✖


Jump to content

ГИСАИД

ГИСАИД
Глобальная инициатива по обмену всеми данными о гриппе
Формирование 19 декабря 2006 г .; 17 лет назад ( 19 декабря 2006 ) [1] [2] [3] [4]
Тип Некоммерческая организация [5]
Цель Глобальное здравоохранение , исследования
Штаб-квартира Мюнхен , Германия [6] [5]
Метод Пожертвования и гранты
Ключевые люди
  • Питер Богнер (президент) [7]
  • Йорг Паура и Кристоф Ветцлер (члены исполнительного совета) [5]
  • Рон Фушье (сопредседатель Научно-консультативного совета) [8]
Веб-сайт https://gisaid.org

GISAID ( / ˈ ɡ ɪ s eɪ d / ), Глобальная инициатива по обмену всеми данными о гриппе , [9] ранее Глобальная инициатива по обмену данными о птичьем гриппе , [10] [11] — это глобальная научная инициатива, созданная в 2008 году для обеспечения доступа к геномным данным вирусов гриппа . База данных была расширена за счет включения коронавируса, вызвавшего пандемию COVID-19 . [12] [13] а также другие возбудители. Базу данных называют «крупнейшим в мире хранилищем последовательностей COVID-19». [14] GISAID содействует геномной эпидемиологии и надзору в режиме реального времени для мониторинга появления новых штаммов вируса COVID-19 по всей планете. [15]

С момента его создания в качестве альтернативы обмену данными о птичьем гриппе. [16] через обычные общедоступные архивы, [17] GISAID способствовал обмену данными о геноме вспышек [17] во время H1N1 пандемии [18] [19] в 2009 году H7N9 эпидемия [20] [21] В 2013 году COVID-19 пандемия [22] [23] и вспышка оспы в 2022–2023 гг . [24]

История [ править ]

Питер Богнер пожимает руку Роберту Клоосу
Президент GISAID Петер Богнер (слева) и государственный секретарь Германии Роберт Клоос [ де ] в Берлине , апрель 2010 г.

Происхождение [ править ]

С 1952 года штаммы гриппа собирались Национальными центрами гриппа (НЦГ) и распространялись через Глобальную систему эпиднадзора за гриппом и реагирования на него (ГСЭГО) ВОЗ. [25] Страны предоставили образцы в ВОЗ, но затем данные были бесплатно переданы им фармацевтическим компаниям, которые могли запатентовать вакцины, произведенные на основе этих образцов. [26] Начиная с января 2006 года итальянский исследователь Илария Капуа отказывалась загружать свои данные в закрытую базу данных и призывала сделать геномные данные о птичьем гриппе H5N1 общедоступными. [27] [28] На конференции Сети экспертов МЭБ/ФАО по гриппу животных Капуа убедила участников согласиться на каждую последовательность и опубликовать данные по 20 штаммам гриппа. Некоторые ученые опасались делиться своими данными на случай, если другие опубликуют научные статьи, используя имеющиеся у них данные, но Капуа отклонил это, заявив журналу Science : «Что важнее? Еще одна статья для команды Иларии Капуа или решение серьезной угрозы здоровью? Давайте четко определим наши приоритеты. ." [28] Питер Богнер , немец в возрасте 40 лет, проживающий в США и ранее не имевший опыта работы в сфере общественного здравоохранения, прочитал статью о призыве Капуи и помог основать и профинансировать GISAID. [29] [30] Богнер встретился Нэнси Кокс , которая тогда возглавляла отделение гриппа Центров по контролю заболеваний США, и Кокс впоследствии стала председателем Научно-консультативного совета GISAID. на конференции с [17]

Аббревиатура GISAID была придумана в переписке, опубликованной в журнале Nature в августе 2006 года. [30] выдвигая первоначальное стремление создать консорциум для новой Глобальной инициативы по обмену данными о птичьем гриппе (позже «Все» заменит «Птичий»), в соответствии с чем его члены [17] будет публиковать данные в общедоступных базах данных в течение шести месяцев после анализа и проверки. [31] Первоначально организация сотрудничала с австралийской некоммерческой организацией Cambia и проектом Creative Commons Science Commons . [32] Хотя не было установлено никаких основных правил обмена, [33] Письмо было подписано более чем 70 ведущими учеными, в том числе семью нобелевскими лауреатами , поскольку доступ к самым последним генетическим данным высокопатогенного H5N1 зоонозного вируса часто был ограничен, отчасти из-за нерешительности государств-членов Всемирной организации здравоохранения делиться своими геномы вирусов и ставят под угрозу права собственности. [34]

К концу 2006 года Индонезия объявила, что не будет передавать образцы птичьего гриппа ВОЗ, что привело к глобальному кризису в области здравоохранения из-за продолжающейся эпидемии. [26] К октябрю 2006 года Индонезия согласилась поделиться своими данными с GISAID. [35] министр здравоохранения страны считал, что это «справедливый и прозрачный» механизм обмена данными. [36] Это была одна из первых стран, которая сделала это. [37] В феврале 2007 года GISAID и Швейцарский институт биоинформатики (SIB) объявили о соглашении о сотрудничестве. [17] с созданием SIB и администрированием базы данных EpiFlu от имени GISAID. [38] В конечном итоге GISAID был запущен в мае 2008 года в Женеве по случаю 61-й Всемирной ассамблеи здравоохранения как база данных, основанная на регистрации, а не как консорциум. [17]

