Следующий штамм
Формирование | 2015 |
---|---|
Расположение | |
Поля | |
Ключевые люди | |
Награда(ы) |
|
Веб-сайт | https://nextstrain.org |
Nextstrain — результат сотрудничества исследователей из Сиэтла , США. [1] и Базель , Швейцария [2] который предоставляет набор инструментов с открытым исходным кодом для визуализации генетики, лежащей в основе распространения вирусных вспышек . [3]
Его цель – поддержать меры общественного здравоохранения и эпиднадзор, способствуя пониманию распространения и эволюции патогенов . Платформа Nextstrain была запущена в 2015 году. [2] Код, разработанный Nextstrain, становится общедоступным, например, через github.com , а его данные доступны и доступны для просмотра в доступной форме на страницах веб-сайта. [4]
Приложения
[ редактировать ]Согласно их веб-сайту, команда Nextstrain проводит актуальный геномный анализ каждого из следующих патогенов: [5]
- Птичий грипп
- Денге
- Энтеровирус D68
- Корь
- Вирус оспы обезьян
- Свинка
- SARS-CoV-2
- Сезонный грипп
- Туберкулез
- Вирус Западного Нила
- Западноафриканская Эбола, 2013–2016 гг.
- Зика
COVID-19 пандемия
[ редактировать ]Nextstrain и его результаты широко цитировались во время пандемии COVID-19 . [6] [7] [ ненадежный источник? ] [8] [9]
Премия
[ редактировать ]В мае 2020 года Nextstrain и Тревор Бедфорд (доцент Центра онкологических исследований Фреда Хатчинсона ) [10] получил награду Webby за особые достижения за этот веб-инструмент. [11]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ричардс, Сара Элизабет (26 марта 2020 г.). «Как мутации коронавируса могут отслеживать его распространение и опровергать заговоры» . www.nationalgeographic.com . Архивировано из оригинала 24 декабря 2020 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б «Распространение нового варианта SARS-CoV-2 по Европе летом 2020 года» . www.unibas.ch . 29 октября 2020 года. Архивировано из оригинала 16 декабря 2020 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
- ^ Реза, Ношин (6 апреля 2020 г.). «РНК, ДНК и COVID-19 следующего штамма]» . Earlycareervoice.professional.heart.org . Архивировано из оригинала 25 января 2021 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
- ^ Хэдфилд, Джеймс; Мегилл, Колин; Белл, Сидни; Хаддлстон, Джон; Поттер, Барни; Каллендер, Чарльтон; и др. (22 мая 2018 г.). Келсо, Джанет (ред.). «Nextstrain: отслеживание эволюции патогенов в реальном времени» . Биоинформатика . 34 (23): 4121–4123. doi : 10.1093/биоинформатика/bty407 . ISSN 1367-4803 . ПМК 6247931 . ПМИД 29790939 .
- ^ «Nextstrain Отслеживание эволюции патогенов в реальном времени. Раздел «Изучение патогенов» . nextstrain.org . Архивировано из оригинала 26 декабря 2020 года . Проверено 26 декабря 2020 г.
- ^ Дрейк, Джон (19 декабря 2020 г.). «Наука, лежащая в основе рождественской блокировки коронавируса в Лондоне» . www.forbes.com . Архивировано из оригинала 22 декабря 2020 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
- ^ Ходкрофт, Эмма Б .; Зубер, Мойра; Надо, Сара; Комас, Иньяки; Гонсалес Канделас, Фернандо; Стадлер, Таня; Неер, Ричард А. (28 октября 2020 г.). «Появление и распространение варианта SARS-CoV-2 по Европе летом 2020 года». medRxiv 10.1101/2020.10.25.20219063v1 .
- ^ «Швейцарская национальная научная целевая группа по COVID-19» . Проверено 21 декабря 2021 г.
- ^ «Nextstrain, секвенирование и пандемия SARS-CoV-2» (PDF) . 2020 . Проверено 21 декабря 2021 г.
- ^ «Здравоохранение 40 до 40» . Fortune.com . Архивировано из оригинала 20 октября 2020 года . Проверено 29 декабря 2020 г. .
- ^ «Особое достижение Уэбби» . Winners.webbyawards.com . Архивировано из оригинала 10 октября 2021 года . Проверено 29 декабря 2020 г. .