Филиппинский геномный центр
 | |
| Учредил | 2009 год |
|---|---|
| Тип исследования | Базовые и прикладные |
Область исследований | Геномика |
| Директор | Синтия Салома |
| Расположение | Кесон-Сити , Филиппины 14 ° 39'06 "N 121 ° 04'18" E / 14,65157 ° N 121,07168 ° E |
| Принадлежности | Филиппинский университет Дилимана |
| Веб-сайт | пгк |
| Карта | |
  Расположение в метро Манилы | |
Филиппинский геномный центр ( PGC ) — это многопрофильный исследовательский центр в Кесон-Сити , метро Манила , Филиппины , который специализируется на геномике .
История [ править ]
Филиппинский центр генома был создан в результате сотрудничества Университета Филиппин и Департамента науки и технологий (DOST) . [1] Впервые он был задуман в 2009 году в ответ на вспышку атипичной пневмонии , поразившей Гонконг, вспышки денге , поразившие Филиппины, и продолжавшуюся тогда пандемию гриппа H1N1 , возникшую в Мексике. Первые гранты, полученные PGC, были предназначены для диагностического тестирования денге и эпиднадзора за гриппом H1N1 . [2] Первоначально учреждение было передано под юрисдикцию Филиппинского университета (UP) в Дилимане в соответствии с одобрением Попечительского совета UP на его заседании 31 июля 2009 года. Управления президента [3]
PGC был официально запущен 28 ноября 2011 года. Вначале центр работал виртуально. С января 2013 года до открытия здания 11 сентября 2019 года [4] он временно размещался в Национальном институте молекулярной биологии и биотехнологии в УП Дилиман.
Чтобы сделать услуги по секвенированию ДНК и биоинформатике доступными для филиппинских исследователей, при финансовой поддержке DOST были созданы Основной центр секвенирования ДНК (DSCF) и Основной центр биоинформатики (CFB). 26 февраля 2016 г. Попечительский совет UP одобрил передачу управления и надзора за PGC из аппарата президента университета в аппарат вице-президента по академическим вопросам. [3]
В 2019 году PGC Минданао [5] и PGC Висайские острова [6] были созданы в качестве дополнительных офисов на Минданао и Висайских островах соответственно.
Пандемия COVID-19 на Филиппинах [ править ]
В январе 2020 года PGC в сотрудничестве с Университета Манилы Национальными институтами здравоохранения разработал с помощью ОТ-ПЦР набор для обнаружения SARS CoV-2 . [7]
В апреле 2020 года Министерство здравоохранения назначило Филиппинский геномный центр 18-м центром тестирования на коронавирус. [8] Также было поручено провести геномное секвенирование образцов COVID-19. [9] В июле 2021 года компаниям PGC Mindanao и PGC Visayas также было поручено обнаружить новые варианты с планом предоставления им машин для проведения секвенирования генома. [10] В сентябре 2021 года PGC переключил свое внимание на выявление новых вариантов COVID-19 в стране и меньше внимания уделяет проведению RT-PCR-тестов. [11]
Удобства [ править ]
У PGC есть два «основных объекта»; Основной центр биоинформатики (CFB) и Основной центр секвенирования ДНК (DSCF). Биобанк . планируется стать третьим объектом PGC [12] Эти два объекта были профинансированы за счет гранта в размере 100 миллионов фунтов стерлингов (2,2 миллиона долларов США) в течение трех лет от Филиппинского совета по исследованиям и разработкам в области промышленности, энергетики и новых технологий (PCIEERD) Министерства науки и технологий . [2]
Базовый секвенирования центр ДНК
Открыт 24 сентября 2013 г. Основной центр секвенирования ДНК (DSCF) был первым открытым основным учреждением. Геномные исследования в области сельского хозяйства, биоразнообразия, криминалистики, здравоохранения и этнической принадлежности проводятся в DSCF с намерением специально удовлетворить потребности филиппинцев. [12] секвенирования ДНК и генома . DSCF предоставляет услуги [2]
биоинформатики Основной центр
Базовый центр биоинформатики (CFB) — это центр, который обеспечивает генерацию и анализ данных в масштабе генома местным исследователям в академических кругах, из государственных учреждений и частных организаций. Он также обеспечивает хранение геномных данных. Он также дополнен суперкомпьютером IBM Blue Gene , который также используется Филиппинским управлением атмосферных, геофизических и астрономических служб (PAGASA) и Проектом общенациональной оперативной оценки опасностей (Проект NOAH) для прогнозирования погоды и моделирования изменения климата в дополнение к геномным задачам. исследовательское использование. CFB был запущен 14 апреля 2014 года, а суперкомпьютер был введен в эксплуатацию в тот же день. [13]
Диагностика и лабораторные услуги [ править ]
PGC Mindanao предоставляет различные диагностические и лабораторные услуги местным исследователям и лабораториям. Эти услуги включают подготовку проб, спектрофотометрию , флуорометрию , полимеразную цепную реакцию , электрофорез , проточную цитометрию и различные другие биоинформатические и лабораторные услуги.