2009 г. и далее [ править ]

В 2009 году SIB отключил базу данных от портала GISAID из-за спора по контракту, что привело к судебному разбирательству. [38] [4] [39] В апреле 2010 года Федеративная Республика Германия объявила во время 7-й Международной министерской конференции по птичьему и пандемическому гриппу в Ханое , Вьетнам , что GISAID заключило соглашение о сотрудничестве. [40] с правительством Германии, что делает Германию долгосрочным хозяином платформы GISAID. [41] В соответствии с соглашением Федеральное министерство продовольствия, сельского хозяйства и защиты потребителей Германии должно было обеспечить устойчивость инициативы, предоставив технические хостинговые услуги. [42] а Федеральный институт здоровья животных , Институт Фридриха Леффлера , должен был обеспечить достоверность и достоверность научных данных в GISAID. К 2021 году министерство больше не занималось ни размещением баз данных, ни их курированием. [43] В 2013 году GISAID распустил некоммерческую организацию, базирующуюся в Вашингтоне, округ Колумбия, и организацией стала управлять немецкая ассоциация под названием Freunde von GISAID (Друзья GISAID). [29]

Некоторые из самых ранних генетических последовательностей SARS-CoV-2 были опубликованы Китайским центром по контролю и профилактике заболеваний и переданы через GISAID в середине января 2020 года. [44] С 2020 года в базу данных GISAID были загружены миллионы последовательностей генома SARS-CoV-2. [45]

В 2022 году GISAID добавил вирус Mpox. [46] и респираторно-синцитиальный вирус (РСВ) [47] к списку патогенов, поддерживаемому его базой данных. Индонезии В ноябре 2023 года Министерство здравоохранения объявило о создании Академии GISAID на Бали , чтобы сосредоточиться на образовании в области биоинформатики, развитии геномного надзора за патогенами и расширении регионального потенциала реагирования. [48]

Модель GISAID по стимулированию и признанию тех, кто депонирует данные, была рекомендована в качестве модели для будущих инициатив; [49] Благодаря этой работе это существо было описано как «важнейший щит для человечества». [50]

геномов SARS-CoV- данных 2 База

GISAID поддерживает то, что было описано как «крупнейшее в мире хранилище последовательностей COVID-19». [14] и «безусловно крупнейшая в мире база данных последовательностей SARS-CoV-2». [7] К середине апреля 2021 года база данных GISAID по SARS-CoV-2 достигла более 1 200 000 заявок, что является свидетельством напряженной работы исследователей в более чем 170 различных странах. [51] Всего три месяца спустя количество загруженных последовательностей SARS-CoV-2 снова удвоилось и превысило 2,4 миллиона. [52] К концу 2021 года база данных содержала более 5 миллионов последовательностей генома; [53] по состоянию на декабрь 2021 года было отправлено более 6 миллионов последовательностей; [54] к апрелю 2022 г. накопилось 10 миллионов последовательностей; а в январе 2023 года это число достигло 14,4 миллиона. [55]

SARS-CoV-2 В январе 2020 года данные о генетической последовательности были переданы через GISAID. [56] В течение первого года пандемии COVID-19 большинство полногеномных последовательностей SARS-CoV-2, которые были созданы и распространены во всем мире, были отправлены через GISAID. [57] Когда вариант Омикрона SARS-CoV-2 был обнаружен в Южной Африке, благодаря быстрой загрузке последовательности в GISAID Национальный институт инфекционных заболеваний смог узнать, что Ботсвана и Гонконг также сообщили о случаях, имеющих ту же последовательность генов. [58]

В марте 2023 года GISAID временно приостановил доступ к базе данных для некоторых ученых, удалив необработанные данные, имеющие отношение к расследованиям происхождения SARS-CoV-2 . [59] [60] [61] В GISAID заявили, что они не удаляют записи из своей базы данных, но данные могут стать временно невидимыми во время обновлений или исправлений. [62] [63] [64] Доступность данных была восстановлена ​​с дополнительным ограничением: любой анализ, основанный на них, не будет доступен общественности. [65]

Управление [ править ]

В совет друзей GISAID входят Питер Богнер и два немецких юриста, которые не участвуют в повседневной деятельности организации. [29] Научные консультации организации предоставляются ее Научно-консультативным советом, в который входят директора ведущих лабораторий общественного здравоохранения , таких как Сотрудничающие центры ВОЗ по гриппу. [66] В 2023 году отсутствие прозрачности GISAID подверглось критике со стороны некоторых спонсоров GISAID, в том числе Европейской комиссии и Фонда Рокфеллера отказала в долгосрочном финансировании , при этом Международная федерация фармацевтических производителей и ассоциаций (IFPMA) . [67] [68] сообщило В июне 2023 года издание Vanity Fair , что Богнер заявил, что «GISAID скоро создаст независимый совет по соблюдению требований, «ответственный за решение широкого спектра вопросов управления»». [10] The Telegraph также сообщила, что штатный юрист GISAID разрабатывает новые процессы управления, которые должны быть прозрачными и позволять разрешать научные споры без участия Богнера. [50]

