Jump to content

Биобанк

Образцы крови берутся у новорожденного ребенка в Швеции для национального биобанка реестра ФКУ.

Биобанк — это тип биохранилища , в котором хранятся биологические образцы (обычно человеческие) для использования в исследованиях. Биобанки стали важным ресурсом в медицинских исследованиях, поддерживая многие виды современных исследований, таких как геномика и персонализированная медицина .

Биобанки могут предоставить исследователям доступ к данным, представляющим большое количество людей. Образцы в биобанках и данные, полученные из этих образцов, часто могут использоваться несколькими исследователями для перекрестных исследований. Например, многие заболевания связаны с однонуклеотидными полиморфизмами . Полногеномные исследования ассоциаций с использованием данных десятков или сотен тысяч людей могут идентифицировать эти генетические ассоциации как потенциальные биомаркеры заболеваний . Многие исследователи изо всех сил пытались получить достаточное количество образцов до появления биобанков.

Биобанки вызвали вопросы о конфиденциальности, этике исследований и медицинской этике . Точки зрения на то, что представляет собой надлежащая этика биобанков , расходятся. Однако был достигнут консенсус в отношении того, что работа биобанков без установления тщательно продуманных руководящих принципов и политики может нанести ущерб сообществам, участвующим в программах биобанков.

Термин «биобанк» впервые появился в конце 1990-х годов и представляет собой широкий термин, который эволюционировал в последние годы. [1] [2] Одно из определений — «организованная коллекция человеческого биологического материала и связанной с ним информации, хранимая для одной или нескольких исследовательских целей». [3] [4] Коллекции растений, животных, микробов и других нечеловеческих материалов также можно назвать биобанками, но в некоторых дискуссиях этот термин применяется к человеческим образцам. [3]

Биобанки обычно включают в себя криогенные хранилища для образцов. [5] Они могут варьироваться по размеру от отдельных холодильников до складов и обслуживаются такими учреждениями, как больницы, университеты, некоммерческие организации и фармацевтические компании. [5]

Биобанки можно классифицировать по назначению или дизайну. Биобанки, ориентированные на заболевания, обычно имеют филиалы в больницах, через которые они собирают образцы, представляющие различные заболевания, возможно, для поиска биомаркеров, связанных с заболеванием. [6] [7] Популяционные биобанки не нуждаются в какой-либо конкретной больничной принадлежности, поскольку они берут образцы у большого количества самых разных людей, возможно, для поиска биомаркеров восприимчивости к болезням среди населения в целом. [8]

  • Виртуальные биобанки объединяют эпидемиологические когорты в общий пул. [9] Виртуальные биобанки позволяют собирать образцы в соответствии с национальным законодательством. [10]
  • Банки тканей собирают и хранят человеческие ткани для трансплантации и исследований. Ожидается, что по мере того, как биобанки станут более авторитетными, банки тканей будут сливаться с биобанками. [10]
  • В банках населения хранятся биоматериалы, а также связанные с ними характеристики, такие как данные об образе жизни, клинические данные и данные об окружающей среде. [10]

В 2008 году исследователи из США хранили в биобанках 270 миллионов образцов, а скорость сбора новых образцов составляла 20 миллионов в год. [11] Эти цифры представляют собой фундаментальное глобальное изменение в характере исследований между временем, когда такое количество образцов было невозможно использовать, и временем, когда исследователи начали требовать их. [11] Совместно исследователи начали переходить от одноцентровых исследовательских центров к качественно иной исследовательской инфраструктуре следующего поколения. [12] Некоторые из проблем, возникших с появлением биобанков, - это этические, правовые и социальные проблемы, связанные с их существованием, включая справедливость сбора пожертвований от уязвимых групп населения, предоставление информированного согласия донорам, логистику раскрытия данных участникам, право на право собственности на интеллектуальную собственность, а также конфиденциальность и безопасность участвующих доноров. [11] Из-за этих новых проблем исследователи и политики начали требовать новых систем управления исследованиями. [12]