Передовое оборудование PGC Mindanao временно размещено в различных лабораториях CSM: биотехнологии , молекулярной биологии и лаборатории экстракции . [14]
Режиссеры [ править ]
- Амелия Гевара (2009–2011)
- Карменсита Падилья (2011–2016)
- Синтия Салома (2017 – настоящее время)
Ссылки [ править ]
- ^ Кесвани, Четан (14 октября 2019 г.). Биоэкономика для устойчивого развития . Спрингер Природа. п. 45. ИСБН 978-981-13-9431-7 . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с Эстоспейс, Эдем (4 марта 2015 г.). «Филиппинский центр генома: большой шаг в исследованиях в области здравоохранения и сельского хозяйства» . Инновации предприятия . Проверено 21 апреля 2018 г.
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б "О" . Филиппинский геномный центр . Проверено 21 апреля 2018 г.
- ^ Томакрус, София (12 сентября 2019 г.). «СМОТРИТЕ: UP открывает передовой центр исследования генома» . Рэплер . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Центр, Филиппинский геном. «PGC Mindanao участвует в совместном исследовании геномики SARS-COV-2 с использованием портативной платформы для секвенирования» . Филиппинский геномный центр . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ «История» . pgc.upv.edu.ph. Филиппинский центр генома Висайские острова. 20 ноября 2020 г. . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Дейро, Элизабет Рут (13 марта 2020 г.). «Как группа филиппинских ученых разработала набор для тестирования на COVID-19» . CNN Филиппины . Архивировано из оригинала 15 сентября 2021 года . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Магсамбол, Бонз (24 апреля 2020 г.). «Филиппинский геномный центр — 18-й центр тестирования на коронавирус в стране» . Рэплер . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Гонсалес, Катрин (6 мая 2021 г.). «Эксперт отмечает «очень низкий» объем выборки PH для секвенирования генома COVID-19» . INQUIRER.net . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Лена, Перла (23 июля 2021 г.). «PGC оборудует центры секвенирования генома в Висайях и Минданао» . www.pna.gov.ph. Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Дейпарин, Кристиан (13 сентября 2021 г.). «Геномный центр сокращает масштабы тестирования на COVID-19, чтобы сосредоточиться на обнаружении вариантов» . Philstar.com . Проверено 15 сентября 2021 г.
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Люсес, Ким (25 сентября 2013 г.). «Геномный центр PHL открывает для местных исследователей новый центр секвенирования ДНК» . Новости ГМА . Проверено 21 апреля 2018 г.
- ^ Ронда, Ренье Аллан (15 апреля 2014 г.). «DOST активирует суперкомпьютер IBM» . Новости АБС-ЦБН . Филиппинский Daily Inquirer . Проверено 21 апреля 2018 г.
- ^ "Услуги" . Филиппинский геномный центр . Проверено 22 апреля 2021 г.
- Научно-исследовательские институты генетики или геномики
- Лаборатории университетов и колледжей на Филиппинах
- Суперкомпьютеры на Филиппинах
- 2009 заведения на Филиппинах
- Филиппинский университет Дилимана
- Биоинформатические организации
- Исследовательские институты в Метро Маниле
- Пандемия COVID-19 на Филиппинах