Доступ и интеллектуальная собственность [ править ]

Создание базы данных GISAID было частично мотивировано обеспокоенностью, поднятой исследователями из развивающихся стран . [69] В 2009 году журнал Scientific American отметил, что «предыдущая система обмена данными, которой управляла ВОЗ, вынуждала их отказываться от прав интеллектуальной собственности на образцы вирусов, когда они отправляли их в ВОЗ. Затем образцы вирусов будут использоваться частными фармацевтическими компаниями для создания вакцины, на которые выдаются патенты и которые продаются с прибылью по ценам, которые многие бедные страны не могут себе позволить». [4] В статье в The Lancet за 2022 год было далее отмечено, что ученые из Северной Америки и Европы стремятся к неограниченному доступу, при этом «ученые из Африки требуют достаточной защиты для тех, кто генерирует и передает данные в соответствии с положениями и условиями GISAID». [69] В отличие от общедоступных баз данных, таких как GenBank и EMBL , пользователи GISAID должны подтвердить свою личность и согласиться с Соглашением о доступе к базе данных, которое регулирует способ использования данных GISAID. [50] [70] Настоящие Условия использования «сбалансированы в пользу поставщика данных и дают ему постоянный контроль над загружаемыми генетическими данными». [50] Они запрещают пользователям делиться какими-либо данными с другими пользователями, которые не согласились с ними, и требуют, чтобы пользователи данных указывали авторам данных в опубликованных работах, а также предпринимали разумные попытки сотрудничать с генераторами данных и вовлекать их в исследования и анализ, использующий их данные. [10] [50]

Трудность, которую пытается решить Соглашение о доступе к данным GISAID, заключается в том, что многие исследователи опасаются, что обмен данными о последовательностях вирусов гриппа может способствовать их незаконному присвоению из-за претензий на интеллектуальную собственность со стороны производителей вакцин и других организаций, что затрудняет доступ к вакцинам и другим товарам в развивающихся странах либо из-за высоких затрат. или путем предотвращения передачи технологий . Хотя большинство экспертов по общественным интересам согласны с GISAID в том, что данные о последовательностях гриппа должны быть обнародованы, и это является предметом согласия многих исследователей, некоторые предоставляют информацию только после подачи патентных заявок, в то время как другие утверждают, что доступ к ней должен быть только при условии, что не будет подано никаких патентов или других претензий на интеллектуальную собственность, что противоречило проекту « Геном человека» . [71] Соглашение GISAID о доступе к данным напрямую рассматривает этот вопрос, чтобы способствовать обмену данными. Процедуры GISAID дополнительно предполагают, что те, кто имеет доступ к базе данных EpiFlu, должны проконсультироваться со странами происхождения генетических последовательностей и с исследователями, которые обнаружили эти последовательности. В результате лицензия GISAID сыграла важную роль в обеспечении быстрой готовности к пандемии. [72] Однако эти ограничения свидетельствуют о распространенной критике в адрес модели открытых данных . [73] [74]

GISAID описывает себя как «открытый доступ», что, естественно, тиражируется средствами массовой информации и журнальными публикациями. Это описание действительно соответствует первоначальному объявлению консорциума. [31] в котором также упоминалось о размещении данных в базах данных, участвующих в INSDC . По состоянию на март 2023 года это не так, поскольку «GISAID не предлагает механизма передачи данных в любую другую базу данных». [75] В нескольких научных статьях модель лицензирования GISAID сравнивалась с неограниченными открытыми базами данных . [76] [72] [77] подчеркивая различия, в то время как другие исследователи подписали открытое письмо, призывающее использовать любую из неограниченных баз данных INSDC. [78] [79]

В 2017 году редакционная коллегия GISAID заявила, что « re3data.org и DataCite , ведущий в мире поставщик идентификаторов цифровых объектов (DOI) для исследовательских данных, подтвердили обозначение доступа к базе данных и данным GISAID как открытый доступ». [80] Однако после того, как в марте 2023 года аккаунты нескольких исследователей были заблокированы, как сообщил журнал Science [81] и другие новостные агентства, [82] его статус открытого доступа был аннулирован Реестром хранилищ исследовательских данных (re3data) , который теперь классифицирует его как «хранилище с ограниченным доступом». [83] В 2020 году Всемирной организации здравоохранения главный научный сотрудник Сумья Сваминатан назвал эту инициативу «меняющей правила игры». [12] в то время как содиректор Европейского института биоинформатики (EBI) Рольф Апвейлер утверждает, что, поскольку он не позволяет публично публиковать последовательности, это препятствует усилиям по пониманию коронавируса и быстрому появлению новых вариантов. [78]

