Пол В. Штернберг
Пол В. Штернберг — американский биолог. Он проводит исследования для WormBase на C. elegans модельном организме .
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Пол Штернберг вырос на Лонг-Айленде, штат Нью-Йорк. Он учился в Хэмпширском колледже в Амхерсте, штат Массачусетс, где получил степень бакалавра в 1978 году. После этого он поступил в Массачусетский технологический институт , где получил докторскую степень по биологии за работу над развитием нематод с Робертом Хорвицем . он продолжил исследования в Вместе с Ирой Херсковиц области молекулярной разработки дрожжей в Калифорнийском университете в Сан-Франциско. [1] В настоящее время он работает в Калифорнийском технологическом институте профессором биологии Томаса Ханта Моргана. [2]
Червячная база
[ редактировать ]Штернберг — главный исследователь WormBase . WormBase — хранилище данных по биологии нематод. C. elegans использовался в исследованиях развития и нейробиологии. WormBase содержит информацию о девяти видах, пять из которых относятся к роду Caenorhabditis , один из которых — C. elegans . WormBase предоставляет: браузер генома, наборы геномов, генов и белков для поиска сходства последовательностей и сводок генов и белков. [3]
Консорциум генной онтологии
[ редактировать ]Он также является главным исследователем Консорциума генной онтологии . Консорциум предоставляет знания о функциях генов и генных продуктов. Он был основан в 1998 году и широко распространен в науках о жизни. Ресурс Gene Ontology содержит наиболее полную информацию о функциях генов. [4] «Онтология охватывает три различных аспекта функции генов: молекулярную функцию, клеточный компонент и биологический процесс». [4]
Текущие исследования
[ редактировать ]Штернберг является соавтором статьи « Миссенс-генетические варианты, связанные с аутизмом , влияют на локомоцию и нервное развитие у Caenorhabditis elegans » (2019). Они использовали C. elegans в качестве генетической модели для поиска фенотипических миссенс-аллелей, собранных в ходе исследований расстройств аутистического спектра, проведенных на людях. Миссенс-варианты вызывают около половины генетических изменений, которые, как известно, вызывают заболевания. Они использовали CRISPR-Cas9 для создания миссенс-мутантов C. elegans, эквивалентных человеческим. Они сравнили фенотипы миссенс-мутантов с диким типом и известными контрольными мутантами с потерей функции в миссенс-аллелях, связанных с аутизмом. Они обнаружили, что 70% миссенс-аллелей демонстрируют очевидные фенотипические изменения в локомоции, морфологии и плодовитости. Они использовали этот метод, чтобы показать тонкие фенотипические изменения и влияние, которое миссенс-мутации могут оказывать на заболевания человека. Они обнаружили, что 14 миссенс-вариантов выполняют значительную функцию в C. elegans . ортологах человеческих генов [5]
Публикации
[ редактировать ]«Линии гонадных клеток нематоды Panagrellus redivivus и последствия для эволюции путем модификации клеточных линий» (1981) Штернберг и Хорвиц сравнили линии гонадных клеток нематоды Panagrellus redivivus с линиями гонад C.elegans. Они обнаружили, что смерть Z4.pp, вероятно, предотвращает развитие заднего яичника у P. redivivus, который у C. elegans контролирует развитие этого заднего яичника. Считается, что это является причиной существенной разницы в морфологии женских гонад P.redivivus и гермафродита C.elegans. [6]
«Постэмбриональные линии негонадных клеток нематоды Panagrellus redivivus: описание и сравнение с линиями Caenorhabditis elegans» (1982) Хорвиц и Штернберг изучили линии постэмбриональных негонадных клеток P.redivivus и сравнили их с C.elegans. Они обнаружили незначительные различия в двух клеточных линиях и обнаружили, что эти различия обусловлены двумя типами эволюционных изменений. [7]
«Мутации, которые влияют на линии нервных клеток и судьбы клеток во время развития нематоды Caenorhabditis elegans» (1983). В этой публикации они обнаружили 19 генов у C. elegans, которые влияют на судьбу нервных клеток и клеточные линии во время развития. Мутации в генах lin-22 , lin-12, unc-86 и ced-3 могут вызывать специфические изменения в судьбе отдельных клеток. Они обнаружили, что эти и другие гены могут действовать в иерархии, влияя на решения на разных стадиях внутри клеточных линий. -86 может влиять на ненейронные аспекты развития, хотя он специфичен для нейронных линий. [8]