Многие исследователи определили биобанкинг как ключевую область развития инфраструктуры, способствующую открытию и разработке лекарств . [3]

Типы и приложения

[ редактировать ]

Исследования генетики человека

[ редактировать ]

К концу 1990-х годов ученые поняли, что, хотя многие болезни вызваны, по крайней мере частично, генетическим компонентом, лишь немногие заболевания возникают из-за одного дефектного гена ; большинство генетических заболеваний вызваны множеством генетических факторов на нескольких генах. [13] Поскольку стратегия изучения только отдельных генов оказалась неэффективной для поиска генетических компонентов многих заболеваний, а также поскольку новые технологии сделали затраты на исследование одного гена по сравнению с полногеномным сканированием примерно одинаковыми, ученые начали собирать гораздо большие объемы данных. генетическая информация, когда ее вообще нужно было собирать. [13] В то же время технологические достижения также сделали возможным широкий обмен информацией, поэтому, когда данные были собраны, многие ученые, занимающиеся генетикой, обнаружили, что доступ к данным полногеномного сканирования, собранным по какой-либо одной причине, на самом деле может быть полезен во многих других видах. генетических исследований. [13] Если раньше данные обычно хранились в одной лаборатории, то теперь ученые начали хранить большие объемы генетических данных в отдельных местах для использования и обмена сообществом. [13]

Непосредственным результатом полногеномного сканирования и обмена данными стало открытие множества однонуклеотидных полиморфизмов , причем первым успехом стало улучшение идентификации около 10 000 из них с помощью сканирования одного гена и до создания биобанков по сравнению с 500 000 к 2007 году после практика полногеномного сканирования существовала уже несколько лет. [13] Проблема осталась; эта меняющаяся практика позволила собирать данные о генотипе , но одновременно не сопровождалась системой сбора соответствующих данных о фенотипе . [13] В то время как данные о генотипе получают из биологического образца, такого как образец крови, данные о фенотипе должны быть получены в результате обследования образца донора посредством интервью, физического обследования, изучения истории болезни или какого-либо другого процесса, который может быть трудно организовать. [13] Даже когда эти данные были доступны, существовала этическая неопределенность относительно того, в какой степени и каким образом права пациентов могут быть сохранены путем сопоставления их с генотипическими данными. [13] Институт биобанков начал развиваться для хранения генотипических данных, их связи с фенотипическими данными и обеспечения более широкой доступности для исследователей, которые в них нуждались. [13]

Биобанки, включающие образцы генетического тестирования , исторически состояли из большинства образцов людей европейского происхождения. [14] Необходима диверсификация образцов биобанков, и исследователи должны учитывать факторы, влияющие на недостаточно представленные группы населения. [15] [16]

Сохранение, восстановление экосистем и геоинженерия

[ редактировать ]

В ноябре 2020 года ученые начали собирать живые фрагменты, образцы тканей и ДНК находящихся под угрозой исчезновения кораллов Большого Барьерного рифа для создания профилактического биобанка для потенциальных будущих мероприятий по восстановлению и реабилитации. [17] Несколькими месяцами ранее другая австралийская группа исследователей сообщила, что они сделали такие кораллы более термостойкими. [18]

Биологические образцы

[ редактировать ]

Образцы , хранящиеся в биобанке и предоставляемые исследователям, отбираются путем отбора проб . Типы образцов включают кровь , мочу , клетки кожи, ткани органов и другие материалы. Методы отбора образцов тканей становятся все более целенаправленными, иногда с использованием МРТ для определения того, из каких конкретных участков ткани следует взять образцы. [19] [20] Биобанк хранит эти образцы в хорошем состоянии до тех пор, пока они не понадобятся исследователю для проведения теста, эксперимента или анализа. [ нужна ссылка ]

Хранилище

[ редактировать ]