Ограничения доступа GISAID привели к конфликту с «лабораториями и учреждениями, чьи приоритеты являются академическими, а не обусловлены непосредственными приоритетами защиты общественного здравоохранения». [50] В январе 2021 года ограниченный доступ GISAID побудил группу ученых написать открытое письмо с просьбой разместить последовательности SARS-CoV-2 в открытых базах данных. [84] что было растиражировано в журналах Nature [73] [85] и наука . [7] Более того, в статье журнала Science отмечается, что отсутствие прозрачности доступа к базе данных также не позволяет многим ученым даже критиковать платформу. [7] В документе 2017 года, описывающем успех GISAID, упоминается, что отзыв полномочий исследователей случался редко, но это случалось. [86] В той же публикации описывается «ощутимое достоинство формулы GISAID, позволяющей сбалансировать необходимость контроля и открытости». В апреле 2023 года журналы Science и The Economist сообщили, что эти проблемы сохраняются, а также об отсутствии прозрачности управления. [68] [67] В расследовании The Telegraph, , проведенном заявлений Science были отмечены стимулы различных потенциальных конкурентов в этой области, для которых GISAID является препятствием на пути консолидации контроля над этой областью, а также отмечено, что позиция GISAID неизбежно ставит его в центр споров между групп ученых, что, как правило, приведет к тому, что проигравшая сторона будет обвинять в этом GISAID. [50]

