Биологический образец
Биологический образец (также называемый биообразцом ) — это биологический лабораторный образец, хранящийся в биохранилище для исследований. Такой образец будет отбираться путем отбора проб таким образом, чтобы он был репрезентативным для любого другого образца, взятого из источника образца. При хранении биологических образцов в идеале они должны оставаться эквивалентными свежесобранным образцам для целей исследования.
Биологические образцы человека хранятся в биохранилищах, называемых биобанками , и наука о сохранении биологических образцов наиболее активна в области биобанков.
Контроль качества
[ редактировать ]Установление широких стандартов качества биологических образцов изначально было недостаточно развитым аспектом роста биобанков. [1] В настоящее время идет дискуссия о том, какие стандарты должны быть установлены и кто должен управлять этими стандартами. Поскольку многие организации устанавливают свои собственные стандарты, а биобанки обязательно используются несколькими организациями и, как правило, стремятся к расширению, гармонизация стандартных операционных процедур для лабораторной практики является высоким приоритетом. [1] Процедуры должны быть основаны на фактических данных и будут меняться со временем по мере появления новых исследований и технологий. [1]
Политики
[ редактировать ]Некоторый прогресс в создании организаций, определяющих политику, включает создание Национальным институтом рака в 2005 году Управления биобанков и исследований биообразцов (OBBR). [1] и ежегодные симпозиумы Сети исследований биообразцов. [2] Международное общество биологических и экологических хранилищ , Международное агентство по исследованию рака, Организация экономического сотрудничества и развития и Австралазийская сеть биообразцов также предложили политику и стандарты. [1] В 2008 году AFNOR , французская организация по стандартизации, опубликовала первый стандарт качества для биобанков. [1] Аспекты ISO 9000 были применены к биобанкам. [1]
Цели качества
[ редактировать ]Критерии качества образцов зависят от рассматриваемого исследования, и не существует универсального стандартного типа образцов. [1] Целостность ДНК является важным фактором для исследований, включающих амплификацию всего генома. [3] Целостность РНК имеет решающее значение для некоторых исследований и может быть оценена с помощью гель-электрофореза . [4] Кроме того, биобанки, которые хранят образцы, не могут взять на себя полную ответственность за целостность образцов, потому что, прежде чем они возьмут образцы на хранение, кто-то должен их собрать и обработать, а такие эффекты, как деградация РНК, более вероятны из-за задержки обработки образцов, чем из-за неправильного хранения. [5]
Образцы хранятся
[ редактировать ]Биорепозитории хранят различные типы образцов. [ нужна ссылка ] Разные экземпляры пригодны для разных целей. [ нужна ссылка ]
| Образцы биобанка | ||||
|---|---|---|---|---|
| образец | использует | техника извлечения | хранилище | характеристики |
| щеки ткань | Профилирование ДНК | буккальный мазок | участники могут собраться сами; можно забрать по почте; настолько легко получить, что информированное согласие может быть учтено недостаточно | |
| цельная кровь | венепункция | требуется флеботомист для сбора | ||
| Пятно засохшей крови | дает высококачественную ДНК и РНК | Палец | легко хранится годами при комнатной температуре | |
| органа ткань | дает высококачественную ДНК , РНК , митохондриальную ДНК и источник заболевания. | Биопсия | многие виды использования совпадают с кровью; также подходит для протеомного анализа; может быть трудно получить | |
| Плазма | ограниченное содержание ДНК и РНК | Фракционирование плазмы крови | требуется флеботомист для сбора | |
| Моча | маркер для некоторых диагностических тестов | Мочеиспускание | неинвазивный | |
| Фекалии | маркер для некоторых диагностических тестов | Образец кала | неинвазивный | |
| Кожа | В основном используется судебно-медицинскими экспертами, расследующими уголовные дела. | по уголовным делам, собранные без согласия дарителя | ||
| Волосы | В основном используется судебно-медицинскими экспертами, расследующими уголовные дела. | Анализ волос | по уголовным делам, собранные без согласия дарителя | |
Методы хранения
[ редактировать ]Многие образцы в биобанках криоконсервированы . [ нужна ссылка ] Остальные экземпляры хранят другими способами. [6]
Методы, связанные с биобанками
[ редактировать ]Некоторые из лабораторных методов, связанных с хранением биологических образцов, включают фенол-хлороформную экстракцию , ПЦР и ПДРФ . [ нужна ссылка ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час Хьюитт, RE (2011). «Биобанкинг: основа персонализированной медицины». Современное мнение в онкологии . 23 (1): 112–119. дои : 10.1097/CCO.0b013e32834161b8 . ПМИД 21076300 .
- ^ Мур, HM; Комптон, CC; Лим, доктор медицины; Воот, Дж.; Кристиансен, КНЦ; Альпер, Дж. (2009). «Симпозиум Сети исследований биообразцов 2009 года: Продвижение исследований рака посредством науки о биообразцах» . Исследования рака . 69 (17): 6770–6772. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-09-1795 . ПМЦ 2782665 . ПМИД 19706749 .
- ^ Юй, М.; Иллиг, Т.; Хвеем, К.; Шмитц, Г.; Хансен, Дж.; Ноймайер, М.; Тайбринг, Г.; Вичманн, Э.; Олье, Б. (2010). «Лабораторное управление образцами в биобанках: отчет Европейской консенсусной экспертной группы». Биоконсервация и биобанкинг . 8 (1): 65–9. дои : 10.1089/bio.2010.8102 . ПМИД 24836342 .
- ^ Герен, Дж.С.; Мюррей, Д.В.; МакГрат, ММ; Юлль, Массачусетс; Макпартлин, Дж. М.; Доран, ПП (2010). «Руководство молекулярной медицины Ирландии по стандартизированному биобанкингу». Биоконсервация и биобанкинг . 8 (1): 3–63. дои : 10.1089/bio.2010.8101 . ПМИД 24836341 .
- ^ Барнс, Миннесота; Гром, А.А.; Гриффин, штат Техас; Кольбер, РА; Томпсон, SD (2010). «Профили экспрессии генов мононуклеарных клеток периферической крови чувствительны к коротким задержкам обработки» . Биоконсервация и биобанкинг . 8 (3): 153–162. дои : 10.1089/bio.2010.0009 . ПМК 3129811 . ПМИД 21743826 .
- ^ Эллиотт, П.; Пикман, TC; Великобритания, Б. (2008). «Протокол обработки и хранения образцов Биобанка Великобритании для сбора, обработки и архивирования человеческой крови и мочи» . Международный журнал эпидемиологии . 37 (2): 234–244. дои : 10.1093/ije/dym276 . ПМИД 18381398 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- База данных исследований биообразцов , тщательно подобранный сборник статей о биообразцах.
- Управление биохранилищ и исследований биообразцов
- Список центральных биохранилищ образцов , список активных биобанков и биохранилищ по всему миру.
- Симпозиумы Сети исследований биообразцов , конференция по образцам биобанков.
- Клиника Мэйо по биобанкингу
- Короткий выпуск общественного телевидения о музейных коллекциях
- Услуги по сбору биообразцов
| Базы данных органов управления : Национальные |
|---|