Биобанки, как и другие базы данных ДНК, должны тщательно хранить и документировать доступ к образцам и информации о донорах. [21] Образцы должны надежно храниться с минимальным ухудшением с течением времени, и их необходимо защищать от физического повреждения, как случайного, так и преднамеренного. Регистрация каждого образца, поступающего в систему и выходящего из нее, хранится централизованно, обычно в компьютерной системе, резервное копирование которой можно часто выполнять. [21] Физическое местоположение каждого образца отмечается, чтобы можно было быстро найти образцы. Архивные системы деидентифицируют образцы, чтобы уважать конфиденциальность доноров и позволяют исследователям скрывать анализ. [21] База данных, включая клинические данные, хранится отдельно с использованием безопасного метода связи клинической информации с образцами тканей. [21] Иногда используется хранение образцов при комнатной температуре, и оно было разработано в ответ на очевидные недостатки низкотемпературного хранения, такие как затраты и вероятность выхода из строя морозильной камеры. [21] Современные системы невелики и способны хранить около 40 000 образцов, занимая примерно одну десятую пространства, необходимого для морозильной камеры при температуре -80 °C (-112 °F). В целях безопасности повторы или разделенные образцы часто хранятся в разных местах. [21]

Право собственности

[ редактировать ]

Одним из спорных вопросов, возникающих в связи с большими базами данных генетического материала, является вопрос о праве собственности на образцы. По состоянию на 2007 год в Исландии действовало три разных закона о праве собственности на физические образцы и содержащуюся в них информацию. [22] Законодательство Исландии гласит, что правительство Исландии имеет права хранения самих физических образцов, в то время как доноры сохраняют права собственности. [22] Напротив, Тонга и Эстония передают право собственности на образцы биобанков правительству, но их законы предусматривают строгую защиту прав доноров. [22]

Ключевое событие, которое возникает в биобанкинге, — это когда исследователь хочет взять образец человека для исследования. Когда это происходит, возникают следующие вопросы: право участников исследования на неприкосновенность частной жизни , право собственности на образец и полученные из него данные, степень, в которой донор может участвовать в возврате результатов исследования , а также степень, в которой донор может участвовать в возврате результатов исследования. донор может дать согласие на участие в научном исследовании. [23]

Что касается согласия, основная проблема заключается в том, что биобанки обычно собирают образцы и данные для нескольких будущих исследовательских целей, и невозможно получить конкретное согласие для всех возможных будущих исследований. Обсуждалось, что разовое согласие или широкое согласие для различных исследовательских целей может быть недостаточным для этических и юридических требований. [24] [25] Динамическое согласие — это подход к согласию, который может лучше подходить для биобанкинга, поскольку он обеспечивает постоянное взаимодействие и связь между исследователями и донорами образцов/данных с течением времени.

Управление

[ редактировать ]

Не существует международно признанного набора руководящих принципов управления, предназначенных для работы с биобанками. Биобанки обычно пытаются адаптироваться к более широким рекомендациям, принятым на международном уровне для исследований на людях, и меняют руководящие принципы по мере их обновления. Надзор за многими видами исследований, особенно в области медицинских исследований, осуществляется на местном уровне со стороны институционального наблюдательного совета . Институциональные наблюдательные советы обычно обеспечивают соблюдение стандартов, установленных правительством своей страны. Законы, используемые в разных странах, в разной степени часто моделируются на основе рекомендаций по управлению биобанками, предложенных на международном уровне.

Ключевые организации

[ редактировать ]

Ниже приведены некоторые примеры организаций, принимавших участие в создании письменных руководств по биобанкингу: [2] Всемирная медицинская ассоциация , Совет международных организаций медицинских наук , Совет Европы , Организация генома человека , Всемирная организация здравоохранения и ЮНЕСКО .Международное общество биологических и экологических хранилищ (ISBER) — это глобальная биобанковская организация, которая создает возможности для налаживания связей, образования и инноваций, а также гармонизирует подходы к решению возникающих проблем в биологических и экологических хранилищах. ISBER объединяет репозитории по всему миру с помощью лучших практик. Четвертое издание ISBER Best Practices было выпущено 31 января 2018 года с дополнением к LN2, выпущенным в начале мая 2019 года. [26]