См. также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Реестр корпораций округа Колумбия , Департамент по делам потребителей и регулированию округа Колумбия, первоначальный номер файла 263748
  2. ^ «Информация OpenCorporates для компании США, округ Колумбия «ГЛОБАЛЬНАЯ ИНИЦИАТИВА ПО ОБМЕНУ ВСЕМИ ДАННЫМИ О ГРИППЕ» » . opencorporates.com . Проверено 28 марта 2023 г.
  3. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Гринмайер, Ларри (14 сентября 2009 г.). «Веб-сайт с открытым доступом по исследованию гриппа перезапущен на фоне разногласий» . Научный американец . Проверено 5 мая 2023 г.
  4. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с » « Реестр ассоциаций окружного суда Мюнхена (Германия) (PDF) . Единый реестровый портал государств . VR 204844 (на немецком языке). Мюнхен, Германия: Министерство юстиции немецкой земли Северный Рейн -Вестфалия . 24 марта 2023 г. . Проверено 24 марта 2023 г.
  5. ^ «GISAID – Выходные данные / Конфиденциальность» . сайт gisaid.org . Проверено 24 марта 2023 г.
  6. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Уодман, Мередит (10 марта 2021 г.). «Критики осуждают проблемы доступа и прозрачности ключевых данных о последовательностях коронавируса» . Наука . дои : 10.1126/science.abi4496 . S2CID   233620925 . Проверено 27 марта 2023 г. GISAID, насчитывающая более 700 000 геномов из более чем 160 стран, на сегодняшний день является крупнейшей в мире базой данных последовательностей SARS-CoV-2.
  7. ^ «Управление и экспертиза: Научно-консультативный совет» . ГИСАИД . 2020 . Проверено 7 июля 2020 г. Научно-консультативный совет (SAC) консультирует и поддерживает Инициативу в достижении ее целей в области общественного здравоохранения и науки. Его членами являются ведущие ученые, обладающие опытом в области вирусологии, микробиологии, вычислительной и молекулярной биологии, эпидемиологии, эволюционной геномики и биоинформатики, а также общественного здравоохранения и здоровья животных.
  8. ^ Шу, Ю.; МакКоли, Дж. (30 марта 2017 г.). «GISAID: Глобальная инициатива по обмену всеми данными о гриппе – от видения к реальности» . Евронаблюдение . 22 (13). дои : 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.13.30494 . ПМЦ   5388101 . ПМИД   28382917 .
  9. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Эбан, Кэтрин (1 июня 2023 г.). «Внутри матча в клетке с енотовидной собакой COVID Origins» . Ярмарка тщеславия .
  10. ^ Богнер, Питер; Капуя, Илария; Липман, Дэвид Дж.; Кокс, Нэнси Дж. (30 августа 2006 г.). «Глобальная инициатива по обмену данными о птичьем гриппе» . Природа . 442 (7106): 981. Бибкод : 2006Natur.442Q.981B . дои : 10.1038/442981a . S2CID   4419375 .
  11. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Сваминатан, Сумья (17 декабря 2020 г.). «Главный учёный ВОЗ о годе потерь и знаний» . Природа . Проверено 20 декабря 2020 г.
  12. ^ Корбер, Бетт (20 августа 2020 г.). «Отслеживание изменений в пике SARS-CoV-2: доказательства того, что D614G увеличивает инфекционность вируса COVID-19» . Клетка . 182 (4): 812–827.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . ПМЦ   7332439 . ПМИД   32697968 . Глобальная выборка SARS-CoV-2 очень эффективно решается с помощью базы данных Глобальной инициативы по обмену всеми данными о гриппе (GISAID).
  13. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Хочул продлевает мандат на маски и представляет новый план резкого увеличения числа случаев заболевания, поскольку Нью-Йорк снова бьет рекорд заболеваемости» . NBC Нью-Йорк . 31 декабря 2021 г. . Проверено 13 января 2022 г. На вариант омикрон... приходилось 78% генетически секвенированных положительных образцов COVID из Нью-Йорка, загруженных в GISAID, крупнейшее в мире хранилище последовательностей COVID-19, за последние две недели.
  14. ^ Джамиль, Шахид (2 апреля 2020 г.). «Пандемия коронавируса подчеркивает ключевую потребность в науке и партнерстве» . Телеграф (Калькутта) . Проверено 29 декабря 2020 г.
  15. ^ Макдауэлл, Робин (15 мая 2008 г.). «Индонезия передает данные о птичьем гриппе в новую базу данных» . Фокс Ньюс . Ассошиэйтед Пресс . Проверено 7 июня 2020 г.
  16. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и ж Эльба, Стефан; Бакленд-Мерретт, Джемма (10 января 2017 г.). «Данные, болезни и дипломатия: инновационный вклад GISAID в глобальное здравоохранение» . Глобальные вызовы . 1 (1): 33–46. Бибкод : 2017ГлоХ...1...33Е . дои : 10.1002/gch2.1018 . ПМК   6607375 . ПМИД   31565258 .
  17. ^ Шнирринг, Лиза (25 июня 2009 г.). «Пандемия раскрывает сильные стороны новой базы данных по гриппу» . Центр исследований и политики в области инфекционных заболеваний . Проверено 7 июня 2020 г.
  18. ^ «Последовательности вирусных генов для помощи в обновлении диагностики свиного гриппа A(H1N1)» (PDF) . Всемирная организация здравоохранения . 25 апреля 2009 года . Проверено 7 июня 2020 г.
  19. ^ «Борьба с птичьим гриппом» . Природа . 496 (7446): 397. 24 апреля 2013 г. doi : 10.1038/496397a . ПМИД   23627002 .
  20. ^ Ларсон, Кристина (10 апреля 2013 г.). «CDC стремится создать вакцину от последнего штамма птичьего гриппа в Китае» . Блумберг БизнесУик . Проверено 7 июня 2020 г.