«Множественные функции let-23, гена тирозинкиназы рецептора caenorhabditis elegans, необходимого для индукции влагалища» (1991). Ген Let-23 выполняет множество различных функций во время развития C.elegans. Ароян и Штернберг обнаружили, что функция let-23 необходима для вульвы. Клетки-предшественники отвечают на сигнал, ответственный за дифференцировку вульвы. Тирозинкиназа рецептора let-23 контролирует два противоположных пути: один путь отвечает за стимуляцию дифференцировки вульвы, а другой предотвращает дифференцировку вульвы. Они также обнаружили, что киназа let-23 функционирует, по крайней мере. 5 разных тканей. [9]
«Локус lin-15 кодирует два негативных регулятора развития вульвы caenorhabditis elegans». (1994) lin-15 является негативным регулятором вувальной дифференцировки. Хуан, Цзоу и Штернберг обнаружили, что lin-15 кодирует 2 транскрипта, которые не перекрываются и транскрибируются в одном направлении. Они смогли проанализировать, какую роль lin-15 играет в сигнальном пути, и обнаружили, что lin-15 действует выше и параллельно индуктивному сигналу let-23. [10]
«Сигнал выживания гонад для клеток-предшественников вульвы у двух видов нематод» (1998) Феликс и Штернберг обнаружили, что существует сигнал выживания, который предотвращает гибель клеток в клетках-предшественниках вульвы у T.aceti и Halicephalobus sp. Удаление гонад у этих двух нематод вызывает гибель клеток-предшественников вульвы. Это противоположно тому, что наблюдается у C.elegans и многих других видов нематод. Обычно, если происходит абляция гонад, клетки-предшественники вульвы не выполняют эпидермальную судьбу и не подвергаются запрограммированной гибели клеток. [11]
«Доказательства наличия сигнала поиска партнера у нематоды-гермафродита Caenorhabditis elegans» (2002) Саймон и Штернберг провели несколько различных анализов и обнаружили, что самцы особенно реагируют на сексуально диморфный сигнал, который испускают гермафродиты. Они обнаружили, что кий не выделяется из тканей вульвы. Сигнал, скорее всего, улавливается хемосенсорным органом мужчины. Их результаты показали, что самцы имеют предпочтения в выборе партнера, а гермафродиты действительно играют роль в спаривании. [12]
«Система визуализации для стандартизированного количественного анализа поведения C. elegans» (2004) Штернберг и др. создали широко доступный количественный метод для оценки поведенческих фенотипов. Они смогли записывать поведение при большом увеличении в течение длительных периодов времени и количественно определять поведенческие характеристики для последующего анализа. Это позволяет легко сравнивать данные из разных лабораторий путем стандартизации поведенческих анализов. Это также позволит регистрировать отдельных нематод и количественно определять 144 конкретных параметра фенотипа. [13]
Популярные издания
[ редактировать ]Ниже приведены некоторые из наиболее цитируемых публикаций Штернберга:
- Мюллер, Ханс-Михаэль; Кенни, Эймир Э.; Штернберг, Пол В. (2004). «Textpresso: система поиска и извлечения информации на основе онтологий для биологической литературы» . ПЛОС Биология . 2 (11): е309. дои : 10.1371/journal.pbio.0020309 . ПМЦ 517822 . ПМИД 15383839 .
- Гринвальд, Ива С.; Штернберг, Пол В.; Роберт Хорвиц, Х. (1983). «Локус lin-12 определяет судьбу клеток caenorhabditis elegans». Клетка . 34 (2): 435–444. дои : 10.1016/0092-8674(83)90377-X . ПМИД 6616618 . S2CID 40668388 .
- Левченко А.; Брук, Дж.; Штернберг, PW (2000). «Белки каркаса могут двухфазно влиять на уровни передачи сигналов митоген-активируемой протеинкиназы и снижать ее пороговые свойства» . Труды Национальной академии наук . 97 (11): 5818–5823. Бибкод : 2000PNAS...97.5818L . дои : 10.1073/pnas.97.11.5818 . ЧВК 18517 . ПМИД 10823939 .
- Ароян, Раффи В.; Кога, Макото; Мендель, Джейн Э.; Осима, Ясуми; Штернберг, Пол В. (1990). «Ген let-23, необходимый для индукции вульвы Caenorhabditis elegans, кодирует тирозинкиназу подсемейства рецепторов EGF». Природа 348 (6303): 693–699. Бибкод : 1990Nature.348..693A . дои : 10.1038/348693a0 . ПМИД 1979659 . S2CID 4358437 .
Членство
[ редактировать ]- Американская академия искусств и наук
- Национальная академия наук
- Член Американской ассоциации содействия развитию науки [2]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Штернберг, Пол В. (сентябрь 2013 г.). «Пол В. Штернберг» . Современная биология . 23 (17): Р704–Р705. дои : 10.1016/j.cub.2013.07.023 . ПМИД 24156105 .
- ^ Jump up to: а б «Пол В. Штернберг» . Американская академия искусств и наук . Проверено 26 апреля 2020 г.