В 1998 году парламент Исландии принял Закон о базе данных сектора здравоохранения . Этот закон позволил создать в этой стране национальный биобанк. США В 1999 году Национальная консультативная комиссия по биоэтике опубликовала отчет, содержащий политические рекомендации по обращению с биологическими образцами человека. [11] США В 2005 году Национальный институт рака основал Управление биохранилищ и исследований биообразцов , чтобы иметь подразделение для создания общей базы данных и стандартных рабочих процедур для своих партнерских организаций, имеющих коллекции биообразцов. [11] В 2006 году Совет Европейского Союза принял политику в отношении биологических образцов человека, которая была новой для обсуждения вопросов, уникальных для биобанков. [11]

Экономика

[ редактировать ]

Исследователи призвали к более критическому изучению экономических аспектов биобанков, особенно тех, которым способствует государство. [27] Национальные биобанки часто финансируются за счет государственно-частных партнерств, при этом финансирование обеспечивается любым сочетанием национальных исследовательских советов, медицинских благотворительных организаций, инвестиций фармацевтических компаний и биотехнологического венчурного капитала. [28] Таким образом, национальные биобанки обеспечивают экономические отношения, опосредованные между государствами, национальным населением и коммерческими организациями. Было продемонстрировано, что существует сильный коммерческий стимул, лежащий в основе систематического сбора тканевого материала. Это особенно заметно в области геномных исследований, где популяционные исследования легче подходят для диагностических технологий, чем для фундаментальных этиологических исследований. [29] Учитывая потенциал значительной прибыли, исследователи Митчелл и Уолдби [27] утверждают, что, поскольку биобанки привлекают большое количество населения страны в качестве продуктивных участников, которые позволяют своим телам и предполагаемым историям болезни создавать ресурс с коммерческим потенциалом, их вклад следует рассматривать как форму «клинического труда», и поэтому участники также должны получать выгоду. экономически.

[ редактировать ]

Были случаи, когда право собственности на хранящиеся человеческие образцы оспаривалось и доводилось до суда. Некоторые случаи включают в себя:

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Хьюитт Р., Уотсон П. (октябрь 2013 г.). «Определение биобанка». Биоконсервация и биобанкинг . 11 (5): 309–15. дои : 10.1089/bio.2013.0042 . ПМИД   24835262 .
  2. ^ Jump up to: а б с Хьюитт Р.Э. (январь 2011 г.). «Биобанкинг: основа персонализированной медицины». Современное мнение в онкологии . 23 (1): 112–9. дои : 10.1097/CCO.0b013e32834161b8 . ПМИД   21076300 . S2CID   205547716 .
  3. ^ Кауфманн Ф., Камбон-Томсен А. (май 2008 г.). «Отслеживание биологических коллекций: между книгами и клиническими испытаниями». ДЖАМА . 299 (19): 2316–8. дои : 10.1001/jama.299.19.2316 . ПМИД   18492973 .
  4. ^ Jump up to: а б Зильберман С. (июнь 2010 г.). «Файлы плоти». Проводной . Том. 18, нет. 6. С. 157–161, 182, 184, 188, 190.
  5. ^ Бевилаква Г., Босман Ф., Дассесс Т., Хёфлер Х., Джанин А., Лангер Р. и др. (апрель 2010 г.). «Роль патологоанатома в банке тканей: отчет Европейской консенсусной экспертной группы» . Архив Вирхова . 456 (4): 449–54. дои : 10.1007/s00428-010-0887-7 . ПМЦ   2852521 . ПМИД   20157825 .
  6. ^ Паскаль В., Паскаль А.М., Дембски Т., Грызяк М., Яворовский Ю. (октябрь 2018 г.). «Аспекты деятельности современных биобанков – комплексный обзор» . Патологические и онкологические исследования . 24 (4): 771–785. дои : 10.1007/s12253-018-0418-4 . ПМК   6132819 . ПМИД   29728978 .
  7. ^ Ригман П.Х., Моренте М.М., Бетсу Ф., де Блазио П., Гири П. и др. (Международная рабочая группа Marble Arch по биобанкингу для биомедицинских исследований) (октябрь 2008 г.). «Биобанкинг для лучшего здравоохранения» . Молекулярная онкология . 2 (3): 213–22. дои : 10.1016/j.molonc.2008.07.004 . ПМК   5527804 . ПМИД   19383342 .
  8. ^ Готвайс Х., Петерсен А.Р. (20 июня 2008 г.). Биобанки: управление в сравнительной перспективе . Тейлор и Фрэнсис. п. 92. ИСБН  978-0-415-42737-1 . Проверено 1 февраля 2012 года .
  9. ^ Jump up to: а б с Лабант М.А. (15 января 2012 г.). «Разнообразие биобанков способствует разработке лекарств и диагностики» . Новости генной инженерии и биотехнологии . 32 (2): 42,44. дои : 10.1089/gen.32.2.21 . ISSN   1935-472X . Проверено 1 февраля 2012 года .
  10. ^ Jump up to: а б с д и ж Хага С., Бесков Л. (2008). «Этические, юридические и социальные последствия биобанков для генетических исследований». Генетическое рассечение сложных признаков . Достижения генетики. Том. 60. стр. 505–544. дои : 10.1016/S0065-2660(07)00418-X . ISBN  9780123738837 . ПМИД   18358331 .
  11. ^ Jump up to: а б Фуллертон С.М., Андерсон Н.Р., Гузаускас Г., Фриман Д., Фрайер-Эдвардс К. (январь 2010 г.). «Решение проблем управления исследованиями биохранилищ нового поколения» . Наука трансляционной медицины . 2 (15): 15см3. doi : 10.1126/scitranslmed.3000361 . ПМК   3038212 . ПМИД   20371468 .
  12. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я Грили HT (2007). «Непростая этическая и правовая основа крупномасштабных геномных биобанков» . Ежегодный обзор геномики и генетики человека . 8 : 343–64. дои : 10.1146/annurev.genom.7.080505.115721 . ПМИД   17550341 .
  13. ^ Фишер Э.Р., Пратт Р., Эш Р., Кохер М., Уилсон К., Ли В., Зирхут Х.А. (февраль 2020 г.). «Роль расы и этнической принадлежности во взглядах и участии в генетических исследованиях и исследованиях точной медицины в Соединенных Штатах: систематический обзор качественных и количественных исследований» . Молекулярная генетика и геномная медицина . 8 (2): e1099. дои : 10.1002/mgg3.1099 . ПМК   7005620 . PMID   31867882 .
  14. ^ Юинг А.Т., Тернер А.Д., Саки К.С., Элми А., Таусон М., Слэйд Дж.Л. и др. (сентябрь 2020 г.). «Усиление их голоса: советы, рекомендации и осознанная ценность исследований в области биобанкинга рака среди более старшей и разнообразной когорты» . Журнал онкологического образования . 37 (3): 683–693. дои : 10.1007/s13187-020-01869-0 . ПМЦ   10286728 . ПМИД   32975747 . S2CID   221917485 .