  21. ^ Прасад, Р. (19 января 2020 г.). «Каков источник новой болезни, похожей на атипичную пневмонию, зарегистрированной в Китае?» . Индус . Проверено 7 июня 2020 г.
  22. ^ Нг, Кан Чунг (12 января 2020 г.). «Уханьская пневмония: Гонконг собирается разработать новый тест на загадочный вирус после получения генетической последовательности из материкового Китая» . Южно-Китайская Морнинг Пост . Проверено 7 июня 2020 г.
  23. ^ «Эпидемиологическая информация: вспышка оспы обезьян в нескольких странах» . www.ecdc.europa.eu . 9 июня 2022 г. . Проверено 25 марта 2023 г.
  24. ^ «70 лет ГСЭГО – Глобальной системе эпиднадзора за гриппом и реагирования» . Всемирная организация здравоохранения . Проверено 4 мая 2023 г.
  25. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Фидлер, Дэвид П. (январь 2008 г.). «Образцы вируса гриппа, международное право и глобальная дипломатия здравоохранения» . Новые инфекционные заболевания . 14 (1): 88–94. дои : 10.3201/eid1401.070700 . ПМК   2600156 . ПМИД   18258086 . S2CID   32706081 .
  26. ^ Редакция (15 марта 2006 г.). «Секретный архив птичьего гриппа» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 4 апреля 2023 года . Проверено 5 мая 2023 г.
  27. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Энсеринк, Мартин (10 ноября 2006 г.). «Итальянская дива гриппа». Наука . 314 (5801): 918–919. дои : 10.1126/science.314.5801.918 . ПМИД   17095672 . S2CID   161378290 .
  28. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Энсеринк, Мартин; Коэн, Джон (19 апреля 2023 г.). «Придуманная личность», стоящая за ключевой базой данных о пандемиях» . Наука . дои : 10.1126/science.adi3224 . Проверено 21 апреля 2023 г.
  29. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Замиска, Николай (30 августа 2006 г.). «Неученый настаивает на обмене данными о птичьем гриппе » . Уолл Стрит Джорнал . Архивировано из оригинала 27 марта 2023 года . Проверено 10 ноября 2016 г.
  30. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Богнер, Питер; Капуя, Илария; Липман, Дэвид; Кокс, Нэнси (30 августа 2006 г.). «Глобальная инициатива по обмену данными о птичьем гриппе» . Природа . 442 (7106): 981. Бибкод : 2006Natur.442Q.981B . дои : 10.1038/442981a .
  31. ^ Джон Лауэрман (25 августа 2006 г.). «Бедные страны могут патентовать штаммы птичьего вируса» . Новости Блумберга .
  32. ^ «Расширение доступа к данным о заболеваниях». Природа (Редакционная статья). 442 (7106): 957. 31 августа 2006 г. Бибкод : 2006Natur.442Q.957. . дои : 10.1038/442957а . ПМИД   16943803 . S2CID   5320096 .
  33. ^ Макдауэлл, Робин (18 мая 2008 г.). «Индонезия добавит свои данные на глобальный веб-сайт по птичьему гриппу» . Орландо Сентинел . Проверено 19 ноября 2020 г. Китай, Россия и другие страны, которые долгое время скрывали от международного сообщества образцы вируса гриппа и данные секвенирования ДНК, также принимают участие в инициативе, заявляя, что она обеспечивает полную прозрачность и впервые базовую защиту прав интеллектуальной собственности. .
  34. ^ Квирк, Мэри (октябрь 2006 г.). «Глобальная инициатива, не входящая в состав ВОЗ, по обмену данными о птичьем гриппе». Ланцет инфекционных заболеваний . 6 (10): 621. doi : 10.1016/S1473-3099(06)70589-8 .
  35. ^ Батлер, Деклан (декабрь 2007 г.). «Вопросы и ответы: Сити Фадилах Супари» . Природа . 450 (7173): 1137. Бибкод : 2007Natur.450.1137B . дои : 10.1038/4501137а . ПМИД   18097360 . S2CID   4384824 .
  36. ^ «Глобальная база данных по гриппу запущена» (PDF) . Новости ФАОАИД . 16 мая 2008 г. с. 1 . Проверено 5 мая 2023 г.
  37. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Батлер, Деклан (2009). «База данных по гриппу потрясена судебным скандалом» . Природа . 460 (7257): 787. дои : 10.1038/460786b . ПМИД   19675613 .
  38. ^ Армстронг Мур, Элизабет (16 сентября 2009 г.). «Запуск новой базы данных по гриппу вызывает раздражение» . CNET . Проверено 5 мая 2023 г.
  39. ^ «База данных возбудителей гриппа глобального значения создана в Бонне» . Домашняя страница БМЭЛ . 15 апреля 2010 года. Архивировано из оригинала 3 января 2017 года . Проверено 2 января 2017 г.
  40. ^ «Заявление Германии по основным вопросам и опасениям в отношении структуры ГПГ и ее реализации, специальная сессия Консультативной группы ГПГ, 13 октября 2015 г.» (PDF) . Всемирная организация здравоохранения , Женева . Проверено 8 ноября 2016 г.
  41. ^ «База данных GISAID предоставляет важную информацию для стратегий контроля» (PDF) . Домашняя страница BLE . 16 апреля 2014 г. Архивировано из оригинала (PDF) 3 января 2017 г. . Проверено 2 января 2017 г.
  42. ^ «Крупнейшая в мире база данных поддерживает исследования вакцин против гриппа» . БМЕЛЬ (на немецком языке). 17 марта 2022 г. . Проверено 7 апреля 2023 г.
  43. ^ «Спор о том, кто первым поделился геномом SARS-CoV-2, кипит» . www.science.org . Проверено 29 марта 2023 г.
  44. ^ Райан, Валери (10 августа 2020 г.). «Идентифицированы штаммы вируса SARS-CoV-2, циркулирующие в Ирландии» . Ирландские медицинские таймс . Проверено 11 августа 2020 г.
