Jump to content

Следующий штамм

Следующий штамм
Формирование 2015 ; 9 лет назад ( 2015 )
Расположение
Поля
Ключевые люди
Награда(ы)
Веб-сайт https://nextstrain.org

Nextstrain — результат сотрудничества исследователей из Сиэтла , США. [1] и Базель , Швейцария [2] который предоставляет набор инструментов с открытым исходным кодом для визуализации генетики, лежащей в основе распространения вирусных вспышек . [3]

Его цель – поддержать меры общественного здравоохранения и эпиднадзор, способствуя пониманию распространения и эволюции патогенов . Платформа Nextstrain была запущена в 2015 году. [2] Код, разработанный Nextstrain, становится общедоступным, например, через github.com , а его данные доступны и доступны для просмотра в доступной форме на страницах веб-сайта. [4]

Приложения

[ редактировать ]

Согласно их веб-сайту, команда Nextstrain проводит актуальный геномный анализ каждого из следующих патогенов: [5]

COVID-19 пандемия

[ редактировать ]

Nextstrain и его результаты широко цитировались во время пандемии COVID-19 . [6] [7] [ ненадежный источник? ] [8] [9]

В мае 2020 года Nextstrain и Тревор Бедфорд (доцент Центра онкологических исследований Фреда Хатчинсона ) [10] получил награду Webby за особые достижения за этот веб-инструмент. [11]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Ричардс, Сара Элизабет (26 марта 2020 г.). «Как мутации коронавируса могут отслеживать его распространение и опровергать заговоры» . www.nationalgeographic.com . Архивировано из оригинала 24 декабря 2020 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б «Распространение нового варианта SARS-CoV-2 по Европе летом 2020 года» . www.unibas.ch . 29 октября 2020 года. Архивировано из оригинала 16 декабря 2020 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
  3. ^ Реза, Ношин (6 апреля 2020 г.). «РНК, ДНК и COVID-19 следующего штамма]» . Earlycareervoice.professional.heart.org . Архивировано из оригинала 25 января 2021 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
  4. ^ Хэдфилд, Джеймс; Мегилл, Колин; Белл, Сидни; Хаддлстон, Джон; Поттер, Барни; Каллендер, Чарльтон; и др. (22 мая 2018 г.). Келсо, Джанет (ред.). «Nextstrain: отслеживание эволюции патогенов в реальном времени» . Биоинформатика . 34 (23): 4121–4123. doi : 10.1093/биоинформатика/bty407 . ISSN   1367-4803 . ПМК   6247931 . ПМИД   29790939 .
  5. ^ «Nextstrain Отслеживание эволюции патогенов в реальном времени. Раздел «Изучение патогенов» . nextstrain.org . Архивировано из оригинала 26 декабря 2020 года . Проверено 26 декабря 2020 г.
  6. ^ Дрейк, Джон (19 декабря 2020 г.). «Наука, лежащая в основе рождественской блокировки коронавируса в Лондоне» . www.forbes.com . Архивировано из оригинала 22 декабря 2020 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
  7. ^ Ходкрофт, Эмма Б .; Зубер, Мойра; Надо, Сара; Комас, Иньяки; Гонсалес Канделас, Фернандо; Стадлер, Таня; Неер, Ричард А. (28 октября 2020 г.). «Появление и распространение варианта SARS-CoV-2 по Европе летом 2020 года». medRxiv   10.1101/2020.10.25.20219063v1 .
  8. ^ «Швейцарская национальная научная целевая группа по COVID-19» . Проверено 21 декабря 2021 г.
  9. ^ «Nextstrain, секвенирование и пандемия SARS-CoV-2» (PDF) . 2020 . Проверено 21 декабря 2021 г.
  10. ^ «Здравоохранение 40 до 40» . Fortune.com . Архивировано из оригинала 20 октября 2020 года . Проверено 29 декабря 2020 г. .
  11. ^ «Особое достижение Уэбби» . Winners.webbyawards.com . Архивировано из оригинала 10 октября 2021 года . Проверено 29 декабря 2020 г. .
[ редактировать ]


Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 2da57ea8a063848f5aaeec833f317078__1700320140
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/2d/78/2da57ea8a063848f5aaeec833f317078.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Nextstrain - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)