апреля 2011 г.). «Обширное исследование генов дает представление о болезни Альцгеймера (опубликовано в 2011 г.)» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 9 июня 2021 г.
- ^ Веб-сайт Альянса за доступ налогоплательщиков
- ^ «Всемирный импульс для общественного доступа к исследованиям, финансируемым государством» . Архивировано из оригинала 27 сентября 2007 г. Проверено 7 сентября 2007 г.
- ^ Шу, Юэлун; Макколи, Джон (2017). «GISAID: Глобальная инициатива по обмену всеми данными о гриппе – от видения к реальности» . Евронадзор . 22 (13). дои : 10.2807/1560-7917.es.2017.22.13.30494 . ПМК 5388101 . ПМИД 28382917 .
- ^ Йозвяк, Натан Л.; Шаффнер, Стивен Ф.; Сабети, Пардис К. (26 февраля 2015 г.). «Обмен данными: сделать исследования вспышек открытыми» . Природа . 518 (7540): 477–479. Бибкод : 2015Natur.518..477Y . дои : 10.1038/518477a . ПМИД 25719649 .
- ^ «Когда исследования сходят с рельсов» . Индус . Проверено 6 сентября 2017 г.
- ^ «Преимущества совместного использования» . Природа . 530 (7589): 129. 11 февраля 2016 г. Бибкод : 2016Natur.530Q.129. . дои : 10.1038/530129а . ПМИД 26863943 .
- ^ Эльба, Стефан; Бакленд-Мерретт, Джемма (1 января 2017 г.). «Данные, болезни и дипломатия: инновационный вклад GISAID в глобальное здравоохранение» . Глобальные вызовы . 1 (1): 33–46. Бибкод : 2017ГлоХ...1...33Е . дои : 10.1002/gch2.1018 . ISSN 2056-6646 . ПМК 6607375 . ПМИД 31565258 .
- ^ «CDC стремится создать вакцину от последнего штамма птичьего гриппа в Китае» . Bloomberg.com . 10 апреля 2013 г. Проверено 6 сентября 2017 г.
- ^ Кэмпбелл Э.Г., Кларидж Б.Р., Гохале М. и др. (2002). «Сокрытие данных в академической генетике: данные национального опроса» . ДЖАМА . 287 (4): 473–80. дои : 10.1001/jama.287.4.473 . ПМИД 11798369 .
- ^ Вихертс, Дж. М.; Борсбум, Д.; Катс, Дж.; Моленаар, Д. (2006). «Плохая доступность данных психологических исследований для повторного анализа». Американский психолог . 61 (7): 726–728. дои : 10.1037/0003-066X.61.7.726 . ПМИД 17032082 .
- ^ Ванпаемель, В.; Верморген, М.; Деримекер, Л.; Стормс, Г. (2015). «Мы теряем хороший кризис? Доступность данных психологических исследований после урагана» (PDF) . Коллабра . 1 (1): 1–5. дои : 10.1525/collabra.13 .
- ^ Марвик, Бен; Берч, Сюзанна Э. Пилаар (5 апреля 2018 г.). «Стандарт научного цитирования археологических данных как стимул к обмену данными» . Достижения археологической практики . 6 (2): 125–143. дои : 10.1017/aap.2018.3 .
- ^ Фогели С., Юсель Р., Бендавид Э. и др. (февраль 2006 г.). «Сокрытие данных и следующее поколение учёных: результаты национального опроса» . Акад Мед . 81 (2): 128–36. дои : 10.1097/00001888-200602000-00007 . ПМИД 16436573 .
- ^ «Политика обмена данными НИЗ и руководство по ее реализации» . Grants.nih.gov . Проверено 9 апреля 2021 г.
- ^ Д Сабогал. 2015. Обмен данными в рамках общинного мониторинга лесов: уроки Гайаны. Глобальная программа Canopy. http://forestcompass.org/how/resources/data-sharing-community-based-forest-monitoring-lessons-guyana
Литература
[ редактировать ]Комитет по проблемам трансграничного потока научных данных, Национальный исследовательский совет (1997). Биты власти: проблемы глобального доступа к научным данным . Вашингтон, округ Колумбия: Издательство Национальной академии. дои : 10.17226/5504 . ISBN 978-0-309-05635-9 . — обсуждается международный обмен данными в области естественных наук.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- « Эгоистичный ген, заархивировано 5 августа 2008 г. в Wayback Machine : обмен и сокрытие данных в академической генетике» Эрика Кэмпбелла и Дэвида Блюменталя, опубликовано 31 мая 2002 г.
- Обмен данными и архивирование данных ― Американская психологическая ассоциация
- Общественное достояние цифровых исследовательских данных
- WaveLab и воспроизводимые исследования Джонатана Б. Бакхейта и Дэвида Л. Донохо из Стэнфордского университета.
- «Роль архивов данных и программного кода в будущем экономических исследований», опубликованная Федеральным резервным банком Сент-Луиса.
- Инициатива по обмену и архивированию данных Экологического общества Америки. Архивировано 10 марта 2008 г. на Wayback Machine.
- FAIRsharing.org Веб-сайт, посвященный обмену данными и политике в отношении данных в биологии.
- Архив данных Великобритании: управление данными и обмен ими
- Ресурсы и примеры плана управления данными - Межуниверситетский консорциум политических и социальных исследований.
- DataONE
- Nature Scientific Data : онлайн-публикация с открытым доступом, содержащая описания наборов научно ценных данных.