  45. ^ Насри, Фердус; Конгкитиманон, Кунафас; Виттиг, Алиса; Кортес, Хорхе Санчес; Бринкманн, Анника; Ниче, Андреас; Шмахтенберг, Анна-Джулиана; Ренар, Бернхард Ю.; Фукс, Стефан (13 марта 2023 г.). «MpoxRadar: всемирная панель мониторинга геномного наблюдения Mpox» . bioRxiv : 2023.02.03.526935. дои : 10.1101/2023.02.03.526935 . S2CID   256630934 .
  46. ^ «GISAID — Глобальное средство отслеживания заявок RSV» . сайт gisaid.org . Проверено 28 марта 2023 г.
  47. ^ «Министерство создает Академию GISAID для улучшения биоинформатики» . Новости Антары . 29 ноября 2023 г.
  48. ^ ЛоТемпио, Джонатан; Спенсер, Д'Андре; Ярвиц, Ребекка; Вилен, Артур Делот; Вилен, Эрик; Дело, Эммануэль (19 августа 2020 г.). «Мы можем добиться большего: уроки, извлеченные из обмена данными во время пандемии COVID-19, могут стать основой для обеспечения готовности к будущим вспышкам и реагирования на них» . Наука и дипломатия – через AAAS. GISAID также потребовал, чтобы пользователи данных не только отдавали должное отправителям данных, но и прилагали максимальные усилия для работы с ними и включения их в совместный анализ данных о последовательностях вирусов, что еще больше склоняло чашу весов в пользу сотрудничества. Этот обязательный обмен не только данными, но и результатами исследований привел к смене парадигмы, которая помогает поставить участников из стран с более высокими или меньшими ресурсами в одинаковые условия. ... Принятие системы распределения кредитов, аналогичной системе GISAID, обеспечит стимулирование и признание вкладчиков данных независимо от структуры ресурсов.
  49. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и ж г Нуки, Пол (13 июня 2023 г.). «Этот человек создал для нас лучший шанс остановить следующую пандемию, но теперь он подвергается нападению. Почему?» . Телеграф .
  50. ^ Максмен, Эми (23 апреля 2021 г.). «Миллион последовательностей коронавируса: популярный геномный сайт достиг мега-вехи» . Природа . Более 1,2 миллиона последовательностей генома коронавируса из 172 стран и территорий теперь опубликованы на популярной онлайн-платформе данных.
  51. ^ Press Trust of India (22 июля 2021 г.). «Распространенность дельта-варианта COVID-19 среди образцов, секвенированных за последние 4 недели, превысила 75%: ВОЗ» . Индус . По состоянию на 20 июля в GISAID было отправлено в общей сложности более 2,4 миллиона последовательностей SARS-CoV-2.
  52. ^ Варела, Анна (16 ноября 2021 г.). «Исследователи штата Джорджия разрабатывают быстрое компьютерное программное обеспечение для отслеживания пандемий по мере их возникновения» . GSU.edu . Государственный университет Джорджии . Проверено 1 декабря 2021 г.
  53. ^ Максмен, Эми (16 декабря 2021 г.). «Слепые пятна Омикрона: почему сложно отслеживать варианты коронавируса» . Природа . 600 (7890): 579. Бибкод : 2021Natur.600..579M . дои : 10.1038/d41586-021-03698-7 . ПМИД   34916668 . S2CID   245262198 .
  54. ^ Суини, Люси (8 января 2023 г.). «Может ли вспышка COVID-19 в Китае привести к следующему варианту беспокойства? Вот что говорят эксперты» . Австралийская радиовещательная корпорация . Проверено 24 февраля 2023 г.
  55. ^ Бурки, Тальха (апрель 2023 г.). «Первый общий геном SARS-CoV-2: GISAID против virological.org» . Ланцетный микроб . 4 (6): S2666524723001337. дои : 10.1016/S2666-5247(23)00133-7 . ПМЦ   10129129 . ПМИД   37116518 .
  56. ^ Маннинк, Бас (9 сентября 2021 г.). «Следующий этап эпиднадзора за SARS-CoV-2: молекулярная эпидемиология в реальном времени» . Природная медицина . 27 (9): 1518–1524. дои : 10.1038/s41591-021-01472-w . ПМИД   34504335 . S2CID   237468106 . В течение первого года пандемии большое количество полногеномных последовательностей SARS-CoV-2 было получено со всего мира и распространено, в основном через GISAID.
  57. ^ Кокс, Тим (30 ноября 2021 г.). «Как южноафриканские ученые заметили вариант Омикрона COVID» . Рейтер . Проверено 1 декабря 2021 г.
  58. ^ «Недавно обнаруженные данные о коронавирусе возобновили дискуссию о происхождении вируса» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Проверено 28 марта 2023 г.
  59. ^ Ву, Кэтрин Дж. (21 марта 2023 г.). «Основной ключ к разгадке происхождения COVID просто недосягаем» . Атлантика . Проверено 28 марта 2023 г.
  60. ^ «Обнаруженные на китайском рынке генетические последовательности могут указывать на животное происхождение COVID-19» . www.science.org . Проверено 28 марта 2023 г.
  61. ^ «Консультанты ВОЗ призывают Китай опубликовать все данные, связанные с COVID, после новых исследований» . Рейтер . 19 марта 2023 г. . Проверено 28 марта 2023 г.
  62. ^ «Новый генетический анализ дает ключ к разгадке животного происхождения вспышки COVID» . www.cbsnews.com . 17 марта 2023 г. . Проверено 28 марта 2023 г.
  63. ^ Сафи, Майкл; Блок, Эли (28 марта 2023 г.). « Быть ​​правдивым очень важно»: высказывается ученый, который наткнулся на данные о Covid в Ухане» . Хранитель . ISSN   0261-3077 . Проверено 28 марта 2023 г.
  64. ^ Маллапати, Смрити (29 марта 2023 г.). «Отчет о происхождении COVID вызывает дебаты по поводу крупного центра генома GISAID» . Природа . 616 (7955): 13–14. Бибкод : 2023Natur.616...13M . дои : 10.1038/d41586-023-00901-9 . ПМИД   36991056 . S2CID   257835687 .
  65. ^ «ГИСАИД – Управление» . сайт gisaid.org . Проверено 28 марта 2023 г.