- ^ Харрис, Тодд В.; Антошечкин Игорь; Берри, Тамберлин; Блазиар, Дарин; Чан, Хуанкарлос; Чен, Вэнь Цзюнь; Де Ла Круз, Нори; Дэвис, Пол; Дьюсбери, Маргарет; Фанг, Жуйхуа; Фернандес, Джолин (январь 2010 г.). «WormBase: комплексный ресурс по исследованию нематод» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (дополнение_1): D463–D467. дои : 10.1093/нар/gkp952 . ISSN 0305-1048 . ПМК 2808986 . ПМИД 19910365 .
- ^ Jump up to: а б Консорциум генной онтологии (08 января 2019 г.). «Ресурс по онтологии генов: 20 лет и все еще набирает силу» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (Д1): Д330–Д338. дои : 10.1093/nar/gky1055 . ISSN 0305-1048 . ПМК 6323945 . ПМИД 30395331 .
- ^ Вонг, Ван-Ронг; Бругман, Кэтрин I; Махер, Шайда; О, Джун Ён; Хау, Кевин; Като, Михоко; Штернберг, Пол В. (01 апреля 2019 г.). «Миссенс-генетические варианты, связанные с аутизмом, влияют на локомоцию и нервное развитие Caenorhabditis elegans» . Молекулярная генетика человека . 28 (13): 2271–2281. дои : 10.1093/hmg/ddz051 . ISSN 0964-6906 . ПМК 6586145 . ПМИД 31220273 .
- ^ Штернберг, Пол В.; Хорвиц, Х. Роберт (ноябрь 1981 г.). «Линии гонадных клеток нематоды Panagrellus redivivus и значение для эволюции путем модификации клеточной линии». Биология развития . 88 (1): 147–166. дои : 10.1016/0012-1606(81)90226-8 . ISSN 0012-1606 . ПМИД 7286441 .
- ^ Штернберг, Пол В.; Хорвиц, Х. Роберт (сентябрь 1982 г.). «Постэмбриональные линии негонадных клеток нематоды Panagrellus redivivus: описание и сравнение с линиями Caenorhabditis elegans». Биология развития . 93 (1): 181–205. дои : 10.1016/0012-1606(82)90251-2 . ISSN 0012-1606 . ПМИД 7128930 .
- ^ Хорвиц, HR; Штернберг, П.В.; Гринвальд, Исландия; Фикссен, В.; Эллис, HM (1 января 1983 г.). «Мутации, которые влияют на линии нервных клеток и клеточные судьбы во время развития нематоды Caenorhabditis elegans». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 48 : 453–463. дои : 10.1101/sqb.1983.048.01.050 . ISSN 0091-7451 . ПМИД 6586368 .
- ^ Ароян, Р.В.; Штернберг, PW (1 июня 1991 г.). «Множественные функции let-23, гена тирозинкиназы рецептора Caenorhabditis elegans, необходимого для индукции вульвы» . Генетика . 128 (2): 251–267. дои : 10.1093/генетика/128.2.251 . ISSN 0016-6731 . ПМК 1204464 . ПМИД 2071015 .
- ^ Хуанг, Л.С.; Цзоу, П; Штернберг, PW (апрель 1994 г.). «Локус lin-15 кодирует два негативных регулятора развития вульвы Caenorhabditis elegans» . Молекулярная биология клетки . 5 (4): 395–411. дои : 10.1091/mbc.5.4.395 . ISSN 1059-1524 . ПМК 301050 . ПМИД 8054684 .
- ^ Феликс, Мари-Анн; Штернберг, Пол В. (февраль 1998 г.). «Сигнал выживания гонад для клеток-предшественников вульвы у двух видов нематод» . Современная биология . 8 (5): 287–290. дои : 10.1016/s0960-9822(98)70111-3 . ISSN 0960-9822 . ПМИД 9501068 .
- ^ Саймон, Дж. М.; Штернберг, PW (29 января 2002 г.). «Свидетельства о сигнале поиска партнера у нематоды-гермафродита Caenorhabditis elegans» . Труды Национальной академии наук . 99 (3): 1598–1603. Бибкод : 2002PNAS...99.1598S . дои : 10.1073/pnas.032225799 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 122236 . ПМИД 11818544 .
- ^ Фэн, Чжаоян; Кронин, Кристофер Дж; Виттиг, Джон Х; Штернберг, Пол В.; Шафер, Уильям Р. (26 августа 2004 г.). «Система визуализации для стандартизированного количественного анализа поведения C. elegans» . БМК Биоинформатика . 5 (1): 115. дои : 10.1186/1471-2105-5-115 . ISSN 1471-2105 . ПМК 517925 . ПМИД 15331023 .