  15. ^ Юинг А.Т., Калу Н., Кейн Дж., Эрби Л.Х., Рикс-Санти Л.Дж., Теттейфио-Кидд Телемак Э., Скотт Д.М. (октябрь 2019 г.). «Факторы, связанные с готовностью предоставить биообразцы для генетических исследований среди афроамериканцев, переживших рак» . Журнал общественной генетики . 10 (4): 471–480. дои : 10.1007/s12687-019-00411-0 . ПМК   6754482 . ПМИД   30877487 .
  16. ^ Лу Д. «Биобанк будет содержать 800 видов кораллов, чтобы мы могли восстановить рифы в будущем» . Новый учёный . Проверено 9 декабря 2020 г.
  17. ^ «Ученые успешно разработали «термостойкий» коралл для борьбы с обесцвечиванием» . физ.орг . Проверено 29 декабря 2020 г.
  18. ^ Хиви С., Хайдер А., Шридхар А., Пай Х., Шоу Дж., Фриман А., Уитакер Х. (октябрь 2019 г.). «Использование данных магнитно-резонансной томографии и биопсии для определения процедур отбора проб для биобанкинга рака простаты» . Журнал визуализированных экспериментов (152). дои : 10.3791/60216 . ПМИД   31657791 .
  19. ^ Хиви С., Коста Х., Пай Х., Берт Э.К., Дженкинсон С., Льюис Г.Р. и др. (май 2019 г.). «ЛЮДИ: ОБРАЗЦЫ ПРОСТАТЫ ПАЦИЕНТОВ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЙ, метод сбора тканей, использующий данные магнитно-резонансной томографии для нацеливания на опухоли и доброкачественные ткани в образцах свежей радикальной простатэктомии» . Простата . 79 (7): 768–777. дои : 10.1002/pros.23782 . ПМК   6618051 . ПМИД   30807665 .
  20. ^ Jump up to: а б с д и ж Маклауд А.К., Лиевальд, округ Колумбия, МакГилкрист М.М., Моррис А.Д., Керр С.М., Портеус DJ (февраль 2009 г.). «Некоторые принципы и практика генетических биобанковских исследований» . Европейский респираторный журнал . 33 (2): 419–25. дои : 10.1183/09031936.00043508 . ПМИД   19181915 . S2CID   6669308 .
  21. ^ Jump up to: а б с Нвабуэзе Р.Н. (30 сентября 2007 г.). Биотехнология и проблема собственности: права собственности на трупы . Олдершот, Англия: Ashgate Press. стр. 169–170 . ISBN  978-0-7546-7168-8 .
  22. ^ Хокинс А.К., О'Доэрти К.К. (октябрь 2011 г.). « Кому принадлежат ваши какашки?»: идеи о пересечении исследований микробиома человека и аспектов ELSI в области биобанков и связанных с ними исследований» . BMC Медицинская Геномика . 4:72 . дои : 10.1186/1755-8794-4-72 . ПМК   3199231 . ПМИД   21982589 .
  23. ^ Хойер К. (2012). «Хладнокровная торговля?». Доверьтесь биобанкингу . стр. 21–41.
  24. ^ Юинг А.Т., Эрби Л.А., Боллинджер Дж., Теттейфио Э., Рикс-Санти Л.Дж., Кауфман Д. (апрель 2015 г.). «Демографические различия в готовности предоставить широкое и узкое согласие на исследования биобанков» . Биоконсервация и биобанкинг . 13 (2): 98–106. дои : 10.1089/bio.2014.0032 . ПМЦ   4574731 . ПМИД   25825819 .
  25. ^ «Лучшие практики ISBER для репозиториев — ISBER» . www.isber.org . Проверено 11 февраля 2020 г.
  26. ^ Jump up to: а б Митчелл Р. (май 2010 г.). «Национальные биобанки: клинический труд, производство риска и создание биоценности» . Наука, технологии и человеческие ценности . 35 (3): 330–355. дои : 10.1177/0162243909340267 . ПМЦ   2879701 . ПМИД   20526462 .
  27. ^ Льюис Дж. (2004). «Коллекция тканей и фармацевтическая промышленность: исследование корпоративных биобанков». В Туттон Р., Корриган О. (ред.). Генетические базы данных: Социально-этические проблемы сбора и использования ДНК . Лондон и Нью-Йорк: Рутледж. стр. 181–201.
  28. ^ Раджан КС (2006). Биокапитал: конституция постгеномной жизни . Дарем: Издательство Университета Дьюка.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 8ee7e98a92270e34016c0dd99b8e5c51__1715871600
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/8e/51/8ee7e98a92270e34016c0dd99b8e5c51.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Biobank - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)