  66. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Придуманная личность», стоящая за ключевой базой данных о пандемиях» . www.science.org . Проверено 21 апреля 2023 г.
  67. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Важнейшая генетическая база данных находится под огнем» . Экономист . ISSN   0013-0613 . Проверено 5 апреля 2023 г.
  68. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Кеймантри Мудли; и др. (2022). «Проблемы этики и управления, связанные с обменом геномными данными в южной Африке: случай SARS-CoV-2» (PDF) . Ланцет . 10 (12): 1855–1859 гг. дои : 10.1016/S2214-109X(22)00417-X . ПМЦ   9826954 . ПМИД   36309034 .
  69. ^ «Соглашение о доступе к базе данных GISAID» . www.gisaid.org . Проверено 8 мая 2020 г.
  70. ^ Лоусон, Чарльз (7 октября 2016 г.). «ДНК, РНК и аминокислотные последовательности открытого доступа: последствия и решения для международного регулирования доступа и распределения выгод» (PDF) . Журнал права и медицины . 24 (1): 96–118. ПМИД   30136777 . Проверено 21 декабря 2021 г.
  71. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Мудли, К; Ченгиз, Н; Доминго, А; Наир, Г; Обаса, А.Е.; Лесселлс, Р.Дж.; де Оливейра, Т. (декабрь 2022 г.). «Проблемы этики и управления, связанные с обменом геномными данными на юге Африки: случай SARS-CoV-2» . «Ланцет». Глобальное здоровье . 10 (12): 1855–1859 гг. дои : 10.1016/S2214-109X(22)00417-X . ПМЦ   9826954 . ПМИД   36309034 . S2CID   253165702 .
  72. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Максмен, Эми (13 мая 2021 г.). «Почему некоторые исследователи выступают против неограниченного обмена данными о геноме коронавируса». Природа . 593 (7858): 176–177. Бибкод : 2021Natur.593..176M . дои : 10.1038/d41586-021-01194-6 . ПМИД   33953391 . S2CID   233867611 .
  73. ^ Зейдервейк, Аннеке; Янссен, Марин; Чоэнни, Сунил; Мейер, Рональд; Алибакс, Роксана Шейх (1 декабря 2012 г.). «Социо‑технические препятствия открытых данных» . Электронный журнал электронного правительства . 10 (2): 156–172. ISSN   1479-439Х . Проверено 30 августа 2023 г.
  74. ^ «ГИСАИД – Часто задаваемые вопросы» . сайт gisaid.org .
  75. ^ Крюков, К; Джин, Л; Накагава, С. (9 сентября 2022 г.). «Эффективное сжатие данных генома SARS-CoV-2 с использованием формата архива нуклеотидов» . Узоры (Нью-Йорк, штат Нью-Йорк) . 3 (9): 100562. doi : 10.1016/j.patter.2022.100562 . ПМЦ   9259476 . ПМИД   35818472 .
  76. ^ Бернаскони, А; Чанакоглу, А; Массероли, М; Пиноли, П; Кери, С. (22 марта 2021 г.). «Обзор источников вирусных данных и поисковых систем для перспективного смягчения последствий COVID-19» . Брифинги по биоинформатике . 22 (2): 664–675. дои : 10.1093/нагрудник/bbaa359 . ПМЦ   7799334 . ПМИД   33348368 .
  77. ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Ван Ноорден, Ричард (11 февраля 2021 г.). «Ученые призывают к полностью открытому обмену данными о геноме коронавируса». Природа . 590 (7845): 195–196. Бибкод : 2021Природа.590..195В . дои : 10.1038/d41586-021-00305-7 . ПМИД   33542487 . S2CID   231817576 .
  78. ^ «Открытое письмо: Поддержите обмен данными о COVID-19» . www.covid19dataportal.org . Проверено 21 апреля 2023 г.
  79. ^ «GISAID - Редакционная коллегия подтверждает статус GISAID в открытом доступе» . сайт gisaid.org . Проверено 27 марта 2023 г.
  80. ^ Коэн, Дж. (24 марта 2023 г.). «Появляются новые сведения о происхождении пандемии, вызывающие бурю негодования» . Наука . 379 (6638): 1175–1176. Бибкод : 2023Sci...379.1175C . дои : 10.1126/science.adh9055 . ПМИД   36952417 . S2CID   257696101 . Проверено 27 марта 2023 г.
  81. ^ Ву, Кэтрин Дж. (21 марта 2023 г.). «Основной ключ к разгадке происхождения COVID просто недосягаем» . Атлантика . Проверено 27 марта 2023 г.
  82. ^ «GISAID | re3data.org» . www.re3data.org . Проверено 27 марта 2023 г.
  83. ^ «Открытое письмо: Поддержите обмен данными о COVID-19» . www.covid19dataportal.org . Портал данных о COVID-19 . Проверено 27 марта 2023 г.
  84. ^ Ван Ноорден, Ричард (11 февраля 2021 г.). «Ученые призывают к полностью открытому обмену данными о геноме коронавируса». Природа . 590 (7845): 195–196. Бибкод : 2021Природа.590..195В . дои : 10.1038/d41586-021-00305-7 . ПМИД   33542487 . S2CID   231817576 .
  85. ^ Эльба, Стефан; Бакленд-Мерретт, Джемма (январь 2017 г.). «Данные, болезни и дипломатия: инновационный вклад GISAID в глобальное здравоохранение: данные, болезни и дипломатия» . Глобальные вызовы . 1 (1): 33–46. Бибкод : 2017ГлоХ...1...33Е . дои : 10.1002/gch2.1018 . ПМК   6607375 . ПМИД   31565258 . S2CID   15830721 . По данным GISAID, процент всех активных пользователей, чьи учетные данные для доступа к платформе GISAID были отозваны на момент написания, составляет около 0,16%.

Дальнейшее чтение [ править ]

Внешние ссылки [ править ]

Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=GISAID&oldid=1221059723"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: c8722077412f6c16cc7b057a8363c8cf__1714224480
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/c8/cf/c8722077412f6c16cc7b057a8363c8cf.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
GISAID - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)